Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1011_g231110.1 (Contig997.g10084)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.21 0.01 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.09
Sro1031_g233450.1 (Contig1465.g13454)
0.0 1.0 0.73 1.0 0.75 0.01 0.25 0.25 0.82 0.17 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.07 0.02 0.0 0.02 0.03 0.66 0.57 0.35 0.44 0.18 0.04
Sro1073_g238150.1 (Contig2105.g17879)
0.16 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.34 0.14 0.0 0.0 0.73 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.49 0.35 0.1 0.35 0.08 0.0 0.0 0.0
Sro1098_g240920.1 (Contig3483.g27013)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1165_g248180.1 (Contig3103.g24689)
0.19 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 1.0 0.01 0.03 0.71 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.23 0.0 0.0 0.71 0.0
Sro116_g057100.1 (Contig2228.g18486)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.38 0.0 1.0 0.15 0.0 0.0 0.05 0.04 0.18 0.39 0.32 0.0 0.06 0.34 0.15 0.15 0.07 0.0 0.0 0.72 0.77 0.23 0.0 0.0 0.26 0.26
Sro1322_g262610.1 (Contig3764.g28911)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1401_g269420.1 (Contig1376.g12626)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1474_g275750.1 (Contig1848.g16180)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.2 0.05 0.03 0.26 0.63 0.21 0.03 0.03 0.2 0.18 0.0 0.53 0.7 1.0 0.49 0.42 0.09 0.05 0.07 0.11 0.27
Sro1530_g280090.1 (Contig886.g9458)
0.02 0.03 0.0 0.17 0.1 0.0 0.14 0.17 0.25 0.13 0.14 0.1 0.6 0.03 0.1 0.05 0.11 0.16 0.07 1.0 0.1 0.2 0.2 0.1 0.43 0.03 0.07
Sro1541_g280980.1 (Contig4013.g30886)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.07 0.03 0.29 0.09 0.09 0.03 0.28 0.18 0.05 0.0 0.09 0.02 0.2 0.51 0.05 1.0 0.28 0.15 0.3 0.04 0.08
0.0 1.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.52 0.23 0.2 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 1.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.52 0.23 0.2 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 1.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.52 0.23 0.2 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 1.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.52 0.23 0.2 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 1.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.52 0.23 0.2 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
Sro1696_g291840.1 (Contig219.g2592)
0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.28 0.0 0.34 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1745_g294910.1 (Contig2557.g20794)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1768_g296370.1 (Contig3421.g26667)
0.17 0.0 0.55 0.6 0.64 0.04 0.29 0.02 0.52 0.28 0.31 0.04 0.57 0.04 0.6 0.53 0.12 0.27 0.0 1.0 0.12 0.6 0.05 0.21 0.36 0.1 0.42
Sro1779_g297010.1 (Contig3653.g28207)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.05 0.56 0.0 0.34 0.49 0.08 0.47 0.0 0.0 0.09 0.66 0.8 0.79 0.51 0.0 0.82 1.0 0.0 0.1
Sro1809_g299080.1 (Contig3159.g25027)
0.0 0.17 0.07 0.0 0.01 0.0 0.06 0.05 0.13 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 1.0 0.06 0.04 0.03 0.03 0.05
Sro191_g082040.1 (Contig2614.g21197)
0.0 1.0 0.19 0.88 0.0 0.0 0.05 0.41 0.35 0.08 0.0 0.0 0.12 0.02 0.07 0.0 0.16 0.12 0.0 0.0 0.08 0.74 0.01 0.1 0.17 0.0 0.32
Sro1951_g307410.1 (Contig2318.g19149)
0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.51 0.14 0.0 0.0 0.48 0.08
Sro1983_g309220.1 (Contig3713.g28519)
0.0 0.18 0.0 0.43 0.0 0.0 0.41 0.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.15 0.0 0.27 0.0 0.0 0.62 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro201_g085070.1 (Contig2914.g23176)
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.17 0.44 0.21 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2070_g313370.1 (Contig1182.g11240)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.3 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro217_g089630.1 (Contig1718.g15337)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.48 0.0 0.29 0.04 0.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro2197_g318700.1 (Contig1089.g10541)
0.0 0.3 0.29 0.0 0.12 0.08 0.0 0.13 0.0 0.23 0.0 0.05 0.35 0.25 0.02 0.0 0.15 0.12 0.11 0.57 0.1 1.0 0.52 0.14 0.27 0.0 0.69
Sro2381_g325480.1 (Contig4498.g33728)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.11 0.0 0.07 0.14 0.17 0.21 1.0 0.05 0.0 0.24 0.36 0.29 0.56 0.81 0.51 0.01 0.0 0.0 0.04 0.19
Sro2546_g330830.1 (Contig2878.g22998)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2779_g336930.1 (Contig4075.g31239)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.5 0.5 0.44 0.36 0.05 0.05 0.1 0.1 0.35 0.07 0.2 0.51 0.56 0.37 0.0 0.11 0.37 0.46 1.0 0.08 0.55 0.04 0.54 0.0 0.0 0.12
0.12 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.56 0.16 0.16 0.18 0.04 0.29 0.7 0.12 0.09 0.1 0.0 0.08 0.08 0.27 0.17 0.55 0.21 0.28 1.0 0.03 0.02
0.0 0.08 0.06 0.0 0.08 0.0 0.13 0.03 0.15 0.18 0.0 0.09 0.53 0.24 0.2 0.03 0.0 0.04 0.2 1.0 0.0 0.71 0.02 0.31 0.08 0.05 0.33
Sro2930_g340480.1 (Contig4729.g35085)
0.0 0.38 0.03 0.41 0.16 0.0 0.22 0.39 0.0 0.12 0.07 0.01 0.24 0.15 0.06 0.92 1.0 0.31 0.35 0.0 0.0 0.52 0.21 0.14 0.41 0.0 0.06
Sro2949_g340860.1 (Contig4300.g32471)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.08 0.05 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.22 0.66 0.0 0.55 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3029_g342470.1 (Contig2925.g23292)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.21 0.03 0.01 0.2 0.04 0.08 0.19 1.0 0.0 0.16 0.01 0.11 0.06 0.04 0.01
Sro304_g112640.1 (Contig465.g6238)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro306_g112950.1 (Contig3593.g27769)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.15 0.06 0.07 0.79 0.14 0.0 0.4 0.04 0.03 0.0 0.11 0.0 0.07 0.0 0.28 0.24 1.0 0.15 0.03 0.0 0.04 0.06
Sro312_g114590.1 (Contig2832.g22704)
0.05 0.09 0.52 0.02 0.63 0.51 0.3 0.57 0.67 0.48 0.72 0.08 0.45 1.0 0.57 0.59 0.43 0.89 0.37 0.82 0.38 0.62 0.38 0.28 0.19 0.28 0.7
0.0 0.16 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.19 0.24 0.0 0.26 0.06 0.23 0.0 0.07 0.27 0.07 1.0 0.0 0.39 0.09 0.05 0.0 0.0 0.05
Sro332_g119330.1 (Contig1165.g11120)
0.0 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.19 1.0 0.34 0.14 0.0 0.04 0.03 0.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.47 0.62 0.17 0.0 0.0 0.03 0.01
Sro3451_g348160.1 (Contig924.g9695)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3480_g348460.1 (Contig3824.g29357)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.74 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.15 0.11 0.13
Sro3562_g349200.1 (Contig1629.g14680)
0.0 0.89 1.0 0.43 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.1 0.14 0.0 0.21 0.17 0.21 0.65 0.0 0.09 0.38 0.11 0.0 0.34 0.02 0.08 0.0 0.0 0.03
Sro373_g129050.1 (Contig1347.g12390)
0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.33 0.1 0.07 0.11 0.0 0.08 0.01 0.1 0.22 1.0 0.12 0.25 0.04 0.0 0.17 0.74 0.14 0.13 0.01 0.47 0.11
Sro384_g131440.1 (Contig425.g5717)
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.19 0.06 0.08 0.0 0.0 0.11 0.4 0.02 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 1.0 0.15 0.16 0.35 0.0 0.15
Sro3883_g351670.1 (Contig2608.g21095)
0.5 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.13 0.1 0.26 0.22 0.28 0.5 0.0 0.0 0.08 0.69 0.91 0.48 0.11 0.46 0.07 0.0 0.25
Sro3988_g352330.1 (Contig3795.g29126)
0.0 0.0 0.19 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.55 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4050_g352670.1 (Contig1679.g15084)
0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.13 0.14 0.0 0.0 0.21 0.0 0.5 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.32 0.0 0.1 0.45 0.0
Sro4156_g353210.1 (Contig3290.g25839)
0.0 0.0 0.13 0.18 0.0 0.0 0.19 0.36 0.02 0.14 0.0 0.0 0.04 0.0 0.13 0.27 0.27 0.06 0.06 1.0 0.0 0.6 0.24 0.0 0.0 0.0 0.13
Sro433_g141800.1 (Contig4540.g33942)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro434_g142050.1 (Contig783.g8762)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.35 0.71 0.16 0.42 0.18 0.37 0.84 0.03 0.35 0.13 0.13 1.0 0.49 1.0 0.38 0.65 0.15 0.55 0.53 0.59 0.41
Sro504_g155930.1 (Contig4263.g32259)
0.03 0.0 0.25 0.11 0.0 0.79 0.08 0.57 0.62 0.21 0.0 0.31 0.38 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.03 1.0 0.12 0.85 0.4 0.0 0.2 0.68 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro561_g166890.1 (Contig575.g7316)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro577_g169750.1 (Contig448.g6082)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.08 0.36 0.0 0.63 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro603_g174050.1 (Contig4246.g32164)
0.0 0.0 0.62 0.7 0.29 0.0 0.0 0.81 0.8 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro630_g178280.1 (Contig456.g6158)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.57 0.09 0.03 0.06 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro639_g179770.1 (Contig197.g2298)
0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 1.0 0.97 0.1 0.0 0.03 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.19 0.28 0.73 0.04 0.0 0.16 0.02 0.01
Sro653_g181920.1 (Contig4252.g32184)
0.0 1.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.07 0.07 0.04 0.23 0.35 0.0 0.31 0.0 0.21 0.16 0.0 0.58 0.24 0.32 0.42 0.39 0.08 0.0 0.0 0.0 0.1
Sro660_g182930.1 (Contig1196.g11298)
0.0 0.43 0.59 0.62 0.43 0.02 0.36 0.48 0.69 0.22 0.5 0.24 0.98 0.15 0.2 0.26 0.33 0.57 0.56 1.0 0.14 0.51 0.56 0.1 0.07 0.11 0.21
Sro660_g182940.1 (Contig1196.g11299)
0.0 0.48 0.73 0.57 0.54 0.07 0.39 0.58 0.33 0.24 0.47 0.1 0.95 0.12 0.24 0.2 0.44 0.77 0.56 1.0 0.12 0.71 0.43 0.12 0.02 0.1 0.4
Sro66_g037300.1 (Contig399.g5400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.09 0.0 0.25 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.13 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro706_g190510.1 (Contig127.g1447)
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.27 0.08 0.3 0.22 0.25 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.55 0.66 0.0 1.0 0.46 0.23 0.0 0.0 0.06
Sro734_g194790.1 (Contig3769.g28957)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.49 1.0 0.25 0.64 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.55 0.0 0.29 0.01 0.41 0.0 0.0 0.24
Sro771_g200140.1 (Contig1544.g14009)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro782_g201820.1 (Contig2391.g19606)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.38 0.23 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.48 0.24
Sro94_g049000.1 (Contig150.g1690)
0.07 0.39 0.1 0.13 0.0 0.0 0.12 0.17 0.1 0.22 0.0 0.39 0.21 0.82 0.18 0.0 0.84 0.09 0.0 0.95 0.0 1.0 0.13 0.22 0.36 0.0 0.07
Sro972_g226560.1 (Contig330.g4385)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)