Heatmap: Cluster_331 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1017_g231720.1 (Contig3686.g28447)	0.3	0.05	0.1	0.06	0.02	0.31	0.17	0.17	0.16	0.6	0.43	0.81	1.0	0.37	0.36	0.26	0.36	0.27	0.54	0.88	0.81	0.28	0.15	0.45	0.52	0.49	0.33
Sro111_g055400.1 (Contig567.g7217)	0.04	0.35	0.31	0.4	0.4	0.28	0.51	0.28	0.08	0.64	0.6	1.0	0.07	0.4	0.47	0.46	0.4	0.45	0.45	0.23	0.63	0.12	0.13	0.53	0.33	0.46	0.74
Sro11_g008590.1 (Contig724.g8333)	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.13	0.29	0.2	0.06	0.77	0.56	0.85	0.13	0.53	0.77	0.82	0.53	1.0	0.78	0.9	0.88	0.13	0.07	0.44	0.57	0.49	0.8
Sro1228_g254390.1 (Contig2695.g21740)	0.01	0.13	0.13	0.08	0.08	0.11	0.34	0.3	0.43	0.65	0.62	0.84	0.62	0.63	0.56	0.77	0.45	0.62	0.86	0.9	1.0	0.36	0.36	0.36	0.29	0.43	0.57
Sro1247_g255900.1 (Contig2843.g22830)	0.14	0.71	0.22	0.61	1.0	0.35	0.3	0.28	0.04	0.98	0.46	1.0	0.29	0.42	0.67	0.74	0.78	0.93	0.88	0.75	0.91	0.11	0.07	0.78	0.8	0.59	0.59
Sro1287_g259490.1 (Contig248.g3035)	0.01	0.06	0.09	0.04	0.05	0.33	0.33	0.24	0.05	0.61	0.71	0.91	0.56	0.43	0.47	0.49	0.59	0.55	1.0	0.95	0.74	0.21	0.17	0.43	0.57	0.55	0.51
Sro1322_g262550.1 (Contig3764.g28905)	0.03	0.17	0.08	0.07	0.12	0.28	0.36	0.32	0.13	0.69	0.52	1.0	0.38	0.55	0.42	0.29	0.37	0.59	0.5	0.71	0.73	0.25	0.12	0.37	0.32	0.35	0.48
Sro1323_g262680.1 (Contig273.g3514)	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.09	0.07	0.54	0.16	0.92	0.48	0.84	0.09	0.23	0.27	0.4	0.6	0.76	1.0	0.3	0.03	0.14	0.16	0.16	0.16
Sro1473_g275590.1 (Contig4548.g33990)	0.01	0.09	0.04	0.04	0.07	0.28	0.5	0.35	0.1	0.56	0.32	0.55	0.2	0.52	0.52	0.5	0.37	0.67	0.54	0.51	0.78	0.23	0.14	0.69	1.0	0.62	0.56
Sro151_g069310.1 (Contig294.g3857)	0.02	0.1	0.07	0.14	0.1	0.12	0.44	0.25	0.37	0.64	0.75	0.78	0.69	0.69	0.5	0.82	0.56	0.71	0.82	1.0	0.86	0.46	0.37	0.44	0.39	0.44	0.44
Sro1579_g283700.1 (Contig3855.g29671)	0.16	0.08	0.05	0.05	0.05	0.06	0.28	0.27	0.17	0.51	0.3	0.42	1.0	0.2	0.5	0.72	0.27	0.4	0.57	0.82	0.54	0.23	0.05	0.24	0.23	0.36	0.42
Sro1666_g289700.1 (Contig3636.g28071)	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.44	0.47	0.39	0.08	0.52	0.63	0.49	0.2	0.27	0.35	0.52	0.43	0.61	0.68	0.57	0.75	0.21	0.1	0.72	1.0	0.84	0.61
Sro16_g011820.1 (Contig916.g9619)	0.02	0.19	0.12	0.13	0.19	0.4	0.38	0.26	0.09	0.71	0.57	1.0	0.06	0.63	0.44	0.49	0.58	0.45	0.68	0.39	0.7	0.09	0.12	0.46	0.4	0.44	0.73
Sro1853_g301770.1 (Contig172.g1976)	0.02	0.06	0.04	0.05	0.07	0.48	0.32	0.47	0.25	0.66	0.53	0.82	0.73	0.35	0.52	0.4	0.61	0.9	0.92	1.0	0.96	0.31	0.32	0.49	1.0	0.94	0.65
Sro1959_g307970.1 (Contig1986.g16998)	0.02	0.18	0.12	0.1	0.09	0.35	0.51	0.38	0.2	0.7	0.55	0.81	0.1	0.43	0.57	0.52	0.45	0.68	0.74	0.72	0.83	0.28	0.21	0.7	1.0	0.78	0.85
Sro2041_g312250.1 (Contig4209.g32027)	0.03	1.0	0.6	0.78	0.62	0.4	0.36	0.4	0.12	0.67	0.79	0.6	0.23	0.55	0.73	0.7	0.69	0.6	0.55	0.49	0.61	0.16	0.12	0.59	0.56	0.56	0.95
Sro2146_g316460.1 (Contig984.g9994)	0.0	0.12	0.05	0.09	0.14	0.19	0.33	0.09	0.09	0.45	0.3	0.47	0.88	0.34	0.33	0.65	0.3	0.64	0.84	1.0	0.51	0.03	0.1	0.34	0.49	0.28	0.26
Sro228_g092720.1 (Contig1235.g11586)	0.01	0.12	0.04	0.07	0.19	0.09	0.44	0.16	0.08	0.76	0.44	0.89	0.14	0.21	0.5	0.63	0.54	0.78	0.92	0.73	0.83	0.03	0.03	0.44	1.0	0.49	0.7
Sro244_g097140.1 (Contig2788.g22430)	0.03	0.18	0.13	0.14	0.22	0.24	0.54	0.35	0.27	0.73	0.77	0.92	0.63	0.67	0.59	0.61	0.46	0.7	1.0	0.9	0.89	0.41	0.34	0.64	0.64	0.79	0.62
Sro247_g098150.1 (Contig3058.g24348)	0.06	0.14	0.11	0.04	0.04	0.52	0.52	0.36	0.13	0.7	0.77	0.95	0.2	0.26	0.67	0.75	0.53	0.54	0.76	0.65	1.0	0.53	0.22	0.67	0.76	0.81	0.7
Sro253_g099900.1 (Contig3900.g29908)	0.1	0.77	0.31	0.37	0.38	0.04	0.27	0.15	0.1	0.7	0.32	0.51	0.22	0.34	0.45	1.0	0.51	0.44	0.53	0.6	0.82	0.15	0.13	0.28	0.2	0.24	0.48
Sro2654_g333830.1 (Contig2938.g23360)	0.04	0.27	0.22	0.13	0.22	0.16	0.33	0.18	0.09	0.7	0.7	0.74	0.13	0.23	0.41	0.42	0.47	0.59	0.64	0.79	1.0	0.16	0.09	0.53	0.81	0.78	0.81
Sro2669_g334270.1 (Contig3859.g29705)	0.02	0.49	0.27	0.29	0.26	0.1	0.25	0.15	0.03	0.6	0.41	0.6	0.17	0.65	0.54	1.0	0.37	0.54	0.63	0.58	0.71	0.09	0.07	0.39	0.41	0.3	0.5
Sro276_g105890.1 (Contig2556.g20769)	0.01	0.16	0.15	0.32	0.1	0.23	0.37	0.35	0.11	0.58	0.39	0.62	0.17	0.4	0.51	0.57	0.27	0.6	1.0	0.56	0.64	0.14	0.09	0.65	0.62	0.43	0.43
Sro2864_g338910.1 (Contig307.g4023)	0.01	0.08	0.05	0.11	0.11	0.12	0.34	0.29	0.11	0.63	0.56	0.7	0.45	0.57	0.61	0.93	0.46	0.62	0.57	1.0	0.83	0.28	0.12	0.38	0.72	0.41	0.56
Sro287_g108650.1 (Contig252.g3106)	0.02	0.12	0.09	0.14	0.1	0.04	0.17	0.18	0.08	0.48	0.52	0.48	0.24	0.44	0.51	1.0	0.5	0.48	0.52	0.52	0.55	0.14	0.08	0.35	0.76	0.36	0.51
Sro312_g114630.1 (Contig2832.g22708)	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.3	0.37	0.26	0.11	0.7	0.71	0.81	0.72	0.28	0.48	0.68	0.41	0.66	0.89	1.0	0.85	0.23	0.09	0.63	0.86	0.62	0.64
Sro312_g114640.1 (Contig2832.g22709)	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.24	0.26	0.19	0.19	0.47	0.48	0.59	0.81	0.3	0.39	0.68	0.37	0.6	0.66	1.0	0.42	0.14	0.14	0.51	0.71	0.41	0.33
Sro328_g118730.1 (Contig3574.g27628)	0.02	0.1	0.07	0.24	0.15	0.3	0.33	0.2	0.06	0.71	0.58	0.82	0.32	0.35	0.53	0.84	0.68	0.72	0.59	0.67	0.97	0.08	0.04	0.58	1.0	0.53	0.58
Sro351_g123890.1 (Contig4381.g32943)	0.0	0.19	0.11	0.12	0.23	0.11	0.2	0.08	0.07	0.68	0.55	0.76	0.6	0.5	0.36	0.78	0.81	0.31	0.5	1.0	0.7	0.09	0.04	0.22	0.45	0.24	0.63
Sro352_g124290.1 (Contig2645.g21405)	0.01	0.22	0.15	0.18	0.26	0.4	0.61	0.4	0.16	0.78	0.47	1.0	0.1	0.34	0.68	0.94	0.69	0.69	0.42	0.35	0.78	0.02	0.09	0.73	0.92	0.5	0.91
Sro357_g125560.1 (Contig708.g8184)	0.01	0.19	0.16	0.19	0.12	0.14	0.3	0.23	0.16	0.59	0.64	0.61	0.35	0.39	0.3	0.31	0.35	0.36	1.0	0.86	0.7	0.28	0.12	0.39	0.54	0.57	0.59
Sro361_g126550.1 (Contig1094.g10580)	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.42	0.4	0.29	0.07	0.67	0.62	0.78	0.22	0.55	0.68	0.58	0.51	0.81	1.0	0.74	0.77	0.46	0.16	0.94	0.77	0.73	0.8
Sro400_g135210.1 (Contig1256.g11764)	0.31	0.1	0.08	0.06	0.07	0.09	0.41	0.32	0.15	0.55	0.55	0.45	0.5	0.28	0.57	0.56	0.41	0.64	0.6	1.0	0.76	0.3	0.17	0.7	0.89	0.52	0.4
Sro404_g135830.1 (Contig4176.g31843)	0.01	0.09	0.12	0.1	0.1	0.27	0.59	0.52	0.25	0.62	0.5	1.0	0.33	0.22	0.53	0.47	0.3	0.52	0.5	0.52	0.73	0.5	0.28	0.52	0.8	0.61	0.56
Sro404_g135940.1 (Contig4176.g31854)	0.02	0.37	0.27	0.33	0.5	0.3	0.56	0.54	0.15	0.79	0.54	1.0	0.07	0.22	0.48	0.64	0.61	0.49	0.57	0.42	0.68	0.07	0.17	0.64	0.41	0.5	0.96
Sro457_g146930.1 (Contig1832.g16122)	0.02	0.21	0.15	0.19	0.16	0.42	0.45	0.44	0.14	0.58	0.73	0.66	0.09	0.26	0.55	0.5	0.41	0.46	1.0	0.41	0.51	0.07	0.13	0.84	0.61	0.4	0.75
Sro460_g147590.1 (Contig3843.g29584)	0.0	0.06	0.03	0.02	0.04	0.28	0.21	0.16	0.06	0.47	0.56	0.47	0.84	0.16	0.34	0.4	0.31	0.68	1.0	0.73	0.74	0.23	0.18	0.48	0.6	0.61	0.79
Sro470_g149420.1 (Contig850.g9336)	0.01	0.07	0.04	0.02	0.09	0.06	0.2	0.17	0.04	0.6	0.33	0.65	0.09	0.72	0.46	0.87	0.55	0.71	0.42	0.69	1.0	0.15	0.06	0.46	0.74	0.44	0.48
Sro490_g153610.1 (Contig328.g4381)	0.02	0.28	0.33	0.28	0.2	0.3	0.41	0.2	0.2	0.64	0.63	0.77	0.95	0.48	0.6	0.81	0.63	0.52	0.67	0.88	1.0	0.36	0.25	0.42	0.47	0.39	0.51
Sro503_g155800.1 (Contig635.g7692)	0.01	0.07	0.07	0.03	0.05	0.38	0.38	0.25	0.25	0.73	0.58	1.0	0.63	0.71	0.58	0.52	0.45	0.65	0.71	0.86	0.88	0.47	0.33	0.58	0.67	0.6	0.49
Sro54_g031960.1 (Contig2430.g19884)	0.02	0.74	0.36	0.36	0.43	0.44	0.43	0.19	0.11	0.69	0.78	1.0	0.14	0.47	0.63	0.73	0.52	0.52	0.61	0.31	0.66	0.38	0.12	0.43	0.48	0.51	0.94
Sro554_g165470.1 (Contig3803.g29146)	0.02	0.09	0.19	0.09	0.04	0.27	0.31	0.2	0.14	0.59	0.42	0.7	0.35	0.53	0.49	0.61	0.46	0.24	0.44	0.67	1.0	0.43	0.17	0.39	0.46	0.5	0.59
Sro55_g032340.1 (Contig4458.g33508)	0.0	0.04	0.06	0.03	0.04	0.27	0.33	0.19	0.15	0.48	0.52	0.64	0.27	0.33	0.37	0.51	0.41	0.56	1.0	0.51	0.79	0.21	0.1	0.43	0.41	0.42	0.32
Sro562_g167140.1 (Contig149.g1666)	0.01	0.07	0.07	0.04	0.03	0.16	0.3	0.27	0.28	0.63	0.58	0.77	0.59	0.46	0.49	0.59	0.35	0.38	0.72	0.79	1.0	0.3	0.21	0.44	0.44	0.44	0.51
Sro607_g174610.1 (Contig3533.g27319)	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.66	0.52	0.43	0.09	0.83	0.65	1.0	0.22	0.93	0.69	0.82	0.85	0.98	0.64	0.51	0.92	0.19	0.13	0.82	0.69	0.48	0.7
Sro658_g182730.1 (Contig1438.g13223)	0.0	0.28	0.2	0.09	0.13	0.3	0.39	0.16	0.17	0.6	0.86	0.82	0.71	0.4	0.46	0.37	0.35	0.5	0.63	1.0	0.99	0.37	0.14	0.59	0.5	0.55	0.46
Sro666_g184000.1 (Contig1358.g12519)	0.01	0.03	0.06	0.0	0.0	0.1	0.32	0.11	0.01	0.67	0.32	0.53	0.04	0.27	0.31	0.34	0.11	0.37	0.73	0.38	1.0	0.23	0.1	0.34	0.37	0.73	0.67
Sro697_g189020.1 (Contig3345.g26201)	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.31	0.21	0.21	0.23	0.67	0.67	1.0	0.27	0.58	0.52	0.63	0.51	0.56	0.38	0.38	0.83	0.39	0.26	0.55	0.61	0.55	0.57
Sro70_g038770.1 (Contig3352.g26224)	0.01	0.06	0.06	0.05	0.02	0.23	0.31	0.24	0.12	0.6	0.57	0.73	0.42	0.35	0.33	0.22	0.42	0.43	0.55	1.0	0.81	0.14	0.1	0.5	0.95	0.45	0.41
Sro70_g038970.1 (Contig3352.g26244)	0.02	0.61	0.35	0.45	0.35	0.34	0.57	0.63	0.14	0.82	0.82	0.96	0.13	0.27	0.61	0.98	0.83	0.84	0.93	0.45	0.78	0.04	0.12	1.0	0.99	0.64	0.93
Sro70_g039120.1 (Contig3352.g26259)	0.01	0.12	0.06	0.08	0.11	0.07	0.34	0.18	0.07	0.66	0.27	1.0	0.4	0.59	0.34	0.43	0.31	0.42	0.34	0.82	0.92	0.37	0.15	0.42	0.78	0.37	0.29
Sro722_g192820.1 (Contig2490.g20402)	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.1	0.25	0.1	0.09	0.66	0.34	0.87	0.46	0.43	0.43	0.52	0.24	0.52	0.75	1.0	0.76	0.18	0.18	0.25	0.32	0.45	0.43
Sro73_g040520.1 (Contig3929.g30153)	0.01	0.4	0.34	0.29	0.37	0.28	0.35	0.21	0.25	0.79	0.97	0.81	0.15	0.58	0.7	0.85	0.69	0.62	1.0	0.77	0.81	0.25	0.21	0.34	0.57	0.65	0.78
Sro749_g196800.1 (Contig2460.g20137)	0.02	0.11	0.06	0.09	0.07	0.33	0.62	0.56	0.23	0.78	0.67	0.72	0.17	0.27	0.75	0.87	0.72	0.9	0.87	0.74	0.83	0.34	0.23	0.8	1.0	0.91	0.88
Sro778_g201190.1 (Contig2552.g20764)	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03	0.15	0.47	0.48	0.29	0.73	0.57	0.96	0.56	0.24	0.6	0.69	0.33	0.74	0.79	1.0	0.88	0.25	0.12	0.5	0.7	0.44	0.51
Sro78_g042530.1 (Contig1698.g15229)	0.05	0.47	0.33	0.25	0.21	0.34	0.4	0.42	0.17	0.55	0.45	0.52	0.08	0.13	0.45	0.65	0.49	0.46	0.48	0.23	0.5	0.08	0.12	0.49	0.54	0.65	1.0
Sro851_g210870.1 (Contig461.g6213)	0.02	0.23	0.22	0.11	0.1	0.19	0.32	0.29	0.18	0.61	0.5	0.66	0.28	0.49	0.49	0.64	0.48	0.57	0.7	0.66	1.0	0.39	0.2	0.36	0.38	0.57	0.55
Sro98_g050600.1 (Contig3362.g26352)	0.0	0.03	0.02	0.04	0.04	0.11	0.19	0.22	0.09	0.63	0.64	0.74	0.55	0.44	0.45	0.72	0.38	0.66	0.87	1.0	0.62	0.21	0.09	0.24	0.25	0.32	0.75

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)