Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1013_g231360.1 (Contig3614.g27945)	0.0	0.69	0.42	0.57	0.29	0.62	0.43	0.2	0.17	0.44	0.52	0.52	1.0	0.32	0.52	0.51	0.44	0.43	0.43	0.79	0.47	0.29	0.13	0.38	0.22	0.31	0.35
Sro1029_g233260.1 (Contig460.g6199)	0.03	0.74	0.66	0.81	0.79	0.54	0.53	0.35	0.58	0.59	0.8	0.67	0.9	0.42	0.63	0.41	1.0	0.43	0.36	0.63	0.51	0.16	0.38	0.31	0.43	0.23	0.48
Sro1060_g236720.1 (Contig1660.g14965)	0.42	0.14	0.11	0.2	0.18	0.2	0.3	0.35	0.17	0.6	0.63	0.69	0.98	0.47	0.54	0.43	0.74	0.41	0.64	1.0	0.7	0.32	0.2	0.43	0.58	0.31	0.41
Sro106_g053640.1 (Contig1122.g10761)	0.01	0.26	0.19	0.29	0.22	0.13	0.43	0.26	0.26	0.56	0.68	0.69	0.76	0.47	0.6	0.75	0.58	0.53	0.74	1.0	0.61	0.2	0.15	0.51	0.55	0.49	0.46
Sro1078_g238790.1 (Contig3778.g29013)	0.04	0.19	0.25	0.38	0.29	0.55	0.27	0.35	0.29	0.58	0.72	0.63	1.0	0.57	0.53	0.47	0.51	0.64	0.56	0.9	0.62	0.23	0.28	0.36	0.47	0.5	0.57
Sro1121_g243440.2	0.46	0.53	0.49	1.0	0.88	0.34	0.47	0.44	0.34	0.7	0.74	0.68	0.78	0.52	0.66	0.46	0.56	0.74	0.83	0.8	0.94	0.26	0.26	0.81	1.0	0.72	0.56
Sro1219_g253410.1 (Contig468.g6356)	0.04	0.6	0.4	0.43	0.4	0.35	0.48	0.51	0.44	0.7	0.92	0.78	0.76	0.66	0.68	0.71	0.71	0.67	0.81	1.0	0.81	0.24	0.28	0.56	0.51	0.41	0.56
Sro1338_g264260.1 (Contig2752.g22182)	0.15	0.54	0.66	0.9	0.82	0.24	0.51	0.47	0.47	0.52	1.0	0.64	0.35	0.61	0.6	0.67	0.87	0.24	0.3	0.33	0.51	0.29	0.53	0.91	0.78	0.51	0.53
Sro1351_g265200.1 (Contig2702.g21763)	0.01	0.24	0.16	0.24	0.23	0.2	0.4	0.23	0.4	0.51	0.62	0.63	0.98	0.57	0.45	0.32	0.76	0.48	0.42	1.0	0.69	0.27	0.24	0.44	0.52	0.28	0.53
Sro1360_g266120.1 (Contig2203.g18333)	0.02	0.23	0.16	0.29	0.35	0.25	0.25	0.27	0.18	0.62	0.91	0.74	0.89	0.37	0.49	0.37	1.0	0.44	0.73	0.84	0.62	0.15	0.11	0.2	0.42	0.29	0.63
Sro136_g064210.1 (Contig2000.g17132)	0.07	0.54	0.39	0.59	0.48	0.36	0.57	0.26	0.3	0.72	0.84	0.83	0.79	0.73	0.75	0.67	0.68	0.57	0.68	1.0	0.78	0.13	0.23	0.61	0.64	0.59	0.72
Sro1726_g293810.1 (Contig1975.g16890)	0.02	0.37	0.19	0.35	0.35	0.3	0.48	0.37	0.31	0.78	0.82	0.95	0.94	0.8	0.69	0.54	0.57	0.49	0.52	1.0	0.88	0.25	0.19	0.53	0.52	0.56	0.64
Sro173_g076420.1 (Contig2926.g23323)	0.04	0.24	0.11	0.23	0.18	0.26	0.32	0.26	0.16	0.58	0.68	0.69	0.34	1.0	0.59	0.76	0.75	0.47	0.46	0.52	0.46	0.12	0.25	0.34	0.35	0.71	0.62
Sro1834_g300520.1 (Contig890.g9471)	0.01	0.71	0.69	0.85	0.76	0.33	0.43	0.34	0.24	0.71	1.0	0.89	0.74	0.61	0.8	0.92	0.95	0.59	0.62	0.7	0.72	0.08	0.19	0.46	0.51	0.39	0.66
Sro190_g081770.1 (Contig3488.g27052)	0.07	0.18	0.25	0.47	0.33	0.25	0.31	0.19	0.15	0.53	0.56	0.64	1.0	0.47	0.43	0.46	0.56	0.35	0.37	0.99	0.6	0.25	0.17	0.4	0.48	0.55	0.41
Sro1991_g309790.1 (Contig4515.g33856)	0.01	0.55	0.56	0.63	0.57	0.31	0.45	0.4	0.5	0.66	0.75	0.69	0.8	0.83	0.69	1.0	0.92	0.41	0.46	0.75	0.74	0.4	0.42	0.33	0.46	0.46	0.61
Sro219_g090580.1 (Contig3313.g25998)	0.02	0.31	0.37	0.48	0.45	0.33	0.49	0.42	0.48	0.58	0.71	0.69	1.0	0.65	0.67	0.85	0.75	0.82	0.62	0.85	0.58	0.27	0.45	0.36	0.36	0.34	0.53
Sro229_g093080.1 (Contig429.g5812)	0.02	0.47	0.45	0.6	0.54	0.42	0.44	0.26	0.38	0.77	1.0	0.92	0.87	0.81	0.78	0.79	0.89	0.74	0.7	0.96	0.75	0.14	0.28	0.46	0.44	0.55	0.76
Sro2349_g324390.1 (Contig4280.g32354)	0.01	0.04	0.09	0.08	0.07	0.23	0.26	0.11	0.15	0.51	0.33	0.59	0.58	0.27	0.4	1.0	0.38	0.67	0.74	0.5	0.66	0.19	0.2	0.21	0.37	0.3	0.49
Sro2398_g326120.2	0.0	0.1	0.13	0.07	0.11	0.07	0.18	0.07	0.21	0.55	0.53	0.47	0.84	0.36	0.56	0.57	0.44	0.26	0.74	1.0	0.53	0.22	0.12	0.23	0.37	0.49	0.78
Sro239_g095950.1 (Contig3063.g24391)	0.35	0.99	1.0	0.72	0.54	0.19	0.45	0.3	0.31	0.56	0.4	0.61	0.7	0.32	0.59	0.91	0.25	0.74	0.76	0.85	0.59	0.18	0.26	0.29	0.22	0.14	0.5
Sro2_g001920.1 (Contig467.g6350)	0.1	0.9	1.0	0.54	0.57	0.32	0.59	0.33	0.5	0.5	0.26	0.54	0.56	0.63	0.62	0.73	0.2	0.58	0.48	0.48	0.43	0.26	0.35	0.32	0.26	0.21	0.44
Sro31_g020410.1 (Contig420.g5636)	0.08	0.64	0.55	0.65	0.63	0.38	0.59	0.51	0.54	0.68	1.0	0.77	0.51	0.61	0.76	0.77	0.88	0.65	0.58	0.49	0.64	0.3	0.55	0.42	0.32	0.37	0.67
Sro324_g117440.1 (Contig590.g7382)	0.01	0.6	0.48	0.4	0.38	0.18	0.65	0.29	0.32	0.7	0.84	1.0	0.63	0.71	0.73	0.94	0.59	0.45	0.55	0.58	0.76	0.02	0.21	0.85	0.61	0.56	0.49
Sro354_g124840.1 (Contig4485.g33707)	0.04	0.18	0.16	0.12	0.13	0.16	0.13	0.07	0.06	0.57	0.45	0.69	0.72	0.32	0.4	0.79	0.26	0.31	0.63	1.0	0.52	0.0	0.06	0.07	0.13	0.14	0.56
Sro355_g125020.1 (Contig2977.g23660)	0.03	0.39	0.27	0.36	0.42	0.41	0.57	0.54	0.46	0.77	1.0	0.93	0.85	0.58	0.71	0.61	0.74	0.64	0.74	0.93	0.89	0.11	0.31	0.47	0.57	0.46	0.65
Sro359_g126110.1 (Contig295.g3872)	0.01	0.53	0.91	0.21	0.26	0.27	0.22	0.13	0.1	0.56	0.49	0.55	0.43	0.53	0.54	1.0	0.17	0.53	0.61	0.45	0.39	0.05	0.1	0.05	0.11	0.07	0.61
Sro368_g127980.1 (Contig2761.g22237)	0.01	0.86	0.54	0.54	0.54	0.24	0.6	0.43	0.87	0.61	0.93	0.84	0.73	0.63	0.73	0.83	1.0	0.65	0.63	0.75	0.66	0.25	0.61	0.47	0.32	0.24	0.57
Sro383_g131300.1 (Contig132.g1495)	0.41	0.28	0.21	0.34	0.35	0.41	0.62	0.38	0.55	0.74	0.94	0.91	0.92	0.69	0.76	0.78	0.74	0.61	0.6	1.0	0.73	0.39	0.39	0.67	0.63	0.36	0.57
Sro394_g133760.1 (Contig4153.g31706)	0.03	0.13	0.08	0.07	0.09	0.24	0.36	0.16	0.26	0.44	0.29	0.44	1.0	0.45	0.37	0.48	0.37	0.32	0.6	0.87	0.46	0.27	0.32	0.19	0.3	0.25	0.32
Sro4138_g353130.1 (Contig3862.g29721)	0.0	0.28	0.17	0.26	0.22	0.47	0.24	0.2	0.06	0.45	0.69	0.63	1.0	0.41	0.59	0.67	0.75	0.29	0.46	0.8	0.54	0.09	0.04	0.49	0.16	0.32	0.43
Sro461_g147800.1 (Contig3552.g27434)	0.01	0.58	0.59	0.59	0.41	0.5	0.35	0.33	0.34	0.76	0.95	0.77	0.81	0.76	0.61	0.5	1.0	0.57	0.69	0.79	0.69	0.44	0.24	0.6	0.72	0.38	0.76
Sro480_g151360.1 (Contig2927.g23337)	0.0	1.0	0.68	0.91	0.7	0.43	0.35	0.38	0.29	0.64	0.87	0.75	0.89	0.44	0.6	0.45	0.92	0.57	0.63	0.75	0.69	0.24	0.15	0.43	0.5	0.4	0.66
Sro481_g151490.1 (Contig3107.g24707)	0.05	0.38	0.23	0.52	0.49	0.49	0.2	0.16	0.32	0.62	1.0	0.78	0.28	0.33	0.51	0.56	0.7	0.27	0.45	0.63	0.51	0.15	0.24	0.19	0.18	0.29	0.68
Sro503_g155710.1 (Contig635.g7683)	0.0	0.17	0.15	0.13	0.19	0.33	0.41	0.18	0.44	0.38	0.53	0.38	1.0	0.49	0.61	0.97	0.61	0.25	0.37	0.56	0.48	0.09	0.32	0.29	0.4	0.43	0.5
Sro524_g159950.1 (Contig202.g2392)	0.03	0.37	0.34	0.42	0.37	0.38	0.42	0.28	0.43	0.5	0.83	0.61	0.72	0.54	0.63	0.59	1.0	0.59	0.55	0.61	0.45	0.11	0.31	0.35	0.28	0.25	0.53
Sro538_g162620.1 (Contig95.g1103)	0.02	0.87	1.0	0.55	0.62	0.13	0.26	0.16	0.2	0.45	0.24	0.47	0.2	0.28	0.4	0.8	0.2	0.4	0.43	0.26	0.37	0.14	0.13	0.18	0.17	0.13	0.42
Sro552_g165060.1 (Contig2064.g17686)	0.02	0.33	0.32	0.52	0.43	0.41	0.53	0.39	0.42	0.54	0.83	0.64	0.54	0.52	0.64	0.42	1.0	0.47	0.42	0.57	0.58	0.24	0.42	0.49	0.68	0.53	0.53
Sro562_g167010.1 (Contig149.g1653)	0.03	1.0	0.71	0.64	0.85	0.19	0.45	0.31	0.37	0.51	0.48	0.53	0.5	0.34	0.47	0.64	0.55	0.38	0.55	0.47	0.29	0.16	0.23	0.5	0.28	0.17	0.57
Sro626_g177830.1 (Contig1809.g15958)	0.09	0.38	0.37	0.41	0.36	0.26	0.33	0.26	0.25	0.55	0.89	0.66	0.99	0.53	0.54	0.39	0.89	0.51	0.45	1.0	0.57	0.23	0.21	0.38	0.38	0.23	0.52
Sro639_g179800.1 (Contig197.g2301)	0.07	0.23	0.38	0.36	0.41	0.35	0.51	0.38	0.5	0.62	0.56	0.68	0.73	0.82	0.68	1.0	0.64	0.82	0.74	0.66	0.63	0.2	0.5	0.2	0.26	0.29	0.53
Sro692_g188150.1 (Contig950.g9823)	0.08	0.03	0.05	0.04	0.01	0.1	0.25	0.23	0.16	0.41	0.4	0.44	1.0	0.36	0.32	0.29	0.35	0.31	0.41	0.89	0.51	0.2	0.16	0.25	0.51	0.25	0.29
Sro6_g005140.1 (Contig175.g2019)	0.08	0.32	0.24	0.38	0.37	0.26	0.29	0.23	0.25	0.52	0.62	0.51	1.0	0.44	0.5	0.55	0.49	0.52	0.66	0.78	0.53	0.16	0.2	0.27	0.3	0.38	0.51
Sro718_g192180.1 (Contig362.g4875)	0.01	0.86	0.94	0.83	0.89	0.49	0.32	0.61	0.53	0.58	0.66	0.62	0.48	0.5	0.65	1.0	0.71	0.55	0.59	0.45	0.54	0.23	0.28	0.24	0.18	0.26	0.64
Sro71_g039300.1 (Contig2582.g20953)	0.58	0.86	1.0	0.6	0.53	0.34	0.45	0.44	0.36	0.58	0.84	0.72	0.7	0.4	0.6	0.64	0.73	0.46	0.56	0.74	0.58	0.33	0.3	0.48	0.29	0.29	0.58
Sro752_g197160.1 (Contig1730.g15440)	0.05	0.19	0.21	0.22	0.27	0.24	0.35	0.29	0.29	0.41	0.38	0.41	0.38	0.4	0.57	1.0	0.39	0.56	0.46	0.32	0.36	0.27	0.33	0.23	0.2	0.18	0.47
Sro752_g197170.1 (Contig1730.g15441)	0.04	0.19	0.25	0.3	0.29	0.23	0.35	0.31	0.38	0.44	0.56	0.52	0.59	0.54	0.62	1.0	0.67	0.59	0.52	0.49	0.49	0.24	0.39	0.21	0.21	0.25	0.37
Sro77_g041960.1 (Contig338.g4591)	0.04	0.69	0.61	0.68	0.63	0.5	0.62	0.51	0.48	0.64	1.0	0.71	0.44	0.48	0.75	0.76	0.94	0.48	0.49	0.51	0.67	0.2	0.41	0.51	0.36	0.42	0.73
Sro819_g207070.1 (Contig8.g93)	0.04	0.75	1.0	0.85	0.76	0.41	0.37	0.27	0.26	0.69	0.7	0.72	0.81	0.78	0.66	0.82	0.82	0.59	0.66	0.69	0.54	0.13	0.22	0.32	0.27	0.26	0.71
Sro841_g209600.1 (Contig2025.g17358)	0.03	0.24	0.26	0.25	0.24	0.58	0.32	0.18	0.15	0.47	0.5	0.43	1.0	0.53	0.54	0.52	0.62	0.43	0.52	0.8	0.53	0.3	0.17	0.46	0.43	0.32	0.35
Sro846_g210160.1 (Contig3685.g28432)	0.1	0.17	0.2	0.2	0.23	0.26	0.36	0.31	0.33	0.47	0.58	0.52	0.63	0.57	0.63	1.0	0.57	0.62	0.54	0.56	0.4	0.26	0.3	0.37	0.2	0.21	0.59
Sro88_g046560.1 (Contig265.g3314)	0.01	0.24	0.22	0.29	0.28	0.35	0.37	0.37	0.31	0.59	1.0	0.64	0.67	0.63	0.61	0.61	0.74	0.63	0.68	0.7	0.59	0.14	0.26	0.35	0.39	0.45	0.67
Sro93_g048640.1 (Contig3841.g29552)	0.06	0.29	0.26	0.25	0.27	0.37	0.35	0.21	0.3	0.62	0.94	0.81	0.7	0.9	0.82	0.97	1.0	0.47	0.37	0.63	0.57	0.23	0.3	0.3	0.28	0.34	0.57
Sro948_g223550.1 (Contig1921.g16562)	0.01	0.64	0.39	0.55	0.55	0.41	0.52	0.4	0.44	0.59	0.84	0.76	0.71	0.48	0.61	0.37	1.0	0.51	0.44	0.85	0.6	0.11	0.34	0.42	0.37	0.34	0.47
Sro968_g226030.1 (Contig1973.g16878)	0.01	0.28	0.18	0.32	0.25	0.12	0.18	0.17	0.13	0.49	0.51	0.52	0.78	0.66	0.33	0.25	0.44	0.43	0.36	1.0	0.46	0.17	0.15	0.29	0.43	0.47	0.45
Sro995_g229160.1 (Contig1284.g11993)	0.02	0.73	0.65	0.96	0.9	0.46	0.43	0.41	0.59	0.67	1.0	0.85	0.92	0.77	0.68	0.6	0.83	0.67	0.69	0.88	0.5	0.15	0.39	0.35	0.16	0.29	0.67

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)