Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro105_g053070.1 (Contig544.g6996)	0.12	0.72	1.0	0.75	0.67	0.02	0.04	0.06	0.05	0.1	0.11	0.02	0.16	0.04	0.06	0.07	0.12	0.31	0.18	0.14	0.05	0.02	0.06	0.1	0.13	0.13	0.08
Sro1195_g251430.1 (Contig4057.g31109)	0.0	0.25	0.57	0.84	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.06	0.17	0.14	0.12	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro1266_g257560.1 (Contig2620.g21275)	0.01	0.0	0.0	1.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.0	0.02	0.03	0.01	0.0
Sro1446_g273480.1 (Contig1815.g15993)	0.01	0.5	0.98	0.99	1.0	0.02	0.0	0.03	0.01	0.08	0.04	0.06	0.05	0.0	0.01	0.01	0.03	0.39	0.26	0.08	0.02	0.05	0.03	0.01	0.1	0.11	0.02
Sro1547_g281480.1 (Contig3266.g25720)	0.0	1.0	0.37	0.36	0.23	0.0	0.01	0.34	0.25	0.08	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.24	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0
Sro17_g012200.1 (Contig269.g3399)	0.0	0.52	1.0	0.65	0.74	0.0	0.11	0.02	0.19	0.08	0.03	0.0	0.02	0.02	0.07	0.05	0.0	0.02	0.03	0.02	0.0	0.26	0.17	0.02	0.05	0.0	0.02
Sro255_g100290.2	0.21	0.59	0.81	0.68	1.0	0.07	0.06	0.06	0.4	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.25	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03
Sro2722_g335590.1 (Contig638.g7711)	0.0	0.11	0.34	1.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.16	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.19	0.0
Sro2820_g337870.1 (Contig3367.g26384)	0.0	0.11	0.18	1.0	0.54	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro507_g156490.1 (Contig4452.g33451)	0.0	0.58	0.47	0.41	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro51_chlor_g029340.1 (ClpC)	0.02	0.31	0.32	0.77	0.68	0.0	0.03	0.22	0.31	0.08	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0	0.02	0.03	0.06	0.04	0.17	0.46	1.0	0.01	0.02	0.01	0.02
Sro51_chlor_g029840.1 (PsbA)	0.0	0.3	0.37	1.0	0.91	0.01	0.02	0.08	0.22	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.19	0.01	0.01	0.01	0.0
Sro51_chlor_g029970.1 (CcsA)	0.0	0.73	0.23	0.97	1.0	0.0	0.17	0.42	0.14	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.12	0.04	0.04	0.0	0.01	0.05	0.01	0.24	0.39	0.08	0.0	0.1	0.04
Sro51_chlor_g029980.1 (PsaC)	0.0	0.44	0.26	0.99	1.0	0.0	0.07	0.05	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.27	0.16	0.01	0.0	0.0	0.07
Sro51_chlor_g030030.1 (AtpA)	0.01	1.0	0.73	0.95	0.89	0.0	0.04	0.14	0.27	0.09	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.36	0.25	0.03	0.01	0.01	0.01
Sro51_chlor_g030040.1 (AtpD)	0.0	0.85	0.64	1.0	0.83	0.0	0.01	0.05	0.04	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.02	0.02	0.0	0.01
Sro51_chlor_g030050.1 (AtpF)	0.0	0.9	0.63	1.0	0.89	0.0	0.03	0.13	0.18	0.09	0.01	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.33	0.23	0.01	0.01	0.01	0.0
Sro51_chlor_g030060.1 (AtpG)	0.0	0.89	0.57	1.0	0.76	0.01	0.03	0.17	0.37	0.09	0.01	0.01	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.45	0.39	0.02	0.02	0.01	0.0
Sro51_chlor_g030070.1 (AtpH)	0.01	0.95	0.61	0.94	1.0	0.0	0.04	0.15	0.39	0.1	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.51	0.29	0.01	0.0	0.0	0.03
Sro51_chlor_g030080.1 (AtpI)	0.0	0.79	0.49	1.0	0.84	0.0	0.03	0.15	0.33	0.07	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.36	0.25	0.0	0.02	0.01	0.02
Sro51_chlor_g030110.1 (RbcS)	0.01	1.0	0.71	0.86	0.81	0.03	0.09	0.29	0.59	0.1	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.49	0.67	0.04	0.04	0.04	0.04
Sro51_chlor_g030120.1 (RbcL)	0.01	1.0	0.67	0.97	0.95	0.02	0.06	0.34	0.61	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.53	0.71	0.03	0.03	0.02	0.03
Sro51_chlor_g030210.1 (AtpB)	0.03	0.67	0.57	1.0	0.93	0.0	0.06	0.23	0.36	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.37	0.55	0.02	0.01	0.02	0.02
Sro51_chlor_g030230.1 (AtpE)	0.02	0.79	0.51	1.0	0.97	0.0	0.05	0.12	0.21	0.09	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.39	0.38	0.02	0.03	0.01	0.02
Sro51_chlor_g030250.1 (PetA)	0.01	1.0	0.81	1.0	0.91	0.0	0.06	0.13	0.38	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.46	0.35	0.04	0.05	0.04	0.01
Sro51_chlor_g030260.1 (PetF)	0.01	0.29	0.24	1.0	0.65	0.01	0.08	0.37	0.34	0.04	0.01	0.03	0.0	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.41	0.63	0.01	0.0	0.01	0.01
Sro51_chlor_g030350.1 (PsaD)	0.03	0.63	0.31	1.0	0.87	0.0	0.08	0.04	0.27	0.06	0.0	0.02	0.01	0.0	0.1	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.21	0.14	0.01	0.03	0.02	0.0
Sro51_chlor_g030360.1 (PetB)	0.03	0.67	0.46	1.0	0.94	0.02	0.06	0.27	0.41	0.08	0.03	0.02	0.01	0.03	0.1	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.32	0.64	0.01	0.01	0.02	0.02
Sro51_chlor_g030370.1 (PetD)	0.02	0.7	0.59	1.0	0.99	0.02	0.08	0.23	0.29	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.35	0.39	0.06	0.04	0.0	0.03
Sro51_chlor_g030380.1 (SecG)	0.0	0.34	0.0	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro51_chlor_g030390.1 (ChlI)	0.02	0.39	0.25	1.0	0.89	0.01	0.04	0.12	0.11	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro51_chlor_g030420.1 (PsbB)	0.01	0.61	0.43	1.0	0.87	0.01	0.03	0.1	0.21	0.07	0.0	0.01	0.0	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.25	0.14	0.01	0.03	0.03	0.01
Sro51_chlor_g030450.1 (PsbH)	0.0	0.89	0.34	0.81	1.0	0.0	0.05	0.01	0.08	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.13	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0
Sro51_chlor_g030520.1 (PsbD)	0.0	0.46	0.43	1.0	0.91	0.01	0.02	0.09	0.16	0.06	0.01	0.01	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.2	0.2	0.01	0.02	0.02	0.01
Sro51_chlor_g030530.1 (PsbC)	0.01	0.55	0.49	1.0	0.91	0.02	0.02	0.09	0.19	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.24	0.19	0.01	0.03	0.02	0.01
Sro51_chlor_g030560.1 (PsbZ)	0.0	0.51	0.37	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro51_chlor_g030610.1 (PsbE)	0.0	0.5	0.37	1.0	0.83	0.01	0.08	0.07	0.06	0.07	0.0	0.01	0.01	0.01	0.14	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.02	0.23	0.21	0.01	0.02	0.0	0.0
Sro51_chlor_g030620.1 (Ycf4)	0.0	0.6	0.51	1.0	0.7	0.0	0.13	0.08	0.19	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.23	0.21	0.03	0.04	0.02	0.01
Sro51_chlor_g030640.1 (PsaL)	0.03	0.52	0.38	1.0	0.71	0.0	0.1	0.1	0.09	0.06	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.17	0.12	0.01	0.0	0.0	0.01
Sro51_chlor_g030650.1 (CbbX)	0.0	0.7	0.4	1.0	0.94	0.0	0.08	0.38	0.42	0.07	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.1	0.0	0.01	0.02	0.0	0.08	0.27	0.24	0.05	0.03	0.0	0.02
Sro51_chlor_g030660.1 (Ycf39)	0.02	0.65	0.42	0.8	1.0	0.0	0.11	0.33	0.35	0.06	0.0	0.03	0.01	0.0	0.03	0.06	0.0	0.04	0.0	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.0	0.01	0.0
Sro51_chlor_g030690.1 (PsaF)	0.01	0.53	0.28	1.0	0.86	0.0	0.04	0.06	0.18	0.05	0.0	0.01	0.01	0.0	0.08	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.02	0.25	0.13	0.02	0.0	0.01	0.02
Sro51_chlor_g030710.1 (PsaA)	0.0	0.48	0.46	1.0	0.89	0.0	0.03	0.13	0.19	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.1	0.22	0.21	0.01	0.02	0.02	0.01
Sro51_chlor_g030720.1 (PsaB)	0.0	0.52	0.54	1.0	0.87	0.01	0.03	0.12	0.18	0.06	0.01	0.01	0.01	0.0	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.17	0.13	0.01	0.02	0.02	0.01
Sro589_g171840.1 (Contig2898.g23121)	0.32	0.4	0.47	0.94	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.04
Sro64_g036530.1 (Contig2497.g20487)	0.0	0.0	0.86	0.61	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.04	0.11	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro709_g190880.1 (Contig1341.g12354)	0.0	0.03	0.03	1.0	0.59	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.06	0.07	0.04	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.05	0.07	0.07	0.04	0.13	0.16	0.2	0.08
Sro81_g043331.1	0.0	0.0	0.01	1.0	0.38	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.05	0.01	0.1	0.02	0.19	0.02	0.0	0.01	0.05	0.13	0.03	0.01
Sro884_mit_g215770.1 (Cox1)	0.01	0.64	0.69	1.0	0.97	0.0	0.04	0.19	0.27	0.08	0.01	0.01	0.01	0.0	0.06	0.01	0.0	0.02	0.01	0.03	0.06	0.26	0.2	0.04	0.06	0.04	0.01
Sro884_mit_g215790.1 (Cob)	0.01	0.47	0.56	1.0	0.87	0.0	0.03	0.08	0.15	0.06	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0	0.13	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01
Sro884_mit_g215800.1 (Nad5)	0.01	0.61	0.52	1.0	0.86	0.0	0.03	0.06	0.09	0.08	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.05	0.11	0.1	0.02	0.06	0.02	0.01
Sro884_mit_g215820.1 (Nad11b)	0.0	0.7	0.5	1.0	0.64	0.01	0.04	0.07	0.1	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.08	0.05	0.0	0.04	0.03	0.0
Sro951_g223820.1 (Contig3277.g25780)	0.01	0.03	0.29	1.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)