Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro105_g053070.1 (Contig544.g6996)
5.73 34.77 48.47 36.51 32.56 1.21 1.78 3.05 2.57 4.91 5.16 1.07 7.74 2.14 2.91 3.32 5.83 15.0 8.86 6.73 2.42 0.96 2.78 4.78 6.16 6.23 4.06
Sro1195_g251430.1 (Contig4057.g31109)
0.0 6.98 15.91 23.33 27.82 0.0 0.0 0.0 0.44 1.16 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 1.39 1.67 4.65 3.96 3.38 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
Sro1266_g257560.1 (Contig2620.g21275)
0.27 0.06 0.2 42.56 19.12 0.0 0.06 0.15 0.11 0.88 0.06 1.44 0.93 0.22 0.02 0.02 0.02 0.12 0.08 0.96 1.2 0.23 0.06 0.77 1.08 0.41 0.04
Sro1446_g273480.1 (Contig1815.g15993)
1.52 58.6 114.17 115.77 116.5 1.95 0.23 3.17 1.72 9.61 4.22 6.7 6.24 0.11 1.39 1.42 2.99 45.88 29.73 9.02 2.72 5.97 2.94 1.52 11.86 12.45 2.02
Sro1547_g281480.1 (Contig3266.g25720)
0.0 6.6 2.42 2.37 1.52 0.0 0.06 2.27 1.63 0.54 0.07 0.09 0.0 0.0 0.11 0.1 0.1 0.0 0.0 0.05 0.23 1.6 0.14 0.0 0.0 0.05 0.0
Sro17_g012200.1 (Contig269.g3399)
0.08 18.85 36.31 23.53 26.92 0.0 3.92 0.57 7.04 2.92 1.13 0.1 0.56 0.74 2.61 1.84 0.0 0.79 1.26 0.81 0.0 9.32 6.07 0.9 1.72 0.0 0.79
13.07 35.99 49.49 41.85 61.27 4.56 3.65 3.72 24.44 3.46 0.71 0.51 0.45 0.4 2.22 3.52 1.82 2.6 1.38 0.36 0.76 15.55 9.09 0.49 1.23 1.18 1.6
Sro2722_g335590.1 (Contig638.g7711)
0.0 0.1 0.31 0.92 0.67 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.17 0.0
Sro2820_g337870.1 (Contig3367.g26384)
0.0 0.24 0.39 2.14 1.16 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro507_g156490.1 (Contig4452.g33451)
0.0 0.46 0.37 0.33 0.79 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 4.55 4.67 11.27 9.87 0.06 0.43 3.25 4.51 1.19 0.08 0.45 0.28 0.09 0.45 0.04 0.27 0.38 0.92 0.65 2.43 6.77 14.55 0.07 0.3 0.14 0.23
2.41 363.77 444.26 1193.28 1087.76 9.28 21.51 90.2 258.38 39.49 4.19 4.52 6.5 2.49 21.04 2.36 6.63 18.76 14.97 23.18 17.3 228.27 223.45 6.68 14.61 11.83 4.3
0.0 1.27 0.4 1.69 1.74 0.0 0.3 0.73 0.25 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21 0.07 0.07 0.0 0.02 0.08 0.02 0.42 0.68 0.15 0.0 0.18 0.08
0.0 19.79 11.65 44.12 44.56 0.0 3.29 2.15 3.02 2.03 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.33 12.16 6.98 0.64 0.0 0.0 3.26
0.27 50.59 37.17 48.3 45.22 0.12 2.02 7.26 13.9 4.58 0.46 0.31 0.14 0.26 2.27 0.21 1.09 0.26 0.41 0.21 0.26 18.05 12.85 1.43 0.64 0.63 0.59
0.07 17.41 13.18 20.56 17.11 0.0 0.19 1.02 0.83 1.61 0.0 0.0 0.05 0.0 0.9 0.62 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 2.45 3.99 0.46 0.43 0.0 0.3
0.07 53.05 37.46 59.18 52.93 0.05 1.55 7.45 10.89 5.25 0.3 0.05 0.32 0.13 2.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.46 19.76 13.5 0.57 0.66 0.56 0.09
0.09 33.78 21.79 38.1 28.97 0.2 1.2 6.53 14.23 3.25 0.47 0.35 0.0 0.44 2.07 0.13 0.0 0.06 0.3 0.34 0.82 17.3 14.92 0.59 0.89 0.23 0.11
0.99 98.48 63.56 97.55 104.17 0.0 4.04 15.68 40.44 10.28 0.0 1.22 0.73 0.9 3.36 0.69 0.0 0.32 0.7 1.42 3.12 53.57 30.63 1.07 0.0 0.38 3.29
0.09 46.59 28.71 58.75 49.35 0.03 1.68 9.03 19.29 4.14 0.35 0.36 0.04 0.65 2.45 0.17 0.13 0.22 0.51 0.31 1.14 20.96 14.73 0.29 1.36 0.41 1.0
2.37 283.99 201.78 243.86 229.27 7.82 24.63 82.91 166.97 27.75 8.28 3.15 4.51 3.38 21.43 5.41 8.48 8.46 6.18 13.7 7.52 139.25 190.78 12.27 11.81 9.95 10.14
2.0 208.75 140.32 202.96 198.54 3.7 12.65 71.18 128.16 19.36 3.48 1.69 3.14 2.81 13.79 3.33 4.25 6.33 5.19 10.27 8.05 110.58 148.2 5.92 5.73 4.39 5.47
1.35 32.26 27.36 47.86 44.7 0.21 3.07 11.03 17.13 3.97 0.57 1.03 0.81 0.63 3.25 0.61 1.21 0.83 1.29 1.2 2.85 17.93 26.5 0.99 0.65 1.05 1.05
0.87 43.03 27.82 54.68 53.19 0.09 2.99 6.48 11.26 4.81 0.13 0.31 0.55 0.37 4.1 0.17 0.61 0.66 0.84 0.79 2.78 21.54 20.53 1.14 1.6 0.4 1.2
0.33 25.34 20.47 25.39 23.18 0.1 1.47 3.36 9.69 2.67 0.41 0.47 0.3 0.44 2.4 0.27 0.67 0.35 0.62 0.51 0.71 11.71 8.98 1.04 1.35 1.05 0.38
0.98 19.85 16.97 69.31 44.9 0.54 5.47 25.96 23.32 3.11 0.48 1.88 0.34 0.89 5.2 0.48 0.53 1.5 0.97 1.12 1.91 28.54 43.98 0.43 0.14 0.98 0.51
0.58 11.55 5.79 18.4 15.98 0.0 1.46 0.78 5.0 1.14 0.0 0.36 0.17 0.07 1.75 0.0 0.0 0.44 0.45 0.0 0.08 3.92 2.64 0.27 0.51 0.28 0.05
1.0 21.38 14.59 32.05 30.23 0.52 2.03 8.63 13.2 2.5 0.8 0.56 0.34 0.93 3.28 0.56 0.82 1.21 0.74 0.49 1.68 10.12 20.42 0.44 0.22 0.55 0.69
0.43 19.41 16.48 27.91 27.73 0.57 2.35 6.32 8.22 2.3 0.53 0.28 0.19 0.58 2.95 0.88 0.56 0.64 0.24 0.46 0.63 9.79 10.96 1.79 1.2 0.0 0.73
0.0 2.66 0.0 5.29 7.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 8.06 5.16 20.85 18.51 0.17 0.94 2.55 2.2 1.2 0.12 0.43 0.15 0.17 1.02 0.17 0.22 0.36 0.2 0.13 0.82 2.68 3.01 0.2 0.21 0.23 0.2
0.92 80.63 56.11 131.4 114.46 1.26 3.34 12.91 28.23 8.9 0.42 1.18 0.54 1.41 7.02 1.25 1.87 3.11 1.89 2.02 6.98 32.99 17.95 1.81 4.08 4.45 1.0
0.0 48.11 18.36 43.88 54.29 0.0 2.74 0.74 4.52 3.8 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.86 7.07 1.37 0.0 0.0 1.06 0.0
0.96 108.41 102.15 235.78 214.27 1.63 4.03 21.13 36.7 14.46 1.63 1.49 1.63 1.17 9.12 0.71 1.25 4.4 2.61 3.72 15.72 47.19 46.69 1.89 4.34 3.79 1.36
1.38 125.84 113.62 230.72 208.91 4.26 4.99 20.48 43.2 16.1 1.87 1.83 2.23 1.17 10.84 2.17 1.69 5.65 2.07 4.14 14.65 55.8 43.09 3.2 6.41 5.7 2.15
0.0 23.49 17.32 37.14 46.37 0.0 0.0 0.0 0.0 2.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 57.47 42.71 114.74 94.75 1.61 8.62 8.14 6.71 7.59 0.0 1.37 0.66 1.58 16.6 0.31 0.0 2.63 1.78 3.32 2.56 25.93 23.83 1.35 2.78 0.0 0.51
0.0 11.26 9.66 18.88 13.2 0.0 2.54 1.51 3.54 1.34 0.0 0.32 0.0 0.0 1.38 0.0 0.0 0.25 0.3 0.05 0.27 4.34 4.05 0.61 0.69 0.38 0.27
0.68 10.23 7.55 19.68 14.04 0.0 1.89 2.04 1.86 1.1 0.0 0.31 0.0 0.0 1.37 0.15 0.0 0.13 0.0 0.2 0.25 3.4 2.37 0.28 0.0 0.0 0.14
0.0 2.96 1.69 4.2 3.94 0.0 0.33 1.59 1.76 0.31 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.4 0.0 0.03 0.09 0.0 0.34 1.14 1.0 0.22 0.15 0.0 0.07
0.06 1.87 1.21 2.33 2.9 0.0 0.31 0.96 1.0 0.16 0.0 0.08 0.03 0.0 0.08 0.18 0.0 0.11 0.0 0.05 0.06 0.32 0.44 0.02 0.0 0.03 0.0
0.14 14.32 7.63 27.08 23.17 0.05 1.03 1.72 4.95 1.45 0.07 0.36 0.21 0.0 2.22 0.0 0.05 0.76 0.29 0.56 0.53 6.67 3.4 0.49 0.0 0.36 0.47
0.58 56.66 54.58 118.54 105.6 0.3 3.34 15.04 22.47 7.97 0.74 1.83 0.93 0.62 4.9 1.12 1.07 2.21 2.93 2.45 12.37 26.02 25.37 1.01 2.77 2.49 0.63
0.52 58.5 60.19 111.73 97.25 0.94 3.39 13.09 19.58 6.98 0.94 1.03 0.9 0.4 4.59 0.87 1.73 1.94 1.52 1.89 7.71 18.95 14.65 1.55 2.77 2.28 0.91
Sro589_g171840.1 (Contig2898.g23121)
1.83 2.32 2.7 5.46 5.78 0.07 0.0 0.0 0.0 0.42 0.13 0.04 0.1 0.18 0.07 0.11 0.0 0.27 0.0 0.0 0.19 0.02 0.09 0.07 0.0 0.0 0.23
Sro64_g036530.1 (Contig2497.g20487)
0.0 0.0 0.79 0.56 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro709_g190880.1 (Contig1341.g12354)
0.91 46.78 56.15 1699.96 1003.52 48.02 79.77 91.05 41.02 131.69 109.14 126.99 64.25 112.09 107.06 108.14 94.12 130.31 121.74 83.03 114.4 126.18 70.85 223.77 264.49 336.03 133.1
0.0 0.0 0.23 24.0 9.02 0.0 0.61 0.0 0.0 0.7 0.0 0.37 1.52 0.0 0.02 1.27 0.21 2.35 0.5 4.54 0.55 0.0 0.26 1.09 3.19 0.62 0.14
0.17 18.89 20.24 29.49 28.47 0.03 1.21 5.73 7.86 2.32 0.26 0.38 0.36 0.07 1.79 0.21 0.03 0.46 0.32 0.91 1.77 7.58 5.98 1.29 1.76 1.05 0.28
0.21 8.03 9.51 16.95 14.82 0.06 0.52 1.3 2.61 0.98 0.14 0.12 0.1 0.0 0.79 0.02 0.36 0.2 0.02 0.41 0.05 2.14 1.2 0.49 0.65 0.2 0.12
0.04 3.73 3.21 6.11 5.28 0.0 0.19 0.38 0.52 0.5 0.0 0.11 0.0 0.01 0.32 0.0 0.0 0.11 0.05 0.13 0.32 0.68 0.61 0.12 0.39 0.1 0.06
0.0 1.66 1.19 2.37 1.52 0.01 0.1 0.17 0.24 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.18 0.13 0.0 0.1 0.08 0.01
Sro951_g223820.1 (Contig3277.g25780)
0.09 0.18 1.84 6.3 5.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.05 0.04 0.06 0.2 0.36 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)