Heatmap: Cluster_260 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230930.1 (Contig4560.g34058)	0.01	0.65	0.93	1.0	0.79	0.26	0.34	0.19	0.17	0.4	0.38	0.5	0.38	0.36	0.32	0.34	0.44	0.39	0.29	0.3	0.5	0.1	0.15	0.43	0.71	0.29	0.35
Sro103_g052410.1 (Contig308.g4038)	0.0	0.02	0.02	0.11	0.08	0.12	0.1	0.08	0.05	0.27	0.26	0.26	0.24	0.2	0.4	0.71	0.21	1.0	0.9	0.52	0.24	0.06	0.02	0.11	0.2	0.21	0.38
Sro1055_g236110.1 (Contig2523.g20599)	0.11	0.22	0.27	1.0	0.25	0.31	0.24	0.32	0.34	0.37	0.36	0.4	0.28	0.17	0.23	0.1	0.2	0.15	0.38	0.36	0.41	0.19	0.11	0.4	0.23	0.24	0.24
Sro1084_g239440.1 (Contig3162.g25051)	0.0	0.19	0.18	0.35	0.41	0.14	0.19	0.26	0.33	0.23	0.28	0.31	0.31	0.24	0.33	0.58	0.23	0.21	0.23	0.34	0.35	0.07	0.25	0.28	1.0	0.61	0.15
Sro120_g058630.1 (Contig2411.g19741)	0.0	0.2	0.19	1.0	0.2	0.05	0.14	0.1	0.1	0.15	0.18	0.12	0.17	0.08	0.13	0.18	0.14	0.12	0.15	0.18	0.14	0.04	0.07	0.15	0.17	0.13	0.15
Sro123_g059550.1 (Contig66.g644)	0.0	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.23	0.14	0.06	0.42	0.25	0.19	0.35	0.19	0.37	0.5	0.12	1.0	0.91	0.68	0.31	0.02	0.05	0.07	0.04	0.06	0.36
Sro1267_g257680.1 (Contig3174.g25101)	0.04	0.47	0.51	1.0	0.65	0.06	0.11	0.05	0.08	0.19	0.12	0.28	0.09	0.06	0.11	0.21	0.11	0.05	0.04	0.16	0.08	0.03	0.1	0.08	0.12	0.04	0.06
Sro128_g061110.1 (Contig1654.g14887)	0.27	0.51	0.46	0.63	0.4	0.21	0.39	0.22	0.19	0.56	0.6	0.78	0.5	0.36	0.52	0.59	0.47	0.65	0.65	0.79	0.54	0.11	0.15	0.59	1.0	0.37	0.38
Sro1318_g262230.1 (Contig4479.g33663)	0.25	1.0	0.98	0.66	0.51	0.17	0.69	0.8	0.42	0.44	0.62	0.47	0.32	0.18	0.54	0.65	0.2	0.74	0.29	0.36	0.45	0.18	0.21	0.91	0.7	0.62	0.48
Sro1334_g263880.1 (Contig785.g8792)	0.28	0.68	0.49	1.0	0.68	0.11	0.14	0.19	0.08	0.35	0.28	0.32	0.35	0.12	0.24	0.4	0.23	0.53	0.22	0.55	0.45	0.04	0.0	0.47	0.67	0.38	0.25
Sro1403_g269670.1 (Contig763.g8663)	0.0	0.35	0.16	1.0	0.17	0.01	0.0	0.06	0.0	0.07	0.05	0.04	0.15	0.1	0.1	0.02	0.03	0.16	0.12	0.19	0.02	0.05	0.03	0.03	0.15	0.0	0.01
Sro148_g068090.1 (Contig3597.g27801)	0.0	0.09	0.02	1.0	0.36	0.22	0.51	0.27	0.19	0.44	0.4	0.49	0.48	0.17	0.38	0.4	0.23	0.53	0.26	0.71	0.9	0.25	0.09	0.32	0.82	0.55	0.39
Sro149_g068490.1 (Contig259.g3217)	0.0	0.09	0.2	1.0	0.32	0.01	0.29	0.07	0.03	0.26	0.24	0.16	0.28	0.13	0.15	0.15	0.16	0.48	0.67	0.65	0.44	0.26	0.08	0.34	0.89	0.71	0.16
Sro161_g072350.1 (Contig3982.g30576)	0.01	0.74	0.8	1.0	0.83	0.26	0.49	0.32	0.27	0.49	0.72	0.5	0.82	0.24	0.62	0.55	0.52	0.56	0.45	0.68	0.49	0.14	0.3	0.35	0.64	0.43	0.42
Sro1628_g287030.1 (Contig1353.g12488)	0.0	0.05	0.01	1.0	0.23	0.02	0.08	0.04	0.03	0.15	0.07	0.22	0.1	0.12	0.1	0.11	0.07	0.07	0.07	0.13	0.16	0.11	0.03	0.09	0.14	0.09	0.07
Sro163_g073400.1 (Contig1793.g15873)	0.0	0.44	1.0	0.81	0.5	0.12	0.07	0.13	0.03	0.22	0.11	0.26	0.28	0.16	0.22	0.38	0.21	0.14	0.23	0.19	0.2	0.07	0.04	0.13	0.18	0.06	0.21
Sro178_g078060.1 (Contig275.g3531)	0.0	0.65	0.69	1.0	0.89	0.05	0.34	0.15	0.15	0.25	0.22	0.26	0.61	0.37	0.23	0.19	0.12	0.25	0.25	0.34	0.22	0.2	0.13	0.33	0.51	0.29	0.15
Sro1790_g297750.1 (Contig4724.g35073)	0.0	0.07	0.04	1.0	0.09	0.11	0.09	0.18	0.04	0.24	0.11	0.54	0.02	0.08	0.1	0.16	0.02	0.04	0.07	0.16	0.3	0.07	0.03	0.05	0.11	0.06	0.08
Sro182_g079380.1 (Contig1301.g12074)	0.01	0.03	0.01	1.0	0.25	0.03	0.07	0.06	0.05	0.21	0.16	0.26	0.22	0.09	0.1	0.13	0.07	0.09	0.16	0.34	0.19	0.04	0.04	0.1	0.09	0.05	0.11
Sro2143_g316230.1 (Contig60.g482)	0.19	0.63	0.7	0.59	0.61	0.38	0.48	0.42	0.34	0.77	0.73	0.98	0.49	0.44	0.61	0.47	0.7	0.86	0.87	0.67	0.87	0.23	0.33	0.5	1.0	0.56	0.5
Sro2209_g319150.1 (Contig3038.g24221)	0.0	0.05	0.06	1.0	0.23	0.0	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.01	0.5	0.19	0.06	0.02	0.05	0.57	0.52	0.49	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02
Sro227_g092330.1 (Contig327.g4345)	0.02	0.94	0.83	0.7	0.87	0.68	0.8	0.99	0.5	0.45	0.62	0.27	0.85	0.51	0.72	0.8	0.27	0.97	0.41	0.37	0.48	0.29	0.39	1.0	0.81	0.56	0.47
Sro2287_g322040.1 (Contig411.g5553)	0.58	0.17	0.31	0.24	0.23	0.11	0.36	0.38	0.2	0.2	0.55	0.25	0.27	0.05	0.39	1.0	0.44	0.23	0.11	0.2	0.21	0.08	0.17	0.91	0.52	0.32	0.35
Sro228_g092700.1 (Contig1235.g11584)	0.36	0.45	1.0	0.84	0.86	0.16	0.27	0.23	0.21	0.46	0.27	0.72	0.4	0.22	0.33	0.8	0.18	0.29	0.37	0.51	0.42	0.1	0.22	0.26	0.49	0.37	0.27
Sro231_g093650.1 (Contig3051.g24278)	0.0	0.31	0.36	0.45	0.43	0.39	0.13	0.14	0.11	0.21	0.83	0.07	0.1	0.06	0.54	0.62	0.76	1.0	0.44	0.13	0.07	0.08	0.14	0.5	0.7	0.51	0.42
Sro2354_g324510.1 (Contig74.g790)	0.0	0.05	0.11	1.0	0.22	0.01	0.15	0.04	0.01	0.18	0.11	0.18	0.63	0.03	0.15	0.09	0.18	0.39	0.41	0.6	0.29	0.05	0.01	0.17	0.19	0.22	0.08
Sro273_g105250.1 (Contig4205.g32006)	0.0	0.07	0.05	1.0	0.31	0.14	0.15	0.12	0.08	0.25	0.29	0.32	0.12	0.08	0.21	0.17	0.16	0.25	0.34	0.29	0.38	0.16	0.05	0.19	0.19	0.2	0.24
Sro274_g105430.1 (Contig1557.g14167)	0.01	1.0	0.72	0.91	0.66	0.12	0.36	0.23	0.18	0.41	0.39	0.34	0.55	0.26	0.54	0.81	0.31	0.83	0.26	0.5	0.35	0.03	0.16	0.42	0.6	0.35	0.28
Sro2939_g340650.1 (Contig2223.g18461)	0.06	0.39	0.51	1.0	0.9	0.19	0.26	0.18	0.14	0.24	0.25	0.27	0.1	0.25	0.33	0.26	0.23	0.17	0.11	0.1	0.26	0.11	0.16	0.35	0.48	0.28	0.16
Sro2_g001750.1 (Contig467.g6333)	0.26	0.29	0.31	1.0	0.3	0.04	0.17	0.12	0.13	0.27	0.2	0.27	0.53	0.09	0.17	0.27	0.14	0.2	0.17	0.56	0.39	0.0	0.11	0.31	0.64	0.21	0.11
Sro300_g111610.1 (Contig270.g3449)	0.0	0.23	0.37	0.81	0.54	0.23	0.16	0.28	0.08	0.25	0.31	0.13	0.46	0.01	0.29	0.36	0.37	0.93	0.55	0.55	0.24	0.08	0.05	0.59	1.0	0.47	0.28
Sro31_g020110.1 (Contig420.g5606)	0.03	0.11	0.13	1.0	0.39	0.06	0.22	0.15	0.06	0.29	0.26	0.42	0.33	0.35	0.27	0.4	0.28	0.48	0.27	0.54	0.31	0.06	0.1	0.3	0.36	0.2	0.16
Sro333_g119490.1 (Contig3012.g24045)	0.0	0.77	0.83	1.0	0.84	0.13	0.3	0.14	0.27	0.36	0.41	0.34	0.29	0.31	0.28	0.25	0.51	0.24	0.23	0.43	0.49	0.08	0.19	0.16	0.44	0.17	0.22
Sro405_g136220.1 (Contig597.g7447)	0.01	0.03	0.04	1.0	0.2	0.1	0.21	0.16	0.04	0.39	0.24	0.49	0.29	0.39	0.32	0.39	0.25	0.25	0.47	0.48	0.44	0.11	0.07	0.26	0.47	0.32	0.21
Sro461_g147630.1 (Contig3552.g27417)	0.01	0.16	0.28	0.2	0.22	0.84	0.79	1.0	0.46	0.52	0.8	0.53	0.44	0.52	0.84	0.89	0.46	0.78	0.3	0.25	0.75	0.05	0.29	0.79	0.86	0.45	0.67
Sro49_g028890.1 (Contig2054.g17639)	0.12	0.5	0.32	0.7	0.84	0.15	0.55	0.23	0.38	0.52	0.48	0.75	0.51	0.56	0.6	0.59	0.43	0.5	0.42	0.78	0.6	0.14	0.27	0.59	1.0	0.91	0.36
Sro537_g162250.1 (Contig1194.g11277)	0.0	0.14	0.05	1.0	0.28	0.02	0.23	0.08	0.06	0.26	0.11	0.31	0.27	0.46	0.17	0.25	0.09	0.24	0.14	0.37	0.52	0.15	0.05	0.2	0.4	0.23	0.09
Sro575_g169360.1 (Contig1981.g16954)	0.09	0.87	0.76	1.0	0.82	0.14	0.28	0.23	0.19	0.43	0.43	0.5	0.52	0.38	0.34	0.35	0.39	0.53	0.3	0.55	0.53	0.09	0.13	0.41	0.7	0.31	0.21
Sro585_g170960.1 (Contig3766.g28920)	0.01	0.95	1.0	0.97	0.72	0.08	0.22	0.12	0.11	0.32	0.29	0.34	0.38	0.14	0.31	0.46	0.23	0.15	0.2	0.39	0.3	0.05	0.07	0.33	0.37	0.21	0.23
Sro592_g172170.1 (Contig2562.g20819)	0.24	0.04	0.04	1.0	0.44	0.02	0.02	0.03	0.02	0.1	0.02	0.2	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.06	0.09	0.03	0.03	0.05	0.08	0.03	0.03
Sro651_g181570.1 (Contig2568.g20861)	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.07	0.22	0.09	0.18	0.15	0.07	0.18	0.36	0.06	1.0	0.75	0.32	0.3	0.09	0.03	0.15	0.16	0.11	0.15
Sro685_g186860.1 (Contig1991.g17041)	0.0	0.59	0.69	1.0	0.94	0.21	0.36	0.38	0.24	0.33	0.51	0.19	0.81	0.37	0.42	0.53	0.31	0.54	0.51	0.7	0.25	0.25	0.3	0.66	0.86	0.63	0.51
Sro697_g189080.1 (Contig3345.g26207)	0.0	0.14	0.13	0.26	0.3	0.24	0.17	0.13	0.03	0.18	0.32	0.11	0.12	0.09	0.3	0.21	0.22	1.0	0.72	0.26	0.16	0.03	0.03	0.33	0.38	0.43	0.31
Sro709_g190870.1 (Contig1341.g12353)	0.01	0.12	0.08	1.0	0.23	0.01	0.13	0.18	0.07	0.15	0.1	0.18	0.13	0.1	0.12	0.11	0.13	0.06	0.12	0.2	0.2	0.18	0.05	0.12	0.22	0.11	0.15
Sro719_g192430.1 (Contig661.g7829)	0.0	0.21	1.0	0.8	0.41	0.04	0.04	0.01	0.0	0.27	0.17	0.26	0.28	0.21	0.27	0.4	0.07	0.07	0.1	0.14	0.29	0.0	0.0	0.16	0.16	0.06	0.36
Sro731_g194250.1 (Contig3971.g30485)	0.31	0.29	0.31	0.88	0.7	0.18	0.26	0.17	0.1	0.36	0.55	0.54	0.34	0.19	0.53	0.41	0.36	0.47	0.29	0.49	0.35	0.04	0.06	0.89	1.0	0.55	0.33
Sro76_g041530.1 (Contig184.g2131)	0.0	0.29	0.4	0.98	0.78	0.18	0.24	0.15	0.02	0.23	0.48	0.1	0.16	0.07	0.46	0.59	0.36	0.85	0.74	0.24	0.19	0.01	0.02	1.0	0.85	0.53	0.37
Sro780_g201460.1 (Contig2838.g22780)	0.31	0.24	0.3	0.39	0.38	0.24	0.25	0.16	0.11	0.49	0.54	0.46	0.4	0.28	0.41	0.38	0.33	0.76	1.0	0.65	0.49	0.04	0.09	0.34	0.52	0.4	0.48
Sro806_g205060.1 (Contig1260.g11792)	0.02	0.57	0.83	1.0	0.86	0.12	0.16	0.15	0.07	0.32	0.29	0.35	0.2	0.25	0.22	0.37	0.11	0.17	0.21	0.12	0.32	0.09	0.08	0.28	0.51	0.25	0.17
Sro810_g205760.1 (Contig3420.g26654)	0.01	0.22	0.34	0.47	0.56	0.2	0.31	0.26	0.19	0.31	0.29	0.3	0.51	0.36	0.43	0.57	0.29	0.62	0.35	0.44	0.39	0.12	0.16	0.59	1.0	0.66	0.24
Sro855_g211490.1 (Contig1132.g10863)	0.01	0.84	0.67	1.0	1.0	0.09	0.36	0.26	0.07	0.32	0.43	0.26	0.46	0.11	0.63	0.88	0.27	0.63	0.31	0.55	0.21	0.1	0.09	0.74	0.87	0.44	0.33
Sro885_g216160.1 (Contig1350.g12425)	0.21	0.7	0.78	0.7	0.6	0.23	0.58	0.68	0.44	0.51	0.55	0.57	0.6	0.31	0.56	0.44	0.36	0.35	0.49	0.74	0.55	0.32	0.32	0.79	1.0	0.48	0.41
Sro934_g221860.1 (Contig2403.g19673)	0.07	0.48	0.82	0.73	0.36	0.02	0.14	0.26	0.12	0.16	0.24	0.08	0.05	0.0	0.66	0.93	0.15	0.28	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.42	1.0	0.37	0.4
Sro954_g224310.1 (Contig1658.g14943)	0.07	0.27	0.38	0.41	0.44	0.08	0.15	0.25	0.14	0.14	0.35	0.07	0.18	0.09	0.31	0.18	0.19	0.45	0.72	0.22	0.12	0.05	0.14	1.0	0.64	0.51	0.19
Sro965_g225560.1 (Contig945.g9785)	0.22	0.52	0.68	0.51	0.54	0.21	0.71	0.59	0.24	0.34	0.43	0.31	0.44	0.2	0.48	0.84	0.43	0.58	0.23	0.34	0.38	0.26	0.26	1.0	1.0	0.78	0.47
Sro994_g229040.1 (Contig3591.g27756)	0.01	0.0	0.03	1.0	0.2	0.11	0.08	0.05	0.01	0.18	0.01	0.32	0.14	0.01	0.12	0.03	0.05	0.1	0.2	0.31	0.08	0.0	0.01	0.28	0.19	0.36	0.13
Sro994_g229040.2	0.0	0.01	0.03	1.0	0.34	0.0	0.06	0.07	0.06	0.08	0.11	0.06	0.08	0.03	0.06	0.03	0.07	0.13	0.15	0.14	0.06	0.02	0.03	0.11	0.43	0.1	0.09
Sro994_g229050.1 (Contig3591.g27757)	0.02	0.0	0.0	1.0	0.51	0.02	0.11	0.22	0.07	0.12	0.24	0.05	0.04	0.05	0.08	0.04	0.07	0.15	0.11	0.03	0.08	0.0	0.06	0.31	0.32	0.34	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)