Heatmap: Cluster_317 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230830.1 (Contig4560.g34048)	0.0	0.55	0.47	0.6	0.51	0.28	0.42	0.2	0.33	0.46	0.65	0.63	0.87	0.55	0.57	0.58	1.0	0.46	0.48	0.75	0.42	0.2	0.27	0.36	0.27	0.43	0.36
Sro1010_g230840.1 (Contig4560.g34049)	0.0	0.2	0.26	0.42	0.26	0.27	0.3	0.24	0.2	0.45	0.86	0.77	1.0	0.69	0.58	0.42	0.7	0.45	0.65	0.71	0.37	0.04	0.21	0.33	0.18	0.37	0.39
Sro101_g051520.1 (Contig348.g4705)	0.03	0.92	0.87	0.71	0.56	0.28	0.52	0.34	0.53	0.7	0.72	0.94	0.91	0.94	0.68	0.84	0.63	0.79	1.0	0.89	0.82	0.49	0.42	0.31	0.21	0.41	0.59
Sro102_g052140.1 (Contig319.g4258)	0.01	0.86	0.67	0.66	0.59	0.26	0.52	0.43	0.59	0.57	0.68	0.7	1.0	0.7	0.42	0.53	0.61	0.48	0.68	0.74	0.58	0.3	0.59	0.32	0.38	0.52	0.38
Sro1223_g253870.1 (Contig4600.g34349)	0.1	0.46	0.41	0.22	0.22	0.22	0.42	0.41	0.45	0.59	0.46	0.77	1.0	0.72	0.51	0.55	0.35	0.43	0.71	0.89	0.71	0.26	0.39	0.56	0.48	0.39	0.38
Sro123_g059460.1 (Contig66.g635)	0.0	0.37	0.39	0.54	0.44	0.16	0.22	0.17	0.24	0.44	0.44	0.57	1.0	0.6	0.48	0.74	0.68	0.47	0.37	0.81	0.56	0.32	0.22	0.17	0.3	0.26	0.29
Sro1257_g256720.1 (Contig743.g8496)	0.03	0.58	0.51	0.5	0.43	0.17	0.22	0.24	0.19	0.58	0.52	0.7	0.39	0.3	0.39	0.77	0.49	0.85	1.0	0.66	0.6	0.34	0.17	0.11	0.1	0.2	0.39
Sro130_g061931.1	0.0	0.66	1.0	0.36	0.28	0.19	0.34	0.19	0.12	0.42	0.43	0.37	0.38	0.3	0.4	0.42	0.35	0.4	0.44	0.66	0.54	0.13	0.12	0.32	0.4	0.32	0.43
Sro136_g064050.1 (Contig2000.g17116)	0.08	0.49	0.33	0.38	0.25	0.26	0.55	0.3	0.33	0.62	1.0	0.71	0.74	0.57	0.62	0.59	0.78	0.58	0.46	0.84	0.93	0.33	0.3	0.56	0.36	0.39	0.46
Sro1375_g267360.1 (Contig4583.g34246)	0.2	0.58	0.72	0.62	0.49	0.33	0.39	0.4	0.37	0.6	0.77	0.59	0.76	0.68	0.45	0.24	0.88	0.32	0.4	1.0	0.57	0.38	0.33	0.33	0.33	0.34	0.32
Sro1558_g282360.1 (Contig208.g2495)	0.02	0.44	0.35	0.49	0.51	0.32	0.41	0.31	0.31	0.6	0.51	0.71	0.71	1.0	0.51	0.66	0.58	0.42	0.47	0.7	0.73	0.4	0.34	0.34	0.47	0.46	0.38
Sro161_g072370.1 (Contig3982.g30578)	0.0	1.0	0.84	0.82	0.76	0.17	0.23	0.16	0.24	0.52	0.41	0.55	0.89	0.48	0.34	0.32	0.36	0.28	0.38	0.62	0.51	0.22	0.25	0.16	0.32	0.22	0.5
Sro163_g073150.1 (Contig1793.g15848)	0.0	0.22	0.21	0.36	0.22	0.23	0.23	0.16	0.3	0.47	0.43	0.62	0.58	0.7	0.41	0.36	1.0	0.5	0.59	0.66	0.67	0.26	0.27	0.18	0.17	0.39	0.28
Sro1711_g292870.1 (Contig3721.g28605)	0.23	1.0	1.0	0.8	0.65	0.37	0.42	0.27	0.32	0.7	0.58	0.89	0.59	0.9	0.53	0.52	0.63	0.47	0.72	0.66	0.77	0.24	0.29	0.69	0.27	0.29	0.51
Sro1765_g296200.1 (Contig1144.g10955)	0.02	1.0	0.96	0.69	0.47	0.33	0.49	0.18	0.29	0.68	0.6	0.76	0.92	0.58	0.56	0.54	0.72	0.43	0.64	0.99	0.81	0.11	0.24	0.37	0.3	0.36	0.41
Sro1828_g300180.1 (Contig4573.g34139)	0.01	0.43	0.39	0.51	0.49	0.21	0.43	0.28	0.62	0.64	0.66	0.79	0.93	0.97	0.58	0.85	0.66	0.46	0.56	1.0	0.73	0.4	0.57	0.27	0.31	0.43	0.44
Sro18_g012850.2	0.22	0.59	0.59	0.59	0.56	0.21	0.46	0.29	0.35	0.61	0.63	0.74	0.89	0.54	0.59	0.63	0.37	0.58	0.74	1.0	0.58	0.24	0.37	0.4	0.1	0.34	0.54
Sro1943_g306840.1 (Contig3086.g24596)	0.03	0.45	0.24	0.32	0.37	0.31	0.2	0.12	0.21	0.32	0.48	0.35	1.0	0.37	0.33	0.23	0.72	0.17	0.22	0.95	0.35	0.08	0.22	0.17	0.18	0.17	0.23
Sro216_g089340.1 (Contig227.g2711)	0.16	0.43	0.53	0.74	0.6	0.29	0.28	0.23	0.42	0.46	0.57	0.67	1.0	0.59	0.4	0.4	0.51	0.16	0.26	0.56	0.47	0.26	0.28	0.23	0.16	0.18	0.37
Sro2224_g319750.1 (Contig559.g7106)	0.06	0.75	0.88	0.8	0.78	0.39	0.48	0.32	0.49	0.72	0.49	0.77	1.0	0.88	0.59	0.85	0.6	0.48	0.66	1.0	0.72	0.48	0.43	0.39	0.53	0.5	0.45
Sro2397_g326070.1 (Contig2368.g19494)	0.0	0.71	0.78	0.64	0.59	0.33	0.55	0.33	0.74	0.66	0.75	0.84	0.91	1.0	0.55	0.54	0.96	0.37	0.42	0.92	0.78	0.34	0.54	0.41	0.37	0.42	0.55
Sro254_g100140.1 (Contig387.g5209)	0.0	0.56	0.57	0.4	0.57	0.27	0.23	0.16	0.32	0.55	0.4	0.54	1.0	0.8	0.44	0.5	0.46	0.25	0.56	0.78	0.41	0.2	0.27	0.14	0.14	0.23	0.43
Sro26_g017750.1 (Contig2432.g19946)	0.07	0.36	0.21	0.32	0.36	0.54	0.45	0.39	0.63	0.56	0.9	0.79	1.0	0.76	0.68	0.42	0.96	0.47	0.62	0.73	0.44	0.16	0.48	0.3	0.25	0.3	0.52
Sro271_g104700.1 (Contig2573.g20903)	0.0	0.33	0.49	0.39	0.27	0.11	0.25	0.2	0.3	0.35	0.34	0.39	1.0	0.44	0.32	0.33	0.36	0.24	0.37	0.77	0.32	0.13	0.22	0.18	0.11	0.11	0.23
Sro3009_g342060.1 (Contig1048.g10331)	0.01	0.3	0.34	0.43	0.41	0.18	0.27	0.2	0.23	0.35	0.35	0.48	1.0	0.42	0.31	0.25	0.35	0.16	0.25	0.64	0.32	0.24	0.2	0.2	0.11	0.15	0.19
Sro3059_g342930.1 (Contig2601.g21072)	0.01	0.59	0.61	0.7	0.57	0.17	0.43	0.35	0.31	0.66	0.64	0.87	0.84	0.63	0.6	0.64	0.62	0.35	0.45	1.0	0.83	0.41	0.32	0.4	0.58	0.45	0.48
Sro30_g019430.1 (Contig3962.g30343)	0.01	0.55	0.33	0.41	0.36	0.39	0.49	0.33	0.41	0.67	0.73	0.8	0.73	0.97	0.66	0.6	1.0	0.28	0.43	0.64	0.8	0.25	0.36	0.56	0.43	0.46	0.59
Sro30_g019630.1 (Contig3962.g30363)	0.02	0.6	0.63	0.79	0.76	0.23	0.38	0.23	0.2	0.6	0.55	0.74	1.0	0.77	0.58	0.62	0.69	0.3	0.49	0.95	0.72	0.31	0.26	0.39	0.41	0.33	0.34
Sro3408_g347690.1 (Contig1147.g10958)	0.01	0.5	0.58	0.49	0.47	0.39	0.33	0.29	0.45	0.54	0.58	0.63	1.0	0.57	0.37	0.4	0.54	0.3	0.41	0.74	0.59	0.19	0.31	0.31	0.55	0.29	0.39
Sro353_g124460.1 (Contig1923.g16580)	0.03	0.62	0.7	0.62	0.48	0.47	0.58	0.52	0.53	0.83	0.86	0.88	0.95	0.79	0.74	0.93	0.66	0.41	0.55	1.0	0.87	0.49	0.48	0.68	0.74	0.64	0.61
Sro361_g126660.1 (Contig1094.g10591)	0.01	0.66	0.54	0.67	0.62	0.2	0.44	0.29	0.33	0.61	0.65	0.74	1.0	0.57	0.69	0.65	0.88	0.52	0.76	0.9	0.73	0.24	0.32	0.29	0.37	0.38	0.5
Sro372_g128810.1 (Contig2891.g23061)	0.03	0.41	0.35	0.44	0.38	0.22	0.33	0.25	0.32	0.44	0.51	0.6	1.0	0.39	0.43	0.59	0.66	0.36	0.34	0.86	0.42	0.16	0.25	0.21	0.17	0.14	0.27
Sro378_g130310.1 (Contig2744.g22074)	0.03	0.52	0.46	0.54	0.49	0.19	0.67	0.48	0.6	0.66	0.44	0.62	0.9	0.67	0.54	0.86	0.4	0.73	0.9	1.0	0.86	0.45	0.57	0.28	0.21	0.31	0.44
Sro407_g136680.1 (Contig2478.g20259)	0.01	0.7	0.78	0.89	0.79	0.32	0.29	0.23	0.18	0.64	0.52	0.76	0.54	0.75	0.61	0.67	0.83	0.59	0.68	1.0	0.66	0.34	0.26	0.42	0.3	0.59	0.52
Sro450_g145490.1 (Contig271.g3474)	0.01	0.75	0.78	0.9	0.72	0.29	0.6	0.54	0.75	0.65	0.94	0.69	0.99	0.74	0.68	0.55	0.86	0.36	0.49	1.0	0.6	0.28	0.5	0.64	0.56	0.47	0.62
Sro483_g152060.1 (Contig4159.g31758)	0.03	0.83	0.55	0.64	0.6	0.33	0.52	0.38	0.51	0.66	0.75	0.69	1.0	0.8	0.67	0.87	0.94	0.71	0.76	0.98	0.83	0.43	0.46	0.43	0.46	0.48	0.5
Sro488_g153180.1 (Contig4435.g33285)	0.06	0.91	1.0	0.47	0.41	0.21	0.35	0.18	0.17	0.52	0.39	0.54	0.5	0.57	0.5	0.8	0.47	0.52	0.52	0.66	0.59	0.28	0.19	0.34	0.25	0.34	0.38
Sro499_g155080.1 (Contig989.g10010)	0.01	0.49	0.47	0.44	0.48	0.36	0.28	0.24	0.33	0.46	0.43	0.57	1.0	0.54	0.44	0.36	0.69	0.23	0.43	0.78	0.45	0.24	0.22	0.21	0.18	0.28	0.26
Sro518_g158780.1 (Contig3565.g27533)	0.0	1.0	0.87	0.81	0.69	0.52	0.5	0.28	0.44	0.68	0.57	0.78	0.8	0.7	0.64	0.63	0.61	0.6	0.79	0.9	0.87	0.35	0.36	0.48	0.48	0.5	0.47
Sro534_g161740.1 (Contig3269.g25739)	0.01	1.0	0.98	0.7	0.51	0.16	0.32	0.2	0.31	0.66	0.6	0.81	0.52	0.56	0.5	0.67	0.56	0.64	0.87	0.85	0.69	0.42	0.24	0.34	0.34	0.31	0.47
Sro536_g162230.1 (Contig299.g3953)	0.02	0.26	0.45	0.62	0.61	0.25	0.3	0.23	0.32	0.47	0.48	0.58	1.0	0.43	0.49	0.84	0.63	0.47	0.45	0.81	0.63	0.13	0.32	0.22	0.3	0.29	0.37
Sro625_g177550.1 (Contig691.g8093)	0.01	0.43	0.42	0.33	0.28	0.21	0.25	0.19	0.28	0.34	0.48	0.41	1.0	0.71	0.41	0.37	0.8	0.31	0.45	0.67	0.41	0.34	0.26	0.18	0.1	0.13	0.26
Sro627_g177880.1 (Contig3366.g26375)	0.01	0.64	0.67	0.97	0.83	0.36	0.33	0.36	0.33	0.5	0.7	0.62	1.0	0.55	0.53	0.66	0.71	0.33	0.37	0.75	0.55	0.28	0.31	0.24	0.19	0.27	0.49
Sro696_g188830.1 (Contig116.g1323)	0.0	0.27	0.31	0.34	0.33	0.07	0.12	0.18	0.24	0.35	0.27	0.41	1.0	0.32	0.34	0.36	0.23	0.19	0.35	0.74	0.51	0.13	0.13	0.16	0.21	0.16	0.28
Sro707_g190560.1 (Contig326.g4317)	0.02	0.47	0.49	0.3	0.25	0.1	0.32	0.19	0.32	0.46	0.46	0.46	1.0	0.33	0.46	0.35	0.57	0.32	0.46	0.88	0.53	0.13	0.22	0.35	0.3	0.24	0.33
Sro753_g197460.1 (Contig4403.g33089)	0.04	0.77	0.76	0.78	0.65	0.56	0.46	0.4	0.33	0.74	0.71	0.87	1.0	0.67	0.62	0.64	0.48	0.36	0.55	0.98	0.75	0.33	0.43	0.65	0.67	0.56	0.55
Sro797_g203880.1 (Contig4746.g35164)	0.46	0.88	0.46	0.72	0.46	0.22	0.33	0.22	0.28	0.6	0.65	0.77	0.8	0.87	0.51	0.38	1.0	0.58	0.53	0.9	0.56	0.27	0.3	0.16	0.13	0.21	0.33
Sro813_g206240.1 (Contig4011.g30870)	0.01	0.86	0.68	0.62	0.45	0.29	0.36	0.23	0.42	0.6	0.65	0.64	0.85	0.62	0.58	0.74	1.0	0.5	0.52	0.87	0.63	0.38	0.38	0.34	0.19	0.33	0.39
Sro81_g043570.1 (Contig1318.g12186)	0.02	0.68	0.79	0.48	0.36	0.25	0.31	0.15	0.26	0.6	0.72	0.73	0.82	0.5	0.54	0.73	0.68	0.56	0.62	1.0	0.85	0.2	0.15	0.39	0.36	0.34	0.43
Sro882_g215330.1 (Contig1771.g15676)	0.01	0.55	0.47	0.36	0.51	0.12	0.46	0.25	0.44	0.5	0.41	0.54	1.0	0.42	0.57	0.52	0.37	0.31	0.46	0.98	0.54	0.09	0.31	0.41	0.4	0.34	0.37
Sro969_g226200.1 (Contig3546.g27394)	0.81	0.86	0.84	0.78	0.67	0.27	0.66	0.4	0.74	0.78	0.72	0.86	0.92	0.84	0.63	0.66	0.65	0.55	0.63	1.0	0.98	0.27	0.68	0.4	0.26	0.38	0.54
Sro986_g228130.1 (Contig4404.g33098)	0.02	0.61	0.51	0.5	0.41	0.3	0.42	0.43	0.85	0.57	0.66	0.86	0.78	0.4	0.48	0.4	1.0	0.29	0.5	0.63	0.43	0.23	0.62	0.29	0.24	0.35	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)