Heatmap: Cluster_274 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro102_g052020.1 (Contig319.g4246)
0.01 0.96 0.99 1.0 0.97 0.27 0.42 0.39 0.86 0.49 0.57 0.58 0.6 0.63 0.54 0.54 0.98 0.5 0.41 0.42 0.42 0.47 0.81 0.18 0.12 0.31 0.41
Sro1032_g233530.1 (Contig2177.g18181)
0.01 0.79 0.96 1.0 0.86 0.4 0.23 0.16 0.31 0.33 0.53 0.45 0.36 0.38 0.27 0.13 0.76 0.04 0.2 0.28 0.17 0.14 0.3 0.15 0.08 0.09 0.31
Sro1039_g234420.1 (Contig313.g4171)
0.03 0.86 0.9 0.97 0.98 0.24 0.37 0.28 0.6 0.41 0.66 0.47 0.44 0.3 0.48 0.65 1.0 0.37 0.36 0.41 0.3 0.22 0.57 0.2 0.1 0.16 0.39
Sro1161_g247800.1 (Contig369.g4992)
0.0 1.0 0.61 0.4 0.53 0.12 0.34 0.23 0.55 0.2 0.34 0.2 0.26 0.2 0.17 0.05 0.86 0.32 0.23 0.2 0.08 0.16 0.49 0.07 0.03 0.16 0.15
Sro117_g057360.1 (Contig3937.g30180)
0.0 1.0 0.98 0.59 0.46 0.08 0.05 0.04 0.12 0.17 0.12 0.1 0.06 0.13 0.12 0.08 0.15 0.04 0.09 0.13 0.14 0.16 0.09 0.03 0.01 0.14 0.14
Sro124_g059890.1 (Contig2339.g19240)
0.02 1.0 0.77 0.74 0.67 0.38 0.27 0.32 0.48 0.34 0.34 0.28 0.43 0.48 0.33 0.24 0.79 0.29 0.27 0.32 0.18 0.36 0.53 0.07 0.04 0.12 0.32
Sro1259_g256920.1 (Contig1889.g16463)
0.0 0.9 0.88 0.77 0.67 0.32 0.2 0.23 0.46 0.32 0.72 0.4 0.81 0.23 0.32 0.15 1.0 0.22 0.21 0.89 0.18 0.16 0.32 0.11 0.06 0.11 0.28
Sro126_g060670.1 (Contig82.g884)
0.02 0.78 0.92 0.89 0.83 0.3 0.36 0.36 0.53 0.43 0.68 0.53 0.62 0.52 0.44 0.31 1.0 0.28 0.41 0.59 0.31 0.34 0.5 0.34 0.17 0.22 0.39
Sro130_g061790.1 (Contig2611.g21102)
0.05 0.85 0.97 0.94 0.9 0.44 0.33 0.29 0.48 0.43 0.7 0.36 0.7 0.46 0.46 0.47 1.0 0.32 0.33 0.54 0.37 0.2 0.44 0.23 0.33 0.41 0.48
Sro135_g063810.1 (Contig2231.g18526)
0.02 1.0 0.79 0.67 0.74 0.21 0.4 0.38 0.62 0.33 0.54 0.38 0.42 0.21 0.32 0.18 0.89 0.25 0.24 0.36 0.24 0.22 0.51 0.19 0.13 0.11 0.3
Sro1377_g267540.1 (Contig2268.g18823)
0.02 0.58 0.61 0.7 0.75 0.3 0.4 0.42 0.78 0.32 0.6 0.41 0.65 0.41 0.36 0.21 1.0 0.37 0.32 0.44 0.24 0.28 0.61 0.17 0.15 0.18 0.3
0.0 1.0 0.77 0.74 0.81 0.27 0.37 0.29 0.48 0.45 0.57 0.43 0.34 0.27 0.4 0.42 0.76 0.23 0.27 0.4 0.5 0.37 0.43 0.22 0.25 0.28 0.46
Sro1458_g274400.1 (Contig1960.g16808)
0.08 0.97 0.82 1.0 0.93 0.36 0.39 0.43 0.53 0.48 0.78 0.58 0.39 0.3 0.51 0.35 0.83 0.42 0.4 0.34 0.39 0.24 0.51 0.29 0.33 0.31 0.47
Sro1533_g280340.1 (Contig2004.g17155)
0.0 0.74 0.77 0.61 0.64 0.21 0.41 0.31 0.6 0.29 0.54 0.3 0.38 0.28 0.4 0.27 1.0 0.22 0.19 0.34 0.23 0.21 0.55 0.15 0.1 0.18 0.31
Sro1660_g289260.1 (Contig4018.g30900)
0.01 0.93 1.0 0.79 0.81 0.41 0.39 0.58 0.68 0.4 0.57 0.42 0.31 0.38 0.4 0.29 0.68 0.22 0.41 0.36 0.3 0.37 0.63 0.21 0.15 0.32 0.41
Sro1717_g293250.1 (Contig1024.g10220)
0.0 0.84 0.84 1.0 0.96 0.37 0.26 0.34 0.37 0.39 0.65 0.39 0.35 0.38 0.37 0.27 0.84 0.16 0.2 0.28 0.21 0.13 0.35 0.19 0.23 0.2 0.43
Sro1789_g297670.1 (Contig4569.g34131)
0.04 0.85 0.78 1.0 0.92 0.31 0.27 0.31 0.45 0.44 0.75 0.44 0.36 0.29 0.51 0.35 0.67 0.3 0.34 0.24 0.32 0.25 0.29 0.34 0.44 0.32 0.38
Sro1843_g301180.1 (Contig4701.g34966)
0.0 1.0 0.68 0.81 0.91 0.29 0.48 0.77 0.84 0.33 0.63 0.35 0.54 0.3 0.44 0.29 1.0 0.33 0.27 0.3 0.14 0.38 0.55 0.21 0.14 0.21 0.37
Sro1867_g302550.1 (Contig3188.g25159)
0.01 0.88 0.86 1.0 0.92 0.36 0.31 0.28 0.47 0.52 0.65 0.63 0.66 0.63 0.46 0.45 0.8 0.33 0.38 0.5 0.48 0.24 0.42 0.3 0.29 0.33 0.42
Sro1891_g303770.1 (Contig3442.g26774)
0.01 0.89 0.67 0.57 0.67 0.28 0.54 0.56 1.0 0.32 0.57 0.34 0.44 0.36 0.4 0.27 0.82 0.26 0.22 0.3 0.21 0.51 0.71 0.18 0.14 0.2 0.35
Sro1915_g305090.1 (Contig3943.g30225)
0.0 1.0 0.85 0.68 0.67 0.26 0.18 0.24 0.39 0.23 0.59 0.25 0.33 0.21 0.35 0.21 0.99 0.21 0.22 0.2 0.12 0.25 0.27 0.13 0.09 0.15 0.29
Sro197_g083910.1 (Contig3509.g27196)
0.0 1.0 0.71 0.73 0.75 0.44 0.25 0.2 0.43 0.4 0.6 0.52 0.63 0.3 0.37 0.22 0.88 0.15 0.25 0.49 0.36 0.25 0.4 0.19 0.15 0.28 0.29
Sro2019_g311300.1 (Contig3048.g24247)
0.0 0.87 1.0 0.55 0.59 0.16 0.16 0.31 0.41 0.36 0.52 0.42 0.54 0.39 0.33 0.24 0.86 0.19 0.31 0.46 0.33 0.18 0.45 0.11 0.11 0.16 0.37
Sro2027_g311690.1 (Contig818.g9106)
0.0 0.89 0.95 0.98 0.77 0.38 0.15 0.17 0.44 0.32 0.35 0.37 1.0 0.35 0.37 0.17 0.57 0.1 0.33 0.45 0.31 0.25 0.26 0.15 0.13 0.18 0.26
Sro2108_g314880.1 (Contig522.g6860)
0.0 0.81 1.0 0.77 0.71 0.15 0.07 0.15 0.25 0.22 0.32 0.19 0.27 0.12 0.19 0.12 0.5 0.12 0.14 0.26 0.14 0.16 0.2 0.04 0.09 0.14 0.22
Sro237_g095300.1 (Contig1864.g16301)
0.06 0.85 1.0 0.61 0.55 0.13 0.11 0.16 0.18 0.27 0.32 0.21 0.18 0.13 0.23 0.19 0.35 0.19 0.26 0.18 0.18 0.37 0.18 0.09 0.08 0.1 0.28
Sro2693_g334830.1 (Contig1365.g12558)
0.0 1.0 0.72 0.87 0.91 0.2 0.15 0.2 0.25 0.26 0.46 0.29 0.3 0.23 0.24 0.09 0.86 0.08 0.09 0.2 0.12 0.09 0.2 0.08 0.01 0.05 0.17
Sro272_g104910.1 (Contig2144.g18032)
0.01 0.92 1.0 0.84 0.77 0.24 0.32 0.25 0.45 0.39 0.55 0.48 0.48 0.4 0.38 0.26 0.66 0.29 0.25 0.53 0.36 0.3 0.41 0.2 0.15 0.19 0.31
Sro299_g111260.1 (Contig1218.g11428)
0.01 1.0 0.7 0.79 0.78 0.23 0.39 0.33 0.49 0.34 0.47 0.34 0.46 0.3 0.34 0.19 0.71 0.32 0.27 0.38 0.2 0.08 0.56 0.12 0.11 0.14 0.33
Sro3041_g342650.1 (Contig2331.g19201)
0.02 0.56 0.79 1.0 0.91 0.18 0.24 0.28 0.31 0.28 0.49 0.19 0.55 0.41 0.4 0.2 0.62 0.4 0.16 0.34 0.23 0.04 0.32 0.2 0.29 0.27 0.27
Sro346_g122710.1 (Contig4731.g35098)
0.01 0.69 0.73 1.0 0.85 0.09 0.27 0.31 0.39 0.29 0.58 0.31 0.67 0.24 0.3 0.28 0.59 0.29 0.34 0.45 0.24 0.23 0.31 0.22 0.32 0.24 0.18
Sro353_g124440.1 (Contig1923.g16578)
0.03 0.49 0.62 0.87 0.83 0.41 0.44 0.51 0.64 0.5 0.97 0.54 0.54 0.29 0.64 0.49 1.0 0.74 0.52 0.46 0.58 0.22 0.51 0.38 0.56 0.4 0.57
Sro37_g023120.1 (Contig1425.g13128)
0.01 0.92 1.0 0.92 0.8 0.27 0.41 0.38 0.58 0.47 0.68 0.51 0.72 0.4 0.51 0.45 0.69 0.29 0.43 0.67 0.36 0.46 0.51 0.37 0.29 0.32 0.45
Sro3842_g351400.1 (Contig3780.g29021)
0.0 0.94 1.0 0.93 0.72 0.15 0.14 0.16 0.21 0.21 0.19 0.2 0.25 0.13 0.16 0.08 0.38 0.07 0.07 0.21 0.11 0.13 0.16 0.06 0.04 0.03 0.12
Sro385_g131750.1 (Contig3292.g25857)
0.01 1.0 0.63 0.64 0.59 0.18 0.19 0.23 0.37 0.2 0.4 0.24 0.19 0.13 0.21 0.11 0.82 0.1 0.11 0.14 0.1 0.1 0.27 0.07 0.03 0.06 0.19
Sro3_g002260.1 (Contig3832.g29411)
0.01 1.0 0.68 0.52 0.54 0.11 0.19 0.25 0.38 0.22 0.47 0.18 0.4 0.21 0.28 0.21 0.66 0.26 0.27 0.37 0.12 0.19 0.29 0.14 0.09 0.14 0.25
Sro406_g136440.1 (Contig2793.g22485)
0.01 0.75 0.98 1.0 0.88 0.23 0.38 0.3 0.61 0.36 0.67 0.43 0.4 0.21 0.43 0.41 0.84 0.23 0.22 0.3 0.35 0.25 0.55 0.21 0.26 0.2 0.38
Sro413_g138090.1 (Contig3915.g30009)
0.03 0.91 0.86 1.0 0.98 0.38 0.38 0.47 0.64 0.3 0.68 0.31 0.52 0.26 0.33 0.18 0.95 0.24 0.21 0.25 0.12 0.25 0.6 0.17 0.13 0.21 0.36
Sro4340_g353780.1 (Contig2486.g20362)
0.0 1.0 0.97 0.66 0.68 0.15 0.33 0.31 0.59 0.42 0.5 0.52 0.62 0.4 0.36 0.29 0.62 0.18 0.28 0.46 0.29 0.34 0.45 0.12 0.18 0.17 0.31
Sro437_g142770.1 (Contig994.g10043)
0.17 0.95 0.84 0.95 1.0 0.22 0.43 0.36 0.66 0.3 0.54 0.28 0.58 0.24 0.3 0.23 0.8 0.2 0.23 0.39 0.17 0.35 0.67 0.16 0.16 0.15 0.3
0.0 0.9 0.87 0.73 0.8 0.46 0.47 0.57 0.76 0.54 0.78 0.66 0.61 0.58 0.57 0.44 1.0 0.35 0.46 0.54 0.48 0.29 0.63 0.4 0.12 0.42 0.53
Sro497_g154700.1 (Contig738.g8452)
0.0 1.0 0.62 0.77 0.85 0.25 0.34 0.26 0.65 0.46 0.44 0.54 0.48 0.42 0.4 0.29 0.72 0.33 0.38 0.45 0.39 0.38 0.51 0.24 0.22 0.23 0.27
Sro498_g154900.1 (Contig3753.g28744)
0.03 0.93 1.0 0.8 0.81 0.26 0.34 0.39 0.59 0.46 0.71 0.61 0.71 0.47 0.49 0.4 0.96 0.33 0.6 0.62 0.39 0.45 0.59 0.44 0.24 0.34 0.44
Sro514_g158060.1 (Contig3991.g30647)
0.01 0.78 0.76 1.0 0.88 0.46 0.36 0.42 0.48 0.48 0.84 0.61 0.83 0.35 0.37 0.08 0.85 0.28 0.47 0.83 0.39 0.24 0.46 0.15 0.19 0.27 0.53
Sro54_g031800.1 (Contig2430.g19868)
0.04 0.7 0.81 0.98 1.0 0.24 0.36 0.38 0.69 0.28 0.47 0.29 0.54 0.39 0.34 0.26 0.68 0.25 0.2 0.41 0.2 0.41 0.69 0.1 0.15 0.22 0.29
Sro557_g166120.1 (Contig1427.g13182)
0.01 0.97 0.72 0.96 1.0 0.18 0.33 0.29 0.51 0.36 0.56 0.39 0.66 0.4 0.39 0.28 0.73 0.35 0.31 0.53 0.32 0.35 0.5 0.21 0.23 0.2 0.3
Sro56_g032870.1 (Contig3029.g24163)
0.0 1.0 0.63 0.67 0.66 0.31 0.41 0.42 0.53 0.4 0.65 0.44 0.43 0.29 0.44 0.27 0.73 0.28 0.28 0.32 0.28 0.19 0.44 0.49 0.35 0.24 0.37
Sro614_g175680.1 (Contig1589.g14422)
0.01 1.0 0.91 0.7 0.59 0.21 0.15 0.13 0.31 0.3 0.47 0.33 0.25 0.19 0.3 0.2 0.68 0.2 0.25 0.23 0.24 0.17 0.19 0.16 0.08 0.1 0.25
Sro623_g177140.1 (Contig3858.g29693)
0.01 1.0 0.7 0.48 0.42 0.16 0.23 0.25 0.54 0.28 0.56 0.29 0.42 0.26 0.3 0.19 0.64 0.17 0.26 0.3 0.25 0.2 0.32 0.28 0.17 0.21 0.3
Sro662_g183330.1 (Contig3613.g27927)
0.0 1.0 0.93 0.74 0.85 0.2 0.12 0.17 0.38 0.3 0.53 0.38 0.24 0.22 0.3 0.15 0.93 0.08 0.18 0.19 0.19 0.19 0.18 0.11 0.12 0.11 0.26
Sro6_g004960.1 (Contig175.g2001)
0.0 0.68 0.97 1.0 0.96 0.23 0.41 0.37 0.83 0.47 0.66 0.57 0.88 0.57 0.46 0.41 0.96 0.41 0.37 0.63 0.45 0.52 0.78 0.12 0.2 0.25 0.37
Sro758_g198060.1 (Contig434.g5858)
0.0 0.63 0.72 0.89 0.82 0.24 0.24 0.25 0.43 0.4 0.58 0.54 0.72 0.44 0.33 0.25 1.0 0.28 0.28 0.57 0.29 0.17 0.41 0.1 0.04 0.17 0.36
Sro791_g202980.1 (Contig1638.g14764)
0.0 0.83 1.0 0.65 0.57 0.18 0.15 0.18 0.38 0.2 0.26 0.21 0.15 0.22 0.15 0.07 0.35 0.06 0.1 0.11 0.15 0.2 0.26 0.1 0.05 0.08 0.14
Sro79_g042800.1 (Contig1826.g16087)
0.0 1.0 0.94 0.9 0.77 0.17 0.29 0.22 0.37 0.33 0.4 0.42 0.44 0.4 0.28 0.15 0.59 0.15 0.13 0.31 0.25 0.12 0.31 0.12 0.18 0.1 0.24
Sro88_g046380.1 (Contig265.g3296)
0.13 0.94 1.0 0.92 0.92 0.28 0.27 0.21 0.41 0.4 0.66 0.45 0.54 0.46 0.43 0.35 0.74 0.26 0.24 0.46 0.32 0.2 0.33 0.23 0.15 0.13 0.33
Sro89_g047020.1 (Contig3846.g29623)
0.0 1.0 0.99 0.95 1.0 0.3 0.32 0.34 0.47 0.38 0.61 0.52 0.42 0.39 0.39 0.32 0.68 0.24 0.24 0.34 0.28 0.09 0.45 0.23 0.26 0.2 0.43
0.01 1.0 0.79 0.78 0.86 0.21 0.26 0.23 0.55 0.44 0.53 0.65 0.67 0.44 0.35 0.24 0.83 0.18 0.24 0.42 0.37 0.15 0.36 0.2 0.11 0.2 0.32
Sro966_g225670.1 (Contig1539.g13985)
0.0 1.0 0.85 0.93 0.9 0.22 0.25 0.3 0.43 0.43 0.63 0.54 0.5 0.35 0.37 0.4 0.88 0.3 0.34 0.42 0.33 0.19 0.34 0.13 0.14 0.24 0.38
Sro982_g227600.1 (Contig2831.g22671)
0.0 0.88 1.0 0.58 0.59 0.16 0.42 0.56 0.6 0.44 0.45 0.53 0.81 0.43 0.4 0.3 0.61 0.38 0.44 0.68 0.39 0.35 0.45 0.36 0.28 0.25 0.33
Sro991_g228670.1 (Contig3422.g26673)
0.0 0.52 1.0 0.43 0.27 0.05 0.17 0.12 0.26 0.18 0.26 0.16 0.47 0.18 0.15 0.1 0.33 0.16 0.27 0.48 0.13 0.1 0.25 0.08 0.05 0.06 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)