Heatmap: Cluster_260 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230930.1 (Contig4560.g34058)
1.0 64.54 91.95 99.0 78.5 25.57 33.75 18.95 16.57 39.75 37.17 49.42 37.7 35.74 31.39 33.8 43.82 38.16 29.16 29.63 49.79 9.68 14.59 42.97 70.46 28.93 34.73
Sro103_g052410.1 (Contig308.g4038)
0.3 1.59 1.42 7.32 5.18 7.78 6.52 5.07 3.18 18.3 17.28 17.44 16.16 13.26 26.49 47.29 14.31 66.64 59.73 34.72 15.72 3.84 1.52 7.28 13.12 14.2 25.5
Sro1055_g236110.1 (Contig2523.g20599)
0.93 1.91 2.33 8.75 2.17 2.71 2.06 2.84 2.97 3.25 3.14 3.46 2.49 1.52 1.99 0.83 1.75 1.33 3.34 3.15 3.62 1.62 0.93 3.5 2.01 2.09 2.07
Sro1084_g239440.1 (Contig3162.g25051)
0.04 2.73 2.63 4.98 5.89 2.0 2.79 3.71 4.71 3.39 4.01 4.53 4.46 3.46 4.69 8.32 3.37 3.07 3.36 4.91 5.09 1.05 3.63 3.99 14.41 8.83 2.19
Sro120_g058630.1 (Contig2411.g19741)
0.08 13.04 12.71 65.34 13.31 3.29 8.87 6.49 6.41 9.71 11.76 8.08 11.38 5.41 8.56 11.75 9.27 7.61 9.85 11.97 9.31 2.72 4.77 10.12 10.81 8.48 9.93
Sro123_g059550.1 (Contig66.g644)
0.0 0.16 0.29 0.19 0.32 0.33 2.08 1.27 0.53 3.9 2.28 1.74 3.27 1.8 3.45 4.62 1.1 9.25 8.39 6.31 2.87 0.18 0.43 0.6 0.36 0.56 3.34
Sro1267_g257680.1 (Contig3174.g25101)
2.52 27.09 29.14 57.09 37.15 3.33 6.14 2.94 4.36 10.82 6.64 15.83 5.03 3.6 6.43 12.26 6.21 2.77 2.02 9.02 4.46 1.71 5.61 4.6 6.62 2.21 3.51
Sro128_g061110.1 (Contig1654.g14887)
13.34 25.12 22.67 30.96 19.82 10.32 19.02 10.68 9.14 27.42 29.86 38.33 24.89 17.88 25.77 28.89 23.41 31.9 32.26 38.82 26.52 5.59 7.28 29.33 49.39 18.14 18.88
Sro1318_g262230.1 (Contig4479.g33663)
5.06 20.0 19.55 13.15 10.27 3.35 13.76 15.93 8.49 8.8 12.36 9.35 6.31 3.51 10.82 13.08 4.08 14.74 5.75 7.14 9.1 3.54 4.28 18.17 14.01 12.49 9.69
Sro1334_g263880.1 (Contig785.g8792)
4.13 10.06 7.27 14.75 10.0 1.6 2.0 2.76 1.16 5.19 4.18 4.74 5.17 1.77 3.5 5.84 3.44 7.82 3.31 8.13 6.64 0.6 0.05 6.96 9.94 5.57 3.72
Sro1403_g269670.1 (Contig763.g8663)
0.0 49.07 22.69 140.28 24.28 1.5 0.65 8.89 0.0 9.73 7.54 5.28 21.03 14.13 13.63 2.96 3.69 22.28 16.65 26.04 2.74 6.34 4.15 4.6 20.51 0.0 1.97
Sro148_g068090.1 (Contig3597.g27801)
0.01 0.39 0.09 4.39 1.59 0.97 2.25 1.16 0.82 1.93 1.77 2.14 2.11 0.75 1.65 1.77 1.03 2.31 1.16 3.1 3.97 1.12 0.4 1.41 3.58 2.4 1.72
Sro149_g068490.1 (Contig259.g3217)
0.0 0.79 1.72 8.58 2.78 0.11 2.48 0.58 0.27 2.27 2.07 1.36 2.38 1.13 1.3 1.3 1.38 4.13 5.79 5.62 3.76 2.21 0.67 2.95 7.67 6.06 1.41
Sro161_g072350.1 (Contig3982.g30576)
0.44 52.6 56.63 71.07 59.16 18.37 34.55 23.07 19.25 34.8 51.0 35.8 58.45 17.09 43.87 38.79 36.93 39.48 31.72 48.33 34.65 10.2 21.14 24.81 45.71 30.25 30.14
Sro1628_g287030.1 (Contig1353.g12488)
0.02 1.03 0.28 22.51 5.12 0.42 1.8 0.9 0.69 3.34 1.61 4.91 2.21 2.61 2.2 2.37 1.51 1.48 1.47 2.87 3.56 2.5 0.77 1.99 3.15 1.93 1.5
Sro163_g073400.1 (Contig1793.g15873)
0.05 8.23 18.67 15.18 9.34 2.21 1.35 2.48 0.59 4.08 2.05 4.82 5.22 2.92 4.01 7.02 4.0 2.69 4.31 3.61 3.66 1.28 0.75 2.5 3.28 1.09 3.84
Sro178_g078060.1 (Contig275.g3531)
0.0 14.53 15.44 22.53 20.05 1.09 7.74 3.31 3.47 5.7 4.89 5.9 13.72 8.37 5.2 4.25 2.64 5.68 5.74 7.61 4.91 4.59 2.87 7.43 11.42 6.52 3.46
Sro1790_g297750.1 (Contig4724.g35073)
0.0 1.78 0.89 24.93 2.33 2.68 2.18 4.45 0.99 6.01 2.8 13.51 0.49 1.94 2.53 3.92 0.48 1.04 1.78 3.92 7.52 1.64 0.65 1.19 2.77 1.4 2.09
Sro182_g079380.1 (Contig1301.g12074)
0.12 0.31 0.17 11.11 2.74 0.35 0.74 0.66 0.52 2.34 1.78 2.93 2.49 1.06 1.14 1.42 0.76 0.96 1.77 3.83 2.06 0.41 0.4 1.11 1.0 0.56 1.24
Sro2143_g316230.1 (Contig60.g482)
12.05 39.49 43.46 36.64 38.04 23.98 29.75 26.06 21.18 48.0 45.75 61.21 30.69 27.61 38.08 29.45 43.89 53.51 54.53 42.17 54.31 14.34 20.44 31.24 62.54 35.3 31.19
Sro2209_g319150.1 (Contig3038.g24221)
0.05 1.27 1.68 27.73 6.4 0.0 0.81 0.19 1.86 1.93 0.2 0.2 13.77 5.29 1.59 0.51 1.25 15.94 14.54 13.49 0.91 1.03 0.93 0.95 1.5 0.73 0.59
Sro227_g092330.1 (Contig327.g4345)
0.43 23.97 21.08 17.98 22.31 17.3 20.5 25.18 12.68 11.56 15.79 6.88 21.72 13.0 18.29 20.33 6.97 24.67 10.46 9.55 12.37 7.44 9.95 25.55 20.82 14.4 11.99
Sro2287_g322040.1 (Contig411.g5553)
200.49 58.21 105.78 83.65 79.08 38.07 125.85 131.33 70.88 68.26 188.72 86.11 93.0 15.76 134.74 346.17 151.83 78.36 39.46 70.83 73.53 27.08 58.46 316.56 180.64 109.83 120.94
Sro228_g092700.1 (Contig1235.g11584)
55.41 70.48 155.12 129.54 133.25 24.34 41.41 36.2 32.95 71.31 41.76 110.98 62.05 34.58 50.99 124.71 27.62 44.67 57.43 78.78 65.9 15.73 34.24 40.64 75.93 57.72 41.17
Sro231_g093650.1 (Contig3051.g24278)
0.31 80.9 91.28 114.47 111.53 101.24 32.51 35.58 28.63 54.25 212.91 16.79 24.5 14.99 138.91 160.28 194.9 257.08 113.76 34.25 17.42 20.17 35.75 127.4 179.21 131.16 107.84
Sro2354_g324510.1 (Contig74.g790)
0.03 0.52 1.04 9.48 2.13 0.06 1.38 0.35 0.06 1.72 1.08 1.69 6.02 0.27 1.44 0.85 1.7 3.71 3.86 5.7 2.75 0.43 0.08 1.63 1.76 2.13 0.72
Sro273_g105250.1 (Contig4205.g32006)
0.12 2.9 1.84 39.11 12.25 5.59 5.96 4.57 3.2 9.77 11.35 12.43 4.6 3.14 8.19 6.59 6.38 9.6 13.19 11.23 14.84 6.15 1.77 7.61 7.6 7.73 9.36
Sro274_g105430.1 (Contig1557.g14167)
0.87 84.65 60.86 76.83 56.29 9.76 30.86 19.31 15.36 35.09 32.73 28.75 46.76 21.88 45.36 68.76 26.37 70.54 22.18 42.24 29.48 2.94 13.49 35.8 50.55 29.8 23.82
Sro2939_g340650.1 (Contig2223.g18461)
10.98 70.39 92.07 180.53 162.6 34.91 47.76 32.33 25.55 43.56 44.95 49.0 17.7 45.74 59.56 47.58 41.33 30.13 20.0 18.21 47.18 19.67 28.47 63.64 86.45 50.79 28.31
Sro2_g001750.1 (Contig467.g6333)
7.04 7.78 8.14 26.64 8.1 1.15 4.66 3.09 3.36 7.24 5.44 7.17 14.23 2.48 4.43 7.1 3.8 5.27 4.5 14.79 10.38 0.06 2.99 8.21 16.96 5.49 2.97
Sro300_g111610.1 (Contig270.g3449)
0.06 5.0 7.93 17.33 11.61 4.84 3.53 6.05 1.66 5.34 6.7 2.71 9.76 0.32 6.17 7.63 7.92 19.87 11.86 11.87 5.1 1.62 1.0 12.59 21.43 10.05 6.0
Sro31_g020110.1 (Contig420.g5606)
0.49 1.83 2.25 17.17 6.77 1.0 3.82 2.52 1.0 5.04 4.49 7.27 5.63 5.94 4.57 6.89 4.74 8.24 4.71 9.3 5.27 0.96 1.73 5.2 6.1 3.39 2.66
Sro333_g119490.1 (Contig3012.g24045)
0.0 95.62 102.67 124.25 103.93 15.67 37.22 17.42 33.9 44.59 51.02 41.63 36.13 38.18 34.78 30.91 62.79 30.33 28.82 53.43 61.48 10.11 23.88 19.93 54.37 20.78 26.73
Sro405_g136220.1 (Contig597.g7447)
0.25 0.77 0.86 24.48 4.8 2.33 5.07 3.89 0.92 9.49 5.79 11.94 7.03 9.5 7.83 9.6 6.18 6.24 11.49 11.79 10.76 2.71 1.59 6.3 11.55 7.9 5.25
Sro461_g147630.1 (Contig3552.g27417)
0.11 2.34 4.25 2.98 3.28 12.72 11.83 15.06 6.92 7.9 11.98 8.04 6.63 7.89 12.64 13.37 6.99 11.73 4.58 3.81 11.25 0.8 4.44 11.84 13.01 6.83 10.11
Sro49_g028890.1 (Contig2054.g17639)
2.61 11.02 7.11 15.43 18.58 3.35 12.31 5.21 8.53 11.54 10.63 16.58 11.31 12.44 13.35 13.17 9.5 11.03 9.3 17.39 13.4 3.02 6.07 13.04 22.2 20.18 7.94
Sro537_g162250.1 (Contig1194.g11277)
0.03 1.52 0.53 11.15 3.1 0.21 2.52 0.9 0.69 2.88 1.19 3.5 2.98 5.12 1.89 2.83 1.03 2.7 1.55 4.09 5.76 1.62 0.51 2.18 4.48 2.54 0.98
Sro575_g169360.1 (Contig1981.g16954)
3.25 32.87 28.94 37.89 31.21 5.15 10.78 8.63 7.38 16.48 16.32 18.82 19.84 14.32 12.89 13.08 14.81 19.91 11.54 20.96 20.2 3.48 5.04 15.67 26.58 11.83 8.13
Sro585_g170960.1 (Contig3766.g28920)
0.33 28.16 29.71 28.76 21.48 2.51 6.55 3.67 3.2 9.59 8.66 10.24 11.24 4.02 9.25 13.68 6.89 4.6 5.84 11.57 8.87 1.4 2.06 9.77 10.86 6.1 6.69
Sro592_g172170.1 (Contig2562.g20819)
31.54 5.45 5.75 132.22 58.18 2.28 3.0 4.08 3.01 13.71 3.24 26.62 4.0 2.69 2.56 2.56 3.56 7.26 6.86 8.36 12.37 3.44 3.52 7.13 11.06 3.8 3.61
Sro651_g181570.1 (Contig2568.g20861)
0.58 3.1 2.44 1.04 1.51 1.75 20.29 18.73 7.67 25.13 9.93 20.42 17.66 7.76 20.64 41.78 6.65 115.14 86.37 36.35 34.8 10.2 3.62 16.8 18.74 12.25 16.72
Sro685_g186860.1 (Contig1991.g17041)
0.0 25.91 30.16 43.99 41.33 9.17 15.75 16.6 10.4 14.41 22.61 8.15 35.84 16.18 18.43 23.12 13.54 23.75 22.5 30.9 11.04 11.15 13.02 29.2 38.0 27.53 22.3
Sro697_g189080.1 (Contig3345.g26207)
0.13 10.3 9.3 18.84 21.77 16.95 12.37 9.06 1.98 12.65 23.08 8.02 8.94 6.78 21.27 14.87 16.03 71.81 51.83 18.47 11.26 1.85 2.5 23.92 27.55 30.81 22.18
Sro709_g190870.1 (Contig1341.g12353)
0.68 10.38 6.84 89.16 20.26 0.49 11.25 16.49 6.06 13.71 8.83 16.29 11.45 9.08 10.97 9.5 11.81 5.56 10.8 17.95 17.75 16.13 4.46 10.51 19.22 10.03 13.07
Sro719_g192430.1 (Contig661.g7829)
0.0 0.61 2.89 2.31 1.18 0.11 0.11 0.02 0.0 0.77 0.48 0.74 0.8 0.61 0.78 1.14 0.2 0.21 0.3 0.4 0.85 0.0 0.0 0.45 0.46 0.17 1.05
Sro731_g194250.1 (Contig3971.g30485)
52.72 49.48 52.37 147.65 116.82 29.59 44.41 28.91 16.8 60.55 92.75 91.14 56.65 32.6 89.13 69.1 61.34 78.25 47.98 81.94 59.29 5.89 10.87 150.03 168.07 92.44 55.27
Sro76_g041530.1 (Contig184.g2131)
0.28 36.51 49.2 121.87 96.57 22.52 30.11 19.18 2.28 28.95 59.14 12.16 19.63 8.53 57.77 73.82 44.98 106.16 92.34 29.46 23.11 0.77 2.96 124.25 105.41 65.55 46.29
Sro780_g201460.1 (Contig2838.g22780)
15.9 12.38 15.67 20.35 19.75 12.33 13.2 8.1 5.65 25.24 28.33 23.98 20.59 14.71 21.1 19.56 17.13 39.73 52.03 33.76 25.52 1.91 4.83 17.65 27.17 20.87 24.89
Sro806_g205060.1 (Contig1260.g11792)
0.49 15.92 23.21 28.12 24.11 3.48 4.37 4.22 2.07 9.09 8.07 9.8 5.5 7.09 6.1 10.32 3.01 4.72 5.85 3.38 8.91 2.46 2.22 7.89 14.38 6.98 4.76
Sro810_g205760.1 (Contig3420.g26654)
0.37 16.51 24.63 34.23 41.44 14.64 23.03 18.84 13.94 23.07 21.29 22.27 37.78 26.53 31.54 41.92 21.13 45.41 25.4 32.21 28.46 8.73 11.71 43.55 73.43 48.49 17.3
Sro855_g211490.1 (Contig1132.g10863)
0.23 24.2 19.42 28.78 28.69 2.6 10.27 7.48 1.91 9.29 12.28 7.38 13.34 3.22 18.16 25.41 7.88 18.23 8.92 15.72 6.06 2.89 2.51 21.4 24.98 12.7 9.44
Sro885_g216160.1 (Contig1350.g12425)
5.68 18.7 20.63 18.5 16.04 6.07 15.3 18.2 11.66 13.6 14.75 15.21 16.04 8.16 14.77 11.82 9.58 9.35 13.03 19.78 14.59 8.39 8.4 20.95 26.58 12.86 10.81
Sro934_g221860.1 (Contig2403.g19673)
10.88 70.1 119.28 106.74 52.97 3.38 20.69 37.54 17.37 22.76 34.63 11.61 7.99 0.44 96.34 135.8 22.56 40.85 3.0 3.99 9.02 1.32 2.55 60.91 145.62 54.59 58.53
Sro954_g224310.1 (Contig1658.g14943)
11.23 41.46 57.82 62.71 67.46 12.29 22.55 37.52 21.83 21.83 52.67 10.55 26.77 13.39 46.53 28.08 29.04 68.26 109.37 32.75 18.34 8.26 22.0 152.1 97.77 76.9 28.53
Sro965_g225560.1 (Contig945.g9785)
6.85 15.96 20.77 15.6 16.33 6.45 21.81 17.88 7.38 10.33 13.1 9.47 13.52 6.12 14.74 25.65 13.11 17.73 7.14 10.36 11.59 7.92 7.99 30.48 30.51 23.76 14.3
Sro994_g229040.1 (Contig3591.g27756)
0.02 0.0 0.12 3.59 0.7 0.41 0.3 0.19 0.03 0.64 0.05 1.14 0.5 0.03 0.45 0.13 0.18 0.37 0.73 1.1 0.27 0.01 0.03 1.0 0.67 1.29 0.47
0.0 0.06 0.14 4.83 1.66 0.0 0.31 0.35 0.31 0.39 0.54 0.27 0.4 0.14 0.31 0.15 0.36 0.64 0.73 0.68 0.27 0.1 0.12 0.54 2.07 0.5 0.43
Sro994_g229050.1 (Contig3591.g27757)
0.02 0.0 0.0 0.7 0.36 0.01 0.07 0.15 0.05 0.08 0.17 0.03 0.03 0.04 0.06 0.03 0.05 0.1 0.08 0.02 0.05 0.0 0.04 0.21 0.22 0.24 0.08

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)