Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1011_g231110.1 (Contig997.g10084)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.23 0.01 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.22 0.0 0.0 0.0 0.1
Sro1031_g233450.1 (Contig1465.g13454)
0.0 20.85 15.2 20.89 15.74 0.24 5.21 5.32 17.16 3.48 0.56 0.25 0.69 0.2 0.73 0.52 1.55 0.39 0.04 0.4 0.6 13.87 11.8 7.33 9.26 3.67 0.82
Sro1073_g238150.1 (Contig2105.g17879)
0.12 0.77 0.24 0.0 0.0 0.0 0.06 0.28 0.26 0.11 0.0 0.0 0.56 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.37 0.27 0.08 0.27 0.06 0.0 0.0 0.0
Sro1098_g240920.1 (Contig3483.g27013)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1165_g248180.1 (Contig3103.g24689)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.46 0.01 0.02 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.0 0.0 0.33 0.0
Sro116_g057100.1 (Contig2228.g18486)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.37 0.0 0.96 0.14 0.0 0.0 0.05 0.03 0.18 0.38 0.31 0.0 0.06 0.33 0.15 0.14 0.07 0.0 0.0 0.7 0.74 0.22 0.0 0.0 0.25 0.25
Sro1322_g262610.1 (Contig3764.g28911)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1401_g269420.1 (Contig1376.g12626)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1474_g275750.1 (Contig1848.g16180)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.05 0.13 0.04 0.01 0.01 0.04 0.04 0.0 0.11 0.14 0.2 0.1 0.09 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05
Sro1530_g280090.1 (Contig886.g9458)
0.03 0.05 0.0 0.28 0.17 0.0 0.23 0.27 0.42 0.21 0.23 0.16 0.97 0.05 0.17 0.08 0.18 0.26 0.11 1.63 0.16 0.32 0.33 0.16 0.7 0.05 0.12
Sro1541_g280980.1 (Contig4013.g30886)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.09 0.04 0.38 0.13 0.12 0.04 0.38 0.24 0.06 0.0 0.12 0.02 0.26 0.69 0.07 1.34 0.38 0.2 0.41 0.05 0.11
0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro1696_g291840.1 (Contig219.g2592)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1745_g294910.1 (Contig2557.g20794)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1768_g296370.1 (Contig3421.g26667)
0.39 0.0 1.23 1.34 1.44 0.09 0.65 0.04 1.16 0.63 0.7 0.08 1.28 0.08 1.35 1.2 0.28 0.61 0.0 2.24 0.26 1.35 0.12 0.47 0.81 0.23 0.94
Sro1779_g297010.1 (Contig3653.g28207)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.08 1.0 0.0 0.6 0.88 0.15 0.84 0.0 0.0 0.16 1.17 1.42 1.4 0.9 0.0 1.46 1.77 0.0 0.18
Sro1809_g299080.1 (Contig3159.g25027)
0.05 3.01 1.13 0.08 0.15 0.0 1.12 0.86 2.26 2.39 0.0 0.0 0.1 0.0 0.74 0.35 0.0 0.55 0.25 0.07 0.46 17.31 1.04 0.72 0.57 0.47 0.9
Sro191_g082040.1 (Contig2614.g21197)
0.0 35.05 6.7 30.98 0.0 0.0 1.8 14.54 12.42 2.72 0.0 0.0 4.08 0.78 2.28 0.0 5.77 4.19 0.0 0.0 2.78 25.98 0.34 3.44 6.05 0.0 11.26
Sro1951_g307410.1 (Contig2318.g19149)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01
Sro1983_g309220.1 (Contig3713.g28519)
0.0 0.13 0.0 0.3 0.0 0.0 0.29 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.7 0.1 0.0 0.19 0.0 0.0 0.43 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro201_g085070.1 (Contig2914.g23176)
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2070_g313370.1 (Contig1182.g11240)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.3 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro217_g089630.1 (Contig1718.g15337)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.81 0.87 0.0 0.52 0.08 0.0 0.36 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro2197_g318700.1 (Contig1089.g10541)
0.0 0.35 0.34 0.0 0.13 0.09 0.0 0.15 0.0 0.26 0.0 0.06 0.41 0.29 0.03 0.0 0.17 0.14 0.13 0.65 0.12 1.15 0.6 0.16 0.32 0.0 0.79
Sro2381_g325480.1 (Contig4498.g33728)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.02 0.3 0.0 0.19 0.38 0.46 0.57 2.78 0.13 0.0 0.67 1.0 0.81 1.57 2.26 1.42 0.02 0.0 0.0 0.11 0.54
Sro2546_g330830.1 (Contig2878.g22998)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2779_g336930.1 (Contig4075.g31239)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.83 0.83 0.72 0.6 0.09 0.08 0.16 0.17 0.58 0.11 0.33 0.84 0.93 0.61 0.0 0.18 0.62 0.77 1.66 0.13 0.91 0.07 0.9 0.0 0.0 0.2
0.33 0.0 0.0 0.17 0.0 0.08 1.62 0.46 0.45 0.51 0.11 0.84 2.02 0.33 0.26 0.28 0.0 0.22 0.24 0.78 0.5 1.61 0.6 0.82 2.9 0.1 0.04
0.0 0.24 0.19 0.0 0.26 0.0 0.4 0.1 0.49 0.56 0.0 0.29 1.69 0.77 0.65 0.08 0.0 0.14 0.64 3.19 0.0 2.25 0.07 1.0 0.27 0.15 1.07
Sro2930_g340480.1 (Contig4729.g35085)
0.0 0.73 0.06 0.77 0.3 0.0 0.42 0.74 0.0 0.24 0.13 0.02 0.45 0.29 0.11 1.75 1.9 0.58 0.66 0.0 0.0 0.99 0.4 0.26 0.77 0.0 0.12
Sro2949_g340860.1 (Contig4300.g32471)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.12 0.07 0.09 0.0 0.0 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.32 0.95 0.0 0.79 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3029_g342470.1 (Contig2925.g23292)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.08 0.02 0.03 0.07 0.38 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02 0.02 0.01
Sro304_g112640.1 (Contig465.g6238)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.39 0.83 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro306_g112950.1 (Contig3593.g27769)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.21 0.08 0.1 1.06 0.19 0.0 0.53 0.05 0.04 0.0 0.15 0.0 0.09 0.0 0.37 0.32 1.33 0.2 0.05 0.0 0.06 0.08
Sro312_g114590.1 (Contig2832.g22704)
0.13 0.25 1.44 0.04 1.77 1.41 0.85 1.58 1.88 1.34 2.02 0.22 1.26 2.79 1.58 1.65 1.19 2.48 1.03 2.29 1.06 1.73 1.05 0.78 0.53 0.79 1.94
0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.07 0.09 0.0 0.1 0.02 0.09 0.0 0.03 0.1 0.03 0.38 0.0 0.15 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02
Sro332_g119330.1 (Contig1165.g11120)
0.0 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.21 1.11 0.38 0.15 0.0 0.05 0.03 0.18 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.52 0.69 0.18 0.0 0.0 0.03 0.01
Sro3451_g348160.1 (Contig924.g9695)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3480_g348460.1 (Contig3824.g29357)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02
Sro3562_g349200.1 (Contig1629.g14680)
0.0 0.28 0.32 0.14 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.07 0.05 0.07 0.21 0.0 0.03 0.12 0.03 0.0 0.11 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01
Sro373_g129050.1 (Contig1347.g12390)
0.08 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.56 0.17 0.12 0.19 0.0 0.13 0.02 0.18 0.38 1.72 0.21 0.44 0.07 0.0 0.3 1.28 0.24 0.22 0.03 0.8 0.19
Sro384_g131440.1 (Contig425.g5717)
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.07 0.0 0.0 0.09 0.33 0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.82 0.12 0.13 0.29 0.0 0.13
Sro3883_g351670.1 (Contig2608.g21095)
0.32 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.1 0.09 0.06 0.17 0.14 0.18 0.32 0.0 0.0 0.05 0.44 0.59 0.31 0.07 0.3 0.05 0.0 0.16
Sro3988_g352330.1 (Contig3795.g29126)
0.0 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.42 0.0 0.77 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4050_g352670.1 (Contig1679.g15084)
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.24 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.15 0.0 0.05 0.21 0.0
Sro4156_g353210.1 (Contig3290.g25839)
0.0 0.0 0.27 0.37 0.0 0.0 0.39 0.73 0.04 0.28 0.0 0.0 0.08 0.0 0.26 0.56 0.55 0.12 0.12 2.06 0.0 1.24 0.49 0.0 0.0 0.0 0.27
Sro433_g141800.1 (Contig4540.g33942)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro434_g142050.1 (Contig783.g8762)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.16 0.32 0.07 0.19 0.08 0.17 0.37 0.02 0.16 0.06 0.06 0.45 0.22 0.45 0.17 0.29 0.07 0.25 0.24 0.26 0.19
Sro504_g155930.1 (Contig4263.g32259)
0.05 0.0 0.4 0.18 0.0 1.27 0.13 0.92 1.01 0.33 0.0 0.51 0.61 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.05 1.62 0.19 1.37 0.64 0.0 0.32 1.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro561_g166890.1 (Contig575.g7316)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro577_g169750.1 (Contig448.g6082)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.05 0.21 0.0 0.37 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.59 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro603_g174050.1 (Contig4246.g32164)
0.0 0.0 0.06 0.06 0.03 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro630_g178280.1 (Contig456.g6158)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.39 0.04 0.22 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro639_g179770.1 (Contig197.g2298)
0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.09 1.41 1.37 0.14 0.0 0.04 0.32 0.04 0.01 0.0 0.0 0.09 0.05 0.26 0.4 1.03 0.06 0.0 0.22 0.03 0.02
Sro653_g181920.1 (Contig4252.g32184)
0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro660_g182930.1 (Contig1196.g11298)
0.0 1.51 2.06 2.17 1.5 0.08 1.26 1.67 2.42 0.76 1.76 0.84 3.43 0.53 0.7 0.92 1.15 2.02 1.96 3.51 0.5 1.79 1.96 0.37 0.25 0.37 0.72
Sro660_g182940.1 (Contig1196.g11299)
0.0 1.65 2.5 1.97 1.86 0.25 1.34 1.99 1.15 0.84 1.63 0.34 3.28 0.41 0.84 0.69 1.52 2.67 1.94 3.45 0.42 2.45 1.47 0.41 0.09 0.36 1.39
Sro66_g037300.1 (Contig399.g5400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08 0.16 0.0 0.47 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.24 1.85 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro706_g190510.1 (Contig127.g1447)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.14 0.1 0.12 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.26 0.31 0.0 0.47 0.22 0.11 0.0 0.0 0.03
Sro734_g194790.1 (Contig3769.g28957)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.13 0.03 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03
Sro771_g200140.1 (Contig1544.g14009)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro782_g201820.1 (Contig2391.g19606)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.11 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06
Sro94_g049000.1 (Contig150.g1690)
0.11 0.58 0.14 0.19 0.0 0.0 0.18 0.25 0.15 0.33 0.01 0.57 0.31 1.2 0.27 0.0 1.24 0.14 0.0 1.4 0.0 1.48 0.19 0.33 0.54 0.0 0.11
Sro972_g226560.1 (Contig330.g4385)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)