Heatmap: Cluster_252 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1026_g232930.1 (Contig4072.g31229)
0.24 16.02 10.02 18.03 17.33 26.11 34.86 23.15 11.51 52.27 43.45 58.6 33.11 68.04 51.91 77.38 54.88 43.85 40.76 49.34 53.31 22.07 16.36 36.1 42.47 45.14 53.14
Sro103_g052430.1 (Contig308.g4040)
1.24 2.06 1.82 2.35 2.51 5.91 7.12 6.92 2.03 18.28 21.54 26.01 14.24 9.48 16.26 22.89 17.25 10.66 13.84 17.17 22.12 5.17 1.15 8.31 12.2 6.85 17.6
Sro103_g052450.1 (Contig308.g4042)
1.71 1.23 1.34 0.74 0.93 4.51 5.72 3.04 1.89 10.75 9.52 11.49 6.45 8.08 10.36 15.07 8.17 8.86 8.35 12.07 10.51 0.54 1.27 7.01 8.29 5.27 11.58
Sro1049_g235440.1 (Contig3572.g27599)
0.29 0.96 0.74 0.61 0.82 1.36 2.17 1.5 0.96 4.26 2.94 5.27 4.27 5.79 4.43 7.69 2.24 4.21 4.82 3.89 5.36 1.87 0.56 2.15 2.13 2.23 3.91
Sro1060_g236710.1 (Contig1660.g14964)
0.59 0.48 0.22 0.16 0.14 7.24 9.75 5.47 1.57 11.56 15.58 13.48 9.62 12.74 16.44 19.34 12.39 16.33 7.08 10.02 12.38 0.83 2.0 16.34 10.99 9.88 10.13
Sro1152_g246880.1 (Contig333.g4428)
0.69 21.76 22.2 29.08 26.87 45.15 59.48 43.25 32.61 76.82 98.55 100.44 70.88 49.61 79.36 78.35 61.03 56.4 75.45 75.02 101.79 29.07 27.16 83.38 100.14 57.51 98.21
Sro1168_g248540.1 (Contig1520.g13876)
0.11 0.24 0.14 0.07 0.11 0.92 1.25 0.39 0.05 3.42 2.78 4.2 1.83 3.7 2.69 6.84 1.61 1.54 2.89 2.72 3.64 0.3 0.1 1.09 1.37 1.85 2.91
Sro1238_g255200.1 (Contig4178.g31867)
0.82 3.28 2.06 0.98 1.06 6.81 4.67 2.56 1.38 10.68 8.12 15.01 11.18 7.51 10.01 14.08 4.03 7.13 7.18 12.91 11.36 0.6 0.86 5.73 3.33 3.41 10.53
Sro1256_g256640.1 (Contig2043.g17569)
0.57 0.83 0.64 0.28 0.16 1.3 5.59 2.31 1.16 8.07 6.15 9.68 4.66 8.0 6.07 11.85 7.3 5.61 4.25 8.08 9.45 0.7 1.19 3.33 4.24 2.44 6.89
Sro13_g009940.1 (Contig337.g4535)
0.07 0.84 0.58 0.6 0.44 0.72 2.98 1.18 1.04 4.99 3.11 6.2 3.83 4.65 4.53 7.12 3.14 2.55 2.71 7.64 5.95 0.44 0.76 1.94 3.35 1.01 4.38
Sro1406_g269920.1 (Contig4418.g33200)
1.91 7.09 3.1 1.99 2.5 23.27 23.6 19.86 7.54 28.84 48.71 24.86 30.8 37.94 46.03 41.25 37.63 46.98 38.41 37.64 30.17 4.52 7.82 31.0 16.85 14.68 33.78
Sro152_g069410.1 (Contig69.g701)
1.55 1.59 0.87 0.3 0.74 2.02 3.37 2.28 1.84 5.25 4.31 8.18 2.84 3.66 4.46 6.07 1.96 5.25 5.54 5.62 5.49 0.33 0.86 3.04 2.61 2.45 4.94
Sro171_g075800.1 (Contig113.g1289)
4.98 1.55 0.73 1.26 1.34 5.38 7.29 6.17 4.88 18.21 40.08 22.18 14.78 26.49 20.06 21.48 15.41 21.23 29.11 18.18 18.34 2.15 4.14 10.63 1.22 6.38 21.5
Sro1771_g296660.1 (Contig3831.g29380)
0.05 0.39 0.4 0.2 0.16 1.33 1.21 0.9 0.49 2.13 1.56 3.65 2.83 1.81 2.36 2.38 1.07 2.25 1.97 3.09 2.05 0.33 0.34 0.95 0.18 0.74 2.09
Sro1864_g302380.1 (Contig4441.g33343)
0.94 4.81 5.23 4.59 3.37 3.38 5.93 2.82 1.47 15.68 14.08 21.2 22.49 29.75 18.85 34.04 8.49 8.59 10.71 12.64 20.39 1.68 1.89 8.04 1.78 1.86 15.59
Sro191_g082060.1 (Contig2614.g21199)
1.04 2.32 3.38 5.25 5.27 10.48 15.99 10.65 10.51 30.28 38.67 38.11 28.1 31.02 27.97 42.46 29.5 21.24 24.32 32.65 34.52 11.29 10.35 14.38 17.85 26.11 25.99
Sro2370_g325160.1 (Contig2982.g23689)
0.02 0.32 0.38 0.51 0.35 2.26 0.81 0.41 0.0 3.08 3.46 5.31 2.66 4.81 3.73 3.11 3.14 2.79 2.68 3.84 4.05 0.0 0.0 3.02 1.49 1.29 4.1
Sro2422_g327200.1 (Contig2242.g18612)
0.24 1.18 0.66 1.46 1.36 3.0 8.28 4.11 2.83 14.79 14.53 18.11 16.65 23.36 16.51 22.77 14.12 9.44 10.76 17.62 21.64 3.2 2.85 6.9 6.97 9.1 13.81
Sro2489_g329120.1 (Contig4353.g32811)
0.19 0.26 0.37 0.76 0.67 2.08 3.31 2.7 1.17 7.99 6.31 10.26 13.62 12.44 7.96 9.17 5.93 7.33 7.21 12.84 12.54 1.03 1.44 2.75 1.21 4.07 6.73
Sro256_g100700.1 (Contig3587.g27715)
0.24 3.77 2.95 4.32 5.21 10.02 15.91 11.7 5.02 26.61 28.26 31.8 25.92 34.89 23.68 31.26 27.16 15.02 19.95 33.84 23.92 4.33 4.67 14.26 14.27 19.53 28.98
Sro256_g100720.1 (Contig3587.g27717)
0.05 3.6 4.75 4.46 3.33 4.18 6.17 2.9 2.68 9.88 8.21 11.38 12.02 12.15 10.25 11.57 6.9 5.91 6.79 14.27 13.69 2.37 1.48 6.93 4.47 3.6 7.47
Sro261_g101830.1 (Contig3068.g24455)
0.54 0.72 0.64 0.75 0.78 0.86 1.98 1.43 0.77 5.53 5.44 8.0 2.13 6.46 4.99 10.03 3.8 3.08 4.25 4.82 4.93 1.7 1.07 4.16 1.36 2.39 4.98
1.27 2.92 1.3 1.82 3.27 9.63 9.56 5.89 2.67 21.12 21.83 28.39 20.55 30.58 25.79 34.37 16.79 19.98 16.53 23.93 27.55 2.18 2.55 15.05 11.66 13.36 21.94
Sro2791_g337200.1 (Contig2507.g20517)
0.43 2.61 2.54 1.42 1.78 2.93 4.11 2.01 0.73 7.28 8.39 10.32 9.28 6.35 8.3 16.53 7.88 6.35 7.53 8.08 4.78 0.82 0.99 5.61 3.75 3.03 4.69
Sro27_g018450.1 (Contig3926.g30106)
0.29 1.14 0.34 0.56 0.79 1.62 2.39 1.62 1.12 3.82 4.1 4.47 1.95 2.99 3.72 4.66 2.25 4.6 5.47 4.1 4.34 0.78 1.01 1.69 0.6 1.17 4.3
Sro2852_g338610.1 (Contig1583.g14373)
0.23 1.6 0.46 0.95 0.77 1.34 2.02 1.22 0.72 3.9 2.75 5.63 4.57 3.43 3.28 3.59 1.96 2.77 3.53 7.28 3.91 0.43 0.47 1.42 1.12 1.14 2.9
Sro289_g109080.1 (Contig4471.g33592)
6.1 16.24 15.18 14.65 14.84 14.26 24.97 20.73 17.5 44.07 51.25 43.46 48.75 51.18 49.06 84.68 36.42 43.73 47.67 54.73 33.91 18.35 17.53 26.43 21.53 22.3 47.98
Sro2906_g340000.1 (Contig4174.g31839)
1.67 1.13 1.03 1.03 0.88 2.26 3.79 2.68 2.07 7.78 7.45 10.45 4.72 5.43 6.6 11.54 4.5 5.12 7.24 7.76 7.06 1.48 1.87 4.64 3.62 2.39 6.62
Sro300_g111590.1 (Contig270.g3447)
0.72 1.71 1.13 2.21 1.56 4.43 7.19 5.18 3.34 15.12 19.76 17.63 7.16 12.15 15.47 28.37 12.24 12.68 12.49 10.2 16.07 2.7 2.83 7.42 4.92 6.25 16.17
Sro3011_g342100.1 (Contig2595.g21051)
2.02 2.89 3.44 3.31 2.28 3.27 3.18 1.43 0.95 8.6 8.13 10.96 13.71 10.95 10.8 17.99 6.63 4.41 5.44 8.62 11.7 0.65 0.58 6.87 7.21 4.9 6.5
Sro328_g118740.1 (Contig3574.g27629)
0.59 4.63 2.69 4.3 4.26 5.54 8.29 8.16 3.59 12.8 13.85 17.32 4.58 4.09 9.58 17.69 9.4 18.85 11.16 7.39 12.12 1.49 1.8 9.28 5.17 4.88 14.21
Sro331_g119170.1 (Contig3186.g25154)
0.14 0.78 0.64 0.32 0.3 2.93 4.76 5.13 1.81 8.72 8.06 9.51 12.11 10.84 9.26 11.6 6.99 7.54 7.9 10.98 12.02 1.81 1.56 5.63 7.76 5.11 7.84
Sro341_g121360.1 (Contig3952.g30268)
14.39 140.37 70.55 120.61 117.85 189.55 199.98 114.28 98.54 241.8 305.98 239.28 223.7 341.01 318.48 401.35 282.96 276.33 257.09 229.03 246.32 66.4 135.3 201.69 221.45 217.83 230.51
Sro348_g123180.1 (Contig2346.g19284)
0.14 0.8 1.08 0.78 0.74 2.07 2.87 2.39 2.24 5.5 4.05 6.23 6.39 7.03 5.28 9.47 3.9 6.39 7.59 7.51 5.72 1.01 1.09 2.43 1.81 2.28 4.47
Sro373_g129100.1 (Contig1347.g12395)
0.06 0.26 0.11 0.11 0.05 0.79 1.79 0.75 0.35 2.75 2.17 3.3 2.41 1.21 2.36 2.73 1.72 1.8 3.1 2.94 3.25 0.33 0.15 1.68 1.47 1.24 2.9
Sro376_g129790.1 (Contig3640.g28129)
0.44 0.92 0.68 0.87 0.9 7.97 10.31 7.29 2.31 34.3 27.93 36.15 8.88 18.78 38.4 65.74 19.27 37.13 29.61 43.14 43.03 3.46 1.67 15.67 15.2 16.03 48.41
Sro417_g138700.1 (Contig2416.g19778)
0.05 0.21 0.21 0.24 0.24 1.05 1.34 1.11 1.12 3.37 7.01 4.05 3.76 4.79 3.34 3.31 2.74 2.69 4.29 5.02 3.31 0.37 0.5 1.69 0.12 0.7 3.94
Sro41_g025210.1 (Contig169.g1927)
0.24 8.51 5.17 9.38 9.98 25.59 23.23 18.35 5.45 41.17 44.73 40.56 22.66 53.41 44.79 59.3 36.24 30.97 31.74 48.64 29.81 11.56 5.32 31.7 23.86 30.89 47.68
Sro4357_g353820.1 (Contig3303.g25902)
0.1 0.1 0.19 0.05 0.04 1.3 2.7 1.33 0.8 4.55 4.66 6.75 4.42 5.62 5.47 6.38 3.91 2.32 1.82 5.46 6.98 0.04 0.78 1.78 2.31 1.78 3.79
Sro46_g027380.1 (Contig1636.g14728)
1.19 0.2 0.57 0.51 0.69 0.97 1.36 0.68 0.97 3.5 5.82 4.53 5.06 1.99 4.2 6.52 2.66 2.14 2.45 3.16 4.8 0.06 0.54 0.96 1.91 0.79 4.6
Sro482_g151850.1 (Contig232.g2795)
0.28 2.1 1.54 0.99 1.56 2.57 2.75 1.87 0.85 4.46 1.89 5.27 3.88 4.56 4.41 7.37 0.86 3.33 4.93 5.43 4.96 1.19 0.69 1.91 2.55 2.21 4.25
Sro4_g003840.1 (Contig3815.g29302)
0.73 7.47 2.95 2.23 4.37 11.25 6.51 4.53 2.13 18.51 19.51 19.08 10.15 26.65 21.0 23.72 17.65 23.71 28.97 23.02 17.49 8.93 4.34 10.68 3.3 10.99 22.87
Sro549_g164580.1 (Contig1749.g15563)
0.7 7.46 4.31 6.74 10.34 24.9 29.4 18.75 8.97 32.0 47.15 37.12 29.95 42.48 47.87 56.44 42.79 38.39 17.8 25.12 28.23 9.13 11.24 32.74 22.49 17.72 32.08
Sro572_g168820.1 (Contig1817.g16011)
0.01 0.08 0.0 0.09 0.07 1.61 2.33 1.21 1.19 6.01 5.31 7.82 10.21 6.92 6.54 9.27 4.64 5.63 5.51 9.93 7.19 0.4 0.5 2.68 1.83 1.92 4.56
Sro5_g004300.1 (Contig4001.g30745)
0.24 2.21 0.88 1.13 1.0 0.86 1.5 0.72 0.94 3.37 2.68 4.44 1.61 2.66 2.88 7.97 1.86 3.47 3.99 4.1 3.9 0.49 0.48 0.89 1.33 1.48 2.3
Sro638_g179530.1 (Contig628.g7616)
0.08 0.8 0.78 0.28 0.21 2.18 3.7 1.93 0.94 6.35 6.65 7.23 2.96 4.23 5.36 6.15 5.12 6.4 5.81 6.31 6.29 0.54 0.58 4.0 4.19 3.39 7.1
Sro685_g186890.1 (Contig1991.g17044)
0.09 1.03 0.78 1.01 0.37 2.61 3.22 1.49 2.06 8.72 14.26 13.71 6.08 11.08 12.46 17.47 5.25 7.21 10.44 3.89 10.4 1.12 1.77 6.26 1.49 3.63 10.5
Sro688_g187370.1 (Contig1782.g15783)
0.22 0.74 0.41 0.43 0.6 2.74 2.56 2.71 1.8 5.73 3.13 7.78 5.49 7.15 5.1 8.88 3.47 3.65 4.32 6.44 7.01 1.31 1.03 2.18 2.77 1.87 4.66
Sro693_g188290.1 (Contig3212.g25394)
0.24 2.6 1.99 1.84 1.01 2.29 4.22 2.52 1.73 5.57 6.38 5.67 4.21 4.28 5.53 8.42 4.0 8.34 9.34 7.08 6.64 3.18 1.62 3.49 3.41 3.76 5.92
Sro6_g005130.1 (Contig175.g2018)
0.09 6.43 4.15 5.12 5.07 4.96 3.56 2.67 2.39 7.88 7.16 8.65 9.4 10.86 8.17 8.82 8.62 6.83 8.93 10.39 7.6 4.95 2.28 3.41 3.24 4.46 5.75
Sro700_g189610.1 (Contig1498.g13678)
5.77 31.29 29.47 42.92 37.46 28.05 24.96 31.26 23.91 52.69 47.51 63.14 52.44 41.81 50.91 62.38 32.7 51.92 61.17 59.43 64.58 17.59 17.75 30.36 24.71 27.21 54.37
Sro714_g191700.1 (Contig596.g7423)
0.67 5.07 3.14 4.52 3.55 5.54 6.04 3.91 1.83 12.74 11.31 14.58 10.01 13.07 14.01 20.91 8.97 8.63 8.87 13.53 13.12 1.52 1.77 5.41 6.1 5.92 12.7
Sro71_g039440.1 (Contig2582.g20967)
4.88 1.74 1.42 1.37 1.36 2.55 5.83 4.05 1.92 10.9 11.75 12.62 5.69 8.91 10.07 22.7 6.76 6.67 10.52 10.42 14.37 2.37 2.11 7.67 7.13 5.8 8.58
Sro720_g192690.1 (Contig2421.g19830)
0.08 2.56 2.35 2.49 2.12 5.29 7.04 4.78 2.84 7.98 13.21 8.7 12.08 11.54 9.23 8.26 8.24 10.97 12.44 12.0 7.73 2.44 1.94 8.11 3.86 5.64 9.36
Sro729_g193820.1 (Contig1259.g11777)
0.29 5.27 4.03 3.07 4.08 7.11 6.21 5.41 4.53 8.7 6.33 10.88 8.86 8.45 9.11 10.62 8.01 4.18 5.68 9.42 9.69 2.94 2.79 5.43 3.69 3.73 8.03
Sro72_g039650.1 (Contig1459.g13364)
124.81 103.31 120.31 144.7 115.2 138.79 246.84 291.11 202.89 402.96 741.92 449.1 326.95 299.04 417.25 511.41 472.14 369.08 322.82 465.24 393.15 38.66 137.21 274.49 364.06 164.17 420.45
Sro733_g194580.1 (Contig4267.g32291)
0.53 4.84 2.88 3.22 5.05 4.15 2.75 2.57 1.43 9.55 9.35 11.72 11.74 7.64 8.09 10.78 8.47 5.07 10.37 14.08 8.02 2.39 1.21 3.66 4.72 4.62 10.11
Sro79_g042750.1 (Contig1826.g16082)
2.3 7.62 10.86 6.85 6.83 6.7 10.84 8.57 11.98 20.86 13.3 26.05 23.14 26.77 19.42 37.89 13.55 20.39 27.15 24.21 26.62 12.41 9.43 8.44 9.88 8.36 16.2
Sro8_g006450.1 (Contig89.g958)
2.96 16.52 10.29 16.58 14.45 29.16 29.01 20.73 11.21 50.3 62.82 59.31 37.17 53.32 53.12 82.99 57.19 56.84 65.64 44.95 50.06 19.8 16.45 42.42 44.3 42.88 54.63
Sro910_g219160.1 (Contig1356.g12508)
1.35 3.96 3.02 2.53 3.15 7.8 9.12 5.79 3.39 16.03 18.27 18.62 12.38 18.94 21.92 32.7 11.08 20.58 16.77 19.82 19.04 0.9 2.42 8.56 3.93 4.01 18.93
Sro985_g228030.1 (Contig762.g8655)
0.18 6.4 5.44 6.89 7.09 5.1 3.99 2.59 2.59 10.72 10.2 13.66 16.96 14.8 9.56 11.79 13.32 9.17 10.41 15.88 8.94 2.72 3.84 3.25 2.52 4.15 9.89

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)