1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1013_g231360.1 (Contig3614.g27945)
 0.01 2.86 1.74 2.39 1.21 2.6 1.78 0.85 0.71 1.85 2.16 2.17 4.17 1.32 2.17 2.11 1.82 1.78 1.8 3.28 1.94 1.22 0.54 1.58 0.91 1.28 1.46
Sro1029_g233260.1 (Contig460.g6199)
 1.44 40.95 36.67 44.84 43.55 30.11 29.08 19.55 31.9 32.87 44.49 36.86 49.63 23.11 34.78 22.52 55.27 23.88 20.1 34.97 28.06 8.61 21.03 17.09 23.94 12.53 26.68
Sro1060_g236720.1 (Contig1660.g14965)
 4.06 1.34 1.08 1.92 1.72 1.91 2.86 3.35 1.69 5.75 6.05 6.69 9.48 4.55 5.25 4.16 7.14 3.99 6.15 9.66 6.76 3.06 1.9 4.18 5.56 3.02 3.97
Sro106_g053640.1 (Contig1122.g10761)
 0.09 2.09 1.52 2.34 1.73 1.04 3.39 2.1 2.1 4.45 5.45 5.5 6.09 3.71 4.75 6.01 4.61 4.27 5.93 7.98 4.88 1.63 1.23 4.05 4.36 3.87 3.68
Sro1078_g238790.1 (Contig3778.g29013)
 0.97 5.09 6.8 10.32 7.69 14.89 7.33 9.37 7.82 15.77 19.41 16.98 26.97 15.47 14.41 12.58 13.74 17.15 15.09 24.27 16.8 6.16 7.67 9.69 12.72 13.4 15.45
16.59 18.81 17.71 35.79 31.56 12.27 16.96 15.63 12.14 24.97 26.37 24.42 27.92 18.65 23.63 16.38 20.2 26.42 29.67 28.69 33.82 9.36 9.24 28.99 35.73 25.81 20.01
Sro1219_g253410.1 (Contig468.g6356)
 0.47 7.51 5.02 5.34 5.05 4.44 6.02 6.35 5.5 8.79 11.48 9.72 9.56 8.24 8.58 8.92 8.85 8.34 10.13 12.53 10.2 2.99 3.48 6.99 6.42 5.17 6.96
Sro1338_g264260.1 (Contig2752.g22182)
 16.65 58.22 71.27 96.65 88.78 25.35 54.94 50.96 51.12 56.52 107.83 69.31 37.44 65.74 64.42 71.86 93.75 25.5 32.65 35.52 54.61 31.21 56.88 98.03 84.56 55.26 56.84
Sro1351_g265200.1 (Contig2702.g21763)
 0.3 6.28 4.21 6.29 6.07 5.17 10.53 6.08 10.54 13.36 16.27 16.31 25.53 14.98 11.85 8.36 19.77 12.43 11.02 26.07 17.9 7.15 6.25 11.54 13.49 7.22 13.87
Sro1360_g266120.1 (Contig2203.g18333)
 0.32 3.96 2.78 5.01 6.13 4.27 4.28 4.67 3.15 10.71 15.65 12.81 15.47 6.41 8.4 6.4 17.29 7.67 12.59 14.5 10.73 2.56 1.89 3.46 7.31 4.94 10.84
Sro136_g064210.1 (Contig2000.g17132)
 0.9 6.87 4.94 7.42 6.03 4.51 7.14 3.23 3.74 9.08 10.62 10.46 9.97 9.19 9.5 8.47 8.54 7.2 8.56 12.61 9.78 1.7 2.92 7.71 8.11 7.41 9.11
Sro1726_g293810.1 (Contig1975.g16890)
 0.11 2.72 1.4 2.61 2.63 2.26 3.59 2.77 2.34 5.77 6.11 7.08 7.0 5.96 5.17 4.02 4.23 3.67 3.87 7.44 6.54 1.89 1.4 3.91 3.86 4.17 4.75
Sro173_g076420.1 (Contig2926.g23323)
 19.12 105.04 50.81 101.57 79.65 116.12 143.68 116.79 71.7 257.1 304.63 307.19 151.25 445.93 263.83 338.59 336.19 208.17 206.84 232.0 206.01 54.98 111.67 151.25 153.9 318.14 276.69
Sro1834_g300520.1 (Contig890.g9471)
 0.8 39.49 38.23 47.25 42.36 18.56 23.86 18.96 13.54 39.19 55.41 49.24 41.01 33.59 44.5 50.91 52.65 32.89 34.54 38.63 40.05 4.32 10.72 25.39 28.18 21.56 36.41
Sro190_g081770.1 (Contig3488.g27052)
 2.38 6.26 8.98 16.56 11.82 8.91 10.93 6.75 5.36 18.85 19.98 22.91 35.59 16.63 15.26 16.23 19.78 12.32 13.04 35.34 21.19 9.05 6.13 14.11 16.97 19.72 14.75
Sro1991_g309790.1 (Contig4515.g33856)
 0.21 15.0 15.16 17.22 15.42 8.43 12.3 10.76 13.7 17.92 20.47 18.7 21.82 22.7 18.76 27.23 25.0 11.05 12.62 20.32 20.09 10.77 11.45 8.88 12.42 12.48 16.48
Sro219_g090580.1 (Contig3313.g25998)
 4.18 63.11 74.66 96.5 89.89 66.34 98.78 85.31 97.03 117.95 142.51 139.93 201.95 131.1 135.81 172.05 150.58 164.95 125.02 172.58 116.85 54.04 91.04 72.79 71.83 68.21 106.49
Sro229_g093080.1 (Contig429.g5812)
 0.53 11.93 11.38 15.14 13.55 10.69 11.13 6.45 9.65 19.41 25.16 23.23 21.79 20.33 19.63 19.87 22.27 18.5 17.5 24.07 18.98 3.61 6.97 11.57 11.0 13.82 19.18
Sro2349_g324390.1 (Contig4280.g32354)
 0.28 1.16 2.46 2.03 1.83 6.13 7.02 2.96 4.02 13.61 8.97 15.97 15.7 7.35 10.77 26.9 10.33 17.9 19.95 13.54 17.89 5.08 5.42 5.65 9.92 7.94 13.1
0.0 0.4 0.55 0.27 0.48 0.31 0.74 0.31 0.89 2.28 2.21 1.94 3.51 1.51 2.32 2.38 1.84 1.09 3.09 4.16 2.19 0.9 0.49 0.97 1.54 2.05 3.23
Sro239_g095950.1 (Contig3063.g24391)
 11.67 32.6 33.08 23.86 17.82 6.42 14.94 9.89 10.2 18.38 13.23 20.17 23.25 10.55 19.6 30.22 8.26 24.48 25.02 27.97 19.68 6.03 8.58 9.72 7.23 4.74 16.46
Sro2_g001920.1 (Contig467.g6350)
 1.55 14.43 15.98 8.67 9.11 5.16 9.37 5.34 7.97 8.05 4.2 8.6 9.03 10.11 9.95 11.61 3.21 9.2 7.65 7.68 6.93 4.11 5.61 5.15 4.15 3.33 7.03
Sro31_g020410.1 (Contig420.g5636)
 23.24 179.5 154.47 182.41 177.94 107.41 166.75 143.18 150.35 189.32 280.31 215.89 142.81 171.01 212.63 215.9 245.54 180.91 161.56 138.07 180.69 83.82 154.96 118.68 90.61 104.05 188.84
Sro324_g117440.1 (Contig590.g7382)
 0.04 2.81 2.25 1.85 1.77 0.83 3.05 1.37 1.51 3.25 3.93 4.67 2.92 3.29 3.42 4.4 2.75 2.08 2.55 2.72 3.54 0.11 0.99 3.98 2.84 2.61 2.27
Sro354_g124840.1 (Contig4485.g33707)
 1.84 9.63 8.44 6.35 6.71 8.29 6.64 3.49 2.95 29.69 23.27 36.15 37.71 16.85 20.66 41.37 13.36 16.02 32.81 52.27 27.16 0.0 2.91 3.6 6.67 7.3 29.02
Sro355_g125020.1 (Contig2977.g23660)
 0.83 12.17 8.49 11.2 13.05 12.69 17.98 16.86 14.29 24.1 31.3 29.2 26.59 18.22 22.3 19.21 23.07 20.02 23.12 29.13 27.91 3.55 9.56 14.58 17.95 14.24 20.5
Sro359_g126110.1 (Contig295.g3872)
 0.04 1.64 2.81 0.64 0.8 0.84 0.68 0.39 0.32 1.74 1.5 1.69 1.33 1.64 1.68 3.1 0.53 1.63 1.88 1.38 1.19 0.15 0.32 0.17 0.34 0.21 1.89
Sro368_g127980.1 (Contig2761.g22237)
 0.41 24.95 15.63 15.74 15.56 7.1 17.37 12.49 25.36 17.72 26.96 24.32 21.18 18.29 21.12 24.23 29.02 18.82 18.34 21.66 19.1 7.34 17.66 13.52 9.33 7.08 16.44
Sro383_g131300.1 (Contig132.g1495)
 13.29 9.15 6.91 10.96 11.46 13.34 20.41 12.57 17.83 24.27 30.66 29.6 29.99 22.66 24.78 25.45 24.2 20.06 19.64 32.67 23.82 12.84 12.72 21.93 20.54 11.84 18.51
Sro394_g133760.1 (Contig4153.g31706)
 0.42 1.99 1.29 1.07 1.41 3.66 5.59 2.51 3.92 6.76 4.45 6.73 15.36 6.94 5.7 7.3 5.67 4.92 9.24 13.42 7.12 4.09 4.86 2.94 4.57 3.89 4.87
Sro4138_g353130.1 (Contig3862.g29721)
 0.02 1.08 0.66 1.0 0.86 1.8 0.92 0.78 0.23 1.73 2.64 2.4 3.84 1.57 2.27 2.58 2.88 1.12 1.77 3.08 2.06 0.36 0.16 1.89 0.61 1.21 1.65
Sro461_g147800.1 (Contig3552.g27434)
 0.09 4.47 4.55 4.55 3.16 3.87 2.71 2.55 2.66 5.87 7.33 5.94 6.22 5.84 4.73 3.83 7.72 4.36 5.36 6.08 5.36 3.42 1.85 4.6 5.52 2.93 5.84
Sro480_g151360.1 (Contig2927.g23337)
 0.03 8.3 5.66 7.55 5.8 3.57 2.94 3.12 2.44 5.32 7.2 6.24 7.42 3.69 5.0 3.7 7.63 4.75 5.23 6.23 5.7 2.0 1.28 3.59 4.15 3.35 5.51
Sro481_g151490.1 (Contig3107.g24707)
 1.35 9.57 5.8 13.06 12.31 12.26 4.95 3.97 8.03 15.39 24.96 19.35 7.05 8.29 12.64 13.9 17.58 6.66 11.15 15.61 12.74 3.73 5.98 4.85 4.37 7.14 17.06
Sro503_g155710.1 (Contig635.g7683)
 0.0 3.1 2.74 2.43 3.55 6.12 7.45 3.37 7.98 6.99 9.73 7.0 18.29 8.92 11.17 17.78 11.15 4.66 6.85 10.31 8.86 1.59 5.78 5.32 7.38 7.95 9.09
Sro524_g159950.1 (Contig202.g2392)
 1.24 16.08 14.76 18.3 15.87 16.39 18.18 12.17 18.79 21.64 35.72 26.56 30.96 23.47 27.42 25.61 43.28 25.61 23.59 26.58 19.3 4.85 13.61 15.0 11.95 10.84 22.84
Sro538_g162620.1 (Contig95.g1103)
 0.25 9.41 10.81 5.91 6.76 1.43 2.77 1.72 2.21 4.85 2.61 5.09 2.2 2.99 4.3 8.66 2.2 4.28 4.63 2.82 4.05 1.54 1.4 1.97 1.79 1.4 4.55
Sro552_g165060.1 (Contig2064.g17686)
 1.71 29.49 27.89 45.57 38.36 36.36 46.79 34.1 36.96 47.68 73.26 56.99 47.96 46.16 56.15 37.0 88.41 41.25 37.19 50.72 51.2 20.89 37.52 43.46 60.17 46.68 46.91
Sro562_g167010.1 (Contig149.g1653)
 0.36 10.42 7.37 6.66 8.9 1.96 4.65 3.21 3.81 5.29 4.98 5.49 5.2 3.54 4.93 6.67 5.69 3.94 5.7 4.92 3.07 1.63 2.35 5.22 2.92 1.78 5.91
Sro626_g177830.1 (Contig1809.g15958)
 4.51 19.23 18.57 20.72 18.52 13.44 16.92 13.3 12.83 27.94 45.36 33.47 50.37 26.89 27.63 20.06 45.47 25.9 22.9 50.85 29.18 11.62 10.67 19.13 19.45 11.48 26.53
Sro639_g179800.1 (Contig197.g2301)
 9.04 29.8 48.42 46.46 52.82 44.42 65.4 49.05 64.79 79.02 72.14 87.44 93.29 105.49 87.16 128.39 82.31 104.83 94.74 84.53 80.49 25.31 64.43 25.33 33.44 37.6 67.55
Sro692_g188150.1 (Contig950.g9823)
 1.01 0.38 0.58 0.44 0.14 1.25 3.05 2.79 2.01 5.07 4.92 5.46 12.41 4.42 3.91 3.63 4.37 3.8 5.12 11.02 6.31 2.43 2.01 3.16 6.32 3.13 3.64
Sro6_g005140.1 (Contig175.g2019)
 4.33 16.53 12.61 19.94 19.41 13.32 15.02 12.22 13.19 27.24 32.02 26.46 52.03 22.97 25.89 28.82 25.61 26.85 34.31 40.84 27.33 8.14 10.64 14.18 15.54 19.75 26.77
Sro718_g192180.1 (Contig362.g4875)
 0.07 7.2 7.92 6.95 7.51 4.15 2.69 5.15 4.47 4.9 5.57 5.17 4.04 4.17 5.46 8.4 5.94 4.62 4.98 3.78 4.51 1.95 2.37 1.99 1.5 2.18 5.36
Sro71_g039300.1 (Contig2582.g20953)
 6.22 9.18 10.73 6.39 5.72 3.7 4.87 4.77 3.81 6.2 9.0 7.68 7.54 4.34 6.42 6.82 7.81 4.99 5.99 7.92 6.18 3.54 3.25 5.11 3.11 3.1 6.23
Sro752_g197160.1 (Contig1730.g15440)
 31.47 111.7 122.27 124.17 153.35 135.71 202.56 165.93 167.98 233.39 217.48 238.53 221.06 232.76 329.91 575.98 223.2 320.35 264.27 181.44 206.29 155.69 188.97 131.47 113.47 103.61 273.46
Sro752_g197170.1 (Contig1730.g15441)
 7.86 40.73 55.26 64.7 63.17 49.14 75.51 67.13 82.5 95.88 122.23 113.36 127.6 118.11 135.33 216.74 146.19 127.62 112.29 107.28 105.86 52.83 85.17 46.52 46.06 55.11 80.63
Sro77_g041960.1 (Contig338.g4591)
 2.34 46.03 40.46 44.91 41.74 32.93 41.18 33.68 31.73 42.48 66.41 46.89 28.92 31.66 50.0 50.2 62.13 31.77 32.67 33.73 44.75 13.14 27.34 33.54 23.61 28.06 48.22
Sro819_g207070.1 (Contig8.g93)
 0.26 4.35 5.78 4.88 4.38 2.36 2.13 1.55 1.5 3.98 4.05 4.16 4.66 4.48 3.84 4.71 4.74 3.38 3.79 3.98 3.11 0.73 1.27 1.86 1.54 1.5 4.1
Sro841_g209600.1 (Contig2025.g17358)
 0.38 2.74 2.93 2.83 2.75 6.51 3.61 2.07 1.75 5.32 5.66 4.88 11.29 5.98 6.13 5.91 6.96 4.84 5.91 9.06 5.93 3.34 1.87 5.18 4.81 3.63 3.98
Sro846_g210160.1 (Contig3685.g28432)
 47.61 81.39 98.29 94.34 112.97 123.72 175.19 149.14 158.72 228.03 282.17 252.97 303.3 276.75 304.39 483.77 274.67 297.56 258.87 269.68 191.47 124.51 147.4 180.96 95.15 99.83 287.29
Sro88_g046560.1 (Contig265.g3314)
 0.41 12.99 11.9 15.86 15.23 19.2 20.22 20.2 17.19 32.53 54.87 35.36 36.62 34.48 33.71 33.64 40.4 34.39 37.58 38.66 32.12 7.76 14.28 19.0 21.54 24.95 36.63
Sro93_g048640.1 (Contig3841.g29552)
 6.11 28.55 26.36 24.64 27.28 37.25 34.88 21.36 29.83 61.88 94.15 81.35 69.58 90.01 81.66 96.85 100.05 47.32 37.43 63.09 56.73 22.82 30.31 30.32 27.87 33.96 56.68
Sro948_g223550.1 (Contig1921.g16562)
 0.42 22.48 13.79 19.2 19.33 14.44 18.27 14.24 15.33 20.71 29.49 26.89 24.99 17.02 21.5 12.89 35.18 17.91 15.57 29.94 21.08 3.93 11.96 14.73 13.02 11.87 16.57
Sro968_g226030.1 (Contig1973.g16878)
 0.22 8.58 5.5 9.81 7.67 3.83 5.65 5.13 3.9 15.03 15.82 15.99 24.01 20.35 10.27 7.62 13.55 13.16 11.11 30.95 14.26 5.3 4.67 9.03 13.16 14.4 14.02
Sro995_g229160.1 (Contig1284.g11993)
 0.76 27.37 24.21 35.82 33.72 17.05 16.28 15.43 22.0 25.12 37.44 31.75 34.42 28.99 25.63 22.56 31.19 24.96 25.69 32.93 18.8 5.64 14.5 13.24 5.92 10.68 24.97

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)