Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1008_g230590.1 (Contig601.g7488)
1.02 20.58 23.11 20.86 16.93 7.02 8.55 14.11 16.87 9.54 19.5 11.44 14.87 7.19 10.65 6.53 11.86 4.2 6.32 9.87 6.27 13.84 14.76 23.85 13.43 6.89 9.01
Sro1029_g233320.1 (Contig460.g6205)
5.07 100.14 113.64 75.37 69.9 29.32 38.82 55.37 53.56 43.28 53.78 52.06 101.33 73.56 47.02 49.7 34.08 38.49 60.19 39.36 28.33 47.42 60.87 38.63 19.47 25.84 41.85
Sro105_g053090.1 (Contig544.g6998)
0.13 0.33 1.51 1.89 2.08 1.03 7.08 8.47 7.76 3.68 5.44 1.91 15.14 5.88 4.2 3.14 3.87 15.8 10.29 18.87 4.52 2.63 8.63 9.52 11.87 7.83 2.64
Sro1078_g238760.1 (Contig3778.g29010)
0.07 32.85 39.44 32.92 24.77 14.09 14.53 13.91 14.12 12.46 24.71 9.62 14.75 8.63 17.73 12.33 22.72 10.95 11.62 12.25 10.93 7.53 15.01 10.18 10.85 13.02 17.84
Sro1084_g239490.1 (Contig3162.g25056)
0.21 17.97 29.27 23.38 18.07 8.51 8.13 15.11 18.55 8.21 17.03 7.26 3.96 1.73 9.89 5.52 15.0 8.96 9.11 4.95 9.16 9.88 17.79 8.45 5.71 6.98 6.65
Sro110_g055080.1 (Contig1501.g13731)
0.3 13.98 18.48 9.91 10.21 13.34 17.18 20.83 25.76 17.01 16.42 18.62 19.89 19.63 16.53 20.83 23.19 16.3 20.76 19.02 14.96 6.03 19.19 10.62 9.72 14.02 16.59
Sro1113_g242720.1 (Contig761.g8646)
1.84 21.95 33.34 30.36 22.01 20.8 23.88 33.0 23.65 18.01 29.96 14.24 34.81 14.39 23.91 23.35 33.61 33.92 34.21 30.32 17.56 14.13 25.48 14.69 21.48 21.34 24.65
Sro1125_g243890.1 (Contig4623.g34495)
0.73 89.22 53.48 73.24 57.16 35.88 103.2 54.58 74.14 48.53 75.08 19.48 147.69 8.4 63.11 77.54 51.7 216.41 127.84 112.2 37.45 11.8 51.58 133.08 197.34 112.71 79.61
Sro1228_g254370.1 (Contig2695.g21738)
1.74 24.59 52.86 28.35 23.53 28.0 30.77 65.7 38.51 28.85 59.79 22.4 97.01 24.88 47.83 53.56 42.54 39.34 40.18 74.58 22.82 29.82 37.91 23.89 22.03 26.47 42.13
Sro1331_g263500.1 (Contig1733.g15456)
0.01 11.26 14.27 10.47 10.8 6.1 5.47 9.72 13.22 5.85 11.2 5.79 6.03 5.61 7.97 8.29 9.86 5.29 7.6 5.11 3.97 4.59 9.85 4.86 2.51 3.65 7.98
Sro1369_g266900.1 (Contig3578.g27661)
0.12 42.12 74.53 56.12 40.64 8.77 14.37 26.62 16.6 10.77 16.81 10.9 19.52 8.92 9.64 9.45 16.69 29.76 17.23 13.04 5.66 21.23 15.09 16.41 18.25 13.11 10.92
Sro1392_g268890.1 (Contig2185.g18224)
11.43 120.97 198.01 146.36 115.39 31.27 47.48 87.85 68.8 67.11 82.33 62.12 55.7 39.41 64.74 73.2 61.21 26.24 52.04 46.01 77.41 36.03 45.31 52.98 63.95 44.13 77.84
Sro1567_g282930.1 (Contig3738.g28659)
1.21 8.72 15.18 17.97 17.6 8.87 20.16 14.46 14.61 13.33 18.93 11.19 24.9 12.32 19.32 34.92 15.74 37.63 28.15 27.96 21.42 6.32 14.82 24.01 40.2 20.29 15.24
Sro161_g072640.1 (Contig3982.g30605)
0.12 13.44 20.78 7.96 7.27 2.16 4.41 3.42 4.44 6.51 6.18 7.37 8.76 3.16 5.06 5.34 5.21 7.66 9.98 8.16 6.9 3.67 5.24 3.97 3.21 4.41 5.25
Sro168_g074930.1 (Contig1642.g14824)
2.8 108.02 278.01 157.77 143.43 70.99 84.27 156.12 183.8 91.71 138.11 77.69 203.53 125.61 97.18 92.4 152.7 176.02 269.01 135.7 93.26 116.18 149.52 91.1 90.49 86.4 107.45
Sro1939_g306550.1 (Contig1997.g17090)
4.71 50.66 72.76 43.44 64.06 9.69 13.28 39.28 26.5 16.78 30.2 16.88 16.24 16.87 21.19 34.9 17.28 22.2 9.13 11.57 15.2 17.64 36.28 11.77 7.81 5.47 26.79
Sro1981_g309160.1 (Contig1131.g10844)
0.24 48.5 63.02 46.72 34.87 21.33 18.75 30.28 49.56 18.06 32.0 15.03 21.67 12.4 27.46 11.45 46.86 53.54 29.07 18.94 18.37 21.25 49.03 28.4 7.83 13.84 18.9
Sro19_g013580.1 (Contig446.g6022)
0.23 17.68 15.06 11.2 9.72 2.89 5.91 5.04 5.13 6.46 9.73 6.7 19.5 3.56 7.09 6.26 11.61 8.47 11.54 14.47 5.84 5.36 4.08 4.84 4.24 3.03 6.38
Sro200_g084610.1 (Contig201.g2352)
0.3 15.12 34.68 37.21 28.43 22.76 23.71 42.75 34.8 25.17 45.68 25.13 52.81 25.48 31.24 30.17 34.32 39.8 44.81 45.62 19.09 17.3 32.01 12.41 11.56 18.57 32.18
Sro200_g084710.1 (Contig201.g2362)
1.22 35.36 36.25 29.49 30.3 12.7 14.64 30.03 24.06 14.47 25.22 9.01 12.85 7.91 16.48 17.52 27.28 27.31 16.16 9.53 13.72 11.69 19.61 16.42 17.04 19.42 22.21
Sro2055_g312830.1 (Contig940.g9756)
6.36 143.01 173.77 84.94 90.09 113.89 117.18 78.14 100.73 51.95 23.61 38.54 56.01 107.92 132.01 2.74 27.47 47.88 30.25 45.69 28.9 146.72 219.3 64.48 56.47 62.1 26.88
Sro205_g086390.1 (Contig2217.g18452)
0.09 31.84 43.25 30.16 37.03 8.65 14.31 32.91 24.66 16.36 25.73 19.25 20.31 14.61 17.63 22.33 18.77 11.84 14.65 9.29 13.19 15.51 18.3 24.03 26.68 13.06 17.28
Sro222_g091120.1 (Contig3134.g24875)
1.15 13.11 25.07 22.91 22.18 16.05 14.56 36.33 20.49 14.55 27.52 16.1 44.98 21.35 22.02 17.37 24.27 31.34 30.57 24.88 10.82 12.2 13.57 12.88 7.33 9.29 17.38
Sro2417_g326930.1 (Contig3438.g26759)
11.32 61.76 89.33 74.04 58.35 30.56 25.34 31.98 41.28 32.01 50.91 36.5 39.5 22.22 35.5 44.2 59.25 32.7 31.65 37.06 23.17 18.45 45.2 13.09 9.01 15.96 36.37
87.85 3400.97 4364.26 2876.25 2736.92 2724.47 5011.49 4092.01 4484.56 3413.2 5269.75 3354.42 5981.36 2315.3 4363.19 4206.54 5160.32 6643.15 5814.11 5536.39 3703.68 1965.23 4279.39 3846.78 4081.71 3693.39 4428.72
Sro2682_g334520.1 (Contig2860.g22935)
50.88 75.09 165.77 140.49 127.69 38.59 29.25 58.54 50.02 42.0 97.55 22.64 50.32 35.33 64.09 83.53 59.27 78.89 52.52 52.59 24.28 62.53 42.59 40.58 29.37 34.35 75.14
Sro283_g107790.1 (Contig4255.g32210)
0.0 11.65 11.25 14.45 11.81 3.63 2.75 5.31 7.67 4.72 7.76 2.96 10.76 4.78 5.44 3.87 3.66 3.14 6.28 12.22 4.99 2.9 5.78 3.76 4.45 5.93 6.43
Sro3047_g342790.1 (Contig4660.g34682)
1.04 10.79 20.28 15.62 11.32 4.45 4.48 7.68 7.64 8.85 8.37 7.91 11.23 5.68 7.76 9.38 8.03 9.07 16.94 14.64 10.04 5.57 6.1 5.85 6.52 7.46 8.48
Sro319_g116180.1 (Contig204.g2458)
0.17 4.19 5.74 3.49 2.86 1.78 1.0 2.43 2.41 1.71 1.61 1.63 1.66 1.3 1.44 1.26 4.05 1.87 4.51 1.6 1.32 2.06 2.42 1.83 0.62 1.3 1.41
Sro321_g116850.1 (Contig56.g441)
2.59 103.46 142.42 107.93 95.66 77.02 92.37 127.33 91.9 54.13 82.08 49.02 95.9 40.85 70.78 69.98 80.18 98.28 89.23 81.71 45.3 55.16 81.36 27.31 28.34 35.34 73.58
Sro331_g119130.1 (Contig3186.g25150)
20.46 159.02 384.53 127.19 105.01 90.77 100.67 68.94 78.05 129.0 135.22 146.69 165.94 76.97 144.28 154.97 120.09 218.74 224.12 178.39 145.7 29.08 59.46 110.71 102.48 93.65 113.07
19.01 1011.5 1346.85 898.23 921.53 552.44 1679.19 1791.99 1684.04 833.37 1198.05 852.58 1731.27 453.54 999.39 863.61 1131.66 1758.44 1561.92 1487.59 860.22 792.36 1549.78 1430.25 1679.44 1140.68 953.07
Sro378_g130180.1 (Contig2744.g22061)
0.13 3.75 4.7 4.21 3.16 1.32 1.13 0.42 1.04 1.93 2.46 1.85 3.73 1.76 1.66 1.53 2.47 2.84 3.83 4.74 1.76 0.35 0.95 1.53 0.71 0.93 1.69
Sro391_g133040.1 (Contig2759.g22205)
0.05 8.2 11.96 7.24 6.77 1.22 1.49 7.52 7.75 5.13 3.65 7.78 5.73 3.23 2.78 1.52 4.41 2.28 5.56 2.4 3.01 7.77 6.39 5.51 2.51 1.66 2.16
Sro42_g025480.1 (Contig312.g4125)
0.15 42.0 58.13 46.74 36.06 10.57 17.74 17.95 21.6 29.43 30.45 31.35 44.71 27.11 23.96 29.46 33.2 26.16 37.63 52.88 29.72 14.48 26.88 19.4 26.57 24.79 20.76
Sro479_g151230.1 (Contig1858.g16258)
2.92 29.85 51.03 37.92 27.01 39.97 20.85 50.43 44.92 43.24 63.04 49.51 66.58 38.83 54.53 54.38 61.54 55.23 66.31 69.25 47.44 26.17 38.9 11.89 10.7 22.91 50.95
Sro481_g151600.1 (Contig3107.g24718)
0.36 8.15 18.62 12.13 8.69 6.28 6.02 3.8 7.22 6.84 7.62 5.96 8.46 5.92 7.16 8.44 6.42 6.0 11.77 10.82 7.44 2.31 5.96 4.34 6.31 6.28 6.73
0.23 5.51 8.8 3.57 3.54 0.38 2.57 1.01 1.67 3.27 4.42 2.7 4.2 1.6 2.97 2.2 3.18 2.33 3.68 4.97 3.99 0.0 1.21 2.61 1.93 1.64 2.27
Sro4_g003280.1 (Contig3815.g29246)
0.29 18.2 30.64 12.05 12.77 11.14 7.64 12.37 15.5 8.69 15.98 6.81 15.02 10.08 10.01 6.84 14.81 8.37 15.18 11.54 5.09 17.16 13.81 10.83 6.39 7.37 7.44
Sro565_g167650.1 (Contig2465.g20190)
0.19 84.85 96.89 52.76 60.65 34.23 56.47 78.14 64.15 30.89 57.9 16.26 76.07 27.88 50.82 38.58 46.3 31.62 63.97 42.51 9.74 77.62 82.78 13.18 10.27 20.9 52.41
Sro56_g032970.1 (Contig3029.g24173)
0.2 34.51 30.79 23.25 25.92 7.15 9.48 19.0 18.34 13.09 17.62 14.53 19.99 8.85 11.92 12.57 14.93 22.47 20.64 16.92 14.57 6.65 11.98 9.44 7.41 5.67 12.05
Sro582_g170430.1 (Contig2996.g23799)
0.0 5.57 12.4 8.82 6.74 1.35 3.61 6.09 7.05 3.78 4.72 3.23 5.5 2.91 3.55 2.13 2.9 2.32 4.05 5.08 3.57 5.68 3.53 5.56 5.66 3.37 3.43
Sro61_g034940.1 (Contig3112.g24747)
0.17 60.85 163.61 107.41 100.13 17.37 13.01 41.55 25.09 26.93 58.69 23.1 19.41 21.59 32.41 41.66 30.23 49.94 29.56 16.09 22.21 14.47 42.77 18.47 24.41 18.42 25.13
Sro624_g177370.1 (Contig2249.g18642)
0.37 36.13 59.04 56.15 58.76 35.88 41.66 55.91 56.75 28.04 20.79 34.33 63.98 52.14 40.66 5.59 26.56 54.04 63.44 34.47 34.61 40.56 70.07 53.13 24.55 14.86 16.82
Sro663_g183460.1 (Contig119.g1344)
0.03 12.15 9.0 6.47 5.41 1.45 4.28 6.24 5.35 4.4 6.18 4.9 3.17 1.56 3.4 2.75 6.85 4.12 3.82 3.15 6.48 1.63 4.19 2.5 1.22 2.42 4.79
Sro70_g038800.1 (Contig3352.g26227)
0.2 57.23 91.62 48.82 42.39 36.05 37.94 51.47 50.65 35.44 61.49 34.1 49.79 18.9 45.18 42.08 61.59 52.82 53.92 47.93 38.93 14.74 43.82 23.88 27.76 32.01 50.36
Sro794_g203420.1 (Contig1634.g14711)
0.03 55.12 54.18 35.37 25.05 3.99 7.52 36.6 22.07 10.66 16.98 5.06 3.52 2.23 10.98 22.03 12.64 20.6 12.18 4.14 22.09 10.3 12.27 9.13 6.99 11.92 17.08
Sro794_g203430.1 (Contig1634.g14712)
3.17 65.06 42.57 26.99 30.17 3.25 18.23 50.37 20.39 9.16 10.36 5.19 5.61 9.23 13.08 14.13 6.21 17.47 6.54 4.53 7.08 9.69 14.72 10.82 3.25 3.66 13.85
Sro84_g044660.1 (Contig220.g2599)
50.84 60.46 68.63 71.69 69.04 52.26 45.91 59.43 71.52 60.45 86.88 71.27 54.3 37.36 68.44 58.53 63.38 42.54 51.71 45.69 64.42 40.84 58.0 69.01 68.13 51.52 60.3
Sro84_g044800.1 (Contig220.g2613)
8.22 43.15 59.96 60.72 56.93 19.19 31.62 26.71 37.77 36.69 62.28 36.42 62.76 27.59 41.28 48.04 41.47 39.98 49.86 62.41 37.88 25.29 29.07 24.36 23.2 28.45 42.73
Sro851_g210810.1 (Contig461.g6207)
0.12 8.06 12.34 6.56 4.12 2.46 3.6 1.68 2.41 3.96 3.0 4.22 2.57 2.32 3.6 3.51 4.33 1.06 3.93 3.54 3.99 0.0 1.71 2.25 2.67 3.33 2.44
Sro887_g216370.1 (Contig1780.g15777)
0.19 17.53 24.88 15.06 11.33 5.7 5.63 8.17 11.47 9.72 6.8 11.43 8.41 4.82 6.8 7.44 13.36 13.88 18.06 9.13 10.6 5.41 9.33 5.84 2.6 5.81 7.25
Sro8_g006870.1 (Contig89.g1000)
0.22 10.54 19.94 8.27 7.65 4.39 8.69 3.99 8.01 8.44 7.2 10.39 12.54 8.05 7.07 6.89 8.95 11.19 15.26 13.03 8.03 1.84 7.43 5.43 4.64 8.31 6.51
Sro919_g220170.1 (Contig2964.g23554)
0.52 1.98 4.33 5.37 4.82 8.37 9.54 13.78 12.96 11.45 28.19 14.49 52.54 18.11 19.58 13.0 39.05 41.17 34.44 22.46 8.77 3.62 7.46 8.57 4.44 5.31 16.23
Sro961_g224930.1 (Contig1333.g12279)
68.68 94.55 127.29 122.88 117.11 35.81 61.17 60.2 72.29 77.17 71.51 80.06 93.18 66.86 57.91 63.52 78.35 60.66 75.33 84.05 83.39 48.51 73.08 48.86 80.11 64.57 51.88
Sro96_g049670.1 (Contig3763.g28893)
0.04 3.47 5.69 3.53 2.13 0.86 1.97 1.67 2.07 2.13 2.71 2.33 3.42 1.15 2.17 2.01 3.92 3.71 4.33 3.83 2.19 1.27 1.91 1.24 1.04 1.6 1.53
Sro989_g228500.1 (Contig1449.g13279)
23.04 25.37 29.21 28.02 29.68 17.27 20.68 20.12 22.08 24.35 28.27 24.12 44.71 21.09 26.79 35.12 34.25 24.84 28.16 42.47 23.32 11.36 19.68 17.02 17.07 15.73 26.51

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)