Heatmap: Cluster_274 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro102_g052020.1 (Contig319.g4246)
1.11 81.15 83.74 84.28 82.15 22.92 35.07 33.0 72.33 41.32 47.8 48.98 50.19 53.34 45.58 45.86 82.36 42.31 34.29 35.04 35.05 39.34 68.23 14.81 9.77 25.94 34.6
Sro1032_g233530.1 (Contig2177.g18181)
0.05 5.39 6.52 6.81 5.86 2.7 1.6 1.1 2.13 2.23 3.62 3.07 2.43 2.56 1.84 0.89 5.21 0.29 1.35 1.88 1.17 0.94 2.03 1.0 0.56 0.58 2.13
Sro1039_g234420.1 (Contig313.g4171)
2.54 86.27 90.42 97.27 98.34 23.73 37.14 27.7 59.91 40.91 66.41 46.9 44.23 29.68 47.63 64.8 99.96 37.22 35.88 40.91 30.41 22.05 57.09 19.77 9.89 16.28 38.97
Sro1161_g247800.1 (Contig369.g4992)
0.34 85.01 51.84 33.82 45.23 10.54 29.14 19.83 46.81 17.12 29.26 17.39 22.24 16.83 14.72 3.83 73.12 27.36 19.46 17.17 6.81 13.65 41.82 6.33 2.23 13.51 12.85
Sro117_g057360.1 (Contig3937.g30180)
0.15 37.9 36.97 22.52 17.5 3.12 1.94 1.59 4.65 6.52 4.63 3.81 2.27 5.09 4.42 2.96 5.84 1.47 3.29 4.98 5.49 5.93 3.41 1.19 0.25 5.19 5.34
Sro124_g059890.1 (Contig2339.g19240)
0.57 35.92 27.83 26.64 24.24 13.53 9.79 11.34 17.42 12.39 12.15 10.23 15.38 17.35 11.71 8.47 28.45 10.53 9.56 11.4 6.3 12.77 18.91 2.61 1.39 4.49 11.42
Sro1259_g256920.1 (Contig1889.g16463)
0.09 19.74 19.23 16.91 14.69 6.92 4.29 5.12 10.18 7.12 15.73 8.68 17.77 4.96 7.14 3.34 21.96 4.88 4.68 19.57 3.91 3.55 7.07 2.39 1.4 2.34 6.24
Sro126_g060670.1 (Contig82.g884)
0.48 19.56 23.17 22.24 20.91 7.54 8.98 9.07 13.4 10.75 17.14 13.24 15.64 13.06 10.95 7.79 25.08 6.94 10.28 14.89 7.83 8.58 12.66 8.54 4.22 5.63 9.89
Sro130_g061790.1 (Contig2611.g21102)
2.56 45.94 52.71 51.23 48.65 23.64 17.9 15.7 25.87 23.2 37.81 19.39 38.0 24.82 24.94 25.32 54.31 17.26 17.8 29.52 19.96 11.08 24.03 12.64 18.19 22.29 25.81
Sro135_g063810.1 (Contig2231.g18526)
2.63 161.77 128.2 108.69 120.19 34.31 64.16 60.89 101.06 52.94 86.56 61.58 67.47 33.32 51.62 28.79 144.19 39.73 38.2 57.52 39.12 36.03 83.25 30.22 20.31 18.29 48.87
Sro1377_g267540.1 (Contig2268.g18823)
0.77 25.77 26.92 30.81 33.15 13.31 17.8 18.78 34.61 14.37 26.41 18.26 28.78 18.02 15.89 9.43 44.27 16.39 13.95 19.35 10.42 12.25 27.02 7.58 6.62 8.08 13.34
0.1 25.88 19.93 19.14 20.94 6.95 9.63 7.46 12.3 11.63 14.65 11.2 8.73 6.91 10.41 10.94 19.79 5.84 7.1 10.25 12.94 9.48 11.16 5.7 6.57 7.26 11.87
Sro1458_g274400.1 (Contig1960.g16808)
19.48 250.71 212.28 259.05 241.82 93.66 101.46 110.4 137.77 123.91 201.7 149.47 100.07 76.79 133.25 89.75 214.8 108.57 102.35 87.52 101.23 61.51 130.83 76.12 84.34 81.46 122.15
Sro1533_g280340.1 (Contig2004.g17155)
0.35 70.87 73.62 58.05 60.98 20.15 38.94 29.03 56.84 27.17 51.58 28.33 35.82 26.75 37.63 25.22 95.14 20.49 18.38 31.96 21.99 19.8 52.3 14.33 9.7 16.72 29.07
Sro1660_g289260.1 (Contig4018.g30900)
0.2 24.96 26.76 21.1 21.69 11.04 10.56 15.5 18.19 10.63 15.35 11.36 8.28 10.09 10.7 7.81 18.32 5.76 10.99 9.75 7.92 9.78 16.9 5.66 3.96 8.48 10.91
Sro1717_g293250.1 (Contig1024.g10220)
0.12 26.81 26.74 31.85 30.69 11.86 8.42 10.73 11.65 12.5 20.67 12.5 11.15 12.17 11.86 8.52 26.73 5.05 6.34 8.78 6.65 4.11 11.09 6.04 7.3 6.48 13.81
Sro1789_g297670.1 (Contig4569.g34131)
3.1 66.21 61.09 78.24 72.09 24.18 21.17 24.17 35.14 34.05 58.85 34.25 28.0 22.51 39.73 27.01 52.3 23.72 26.73 18.79 24.74 19.38 22.97 26.57 34.53 24.88 29.35
Sro1843_g301180.1 (Contig4701.g34966)
0.21 45.53 30.88 37.06 41.37 13.11 21.88 35.04 38.35 15.12 28.68 16.02 24.81 13.49 20.04 13.39 45.41 14.9 12.4 13.67 6.58 17.29 24.94 9.72 6.16 9.35 16.85
Sro1867_g302550.1 (Contig3188.g25159)
0.46 29.57 29.1 33.65 30.9 12.19 10.41 9.46 15.91 17.38 21.73 21.23 22.17 21.09 15.4 15.0 27.08 11.03 12.64 16.99 15.99 7.97 14.26 10.21 9.89 11.26 14.13
Sro1891_g303770.1 (Contig3442.g26774)
0.63 70.95 53.57 45.86 53.85 22.23 43.05 44.82 80.08 25.64 45.25 27.23 35.39 29.13 32.08 21.8 65.58 21.13 17.74 23.7 17.11 40.46 56.72 14.71 10.95 16.04 27.65
Sro1915_g305090.1 (Contig3943.g30225)
0.1 33.44 28.53 22.7 22.26 8.58 6.16 8.0 13.16 7.78 19.67 8.35 10.89 7.18 11.8 6.96 32.99 7.16 7.33 6.58 4.05 8.4 9.15 4.21 2.92 4.88 9.54
Sro197_g083910.1 (Contig3509.g27196)
0.03 7.36 5.25 5.35 5.5 3.23 1.82 1.48 3.19 2.93 4.44 3.85 4.63 2.24 2.7 1.58 6.44 1.12 1.83 3.63 2.64 1.81 2.96 1.37 1.1 2.05 2.17
Sro2019_g311300.1 (Contig3048.g24247)
0.02 10.04 11.59 6.35 6.83 1.84 1.88 3.54 4.77 4.22 6.08 4.92 6.25 4.48 3.78 2.73 10.01 2.24 3.56 5.35 3.84 2.04 5.19 1.31 1.23 1.88 4.25
Sro2027_g311690.1 (Contig818.g9106)
0.02 10.35 11.12 11.44 8.99 4.48 1.72 2.04 5.18 3.67 4.11 4.25 11.65 4.08 4.25 1.96 6.68 1.13 3.81 5.24 3.57 2.91 3.02 1.8 1.55 2.09 3.0
Sro2108_g314880.1 (Contig522.g6860)
0.07 32.14 39.84 30.85 28.26 6.11 2.84 5.83 9.91 8.67 12.6 7.49 10.92 4.86 7.71 4.67 19.87 4.62 5.71 10.55 5.76 6.5 8.15 1.63 3.72 5.54 8.68
Sro237_g095300.1 (Contig1864.g16301)
1.11 14.87 17.44 10.57 9.55 2.21 1.96 2.75 3.15 4.71 5.66 3.6 3.2 2.34 3.96 3.32 6.16 3.23 4.51 3.23 3.21 6.37 3.1 1.64 1.45 1.7 4.88
Sro2693_g334830.1 (Contig1365.g12558)
0.02 15.77 11.37 13.68 14.28 3.12 2.4 3.11 3.93 4.08 7.24 4.55 4.76 3.65 3.79 1.46 13.5 1.28 1.48 3.1 1.94 1.5 3.15 1.27 0.22 0.78 2.69
Sro272_g104910.1 (Contig2144.g18032)
0.42 56.31 61.2 51.3 47.08 14.91 19.79 15.41 27.49 23.91 33.75 29.59 29.6 24.5 23.01 15.69 40.61 17.57 15.08 32.27 21.86 18.18 25.08 11.95 9.16 11.6 19.05
Sro299_g111260.1 (Contig1218.g11428)
0.59 98.18 68.66 77.16 76.97 22.52 38.64 32.58 47.81 33.43 46.54 33.48 44.71 29.77 33.47 18.18 69.79 31.12 26.2 37.68 19.97 7.8 55.36 11.87 10.64 13.96 31.99
Sro3041_g342650.1 (Contig2331.g19201)
6.9 195.33 273.03 347.8 317.95 60.89 84.33 96.02 106.29 97.03 169.46 66.12 192.71 141.88 138.98 67.86 215.59 139.79 57.3 117.66 81.2 12.28 109.57 68.11 102.45 95.25 92.71
Sro346_g122710.1 (Contig4731.g35098)
0.11 10.56 11.17 15.33 13.06 1.32 4.12 4.83 6.04 4.48 8.85 4.72 10.32 3.61 4.62 4.35 9.09 4.46 5.23 6.93 3.67 3.57 4.71 3.42 4.9 3.71 2.82
Sro353_g124440.1 (Contig1923.g16578)
12.25 191.95 242.7 342.49 323.69 159.84 170.91 200.16 250.63 196.66 381.2 212.97 212.99 114.08 249.53 190.71 392.07 289.9 203.64 182.19 225.91 85.39 201.82 150.79 218.99 157.23 223.59
Sro37_g023120.1 (Contig1425.g13128)
0.37 33.68 36.43 33.61 29.2 9.68 15.11 13.77 21.28 17.0 24.86 18.52 26.07 14.47 18.4 16.56 25.05 10.46 15.63 24.26 13.22 16.75 18.71 13.32 10.53 11.67 16.51
Sro3842_g351400.1 (Contig3780.g29021)
0.05 26.85 28.64 26.58 20.73 4.32 4.04 4.47 6.11 6.09 5.45 5.66 7.05 3.74 4.62 2.22 10.75 2.02 2.07 5.92 3.13 3.72 4.71 1.58 1.14 0.88 3.56
Sro385_g131750.1 (Contig3292.g25857)
0.35 30.52 19.27 19.49 18.07 5.56 5.83 7.07 11.42 6.07 12.33 7.32 5.93 3.89 6.41 3.24 25.12 2.97 3.34 4.37 3.06 3.01 8.1 2.2 0.9 1.81 5.82
Sro3_g002260.1 (Contig3832.g29411)
0.18 32.96 22.29 17.11 17.78 3.77 6.29 8.16 12.37 7.25 15.54 5.86 13.34 6.96 9.29 6.94 21.74 8.67 8.83 12.1 3.97 6.16 9.61 4.54 2.82 4.62 8.26
Sro406_g136440.1 (Contig2793.g22485)
0.49 46.5 60.92 62.39 55.19 14.12 23.59 18.84 37.91 22.49 41.93 27.02 24.73 13.21 26.62 25.41 52.15 14.53 14.03 18.46 21.63 15.5 34.12 12.8 16.47 12.41 23.89
Sro413_g138090.1 (Contig3915.g30009)
1.98 70.7 67.25 77.78 76.03 29.92 29.31 36.77 49.56 23.01 52.69 24.24 40.56 20.01 25.97 13.83 74.27 18.61 16.19 19.27 9.57 19.07 47.02 13.52 9.85 16.25 28.07
Sro4340_g353780.1 (Contig2486.g20362)
0.02 8.04 7.8 5.29 5.47 1.2 2.63 2.49 4.74 3.35 4.04 4.18 5.0 3.21 2.87 2.37 5.02 1.41 2.24 3.7 2.31 2.76 3.65 0.99 1.48 1.4 2.48
Sro437_g142770.1 (Contig994.g10043)
4.69 25.91 22.88 25.92 27.36 5.92 11.84 9.9 17.96 8.26 14.68 7.74 15.76 6.66 8.07 6.17 21.82 5.47 6.43 10.68 4.59 9.44 18.3 4.39 4.38 4.0 8.12
0.03 17.29 16.66 13.96 15.39 8.9 9.05 10.9 14.59 10.28 14.94 12.77 11.71 11.11 10.95 8.53 19.2 6.63 8.83 10.31 9.24 5.59 12.18 7.76 2.35 8.03 10.24
Sro497_g154700.1 (Contig738.g8452)
0.17 41.37 25.63 31.78 35.05 10.35 13.89 10.96 26.89 18.91 18.2 22.35 19.82 17.34 16.7 12.07 29.95 13.62 15.62 18.45 16.05 15.69 21.26 10.06 8.93 9.46 11.04
Sro498_g154900.1 (Contig3753.g28744)
0.33 10.25 11.06 8.89 8.96 2.92 3.78 4.28 6.56 5.14 7.84 6.75 7.85 5.23 5.45 4.48 10.64 3.7 6.66 6.86 4.26 4.94 6.57 4.87 2.66 3.74 4.82
Sro514_g158060.1 (Contig3991.g30647)
0.48 28.25 27.34 36.08 31.85 16.69 12.83 15.0 17.18 17.46 30.15 21.89 29.85 12.68 13.47 2.83 30.82 10.07 17.0 29.85 14.1 8.53 16.68 5.54 6.83 9.79 19.05
Sro54_g031800.1 (Contig2430.g19868)
16.12 313.43 361.1 438.66 445.95 105.76 161.06 170.53 306.14 125.63 208.43 130.07 242.45 173.69 153.4 114.45 301.89 111.95 87.57 181.87 88.81 182.05 306.32 46.15 66.63 97.11 130.88
Sro557_g166120.1 (Contig1427.g13182)
0.32 60.88 45.16 60.42 63.0 11.55 20.77 18.22 31.91 22.66 35.45 24.79 41.78 24.93 24.33 17.82 45.72 21.87 19.73 33.31 20.22 21.87 31.5 13.17 14.78 12.35 19.15
Sro56_g032870.1 (Contig3029.g24163)
0.13 83.73 52.49 56.04 55.0 25.66 34.26 34.81 44.65 33.26 54.41 37.08 36.05 24.02 36.54 22.28 60.76 23.16 23.15 27.03 23.66 15.92 36.59 40.84 29.17 19.91 30.69
Sro614_g175680.1 (Contig1589.g14422)
0.14 20.65 18.72 14.46 12.21 4.31 3.15 2.58 6.5 6.2 9.61 6.73 5.14 3.88 6.19 4.06 14.06 4.22 5.22 4.77 4.92 3.61 3.83 3.33 1.73 1.96 5.25
Sro623_g177140.1 (Contig3858.g29693)
0.13 22.33 15.58 10.61 9.35 3.61 5.18 5.51 12.15 6.3 12.46 6.46 9.47 5.88 6.75 4.14 14.34 3.85 5.85 6.77 5.53 4.42 7.18 6.35 3.9 4.76 6.65
Sro662_g183330.1 (Contig3613.g27927)
0.04 21.09 19.55 15.54 18.02 4.15 2.59 3.49 8.06 6.25 11.08 7.95 5.12 4.57 6.36 3.15 19.53 1.74 3.89 3.94 3.94 4.05 3.81 2.33 2.51 2.4 5.56
Sro6_g004960.1 (Contig175.g2001)
0.73 120.64 171.02 176.91 170.11 41.39 72.0 65.43 146.3 83.94 117.57 100.07 155.31 100.44 81.2 71.66 169.88 72.68 64.58 111.89 80.46 92.15 137.44 20.51 35.58 45.11 65.08
Sro758_g198060.1 (Contig434.g5858)
0.15 26.72 30.18 37.37 34.54 9.99 10.2 10.68 17.93 16.86 24.51 22.71 30.52 18.35 13.95 10.47 42.13 11.77 11.64 24.07 12.3 7.29 17.16 4.28 1.59 7.04 15.3
Sro791_g202980.1 (Contig1638.g14764)
0.18 56.15 68.0 44.28 38.98 11.97 10.22 12.06 25.87 13.31 17.76 14.32 10.13 14.85 10.53 4.83 24.11 4.0 6.56 7.52 9.97 13.48 17.83 6.98 3.35 5.34 9.8
Sro79_g042800.1 (Contig1826.g16087)
0.31 76.6 72.28 69.09 58.65 12.86 21.89 16.96 28.15 25.6 30.38 32.46 33.64 30.7 21.16 11.81 45.07 11.27 9.91 23.92 19.07 9.55 23.44 9.52 13.99 7.37 18.12
Sro88_g046380.1 (Contig265.g3296)
15.2 112.26 118.91 109.03 108.86 33.06 31.91 24.67 48.57 47.71 78.79 53.02 64.69 54.76 50.59 41.71 88.02 30.48 28.3 54.3 38.27 24.36 39.54 27.63 17.78 15.91 39.49
Sro89_g047020.1 (Contig3846.g29623)
0.19 48.82 48.12 46.36 48.64 14.76 15.68 16.49 22.74 18.73 29.55 25.32 20.58 18.82 19.19 15.83 33.3 11.48 11.78 16.79 13.84 4.44 21.88 11.32 12.72 9.8 20.85
0.1 12.29 9.76 9.57 10.57 2.6 3.19 2.82 6.71 5.46 6.49 7.97 8.19 5.47 4.29 2.94 10.16 2.19 2.93 5.21 4.57 1.88 4.43 2.47 1.32 2.41 3.89
Sro966_g225670.1 (Contig1539.g13985)
0.0 21.44 18.13 20.03 19.33 4.62 5.42 6.53 9.28 9.23 13.44 11.64 10.78 7.47 7.92 8.63 18.81 6.52 7.39 9.07 7.08 4.17 7.24 2.87 2.95 5.2 8.07
Sro982_g227600.1 (Contig2831.g22671)
0.05 11.21 12.81 7.37 7.58 2.05 5.37 7.17 7.68 5.59 5.78 6.78 10.34 5.45 5.12 3.85 7.85 4.91 5.67 8.65 4.96 4.43 5.77 4.65 3.64 3.19 4.24
Sro991_g228670.1 (Contig3422.g26673)
0.03 4.46 8.63 3.68 2.35 0.42 1.5 1.0 2.24 1.59 2.23 1.34 4.06 1.52 1.34 0.87 2.81 1.38 2.32 4.16 1.1 0.86 2.13 0.71 0.46 0.55 1.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)