Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1008_g230590.1 (Contig601.g7488)
0.04 0.86 0.97 0.87 0.71 0.29 0.36 0.59 0.71 0.4 0.82 0.48 0.62 0.3 0.45 0.27 0.5 0.18 0.27 0.41 0.26 0.58 0.62 1.0 0.56 0.29 0.38
Sro1029_g233320.1 (Contig460.g6205)
0.04 0.88 1.0 0.66 0.62 0.26 0.34 0.49 0.47 0.38 0.47 0.46 0.89 0.65 0.41 0.44 0.3 0.34 0.53 0.35 0.25 0.42 0.54 0.34 0.17 0.23 0.37
Sro105_g053090.1 (Contig544.g6998)
0.01 0.02 0.08 0.1 0.11 0.05 0.38 0.45 0.41 0.19 0.29 0.1 0.8 0.31 0.22 0.17 0.21 0.84 0.55 1.0 0.24 0.14 0.46 0.5 0.63 0.41 0.14
Sro1078_g238760.1 (Contig3778.g29010)
0.0 0.83 1.0 0.83 0.63 0.36 0.37 0.35 0.36 0.32 0.63 0.24 0.37 0.22 0.45 0.31 0.58 0.28 0.29 0.31 0.28 0.19 0.38 0.26 0.28 0.33 0.45
Sro1084_g239490.1 (Contig3162.g25056)
0.01 0.61 1.0 0.8 0.62 0.29 0.28 0.52 0.63 0.28 0.58 0.25 0.14 0.06 0.34 0.19 0.51 0.31 0.31 0.17 0.31 0.34 0.61 0.29 0.2 0.24 0.23
Sro110_g055080.1 (Contig1501.g13731)
0.01 0.54 0.72 0.38 0.4 0.52 0.67 0.81 1.0 0.66 0.64 0.72 0.77 0.76 0.64 0.81 0.9 0.63 0.81 0.74 0.58 0.23 0.75 0.41 0.38 0.54 0.64
Sro1113_g242720.1 (Contig761.g8646)
0.05 0.63 0.96 0.87 0.63 0.6 0.69 0.95 0.68 0.52 0.86 0.41 1.0 0.41 0.69 0.67 0.97 0.97 0.98 0.87 0.5 0.41 0.73 0.42 0.62 0.61 0.71
Sro1125_g243890.1 (Contig4623.g34495)
0.0 0.41 0.25 0.34 0.26 0.17 0.48 0.25 0.34 0.22 0.35 0.09 0.68 0.04 0.29 0.36 0.24 1.0 0.59 0.52 0.17 0.05 0.24 0.61 0.91 0.52 0.37
Sro1228_g254370.1 (Contig2695.g21738)
0.02 0.25 0.54 0.29 0.24 0.29 0.32 0.68 0.4 0.3 0.62 0.23 1.0 0.26 0.49 0.55 0.44 0.41 0.41 0.77 0.24 0.31 0.39 0.25 0.23 0.27 0.43
Sro1331_g263500.1 (Contig1733.g15456)
0.0 0.79 1.0 0.73 0.76 0.43 0.38 0.68 0.93 0.41 0.78 0.41 0.42 0.39 0.56 0.58 0.69 0.37 0.53 0.36 0.28 0.32 0.69 0.34 0.18 0.26 0.56
Sro1369_g266900.1 (Contig3578.g27661)
0.0 0.57 1.0 0.75 0.55 0.12 0.19 0.36 0.22 0.14 0.23 0.15 0.26 0.12 0.13 0.13 0.22 0.4 0.23 0.17 0.08 0.28 0.2 0.22 0.24 0.18 0.15
Sro1392_g268890.1 (Contig2185.g18224)
0.06 0.61 1.0 0.74 0.58 0.16 0.24 0.44 0.35 0.34 0.42 0.31 0.28 0.2 0.33 0.37 0.31 0.13 0.26 0.23 0.39 0.18 0.23 0.27 0.32 0.22 0.39
Sro1567_g282930.1 (Contig3738.g28659)
0.03 0.22 0.38 0.45 0.44 0.22 0.5 0.36 0.36 0.33 0.47 0.28 0.62 0.31 0.48 0.87 0.39 0.94 0.7 0.7 0.53 0.16 0.37 0.6 1.0 0.5 0.38
Sro161_g072640.1 (Contig3982.g30605)
0.01 0.65 1.0 0.38 0.35 0.1 0.21 0.16 0.21 0.31 0.3 0.35 0.42 0.15 0.24 0.26 0.25 0.37 0.48 0.39 0.33 0.18 0.25 0.19 0.15 0.21 0.25
Sro168_g074930.1 (Contig1642.g14824)
0.01 0.39 1.0 0.57 0.52 0.26 0.3 0.56 0.66 0.33 0.5 0.28 0.73 0.45 0.35 0.33 0.55 0.63 0.97 0.49 0.34 0.42 0.54 0.33 0.33 0.31 0.39
Sro1939_g306550.1 (Contig1997.g17090)
0.06 0.7 1.0 0.6 0.88 0.13 0.18 0.54 0.36 0.23 0.42 0.23 0.22 0.23 0.29 0.48 0.24 0.31 0.13 0.16 0.21 0.24 0.5 0.16 0.11 0.08 0.37
Sro1981_g309160.1 (Contig1131.g10844)
0.0 0.77 1.0 0.74 0.55 0.34 0.3 0.48 0.79 0.29 0.51 0.24 0.34 0.2 0.44 0.18 0.74 0.85 0.46 0.3 0.29 0.34 0.78 0.45 0.12 0.22 0.3
Sro19_g013580.1 (Contig446.g6022)
0.01 0.91 0.77 0.57 0.5 0.15 0.3 0.26 0.26 0.33 0.5 0.34 1.0 0.18 0.36 0.32 0.6 0.43 0.59 0.74 0.3 0.27 0.21 0.25 0.22 0.16 0.33
Sro200_g084610.1 (Contig201.g2352)
0.01 0.29 0.66 0.7 0.54 0.43 0.45 0.81 0.66 0.48 0.87 0.48 1.0 0.48 0.59 0.57 0.65 0.75 0.85 0.86 0.36 0.33 0.61 0.24 0.22 0.35 0.61
Sro200_g084710.1 (Contig201.g2362)
0.03 0.98 1.0 0.81 0.84 0.35 0.4 0.83 0.66 0.4 0.7 0.25 0.35 0.22 0.45 0.48 0.75 0.75 0.45 0.26 0.38 0.32 0.54 0.45 0.47 0.54 0.61
Sro2055_g312830.1 (Contig940.g9756)
0.03 0.65 0.79 0.39 0.41 0.52 0.53 0.36 0.46 0.24 0.11 0.18 0.26 0.49 0.6 0.01 0.13 0.22 0.14 0.21 0.13 0.67 1.0 0.29 0.26 0.28 0.12
Sro205_g086390.1 (Contig2217.g18452)
0.0 0.74 1.0 0.7 0.86 0.2 0.33 0.76 0.57 0.38 0.59 0.45 0.47 0.34 0.41 0.52 0.43 0.27 0.34 0.21 0.3 0.36 0.42 0.56 0.62 0.3 0.4
Sro222_g091120.1 (Contig3134.g24875)
0.03 0.29 0.56 0.51 0.49 0.36 0.32 0.81 0.46 0.32 0.61 0.36 1.0 0.47 0.49 0.39 0.54 0.7 0.68 0.55 0.24 0.27 0.3 0.29 0.16 0.21 0.39
Sro2417_g326930.1 (Contig3438.g26759)
0.13 0.69 1.0 0.83 0.65 0.34 0.28 0.36 0.46 0.36 0.57 0.41 0.44 0.25 0.4 0.49 0.66 0.37 0.35 0.41 0.26 0.21 0.51 0.15 0.1 0.18 0.41
0.01 0.51 0.66 0.43 0.41 0.41 0.75 0.62 0.68 0.51 0.79 0.5 0.9 0.35 0.66 0.63 0.78 1.0 0.88 0.83 0.56 0.3 0.64 0.58 0.61 0.56 0.67
Sro2682_g334520.1 (Contig2860.g22935)
0.31 0.45 1.0 0.85 0.77 0.23 0.18 0.35 0.3 0.25 0.59 0.14 0.3 0.21 0.39 0.5 0.36 0.48 0.32 0.32 0.15 0.38 0.26 0.24 0.18 0.21 0.45
Sro283_g107790.1 (Contig4255.g32210)
0.0 0.81 0.78 1.0 0.82 0.25 0.19 0.37 0.53 0.33 0.54 0.2 0.74 0.33 0.38 0.27 0.25 0.22 0.43 0.85 0.35 0.2 0.4 0.26 0.31 0.41 0.44
Sro3047_g342790.1 (Contig4660.g34682)
0.05 0.53 1.0 0.77 0.56 0.22 0.22 0.38 0.38 0.44 0.41 0.39 0.55 0.28 0.38 0.46 0.4 0.45 0.84 0.72 0.5 0.27 0.3 0.29 0.32 0.37 0.42
Sro319_g116180.1 (Contig204.g2458)
0.03 0.73 1.0 0.61 0.5 0.31 0.17 0.42 0.42 0.3 0.28 0.28 0.29 0.23 0.25 0.22 0.71 0.33 0.78 0.28 0.23 0.36 0.42 0.32 0.11 0.23 0.25
Sro321_g116850.1 (Contig56.g441)
0.02 0.73 1.0 0.76 0.67 0.54 0.65 0.89 0.65 0.38 0.58 0.34 0.67 0.29 0.5 0.49 0.56 0.69 0.63 0.57 0.32 0.39 0.57 0.19 0.2 0.25 0.52
Sro331_g119130.1 (Contig3186.g25150)
0.05 0.41 1.0 0.33 0.27 0.24 0.26 0.18 0.2 0.34 0.35 0.38 0.43 0.2 0.38 0.4 0.31 0.57 0.58 0.46 0.38 0.08 0.15 0.29 0.27 0.24 0.29
0.01 0.56 0.75 0.5 0.51 0.31 0.94 1.0 0.94 0.47 0.67 0.48 0.97 0.25 0.56 0.48 0.63 0.98 0.87 0.83 0.48 0.44 0.86 0.8 0.94 0.64 0.53
Sro378_g130180.1 (Contig2744.g22061)
0.03 0.79 0.99 0.89 0.67 0.28 0.24 0.09 0.22 0.41 0.52 0.39 0.79 0.37 0.35 0.32 0.52 0.6 0.81 1.0 0.37 0.07 0.2 0.32 0.15 0.2 0.36
Sro391_g133040.1 (Contig2759.g22205)
0.0 0.69 1.0 0.61 0.57 0.1 0.12 0.63 0.65 0.43 0.31 0.65 0.48 0.27 0.23 0.13 0.37 0.19 0.47 0.2 0.25 0.65 0.53 0.46 0.21 0.14 0.18
Sro42_g025480.1 (Contig312.g4125)
0.0 0.72 1.0 0.8 0.62 0.18 0.31 0.31 0.37 0.51 0.52 0.54 0.77 0.47 0.41 0.51 0.57 0.45 0.65 0.91 0.51 0.25 0.46 0.33 0.46 0.43 0.36
Sro479_g151230.1 (Contig1858.g16258)
0.04 0.43 0.74 0.55 0.39 0.58 0.3 0.73 0.65 0.62 0.91 0.71 0.96 0.56 0.79 0.79 0.89 0.8 0.96 1.0 0.69 0.38 0.56 0.17 0.15 0.33 0.74
Sro481_g151600.1 (Contig3107.g24718)
0.02 0.44 1.0 0.65 0.47 0.34 0.32 0.2 0.39 0.37 0.41 0.32 0.45 0.32 0.38 0.45 0.34 0.32 0.63 0.58 0.4 0.12 0.32 0.23 0.34 0.34 0.36
0.03 0.63 1.0 0.41 0.4 0.04 0.29 0.11 0.19 0.37 0.5 0.31 0.48 0.18 0.34 0.25 0.36 0.26 0.42 0.56 0.45 0.0 0.14 0.3 0.22 0.19 0.26
Sro4_g003280.1 (Contig3815.g29246)
0.01 0.59 1.0 0.39 0.42 0.36 0.25 0.4 0.51 0.28 0.52 0.22 0.49 0.33 0.33 0.22 0.48 0.27 0.5 0.38 0.17 0.56 0.45 0.35 0.21 0.24 0.24
Sro565_g167650.1 (Contig2465.g20190)
0.0 0.88 1.0 0.54 0.63 0.35 0.58 0.81 0.66 0.32 0.6 0.17 0.79 0.29 0.52 0.4 0.48 0.33 0.66 0.44 0.1 0.8 0.85 0.14 0.11 0.22 0.54
Sro56_g032970.1 (Contig3029.g24173)
0.01 1.0 0.89 0.67 0.75 0.21 0.27 0.55 0.53 0.38 0.51 0.42 0.58 0.26 0.35 0.36 0.43 0.65 0.6 0.49 0.42 0.19 0.35 0.27 0.21 0.16 0.35
Sro582_g170430.1 (Contig2996.g23799)
0.0 0.45 1.0 0.71 0.54 0.11 0.29 0.49 0.57 0.3 0.38 0.26 0.44 0.24 0.29 0.17 0.23 0.19 0.33 0.41 0.29 0.46 0.28 0.45 0.46 0.27 0.28
Sro61_g034940.1 (Contig3112.g24747)
0.0 0.37 1.0 0.66 0.61 0.11 0.08 0.25 0.15 0.16 0.36 0.14 0.12 0.13 0.2 0.25 0.18 0.31 0.18 0.1 0.14 0.09 0.26 0.11 0.15 0.11 0.15
Sro624_g177370.1 (Contig2249.g18642)
0.01 0.52 0.84 0.8 0.84 0.51 0.59 0.8 0.81 0.4 0.3 0.49 0.91 0.74 0.58 0.08 0.38 0.77 0.91 0.49 0.49 0.58 1.0 0.76 0.35 0.21 0.24
Sro663_g183460.1 (Contig119.g1344)
0.0 1.0 0.74 0.53 0.45 0.12 0.35 0.51 0.44 0.36 0.51 0.4 0.26 0.13 0.28 0.23 0.56 0.34 0.31 0.26 0.53 0.13 0.34 0.21 0.1 0.2 0.39
Sro70_g038800.1 (Contig3352.g26227)
0.0 0.62 1.0 0.53 0.46 0.39 0.41 0.56 0.55 0.39 0.67 0.37 0.54 0.21 0.49 0.46 0.67 0.58 0.59 0.52 0.42 0.16 0.48 0.26 0.3 0.35 0.55
Sro794_g203420.1 (Contig1634.g14711)
0.0 1.0 0.98 0.64 0.45 0.07 0.14 0.66 0.4 0.19 0.31 0.09 0.06 0.04 0.2 0.4 0.23 0.37 0.22 0.08 0.4 0.19 0.22 0.17 0.13 0.22 0.31
Sro794_g203430.1 (Contig1634.g14712)
0.05 1.0 0.65 0.41 0.46 0.05 0.28 0.77 0.31 0.14 0.16 0.08 0.09 0.14 0.2 0.22 0.1 0.27 0.1 0.07 0.11 0.15 0.23 0.17 0.05 0.06 0.21
Sro84_g044660.1 (Contig220.g2599)
0.59 0.7 0.79 0.83 0.79 0.6 0.53 0.68 0.82 0.7 1.0 0.82 0.63 0.43 0.79 0.67 0.73 0.49 0.6 0.53 0.74 0.47 0.67 0.79 0.78 0.59 0.69
Sro84_g044800.1 (Contig220.g2613)
0.13 0.69 0.96 0.97 0.91 0.31 0.5 0.43 0.6 0.58 0.99 0.58 1.0 0.44 0.66 0.77 0.66 0.64 0.79 0.99 0.6 0.4 0.46 0.39 0.37 0.45 0.68
Sro851_g210810.1 (Contig461.g6207)
0.01 0.65 1.0 0.53 0.33 0.2 0.29 0.14 0.2 0.32 0.24 0.34 0.21 0.19 0.29 0.28 0.35 0.09 0.32 0.29 0.32 0.0 0.14 0.18 0.22 0.27 0.2
Sro887_g216370.1 (Contig1780.g15777)
0.01 0.7 1.0 0.61 0.46 0.23 0.23 0.33 0.46 0.39 0.27 0.46 0.34 0.19 0.27 0.3 0.54 0.56 0.73 0.37 0.43 0.22 0.38 0.23 0.1 0.23 0.29
Sro8_g006870.1 (Contig89.g1000)
0.01 0.53 1.0 0.41 0.38 0.22 0.44 0.2 0.4 0.42 0.36 0.52 0.63 0.4 0.35 0.35 0.45 0.56 0.77 0.65 0.4 0.09 0.37 0.27 0.23 0.42 0.33
Sro919_g220170.1 (Contig2964.g23554)
0.01 0.04 0.08 0.1 0.09 0.16 0.18 0.26 0.25 0.22 0.54 0.28 1.0 0.34 0.37 0.25 0.74 0.78 0.66 0.43 0.17 0.07 0.14 0.16 0.08 0.1 0.31
Sro961_g224930.1 (Contig1333.g12279)
0.54 0.74 1.0 0.97 0.92 0.28 0.48 0.47 0.57 0.61 0.56 0.63 0.73 0.53 0.45 0.5 0.62 0.48 0.59 0.66 0.66 0.38 0.57 0.38 0.63 0.51 0.41
Sro96_g049670.1 (Contig3763.g28893)
0.01 0.61 1.0 0.62 0.37 0.15 0.35 0.29 0.36 0.37 0.48 0.41 0.6 0.2 0.38 0.35 0.69 0.65 0.76 0.67 0.38 0.22 0.34 0.22 0.18 0.28 0.27
Sro989_g228500.1 (Contig1449.g13279)
0.52 0.57 0.65 0.63 0.66 0.39 0.46 0.45 0.49 0.54 0.63 0.54 1.0 0.47 0.6 0.79 0.77 0.56 0.63 0.95 0.52 0.25 0.44 0.38 0.38 0.35 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)