Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051780.1 (Contig348.g4731)
0.04 0.14 0.17 0.11 0.06 0.33 0.31 0.13 0.06 0.67 0.4 0.67 0.22 0.53 0.58 1.0 0.3 0.62 0.83 0.3 0.48 0.01 0.05 0.16 0.08 0.07 0.82
Sro1095_g240670.1 (Contig3661.g28257)
0.11 0.48 0.42 0.33 0.3 0.6 0.61 0.5 0.4 0.83 0.47 0.95 0.49 0.55 0.63 1.0 0.34 0.73 0.72 0.56 0.69 0.28 0.35 0.37 0.35 0.25 0.83
Sro117_g057410.1 (Contig3937.g30185)
0.01 0.34 0.25 0.31 0.19 0.73 0.42 0.26 0.26 0.91 0.9 0.85 1.0 0.94 0.9 0.75 0.57 0.56 0.79 0.92 0.97 0.23 0.21 0.42 0.29 0.33 1.0
Sro1273_g258290.1 (Contig3385.g26472)
0.02 0.33 0.26 0.22 0.25 0.66 0.44 0.28 0.15 0.81 0.56 0.88 0.53 0.66 0.61 0.57 0.34 0.64 0.76 0.93 0.71 0.14 0.17 0.35 0.18 0.26 1.0
Sro128_g061200.1 (Contig1654.g14896)
0.05 0.15 0.24 0.1 0.09 0.26 0.25 0.13 0.05 0.42 0.21 0.45 0.13 0.31 0.33 0.56 0.12 0.56 1.0 0.19 0.4 0.01 0.04 0.12 0.03 0.03 0.46
Sro1322_g262590.1 (Contig3764.g28909)
0.0 0.81 0.85 0.42 0.37 0.86 0.44 0.38 0.18 0.72 0.5 0.96 0.14 0.71 0.61 0.43 0.35 0.42 0.63 0.19 0.31 0.09 0.13 0.52 0.42 0.22 1.0
Sro1505_g278190.1 (Contig474.g6441)
0.04 0.4 0.26 0.19 0.16 0.71 0.58 0.41 0.2 0.88 0.41 0.84 0.23 0.83 0.64 0.55 0.33 0.67 0.66 0.55 1.0 0.19 0.18 0.58 0.64 0.41 0.89
Sro1565_g282840.1 (Contig2951.g23398)
0.18 0.15 0.15 0.15 0.15 0.78 0.3 0.12 0.07 0.94 0.56 0.93 0.06 0.56 0.58 0.58 0.25 0.13 0.14 0.12 0.9 0.01 0.05 0.67 0.55 0.31 1.0
Sro156_g070610.1 (Contig473.g6399)
0.39 0.78 0.32 0.27 0.24 0.55 0.47 0.42 0.23 0.82 0.31 0.94 0.13 0.61 0.7 0.79 0.21 0.92 1.0 0.17 0.62 0.09 0.23 0.09 0.01 0.04 0.82
Sro15_g011270.1 (Contig791.g8853)
0.11 0.37 0.17 0.13 0.16 0.47 0.29 0.25 0.14 0.63 0.29 0.63 0.29 0.66 0.51 0.62 0.2 0.81 1.0 0.48 0.37 0.08 0.14 0.11 0.02 0.11 0.67
Sro1677_g290550.1 (Contig102.g1220)
0.02 0.18 0.21 0.13 0.12 0.28 0.17 0.1 0.12 0.37 0.23 0.52 0.17 0.38 0.38 0.61 0.15 0.48 1.0 0.17 0.45 0.02 0.06 0.07 0.01 0.04 0.45
Sro16_g011880.1 (Contig916.g9625)
0.05 0.56 0.4 0.33 0.31 0.38 0.4 0.31 0.22 0.57 0.39 0.54 0.18 0.38 0.48 0.81 0.39 0.88 1.0 0.25 0.25 0.05 0.18 0.1 0.2 0.06 0.65
Sro174_g076750.1 (Contig4298.g32459)
0.04 0.35 0.25 0.22 0.22 0.51 0.57 0.42 0.32 0.86 0.62 0.85 0.69 1.0 0.7 0.9 0.49 0.63 0.66 0.73 0.79 0.2 0.25 0.41 0.46 0.4 0.92
Sro1770_g296570.1 (Contig2654.g21452)
0.2 0.43 0.41 0.28 0.31 0.29 0.32 0.19 0.13 0.52 0.28 0.53 0.23 0.38 0.43 0.69 0.16 0.72 1.0 0.42 0.53 0.08 0.09 0.15 0.03 0.05 0.61
Sro2010_g310810.1 (Contig3241.g25609)
0.02 0.3 0.2 0.09 0.05 0.72 0.4 0.29 0.19 0.82 0.46 0.76 0.93 0.74 0.61 0.87 0.33 0.69 0.87 0.55 0.61 0.06 0.1 0.21 0.23 0.19 1.0
Sro209_g087370.1 (Contig4070.g31208)
0.0 0.57 0.37 0.26 0.15 0.75 0.39 0.25 0.14 0.85 0.49 0.83 0.67 0.72 0.52 0.43 0.33 0.44 0.6 0.63 0.44 0.02 0.08 0.25 0.1 0.1 1.0
Sro210_g087660.1 (Contig2488.g20383)
0.04 0.89 0.74 0.27 0.25 0.75 0.58 0.3 0.18 0.83 0.34 1.0 0.14 0.54 0.53 0.31 0.33 0.63 0.57 0.15 0.88 0.05 0.13 0.51 0.45 0.29 0.91
Sro2197_g318680.1 (Contig1089.g10539)
0.12 0.18 0.12 0.17 0.15 0.48 0.46 0.45 0.16 0.82 0.41 0.73 0.34 0.38 0.5 0.56 0.41 1.0 0.83 0.59 0.84 0.02 0.1 0.34 0.43 0.23 0.82
Sro2243_g320480.1 (Contig4392.g32996)
0.03 0.48 0.39 0.22 0.23 0.67 0.42 0.34 0.14 0.74 0.38 0.91 0.13 0.42 0.48 0.29 0.41 1.0 0.93 0.26 0.36 0.01 0.13 0.28 0.12 0.07 0.74
Sro23_g015670.1 (Contig2259.g18717)
0.06 0.5 0.77 0.23 0.41 0.25 0.48 0.5 0.28 0.42 0.28 0.51 0.15 0.3 0.45 1.0 0.32 0.7 0.5 0.17 0.32 0.03 0.12 0.15 0.02 0.03 0.56
Sro243_g096760.1 (Contig3073.g24500)
0.04 0.43 0.45 0.5 0.19 0.99 0.4 0.32 0.29 0.84 0.6 0.55 0.27 0.62 0.55 0.58 0.38 0.46 0.55 0.52 0.74 0.03 0.09 0.8 0.81 0.22 1.0
Sro255_g100470.1 (Contig2336.g19224)
0.01 0.65 0.82 0.4 0.57 0.24 0.28 0.14 0.11 0.45 0.24 0.51 0.17 0.34 0.47 0.7 0.15 0.71 1.0 0.29 0.39 0.03 0.08 0.19 0.05 0.04 0.54
Sro260_g101640.1 (Contig1663.g15016)
0.03 0.18 0.14 0.07 0.06 0.28 0.35 0.22 0.1 0.63 0.84 0.52 0.29 0.43 0.47 0.36 0.39 0.44 1.0 0.46 0.81 0.03 0.08 0.22 0.09 0.15 0.87
Sro27_g018250.1 (Contig3926.g30086)
0.06 0.04 0.05 0.02 0.03 0.23 0.26 0.22 0.11 0.44 0.15 0.44 0.18 0.33 0.43 0.9 0.16 0.97 1.0 0.28 0.39 0.01 0.09 0.09 0.03 0.03 0.5
Sro3197_g345010.1 (Contig2804.g22538)
0.14 0.9 0.51 0.4 0.45 0.34 0.54 0.41 0.25 0.66 0.52 0.59 0.05 0.29 0.76 1.0 0.23 0.82 0.84 0.12 0.32 0.06 0.11 0.29 0.12 0.06 0.85
Sro325_g117880.1 (Contig3568.g27577)
0.03 0.47 0.39 0.12 0.11 0.22 0.51 0.24 0.16 0.63 0.16 1.0 0.12 0.38 0.5 0.92 0.22 0.91 0.91 0.14 0.52 0.01 0.12 0.15 0.12 0.05 0.61
Sro325_g117890.1 (Contig3568.g27578)
0.01 0.12 0.33 0.03 0.05 0.21 0.34 0.21 0.1 0.46 0.17 0.52 0.15 0.35 0.42 0.66 0.12 0.63 1.0 0.11 0.59 0.02 0.07 0.13 0.02 0.03 0.47
Sro3333_g346910.1 (Contig941.g9758)
0.02 0.28 0.23 0.18 0.12 0.68 0.51 0.41 0.2 0.85 0.47 0.91 0.47 0.6 0.56 0.47 0.24 0.74 0.86 0.85 0.72 0.08 0.15 0.34 0.48 0.21 1.0
Sro358_g125750.1 (Contig1210.g11362)
0.02 0.07 0.12 0.06 0.02 0.65 0.38 0.25 0.15 0.96 0.37 0.94 0.31 0.82 0.57 0.87 0.48 0.63 0.67 0.49 1.0 0.1 0.09 0.22 0.3 0.29 0.86
Sro35_g022330.1 (Contig3323.g26110)
0.0 0.12 0.12 0.05 0.09 0.55 0.35 0.23 0.07 0.78 0.37 0.4 0.22 0.41 0.55 0.61 0.23 1.0 0.89 0.45 0.59 0.03 0.08 0.13 0.27 0.08 0.87
Sro375_g129460.1 (Contig4478.g33647)
0.73 0.39 0.12 0.11 0.2 0.62 0.66 0.35 0.22 0.85 0.64 0.77 0.28 0.59 0.83 0.8 0.44 0.56 0.65 0.34 0.91 0.03 0.19 0.49 0.53 0.46 1.0
Sro381_g130790.1 (Contig161.g1812)
0.03 0.26 0.11 0.22 0.28 0.42 0.4 0.36 0.19 0.53 0.25 0.43 1.0 0.49 0.57 0.6 0.18 0.5 0.41 0.3 0.5 0.01 0.15 0.06 0.03 0.02 0.64
Sro47_g027820.1 (Contig1172.g11175)
0.02 0.69 0.35 0.29 0.24 0.96 0.46 0.4 0.17 0.82 0.38 0.65 0.21 0.63 0.48 0.43 0.28 0.46 0.65 0.73 0.51 0.08 0.15 0.16 0.06 0.07 1.0
Sro481_g151480.1 (Contig3107.g24706)
0.05 0.47 0.38 0.29 0.22 0.58 0.37 0.35 0.14 0.75 0.69 0.8 0.08 0.43 0.43 0.39 0.28 0.36 0.33 0.1 0.46 0.04 0.11 0.47 0.48 0.28 1.0
Sro486_g152540.1 (Contig3152.g24993)
0.0 0.46 0.21 0.26 0.19 0.8 0.26 0.18 0.1 0.84 0.43 0.75 0.26 0.78 0.53 0.42 0.26 0.38 0.48 0.21 0.68 0.01 0.09 0.07 0.01 0.07 1.0
0.03 0.33 0.21 0.27 0.13 0.54 0.37 0.25 0.16 0.68 0.74 0.68 0.07 0.72 0.55 0.25 0.4 0.15 0.61 0.15 0.27 0.06 0.18 0.21 0.04 0.21 1.0
Sro53_g031260.1 (Contig1592.g14466)
0.08 0.32 0.21 0.08 0.08 0.58 0.43 0.25 0.17 0.8 0.79 1.0 0.15 0.37 0.47 0.41 0.5 0.56 0.84 0.19 0.33 0.04 0.1 0.35 0.12 0.14 0.92
Sro53_g031270.1 (Contig1592.g14467)
0.01 0.58 0.56 0.23 0.23 0.71 0.38 0.24 0.09 0.83 0.56 0.87 0.15 0.48 0.47 0.54 0.51 0.26 0.77 0.25 0.43 0.03 0.09 0.3 0.09 0.14 1.0
Sro58_g033940.1 (Contig64.g588)
0.0 0.64 0.6 0.47 0.24 0.79 0.32 0.27 0.27 0.73 0.47 0.72 0.16 0.61 0.43 0.38 0.41 0.39 0.61 0.21 0.29 0.02 0.05 0.17 0.14 0.19 1.0
Sro726_g193500.1 (Contig3737.g28654)
0.13 0.39 0.39 0.34 0.43 0.54 0.54 0.32 0.18 0.76 0.47 0.94 0.21 0.38 0.48 0.75 0.38 0.72 1.0 0.43 0.4 0.04 0.14 0.34 0.15 0.08 0.76
Sro73_g040330.1 (Contig3929.g30134)
0.06 0.67 0.39 0.26 0.24 0.63 0.66 0.35 0.22 0.9 0.62 1.0 0.35 0.56 0.53 0.53 0.39 0.67 0.98 0.3 0.44 0.07 0.21 0.43 0.35 0.21 0.98
Sro82_g043760.1 (Contig4032.g30967)
0.06 0.64 0.29 0.26 0.22 0.67 0.34 0.25 0.16 0.84 0.41 0.81 0.35 0.79 0.55 0.43 0.3 0.43 0.54 0.42 0.72 0.03 0.13 0.17 0.02 0.06 1.0
Sro855_g211430.1 (Contig1132.g10857)
0.34 0.29 0.26 0.29 0.14 0.71 0.32 0.26 0.16 0.81 0.56 0.79 0.49 0.86 0.65 0.81 0.39 0.4 0.53 0.5 0.54 0.05 0.12 0.17 0.13 0.15 1.0
Sro879_g214930.1 (Contig3022.g24104)
0.03 0.29 0.18 0.13 0.13 0.42 0.35 0.24 0.12 0.6 0.5 0.62 0.26 0.35 0.51 0.56 0.26 1.0 0.99 0.51 0.46 0.04 0.09 0.16 0.1 0.06 0.72
Sro89_g047050.1 (Contig3846.g29626)
0.06 0.26 0.12 0.18 0.24 0.47 0.25 0.25 0.13 0.59 0.32 0.58 0.99 0.71 0.61 1.0 0.28 0.58 0.53 0.44 0.32 0.09 0.12 0.08 0.03 0.09 0.73
Sro919_g220130.1 (Contig2964.g23550)
0.03 0.3 0.23 0.2 0.26 0.4 0.25 0.29 0.17 0.49 0.24 0.45 0.2 0.35 0.35 0.39 0.17 1.0 0.88 0.29 0.27 0.03 0.12 0.05 0.02 0.04 0.55
Sro966_g225750.1 (Contig1539.g13993)
0.06 0.35 0.3 0.21 0.33 0.56 0.47 0.28 0.17 0.74 0.38 0.66 0.21 0.48 0.76 1.0 0.35 0.99 0.66 0.51 0.64 0.03 0.25 0.28 0.47 0.25 0.9
Sro972_g226590.1 (Contig330.g4388)
0.02 0.13 0.05 0.15 0.08 0.63 0.3 0.25 0.2 0.79 0.51 0.77 0.37 0.93 0.46 0.8 0.5 0.47 0.51 0.34 0.32 0.05 0.12 0.11 0.08 0.11 1.0
Sro979_g227220.1 (Contig4114.g31404)
0.07 0.16 0.07 0.1 0.15 0.42 0.2 0.19 0.1 0.49 0.27 0.45 0.73 0.58 0.56 1.0 0.22 0.44 0.42 0.32 0.3 0.06 0.09 0.05 0.01 0.09 0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)