Heatmap: Cluster_252 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1026_g232930.1 (Contig4072.g31229)	0.0	0.21	0.13	0.23	0.22	0.34	0.45	0.3	0.15	0.68	0.56	0.76	0.43	0.88	0.67	1.0	0.71	0.57	0.53	0.64	0.69	0.29	0.21	0.47	0.55	0.58	0.69
Sro103_g052430.1 (Contig308.g4040)	0.05	0.08	0.07	0.09	0.1	0.23	0.27	0.27	0.08	0.7	0.83	1.0	0.55	0.36	0.63	0.88	0.66	0.41	0.53	0.66	0.85	0.2	0.04	0.32	0.47	0.26	0.68
Sro103_g052450.1 (Contig308.g4042)	0.11	0.08	0.09	0.05	0.06	0.3	0.38	0.2	0.13	0.71	0.63	0.76	0.43	0.54	0.69	1.0	0.54	0.59	0.55	0.8	0.7	0.04	0.08	0.47	0.55	0.35	0.77
Sro1049_g235440.1 (Contig3572.g27599)	0.04	0.12	0.1	0.08	0.11	0.18	0.28	0.19	0.12	0.55	0.38	0.69	0.55	0.75	0.58	1.0	0.29	0.55	0.63	0.51	0.7	0.24	0.07	0.28	0.28	0.29	0.51
Sro1060_g236710.1 (Contig1660.g14964)	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.37	0.5	0.28	0.08	0.6	0.81	0.7	0.5	0.66	0.85	1.0	0.64	0.84	0.37	0.52	0.64	0.04	0.1	0.84	0.57	0.51	0.52
Sro1152_g246880.1 (Contig333.g4428)	0.01	0.21	0.22	0.29	0.26	0.44	0.58	0.42	0.32	0.75	0.97	0.99	0.7	0.49	0.78	0.77	0.6	0.55	0.74	0.74	1.0	0.29	0.27	0.82	0.98	0.56	0.96
Sro1168_g248540.1 (Contig1520.g13876)	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.14	0.18	0.06	0.01	0.5	0.41	0.62	0.27	0.54	0.39	1.0	0.24	0.23	0.42	0.4	0.53	0.04	0.01	0.16	0.2	0.27	0.43
Sro1238_g255200.1 (Contig4178.g31867)	0.05	0.22	0.14	0.07	0.07	0.45	0.31	0.17	0.09	0.71	0.54	1.0	0.74	0.5	0.67	0.94	0.27	0.48	0.48	0.86	0.76	0.04	0.06	0.38	0.22	0.23	0.7
Sro1256_g256640.1 (Contig2043.g17569)	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.11	0.47	0.2	0.1	0.68	0.52	0.82	0.39	0.68	0.51	1.0	0.62	0.47	0.36	0.68	0.8	0.06	0.1	0.28	0.36	0.21	0.58
Sro13_g009940.1 (Contig337.g4535)	0.01	0.11	0.08	0.08	0.06	0.09	0.39	0.15	0.14	0.65	0.41	0.81	0.5	0.61	0.59	0.93	0.41	0.33	0.36	1.0	0.78	0.06	0.1	0.25	0.44	0.13	0.57
Sro1406_g269920.1 (Contig4418.g33200)	0.04	0.15	0.06	0.04	0.05	0.48	0.48	0.41	0.15	0.59	1.0	0.51	0.63	0.78	0.94	0.85	0.77	0.96	0.79	0.77	0.62	0.09	0.16	0.64	0.35	0.3	0.69
Sro152_g069410.1 (Contig69.g701)	0.19	0.19	0.11	0.04	0.09	0.25	0.41	0.28	0.22	0.64	0.53	1.0	0.35	0.45	0.55	0.74	0.24	0.64	0.68	0.69	0.67	0.04	0.11	0.37	0.32	0.3	0.6
Sro171_g075800.1 (Contig113.g1289)	0.12	0.04	0.02	0.03	0.03	0.13	0.18	0.15	0.12	0.45	1.0	0.55	0.37	0.66	0.5	0.54	0.38	0.53	0.73	0.45	0.46	0.05	0.1	0.27	0.03	0.16	0.54
Sro1771_g296660.1 (Contig3831.g29380)	0.01	0.11	0.11	0.05	0.04	0.36	0.33	0.25	0.14	0.58	0.43	1.0	0.78	0.5	0.65	0.65	0.29	0.62	0.54	0.85	0.56	0.09	0.09	0.26	0.05	0.2	0.57
Sro1864_g302380.1 (Contig4441.g33343)	0.03	0.14	0.15	0.13	0.1	0.1	0.17	0.08	0.04	0.46	0.41	0.62	0.66	0.87	0.55	1.0	0.25	0.25	0.31	0.37	0.6	0.05	0.06	0.24	0.05	0.05	0.46
Sro191_g082060.1 (Contig2614.g21199)	0.02	0.05	0.08	0.12	0.12	0.25	0.38	0.25	0.25	0.71	0.91	0.9	0.66	0.73	0.66	1.0	0.69	0.5	0.57	0.77	0.81	0.27	0.24	0.34	0.42	0.62	0.61
Sro2370_g325160.1 (Contig2982.g23689)	0.0	0.06	0.07	0.1	0.07	0.43	0.15	0.08	0.0	0.58	0.65	1.0	0.5	0.91	0.7	0.59	0.59	0.52	0.5	0.72	0.76	0.0	0.0	0.57	0.28	0.24	0.77
Sro2422_g327200.1 (Contig2242.g18612)	0.01	0.05	0.03	0.06	0.06	0.13	0.35	0.18	0.12	0.63	0.62	0.78	0.71	1.0	0.71	0.97	0.6	0.4	0.46	0.75	0.93	0.14	0.12	0.3	0.3	0.39	0.59
Sro2489_g329120.1 (Contig4353.g32811)	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.15	0.24	0.2	0.09	0.59	0.46	0.75	1.0	0.91	0.58	0.67	0.44	0.54	0.53	0.94	0.92	0.08	0.11	0.2	0.09	0.3	0.49
Sro256_g100700.1 (Contig3587.g27715)	0.01	0.11	0.08	0.12	0.15	0.29	0.46	0.34	0.14	0.76	0.81	0.91	0.74	1.0	0.68	0.9	0.78	0.43	0.57	0.97	0.69	0.12	0.13	0.41	0.41	0.56	0.83
Sro256_g100720.1 (Contig3587.g27717)	0.0	0.25	0.33	0.31	0.23	0.29	0.43	0.2	0.19	0.69	0.58	0.8	0.84	0.85	0.72	0.81	0.48	0.41	0.48	1.0	0.96	0.17	0.1	0.49	0.31	0.25	0.52
Sro261_g101830.1 (Contig3068.g24455)	0.05	0.07	0.06	0.07	0.08	0.09	0.2	0.14	0.08	0.55	0.54	0.8	0.21	0.64	0.5	1.0	0.38	0.31	0.42	0.48	0.49	0.17	0.11	0.41	0.14	0.24	0.5
Sro273_g105180.2	0.04	0.09	0.04	0.05	0.1	0.28	0.28	0.17	0.08	0.61	0.63	0.83	0.6	0.89	0.75	1.0	0.49	0.58	0.48	0.7	0.8	0.06	0.07	0.44	0.34	0.39	0.64
Sro2791_g337200.1 (Contig2507.g20517)	0.03	0.16	0.15	0.09	0.11	0.18	0.25	0.12	0.04	0.44	0.51	0.62	0.56	0.38	0.5	1.0	0.48	0.38	0.46	0.49	0.29	0.05	0.06	0.34	0.23	0.18	0.28
Sro27_g018450.1 (Contig3926.g30106)	0.05	0.21	0.06	0.1	0.14	0.3	0.44	0.3	0.2	0.7	0.75	0.82	0.36	0.55	0.68	0.85	0.41	0.84	1.0	0.75	0.79	0.14	0.18	0.31	0.11	0.21	0.78
Sro2852_g338610.1 (Contig1583.g14373)	0.03	0.22	0.06	0.13	0.11	0.18	0.28	0.17	0.1	0.54	0.38	0.77	0.63	0.47	0.45	0.49	0.27	0.38	0.48	1.0	0.54	0.06	0.06	0.19	0.15	0.16	0.4
Sro289_g109080.1 (Contig4471.g33592)	0.07	0.19	0.18	0.17	0.18	0.17	0.29	0.24	0.21	0.52	0.61	0.51	0.58	0.6	0.58	1.0	0.43	0.52	0.56	0.65	0.4	0.22	0.21	0.31	0.25	0.26	0.57
Sro2906_g340000.1 (Contig4174.g31839)	0.14	0.1	0.09	0.09	0.08	0.2	0.33	0.23	0.18	0.67	0.65	0.91	0.41	0.47	0.57	1.0	0.39	0.44	0.63	0.67	0.61	0.13	0.16	0.4	0.31	0.21	0.57
Sro300_g111590.1 (Contig270.g3447)	0.03	0.06	0.04	0.08	0.05	0.16	0.25	0.18	0.12	0.53	0.7	0.62	0.25	0.43	0.55	1.0	0.43	0.45	0.44	0.36	0.57	0.1	0.1	0.26	0.17	0.22	0.57
Sro3011_g342100.1 (Contig2595.g21051)	0.11	0.16	0.19	0.18	0.13	0.18	0.18	0.08	0.05	0.48	0.45	0.61	0.76	0.61	0.6	1.0	0.37	0.25	0.3	0.48	0.65	0.04	0.03	0.38	0.4	0.27	0.36
Sro328_g118740.1 (Contig3574.g27629)	0.03	0.25	0.14	0.23	0.23	0.29	0.44	0.43	0.19	0.68	0.73	0.92	0.24	0.22	0.51	0.94	0.5	1.0	0.59	0.39	0.64	0.08	0.1	0.49	0.27	0.26	0.75
Sro331_g119170.1 (Contig3186.g25154)	0.01	0.06	0.05	0.03	0.02	0.24	0.39	0.42	0.15	0.72	0.67	0.79	1.0	0.89	0.76	0.96	0.58	0.62	0.65	0.91	0.99	0.15	0.13	0.46	0.64	0.42	0.65
Sro341_g121360.1 (Contig3952.g30268)	0.04	0.35	0.18	0.3	0.29	0.47	0.5	0.28	0.25	0.6	0.76	0.6	0.56	0.85	0.79	1.0	0.71	0.69	0.64	0.57	0.61	0.17	0.34	0.5	0.55	0.54	0.57
Sro348_g123180.1 (Contig2346.g19284)	0.02	0.08	0.11	0.08	0.08	0.22	0.3	0.25	0.24	0.58	0.43	0.66	0.67	0.74	0.56	1.0	0.41	0.67	0.8	0.79	0.6	0.11	0.11	0.26	0.19	0.24	0.47
Sro373_g129100.1 (Contig1347.g12395)	0.02	0.08	0.03	0.03	0.02	0.24	0.54	0.23	0.11	0.84	0.66	1.0	0.73	0.37	0.72	0.83	0.52	0.54	0.94	0.89	0.98	0.1	0.05	0.51	0.45	0.38	0.88
Sro376_g129790.1 (Contig3640.g28129)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.11	0.04	0.52	0.42	0.55	0.14	0.29	0.58	1.0	0.29	0.56	0.45	0.66	0.65	0.05	0.03	0.24	0.23	0.24	0.74
Sro417_g138700.1 (Contig2416.g19778)	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.15	0.19	0.16	0.16	0.48	1.0	0.58	0.54	0.68	0.48	0.47	0.39	0.38	0.61	0.72	0.47	0.05	0.07	0.24	0.02	0.1	0.56
Sro41_g025210.1 (Contig169.g1927)	0.0	0.14	0.09	0.16	0.17	0.43	0.39	0.31	0.09	0.69	0.75	0.68	0.38	0.9	0.76	1.0	0.61	0.52	0.54	0.82	0.5	0.19	0.09	0.53	0.4	0.52	0.8
Sro4357_g353820.1 (Contig3303.g25902)	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.19	0.39	0.19	0.11	0.65	0.67	0.97	0.63	0.8	0.78	0.91	0.56	0.33	0.26	0.78	1.0	0.01	0.11	0.25	0.33	0.26	0.54
Sro46_g027380.1 (Contig1636.g14728)	0.18	0.03	0.09	0.08	0.11	0.15	0.21	0.1	0.15	0.54	0.89	0.69	0.78	0.31	0.64	1.0	0.41	0.33	0.38	0.48	0.73	0.01	0.08	0.15	0.29	0.12	0.7
Sro482_g151850.1 (Contig232.g2795)	0.04	0.28	0.21	0.13	0.21	0.35	0.37	0.25	0.12	0.61	0.26	0.72	0.53	0.62	0.6	1.0	0.12	0.45	0.67	0.74	0.67	0.16	0.09	0.26	0.35	0.3	0.58
Sro4_g003840.1 (Contig3815.g29302)	0.03	0.26	0.1	0.08	0.15	0.39	0.22	0.16	0.07	0.64	0.67	0.66	0.35	0.92	0.72	0.82	0.61	0.82	1.0	0.79	0.6	0.31	0.15	0.37	0.11	0.38	0.79
Sro549_g164580.1 (Contig1749.g15563)	0.01	0.13	0.08	0.12	0.18	0.44	0.52	0.33	0.16	0.57	0.84	0.66	0.53	0.75	0.85	1.0	0.76	0.68	0.32	0.45	0.5	0.16	0.2	0.58	0.4	0.31	0.57
Sro572_g168820.1 (Contig1817.g16011)	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.16	0.23	0.12	0.12	0.59	0.52	0.77	1.0	0.68	0.64	0.91	0.45	0.55	0.54	0.97	0.7	0.04	0.05	0.26	0.18	0.19	0.45
Sro5_g004300.1 (Contig4001.g30745)	0.03	0.28	0.11	0.14	0.13	0.11	0.19	0.09	0.12	0.42	0.34	0.56	0.2	0.33	0.36	1.0	0.23	0.43	0.5	0.51	0.49	0.06	0.06	0.11	0.17	0.19	0.29
Sro638_g179530.1 (Contig628.g7616)	0.01	0.11	0.11	0.04	0.03	0.3	0.51	0.27	0.13	0.88	0.92	1.0	0.41	0.59	0.74	0.85	0.71	0.89	0.8	0.87	0.87	0.07	0.08	0.55	0.58	0.47	0.98
Sro685_g186890.1 (Contig1991.g17044)	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.15	0.18	0.09	0.12	0.5	0.82	0.78	0.35	0.63	0.71	1.0	0.3	0.41	0.6	0.22	0.6	0.06	0.1	0.36	0.09	0.21	0.6
Sro688_g187370.1 (Contig1782.g15783)	0.02	0.08	0.05	0.05	0.07	0.31	0.29	0.3	0.2	0.65	0.35	0.88	0.62	0.81	0.57	1.0	0.39	0.41	0.49	0.73	0.79	0.15	0.12	0.25	0.31	0.21	0.53
Sro693_g188290.1 (Contig3212.g25394)	0.03	0.28	0.21	0.2	0.11	0.25	0.45	0.27	0.18	0.6	0.68	0.61	0.45	0.46	0.59	0.9	0.43	0.89	1.0	0.76	0.71	0.34	0.17	0.37	0.36	0.4	0.63
Sro6_g005130.1 (Contig175.g2018)	0.01	0.59	0.38	0.47	0.47	0.46	0.33	0.25	0.22	0.73	0.66	0.8	0.87	1.0	0.75	0.81	0.79	0.63	0.82	0.96	0.7	0.46	0.21	0.31	0.3	0.41	0.53
Sro700_g189610.1 (Contig1498.g13678)	0.09	0.48	0.46	0.66	0.58	0.43	0.39	0.48	0.37	0.82	0.74	0.98	0.81	0.65	0.79	0.97	0.51	0.8	0.95	0.92	1.0	0.27	0.27	0.47	0.38	0.42	0.84
Sro714_g191700.1 (Contig596.g7423)	0.03	0.24	0.15	0.22	0.17	0.26	0.29	0.19	0.09	0.61	0.54	0.7	0.48	0.62	0.67	1.0	0.43	0.41	0.42	0.65	0.63	0.07	0.08	0.26	0.29	0.28	0.61
Sro71_g039440.1 (Contig2582.g20967)	0.21	0.08	0.06	0.06	0.06	0.11	0.26	0.18	0.08	0.48	0.52	0.56	0.25	0.39	0.44	1.0	0.3	0.29	0.46	0.46	0.63	0.1	0.09	0.34	0.31	0.26	0.38
Sro720_g192690.1 (Contig2421.g19830)	0.01	0.19	0.18	0.19	0.16	0.4	0.53	0.36	0.21	0.6	1.0	0.66	0.91	0.87	0.7	0.63	0.62	0.83	0.94	0.91	0.59	0.18	0.15	0.61	0.29	0.43	0.71
Sro729_g193820.1 (Contig1259.g11777)	0.03	0.48	0.37	0.28	0.38	0.65	0.57	0.5	0.42	0.8	0.58	1.0	0.81	0.78	0.84	0.98	0.74	0.38	0.52	0.87	0.89	0.27	0.26	0.5	0.34	0.34	0.74
Sro72_g039650.1 (Contig1459.g13364)	0.17	0.14	0.16	0.2	0.16	0.19	0.33	0.39	0.27	0.54	1.0	0.61	0.44	0.4	0.56	0.69	0.64	0.5	0.44	0.63	0.53	0.05	0.18	0.37	0.49	0.22	0.57
Sro733_g194580.1 (Contig4267.g32291)	0.04	0.34	0.2	0.23	0.36	0.29	0.2	0.18	0.1	0.68	0.66	0.83	0.83	0.54	0.57	0.77	0.6	0.36	0.74	1.0	0.57	0.17	0.09	0.26	0.34	0.33	0.72
Sro79_g042750.1 (Contig1826.g16082)	0.06	0.2	0.29	0.18	0.18	0.18	0.29	0.23	0.32	0.55	0.35	0.69	0.61	0.71	0.51	1.0	0.36	0.54	0.72	0.64	0.7	0.33	0.25	0.22	0.26	0.22	0.43
Sro8_g006450.1 (Contig89.g958)	0.04	0.2	0.12	0.2	0.17	0.35	0.35	0.25	0.14	0.61	0.76	0.71	0.45	0.64	0.64	1.0	0.69	0.68	0.79	0.54	0.6	0.24	0.2	0.51	0.53	0.52	0.66
Sro910_g219160.1 (Contig1356.g12508)	0.04	0.12	0.09	0.08	0.1	0.24	0.28	0.18	0.1	0.49	0.56	0.57	0.38	0.58	0.67	1.0	0.34	0.63	0.51	0.61	0.58	0.03	0.07	0.26	0.12	0.12	0.58
Sro985_g228030.1 (Contig762.g8655)	0.01	0.38	0.32	0.41	0.42	0.3	0.24	0.15	0.15	0.63	0.6	0.81	1.0	0.87	0.56	0.7	0.79	0.54	0.61	0.94	0.53	0.16	0.23	0.19	0.15	0.25	0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)