1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051780.1 (Contig348.g4731)
 1.72 6.59 8.13 5.39 3.03 15.51 14.58 6.27 2.74 31.34 18.89 31.69 10.51 24.95 27.37 47.03 13.94 28.98 39.26 13.98 22.67 0.42 2.19 7.68 3.68 3.19 38.56
Sro1095_g240670.1 (Contig3661.g28257)
 4.42 19.57 17.31 13.71 12.53 24.68 25.26 20.53 16.59 34.13 19.22 39.25 20.28 22.59 26.0 41.19 14.13 30.1 29.53 23.23 28.56 11.44 14.3 15.14 14.51 10.37 34.34
Sro117_g057410.1 (Contig3937.g30185)
 0.35 10.1 7.34 9.43 5.55 21.87 12.57 7.71 7.92 27.24 27.11 25.53 29.86 28.22 26.9 22.5 17.06 16.75 23.74 27.65 29.18 6.94 6.38 12.63 8.74 9.82 29.96
Sro1273_g258290.1 (Contig3385.g26472)
 0.7 10.89 8.57 7.09 8.15 21.41 14.48 8.97 4.89 26.39 18.23 28.54 17.27 21.54 19.92 18.66 11.05 20.73 24.75 30.4 23.19 4.47 5.54 11.27 5.92 8.49 32.59
Sro128_g061200.1 (Contig1654.g14896)
 1.13 3.15 5.19 2.19 1.93 5.67 5.32 2.78 1.14 9.02 4.49 9.75 2.77 6.7 7.05 11.94 2.57 12.11 21.48 4.07 8.6 0.26 0.94 2.49 0.59 0.66 9.98
Sro1322_g262590.1 (Contig3764.g28909)
 0.0 8.03 8.34 4.17 3.69 8.53 4.31 3.76 1.82 7.15 4.91 9.42 1.38 7.05 5.99 4.26 3.47 4.14 6.2 1.92 3.1 0.85 1.3 5.17 4.15 2.13 9.86
Sro1505_g278190.1 (Contig474.g6441)
 1.68 15.3 10.06 7.21 6.17 27.38 22.22 15.9 7.69 33.65 15.54 32.06 8.64 32.0 24.36 21.1 12.67 25.62 25.35 21.26 38.36 7.31 6.88 22.28 24.6 15.71 33.97
Sro1565_g282840.1 (Contig2951.g23398)
 1.39 1.2 1.15 1.19 1.16 6.17 2.37 0.91 0.54 7.44 4.47 7.33 0.48 4.43 4.56 4.55 1.96 1.06 1.11 0.94 7.08 0.05 0.38 5.32 4.33 2.49 7.91
Sro156_g070610.1 (Contig473.g6399)
 3.43 6.95 2.81 2.36 2.12 4.86 4.14 3.74 2.07 7.29 2.77 8.3 1.19 5.44 6.18 6.98 1.88 8.16 8.86 1.5 5.47 0.78 2.01 0.79 0.09 0.32 7.26
Sro15_g011270.1 (Contig791.g8853)
 3.33 11.46 5.3 4.19 5.13 14.67 9.07 7.7 4.43 19.58 9.19 19.58 9.11 20.8 15.97 19.48 6.28 25.26 31.32 15.16 11.74 2.53 4.39 3.51 0.69 3.59 20.92
Sro1677_g290550.1 (Contig102.g1220)
 0.21 1.84 2.16 1.38 1.29 2.88 1.78 1.08 1.25 3.89 2.39 5.39 1.74 3.93 3.92 6.33 1.56 4.97 10.42 1.73 4.67 0.24 0.6 0.77 0.08 0.42 4.7
Sro16_g011880.1 (Contig916.g9625)
 2.57 31.21 22.59 18.41 17.33 21.27 22.31 17.3 12.13 31.8 22.05 30.09 9.86 21.21 27.19 45.34 21.72 49.48 56.11 13.85 14.17 2.68 10.1 5.45 10.96 3.36 36.53
Sro174_g076750.1 (Contig4298.g32459)
 1.97 17.85 12.92 11.15 11.11 26.12 28.82 21.38 16.42 43.73 31.59 43.05 35.0 50.81 35.34 45.75 25.05 31.81 33.33 37.11 40.39 10.17 12.94 20.73 23.33 20.19 46.53
Sro1770_g296570.1 (Contig2654.g21452)
 8.19 17.67 16.64 11.6 12.56 11.81 13.08 7.95 5.15 21.22 11.49 21.89 9.44 15.4 17.51 28.49 6.62 29.52 41.06 17.18 21.61 3.48 3.64 5.97 1.1 1.93 24.89
Sro2010_g310810.1 (Contig3241.g25609)
 0.16 2.7 1.85 0.84 0.47 6.51 3.59 2.66 1.68 7.43 4.18 6.87 8.38 6.72 5.49 7.88 2.96 6.25 7.84 5.0 5.56 0.57 0.88 1.91 2.08 1.69 9.05
Sro209_g087370.1 (Contig4070.g31208)
 0.07 9.23 6.09 4.21 2.41 12.27 6.4 4.01 2.29 13.78 8.02 13.49 10.97 11.72 8.49 7.01 5.34 7.11 9.74 10.19 7.19 0.33 1.39 3.99 1.56 1.68 16.3
Sro210_g087660.1 (Contig2488.g20383)
 0.22 5.41 4.47 1.62 1.49 4.56 3.5 1.81 1.06 5.03 2.03 6.05 0.88 3.25 3.2 1.89 1.99 3.79 3.44 0.92 5.35 0.29 0.8 3.09 2.75 1.77 5.51
Sro2197_g318680.1 (Contig1089.g10539)
 0.91 1.36 0.9 1.27 1.15 3.58 3.43 3.36 1.2 6.16 3.05 5.52 2.57 2.85 3.77 4.24 3.08 7.51 6.25 4.42 6.3 0.13 0.72 2.57 3.23 1.74 6.19
Sro2243_g320480.1 (Contig4392.g32996)
 0.34 6.1 4.93 2.82 2.93 8.6 5.33 4.27 1.75 9.45 4.85 11.65 1.68 5.37 6.18 3.64 5.29 12.75 11.9 3.34 4.61 0.12 1.69 3.58 1.56 0.85 9.46
Sro23_g015670.1 (Contig2259.g18717)
 1.02 7.89 12.35 3.66 6.6 3.96 7.61 7.99 4.41 6.68 4.43 8.1 2.37 4.84 7.18 15.93 5.14 11.1 7.89 2.72 5.07 0.42 1.93 2.43 0.34 0.48 8.88
Sro243_g096760.1 (Contig3073.g24500)
 0.11 1.34 1.41 1.56 0.6 3.07 1.24 1.0 0.89 2.61 1.87 1.7 0.84 1.92 1.71 1.82 1.18 1.42 1.71 1.62 2.31 0.09 0.29 2.5 2.51 0.68 3.11
Sro255_g100470.1 (Contig2336.g19224)
 0.23 10.09 12.72 6.23 8.81 3.66 4.26 2.15 1.69 6.94 3.68 7.95 2.56 5.19 7.34 10.76 2.32 11.0 15.45 4.53 5.95 0.48 1.24 2.97 0.76 0.58 8.36
Sro260_g101640.1 (Contig1663.g15016)
 0.47 2.51 1.97 0.89 0.82 3.78 4.75 3.0 1.29 8.58 11.45 7.01 3.98 5.9 6.35 4.91 5.26 5.95 13.59 6.31 11.05 0.39 1.08 3.04 1.2 2.0 11.87
Sro27_g018250.1 (Contig3926.g30086)
 32.66 21.08 24.22 11.62 16.6 122.08 135.47 117.34 59.53 231.14 81.49 232.71 94.29 177.03 228.68 474.34 85.16 515.23 529.8 147.14 205.65 2.86 45.05 48.76 16.35 13.39 264.45
Sro3197_g345010.1 (Contig2804.g22538)
 10.22 64.32 36.46 28.51 32.19 24.34 38.2 29.32 17.67 46.84 37.2 42.25 3.91 20.37 54.41 71.25 16.24 58.22 60.02 8.55 22.75 4.58 7.67 20.36 8.54 3.98 60.79
Sro325_g117880.1 (Contig3568.g27577)
 1.7 29.23 24.53 7.31 6.67 13.96 31.75 15.29 10.35 39.63 9.76 62.84 7.23 23.81 31.3 57.73 14.04 57.1 56.87 8.63 32.88 0.9 7.39 9.41 7.83 2.97 38.42
Sro325_g117890.1 (Contig3568.g27578)
 0.72 5.99 15.75 1.6 2.52 10.16 16.23 10.07 4.64 22.33 8.01 24.99 7.4 16.91 20.31 31.65 5.91 30.6 48.3 5.27 28.37 0.9 3.23 6.17 0.96 1.52 22.64
Sro3333_g346910.1 (Contig941.g9758)
 0.47 6.97 5.6 4.54 2.85 16.76 12.57 10.07 4.96 21.13 11.74 22.67 11.6 14.91 13.82 11.72 5.91 18.27 21.32 21.17 17.92 2.02 3.64 8.37 11.92 5.19 24.78
Sro358_g125750.1 (Contig1210.g11362)
 0.12 0.35 0.64 0.32 0.1 3.39 1.97 1.33 0.78 5.0 1.92 4.92 1.63 4.28 2.98 4.51 2.49 3.26 3.47 2.53 5.21 0.53 0.47 1.15 1.54 1.51 4.48
Sro35_g022330.1 (Contig3323.g26110)
 0.0 1.01 1.03 0.42 0.82 4.77 3.04 2.03 0.62 6.74 3.18 3.5 1.94 3.55 4.75 5.31 2.03 8.64 7.66 3.87 5.12 0.26 0.73 1.17 2.29 0.72 7.52
Sro375_g129460.1 (Contig4478.g33647)
 7.09 3.8 1.19 1.05 1.9 5.98 6.42 3.36 2.1 8.24 6.2 7.46 2.75 5.73 8.07 7.77 4.32 5.45 6.35 3.26 8.83 0.31 1.88 4.74 5.18 4.43 9.7
Sro381_g130790.1 (Contig161.g1812)
 2.05 15.27 6.51 13.35 16.97 24.84 23.94 21.58 11.23 31.66 14.78 25.4 59.71 29.3 34.02 35.79 10.48 29.87 24.73 17.88 29.76 0.57 8.77 3.58 1.75 1.1 38.46
Sro47_g027820.1 (Contig1172.g11175)
 0.61 17.11 8.61 7.25 5.84 23.81 11.47 9.83 4.24 20.27 9.45 16.12 5.18 15.65 11.94 10.57 7.0 11.31 16.1 18.13 12.69 1.94 3.62 3.92 1.54 1.77 24.68
Sro481_g151480.1 (Contig3107.g24706)
 1.78 17.98 14.48 11.02 8.46 22.29 14.0 13.54 5.41 28.8 26.38 30.72 2.96 16.5 16.37 15.06 10.75 13.68 12.43 3.78 17.5 1.35 4.05 17.81 18.44 10.84 38.21
Sro486_g152540.1 (Contig3152.g24993)
 0.02 2.45 1.11 1.37 1.0 4.22 1.35 0.95 0.52 4.44 2.29 3.97 1.36 4.15 2.81 2.24 1.4 2.0 2.54 1.13 3.61 0.06 0.45 0.35 0.07 0.39 5.3
0.47 4.96 3.27 4.03 2.0 8.28 5.67 3.83 2.46 10.3 11.26 10.35 1.11 10.97 8.35 3.83 6.15 2.21 9.29 2.21 4.14 0.98 2.74 3.24 0.59 3.24 15.2
Sro53_g031260.1 (Contig1592.g14466)
 5.75 21.59 14.38 5.47 5.5 39.86 29.67 17.23 11.86 54.71 54.35 68.38 10.48 25.62 32.28 27.89 34.45 38.55 57.47 13.18 22.62 2.49 6.76 23.94 7.9 9.61 63.14
Sro53_g031270.1 (Contig1592.g14467)
 0.15 9.1 8.87 3.57 3.57 11.2 5.96 3.78 1.39 13.04 8.76 13.75 2.35 7.61 7.4 8.52 7.98 4.06 12.13 3.88 6.74 0.47 1.44 4.79 1.4 2.17 15.76
Sro58_g033940.1 (Contig64.g588)
 0.1 16.88 15.88 12.34 6.26 20.87 8.39 7.11 7.19 19.28 12.37 19.05 4.2 16.16 11.22 9.89 10.91 10.14 16.08 5.59 7.68 0.62 1.44 4.34 3.64 5.1 26.3
Sro726_g193500.1 (Contig3737.g28654)
 46.42 142.86 140.58 122.45 153.85 194.62 194.35 116.19 65.85 273.22 171.82 340.62 74.7 138.95 175.32 270.07 139.13 261.0 361.85 153.9 146.52 12.68 49.47 122.43 55.62 28.14 276.69
Sro73_g040330.1 (Contig3929.g30134)
 0.82 9.62 5.6 3.71 3.35 8.96 9.47 4.95 3.19 12.89 8.8 14.25 4.93 8.01 7.58 7.57 5.54 9.6 14.0 4.26 6.22 0.95 2.94 6.14 4.96 3.0 13.92
Sro82_g043760.1 (Contig4032.g30967)
 0.27 3.16 1.45 1.3 1.07 3.29 1.67 1.23 0.78 4.11 2.02 3.97 1.73 3.88 2.7 2.1 1.46 2.12 2.66 2.08 3.55 0.16 0.63 0.83 0.12 0.27 4.93
Sro855_g211430.1 (Contig1132.g10857)
 14.43 12.41 11.12 12.57 6.0 30.5 13.74 11.11 6.96 34.42 24.06 33.75 21.14 36.54 27.97 34.76 16.83 17.12 22.54 21.29 23.08 2.09 5.16 7.24 5.67 6.25 42.72
Sro879_g214930.1 (Contig3022.g24104)
 0.47 5.07 3.12 2.25 2.27 7.48 6.12 4.27 2.1 10.65 8.8 10.86 4.62 6.25 8.92 9.88 4.67 17.65 17.45 9.08 8.19 0.66 1.56 2.9 1.76 1.12 12.64
Sro89_g047050.1 (Contig3846.g29626)
 70.04 304.15 140.79 208.82 280.53 543.5 286.38 285.34 144.95 674.39 373.04 660.25 1135.53 819.09 699.42 1148.25 317.79 666.7 614.15 501.01 366.16 99.94 140.41 89.98 39.71 104.8 836.81
Sro919_g220130.1 (Contig2964.g23550)
 2.5 22.37 17.15 14.72 19.17 29.42 18.58 21.14 12.62 36.17 17.47 32.97 14.52 26.12 25.95 28.6 12.82 73.97 64.92 21.75 20.03 2.46 8.89 3.76 1.72 2.63 40.79
Sro966_g225750.1 (Contig1539.g13993)
 0.67 3.78 3.21 2.25 3.54 6.07 5.03 3.04 1.89 8.01 4.12 7.12 2.27 5.14 8.22 10.8 3.8 10.69 7.14 5.55 6.96 0.28 2.69 3.05 5.07 2.73 9.74
Sro972_g226590.1 (Contig330.g4388)
 0.49 3.83 1.4 4.27 2.28 18.03 8.67 7.22 5.6 22.45 14.6 21.94 10.59 26.61 13.13 22.78 14.15 13.51 14.43 9.74 9.07 1.29 3.31 3.15 2.21 3.25 28.52
Sro979_g227220.1 (Contig4114.g31404)
 49.72 113.44 47.12 73.01 107.79 289.39 136.6 132.79 70.06 339.29 189.59 313.23 508.55 405.7 391.98 697.24 156.28 305.76 294.96 222.07 210.99 42.35 65.25 33.31 9.09 61.21 441.55

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)