Heatmap: Cluster_317 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230830.1 (Contig4560.g34048)
0.03 6.86 5.83 7.49 6.41 3.49 5.24 2.56 4.1 5.81 8.1 7.84 10.88 6.89 7.13 7.26 12.49 5.78 5.97 9.35 5.21 2.51 3.32 4.49 3.37 5.43 4.44
Sro1010_g230840.1 (Contig4560.g34049)
0.0 2.54 3.3 5.4 3.32 3.52 3.84 3.12 2.61 5.87 11.11 9.98 12.93 8.99 7.51 5.44 9.02 5.85 8.34 9.21 4.74 0.55 2.71 4.22 2.27 4.82 5.1
Sro101_g051520.1 (Contig348.g4705)
0.62 21.52 20.44 16.72 13.15 6.58 12.14 8.07 12.55 16.41 16.81 22.06 21.46 21.99 15.9 19.84 14.86 18.45 23.5 20.99 19.24 11.52 9.82 7.38 4.84 9.56 13.86
Sro102_g052140.1 (Contig319.g4258)
0.05 7.02 5.47 5.41 4.78 2.15 4.25 3.48 4.8 4.64 5.59 5.71 8.17 5.69 3.46 4.31 5.0 3.96 5.54 6.09 4.75 2.41 4.8 2.62 3.09 4.27 3.11
Sro1223_g253870.1 (Contig4600.g34349)
1.18 5.47 4.88 2.67 2.62 2.67 5.05 4.89 5.37 6.99 5.45 9.22 11.95 8.62 6.05 6.54 4.23 5.14 8.48 10.59 8.44 3.12 4.66 6.68 5.73 4.65 4.51
Sro123_g059460.1 (Contig66.g635)
0.0 10.51 10.93 15.18 12.37 4.61 6.1 4.7 6.82 12.47 12.47 16.01 28.24 16.8 13.69 20.92 19.19 13.38 10.59 22.87 15.83 8.92 6.14 4.86 8.5 7.47 8.19
Sro1257_g256720.1 (Contig743.g8496)
0.09 2.01 1.75 1.73 1.49 0.58 0.76 0.81 0.65 2.0 1.79 2.42 1.35 1.03 1.36 2.65 1.67 2.92 3.44 2.27 2.08 1.16 0.58 0.38 0.34 0.7 1.33
0.19 31.91 48.57 17.48 13.72 9.18 16.31 9.17 5.95 20.52 20.91 17.8 18.6 14.66 19.45 20.55 16.76 19.38 21.61 32.14 26.46 6.18 5.86 15.53 19.45 15.46 20.77
Sro136_g064050.1 (Contig2000.g17116)
0.23 1.35 0.9 1.05 0.69 0.7 1.51 0.83 0.9 1.69 2.74 1.95 2.03 1.58 1.7 1.62 2.13 1.6 1.26 2.31 2.54 0.9 0.83 1.54 0.99 1.06 1.26
Sro1375_g267360.1 (Contig4583.g34246)
6.85 19.87 24.64 21.06 16.55 11.34 13.18 13.65 12.7 20.53 26.28 20.22 25.89 23.14 15.19 8.09 29.91 10.75 13.58 34.06 19.53 12.96 11.33 11.26 11.18 11.46 10.91
Sro1558_g282360.1 (Contig208.g2495)
0.89 25.49 20.2 28.6 29.43 18.43 23.7 18.21 17.72 34.66 29.64 41.1 41.01 58.11 29.83 38.52 33.54 24.46 27.1 40.89 42.2 23.26 19.49 19.8 27.53 26.81 22.22
Sro161_g072370.1 (Contig3982.g30578)
0.11 28.62 24.01 23.42 21.73 4.76 6.59 4.62 6.98 14.84 11.68 15.84 25.56 13.81 9.71 9.26 10.28 8.11 10.78 17.85 14.69 6.38 7.28 4.5 9.28 6.28 14.35
Sro163_g073150.1 (Contig1793.g15848)
0.1 4.93 4.59 7.88 4.85 5.05 5.14 3.42 6.53 10.4 9.53 13.54 12.8 15.44 9.04 7.98 22.01 10.98 13.08 14.55 14.76 5.62 5.84 3.87 3.69 8.56 6.26
Sro1711_g292870.1 (Contig3721.g28605)
2.94 12.62 12.58 10.06 8.25 4.65 5.3 3.44 4.0 8.78 7.26 11.24 7.44 11.34 6.73 6.55 7.92 5.95 9.12 8.28 9.7 2.98 3.67 8.76 3.39 3.67 6.4
Sro1765_g296200.1 (Contig1144.g10955)
0.1 5.47 5.27 3.79 2.58 1.83 2.7 0.96 1.57 3.74 3.29 4.14 5.01 3.16 3.08 2.95 3.93 2.36 3.48 5.41 4.45 0.6 1.32 2.02 1.63 1.96 2.25
Sro1828_g300180.1 (Contig4573.g34139)
0.16 9.95 8.94 11.77 11.39 4.9 9.99 6.46 14.32 14.73 15.14 18.18 21.57 22.37 13.48 19.7 15.25 10.62 12.88 23.09 16.83 9.3 13.2 6.27 7.22 10.01 10.07
2.85 7.71 7.68 7.78 7.29 2.69 6.07 3.82 4.61 7.96 8.31 9.74 11.65 7.05 7.71 8.23 4.83 7.64 9.64 13.11 7.64 3.15 4.8 5.18 1.28 4.41 7.11
Sro1943_g306840.1 (Contig3086.g24596)
0.55 8.49 4.6 6.11 7.01 5.83 3.84 2.21 3.92 6.12 9.11 6.64 19.02 7.1 6.21 4.37 13.77 3.3 4.25 18.14 6.58 1.59 4.1 3.23 3.35 3.24 4.39
Sro216_g089340.1 (Contig227.g2711)
6.43 16.96 20.82 29.32 23.53 11.31 10.89 8.94 16.46 18.31 22.44 26.36 39.46 23.24 15.66 15.64 20.16 6.36 10.39 22.26 18.47 10.25 11.24 9.17 6.48 7.08 14.42
Sro2224_g319750.1 (Contig559.g7106)
4.03 47.74 55.9 50.67 49.74 24.82 30.28 20.28 30.91 45.97 31.15 48.72 63.42 56.1 37.4 54.25 38.32 30.57 41.8 63.6 45.77 30.72 27.05 25.05 33.84 31.87 28.73
Sro2397_g326070.1 (Contig2368.g19494)
0.06 11.61 12.81 10.53 9.72 5.51 9.08 5.52 12.23 10.93 12.36 13.85 14.97 16.47 9.1 8.89 15.81 6.06 6.86 15.17 12.82 5.6 8.94 6.69 6.08 6.94 9.04
Sro254_g100140.1 (Contig387.g5209)
0.12 13.02 13.41 9.41 13.39 6.31 5.49 3.81 7.42 12.81 9.44 12.62 23.35 18.69 10.29 11.65 10.78 5.85 12.98 18.22 9.6 4.71 6.2 3.3 3.34 5.34 9.94
Sro26_g017750.1 (Contig2432.g19946)
0.83 4.29 2.44 3.77 4.18 6.34 5.26 4.59 7.41 6.54 10.58 9.34 11.75 8.88 7.94 4.95 11.34 5.5 7.3 8.53 5.22 1.89 5.63 3.49 2.97 3.51 6.09
Sro271_g104700.1 (Contig2573.g20903)
0.07 8.02 11.71 9.38 6.41 2.67 5.94 4.72 7.14 8.32 8.06 9.27 23.96 10.45 7.69 7.79 8.69 5.85 8.94 18.56 7.66 3.16 5.34 4.27 2.67 2.69 5.53
Sro3009_g342060.1 (Contig1048.g10331)
0.2 8.06 8.89 11.49 10.75 4.9 7.2 5.22 6.02 9.21 9.39 12.61 26.54 11.11 8.1 6.54 9.41 4.37 6.58 16.96 8.5 6.49 5.41 5.19 3.04 3.88 5.1
Sro3059_g342930.1 (Contig2601.g21072)
0.15 10.29 10.53 12.22 9.9 2.91 7.46 6.1 5.37 11.41 11.09 15.17 14.55 10.88 10.37 11.13 10.71 6.12 7.79 17.34 14.36 7.03 5.6 6.94 10.09 7.85 8.27
Sro30_g019430.1 (Contig3962.g30343)
0.19 11.85 7.18 8.78 7.83 8.42 10.58 7.1 8.78 14.55 15.75 17.44 15.81 21.12 14.36 13.06 21.66 6.14 9.24 13.97 17.41 5.49 7.75 12.18 9.41 9.99 12.86
Sro30_g019630.1 (Contig3962.g30363)
0.22 7.43 7.89 9.76 9.4 2.9 4.74 2.9 2.43 7.41 6.82 9.23 12.43 9.61 7.2 7.72 8.59 3.7 6.05 11.87 8.96 3.8 3.25 4.84 5.08 4.1 4.29
Sro3408_g347690.1 (Contig1147.g10958)
0.29 12.68 14.81 12.5 12.01 9.87 8.36 7.43 11.44 13.69 14.85 15.93 25.42 14.41 9.48 10.16 13.63 7.51 10.46 18.77 14.9 4.83 7.77 7.78 13.93 7.31 9.85
Sro353_g124460.1 (Contig1923.g16580)
0.73 14.16 16.08 14.12 11.02 10.67 13.37 11.97 12.22 18.99 19.59 20.26 21.64 18.17 16.98 21.25 15.09 9.49 12.66 22.9 19.9 11.12 10.97 15.49 16.87 14.62 14.01
Sro361_g126660.1 (Contig1094.g10591)
0.12 5.23 4.28 5.29 4.94 1.56 3.47 2.26 2.62 4.85 5.15 5.9 7.92 4.54 5.44 5.19 6.94 4.15 6.04 7.12 5.78 1.94 2.55 2.31 2.9 2.98 3.92
Sro372_g128810.1 (Contig2891.g23061)
1.34 21.01 17.95 22.51 19.62 11.5 16.72 12.84 16.37 22.5 26.28 31.01 51.3 19.85 22.0 30.51 33.9 18.34 17.26 43.93 21.41 8.01 12.68 10.66 8.67 7.06 14.03
Sro378_g130310.1 (Contig2744.g22074)
1.04 15.46 13.64 16.1 14.65 5.54 19.82 14.35 17.95 19.55 13.1 18.56 26.89 19.92 15.97 25.69 11.91 21.76 26.79 29.79 25.52 13.34 16.99 8.28 6.21 9.33 13.02
Sro407_g136680.1 (Contig2478.g20259)
0.17 8.51 9.51 10.93 9.71 3.85 3.59 2.79 2.23 7.8 6.34 9.26 6.66 9.21 7.46 8.14 10.11 7.22 8.33 12.23 8.11 4.11 3.12 5.18 3.69 7.21 6.42
Sro450_g145490.1 (Contig271.g3474)
0.27 14.2 14.79 17.09 13.64 5.57 11.48 10.3 14.2 12.37 17.92 13.17 18.89 14.05 13.0 10.43 16.38 6.86 9.24 18.99 11.49 5.4 9.56 12.23 10.6 8.84 11.7
Sro483_g152060.1 (Contig4159.g31758)
0.49 16.12 10.63 12.41 11.55 6.28 10.06 7.26 9.91 12.76 14.44 13.31 19.32 15.4 12.9 16.79 18.07 13.79 14.64 18.9 16.1 8.39 8.97 8.23 8.94 9.33 9.7
Sro488_g153180.1 (Contig4435.g33285)
0.99 14.26 15.62 7.34 6.47 3.22 5.54 2.86 2.71 8.13 6.04 8.49 7.8 8.91 7.81 12.54 7.36 8.19 8.1 10.36 9.2 4.34 3.02 5.37 3.94 5.33 5.97
Sro499_g155080.1 (Contig989.g10010)
0.11 7.46 7.15 6.81 7.32 5.5 4.32 3.75 5.06 7.05 6.54 8.68 15.33 8.22 6.76 5.47 10.62 3.59 6.65 11.98 6.89 3.61 3.42 3.17 2.8 4.22 3.98
Sro518_g158780.1 (Contig3565.g27533)
0.05 12.51 10.93 10.11 8.59 6.49 6.31 3.53 5.57 8.56 7.13 9.75 10.0 8.78 8.04 7.9 7.6 7.55 9.93 11.24 10.83 4.44 4.52 5.99 6.01 6.23 5.94
Sro534_g161740.1 (Contig3269.g25739)
0.06 5.14 5.06 3.61 2.61 0.81 1.66 1.04 1.59 3.38 3.08 4.15 2.66 2.85 2.55 3.44 2.88 3.3 4.45 4.36 3.54 2.13 1.24 1.73 1.74 1.6 2.4
Sro536_g162230.1 (Contig299.g3953)
3.21 39.17 67.27 91.88 90.96 36.83 44.03 34.25 47.76 69.99 72.12 86.09 148.87 64.28 72.64 124.98 94.48 69.86 67.46 120.16 94.34 19.88 48.12 33.31 43.97 43.07 55.05
Sro625_g177550.1 (Contig691.g8093)
0.08 4.66 4.51 3.54 3.02 2.27 2.66 2.0 3.06 3.72 5.16 4.37 10.78 7.63 4.41 4.03 8.63 3.35 4.89 7.22 4.4 3.66 2.82 1.9 1.08 1.39 2.84
Sro627_g177880.1 (Contig3366.g26375)
0.22 18.97 19.78 28.64 24.42 10.51 9.77 10.61 9.8 14.93 20.62 18.44 29.58 16.18 15.71 19.56 20.96 9.75 10.98 22.3 16.4 8.42 9.22 7.01 5.49 8.06 14.46
Sro696_g188830.1 (Contig116.g1323)
0.0 3.03 3.5 3.84 3.71 0.8 1.33 2.02 2.69 4.04 3.13 4.65 11.41 3.65 3.83 4.15 2.65 2.15 3.95 8.47 5.81 1.49 1.44 1.83 2.38 1.82 3.14
Sro707_g190560.1 (Contig326.g4317)
0.16 4.49 4.64 2.85 2.42 0.91 3.06 1.82 3.04 4.33 4.35 4.34 9.5 3.14 4.35 3.34 5.37 3.05 4.41 8.34 5.06 1.2 2.07 3.33 2.88 2.3 3.11
Sro753_g197460.1 (Contig4403.g33089)
0.72 13.76 13.55 13.97 11.64 10.01 8.24 7.19 5.87 13.23 12.68 15.6 17.91 12.08 11.06 11.52 8.53 6.51 9.86 17.54 13.47 5.91 7.61 11.59 11.95 10.06 9.81
Sro797_g203880.1 (Contig4746.g35164)
10.54 20.2 10.7 16.65 10.66 5.05 7.65 5.04 6.42 13.8 14.96 17.74 18.45 20.05 11.84 8.66 23.04 13.27 12.33 20.83 12.85 6.12 6.82 3.58 2.93 4.78 7.69
Sro813_g206240.1 (Contig4011.g30870)
0.16 11.01 8.71 8.01 5.82 3.73 4.68 2.92 5.41 7.76 8.29 8.21 10.88 7.97 7.39 9.47 12.84 6.41 6.72 11.17 8.06 4.9 4.85 4.36 2.45 4.22 5.01
Sro81_g043570.1 (Contig1318.g12186)
0.08 3.4 3.97 2.39 1.79 1.26 1.54 0.76 1.3 2.99 3.62 3.63 4.09 2.49 2.68 3.65 3.4 2.81 3.09 5.0 4.28 1.0 0.75 1.96 1.79 1.71 2.17
Sro882_g215330.1 (Contig1771.g15676)
0.1 5.21 4.43 3.37 4.84 1.14 4.33 2.34 4.13 4.72 3.83 5.08 9.44 3.93 5.38 4.95 3.49 2.96 4.36 9.29 5.14 0.82 2.95 3.88 3.74 3.17 3.53
Sro969_g226200.1 (Contig3546.g27394)
51.93 54.86 53.75 50.21 43.23 17.32 42.06 25.91 47.26 50.12 45.92 55.01 58.84 54.0 40.41 42.56 41.58 35.42 40.51 64.15 62.8 17.34 43.69 25.54 16.86 24.31 34.41
Sro986_g228130.1 (Contig4404.g33098)
0.1 3.9 3.28 3.21 2.66 1.9 2.68 2.77 5.48 3.69 4.22 5.51 4.98 2.6 3.05 2.55 6.42 1.86 3.2 4.05 2.76 1.49 3.98 1.85 1.53 2.22 2.86

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)