Heatmap: Cluster_331 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1017_g231720.1 (Contig3686.g28447)
7.28 1.32 2.33 1.38 0.5 7.47 4.08 4.08 3.78 14.48 10.52 19.71 24.24 8.88 8.71 6.31 8.61 6.56 12.98 21.41 19.7 6.68 3.65 10.8 12.67 11.81 8.02
Sro111_g055400.1 (Contig567.g7217)
0.57 5.58 5.04 6.48 6.34 4.51 8.17 4.5 1.21 10.3 9.59 16.03 1.07 6.49 7.5 7.41 6.46 7.29 7.25 3.72 10.16 2.0 2.1 8.54 5.34 7.44 11.94
Sro11_g008590.1 (Contig724.g8333)
0.19 0.38 0.46 0.57 0.35 2.84 6.53 4.42 1.45 17.15 12.59 18.99 3.0 11.74 17.19 18.34 11.82 22.3 17.46 20.03 19.71 2.9 1.56 9.81 12.75 10.84 17.75
Sro1228_g254390.1 (Contig2695.g21740)
0.18 2.26 2.2 1.32 1.41 1.82 5.86 5.1 7.25 11.06 10.58 14.19 10.57 10.78 9.55 13.05 7.65 10.46 14.55 15.37 17.0 6.12 6.11 6.19 4.95 7.26 9.74
Sro1247_g255900.1 (Contig2843.g22830)
0.71 3.53 1.11 3.01 4.95 1.74 1.46 1.37 0.19 4.85 2.26 4.93 1.45 2.08 3.29 3.65 3.84 4.59 4.34 3.71 4.5 0.53 0.33 3.86 3.95 2.92 2.92
Sro1287_g259490.1 (Contig248.g3035)
0.05 0.31 0.5 0.24 0.31 1.87 1.85 1.34 0.28 3.42 3.99 5.1 3.14 2.4 2.65 2.77 3.31 3.07 5.61 5.35 4.17 1.2 0.97 2.43 3.17 3.07 2.88
Sro1322_g262550.1 (Contig3764.g28905)
0.67 3.79 1.88 1.67 2.74 6.26 8.25 7.34 3.05 15.77 11.71 22.72 8.74 12.45 9.55 6.69 8.46 13.45 11.36 16.08 16.51 5.64 2.62 8.3 7.18 7.84 11.02
Sro1323_g262680.1 (Contig273.g3514)
0.03 0.2 0.2 0.16 0.16 0.23 0.55 0.8 0.61 4.84 1.42 8.16 4.28 7.49 0.84 2.04 2.44 3.59 5.32 6.77 8.9 2.7 0.24 1.27 1.42 1.44 1.44
Sro1473_g275590.1 (Contig4548.g33990)
0.87 5.93 2.39 2.72 4.27 17.41 31.4 21.98 6.05 35.03 20.15 34.22 12.74 32.6 32.23 31.03 23.14 41.65 34.04 31.6 48.57 14.33 8.62 42.97 62.49 39.01 34.99
Sro151_g069310.1 (Contig294.g3857)
1.13 4.75 3.31 6.4 4.59 5.79 20.22 11.57 17.25 29.89 34.65 36.05 31.98 32.23 23.21 37.9 26.2 33.05 38.34 46.48 39.79 21.61 17.28 20.22 18.19 20.32 20.64
Sro1579_g283700.1 (Contig3855.g29671)
1.15 0.59 0.37 0.34 0.35 0.43 2.02 1.89 1.21 3.62 2.16 2.98 7.11 1.43 3.59 5.11 1.92 2.82 4.07 5.82 3.83 1.6 0.38 1.69 1.67 2.59 2.96
Sro1666_g289700.1 (Contig3636.g28071)
0.31 1.06 0.66 0.21 0.63 11.85 12.67 10.56 2.18 13.96 16.88 13.12 5.36 7.19 9.42 13.99 11.42 16.36 18.25 15.26 20.03 5.66 2.73 19.21 26.75 22.6 16.38
Sro16_g011820.1 (Contig916.g9619)
0.65 5.9 3.86 4.17 5.94 12.45 11.97 7.96 2.65 22.03 17.74 31.16 1.93 19.77 13.6 15.37 18.21 13.94 21.18 12.25 21.7 2.73 3.75 14.23 12.34 13.68 22.76
Sro1853_g301770.1 (Contig172.g1976)
1.17 3.36 2.5 2.86 3.83 26.81 17.81 26.17 13.93 37.01 29.92 46.08 41.1 19.41 29.05 22.58 33.89 50.15 51.54 56.01 53.84 17.52 17.79 27.7 55.85 52.65 36.52
Sro1959_g307970.1 (Contig1986.g16998)
0.46 5.44 3.75 2.97 2.76 10.7 15.6 11.41 5.99 21.42 16.75 24.64 3.01 12.96 17.44 15.67 13.6 20.54 22.44 21.97 25.22 8.54 6.31 21.26 30.4 23.73 25.97
Sro2041_g312250.1 (Contig4209.g32027)
1.09 38.31 23.09 30.04 23.87 15.46 13.96 15.34 4.64 25.81 30.16 22.91 8.71 21.09 28.13 26.86 26.57 22.96 21.21 18.7 23.44 6.1 4.53 22.76 21.39 21.3 36.49
Sro2146_g316460.1 (Contig984.g9994)
0.0 1.29 0.5 0.97 1.5 1.99 3.5 1.0 0.99 4.79 3.16 4.98 9.34 3.59 3.51 6.97 3.22 6.77 8.94 10.66 5.47 0.3 1.05 3.58 5.19 2.99 2.75
Sro228_g092720.1 (Contig1235.g11586)
0.12 1.05 0.39 0.64 1.74 0.8 3.97 1.45 0.73 6.83 3.99 8.04 1.24 1.92 4.57 5.72 4.84 7.03 8.36 6.56 7.5 0.23 0.25 3.94 9.05 4.42 6.32
Sro244_g097140.1 (Contig2788.g22430)
0.26 1.88 1.38 1.39 2.29 2.48 5.53 3.58 2.81 7.5 7.89 9.39 6.41 6.81 6.07 6.26 4.72 7.19 10.24 9.2 9.12 4.17 3.5 6.59 6.59 8.05 6.33
Sro247_g098150.1 (Contig3058.g24348)
0.45 1.09 0.88 0.29 0.31 4.09 4.08 2.86 1.05 5.52 6.09 7.46 1.57 2.08 5.31 5.92 4.17 4.22 6.02 5.09 7.88 4.15 1.72 5.28 5.95 6.42 5.48
Sro253_g099900.1 (Contig3900.g29908)
3.51 26.42 10.76 12.69 13.19 1.38 9.27 5.3 3.42 23.98 10.9 17.68 7.72 11.6 15.63 34.49 17.72 15.32 18.17 20.7 28.11 5.1 4.41 9.56 6.73 8.23 16.62
Sro2654_g333830.1 (Contig2938.g23360)
0.41 2.75 2.25 1.32 2.16 1.62 3.3 1.79 0.92 7.04 7.06 7.38 1.33 2.31 4.14 4.18 4.71 5.93 6.44 7.91 10.02 1.57 0.85 5.27 8.12 7.8 8.16
Sro2669_g334270.1 (Contig3859.g29705)
0.67 13.85 7.56 8.25 7.32 2.8 6.99 4.36 0.99 16.93 11.56 17.05 4.8 18.4 15.25 28.3 10.6 15.4 17.96 16.38 20.16 2.61 1.9 11.02 11.56 8.59 14.02
Sro276_g105890.1 (Contig2556.g20769)
0.25 3.45 3.31 7.02 2.13 5.0 8.05 7.64 2.41 12.54 8.51 13.35 3.76 8.54 10.99 12.28 5.83 12.85 21.59 12.11 13.83 3.05 1.84 14.05 13.48 9.34 9.38
Sro2864_g338910.1 (Contig307.g4023)
0.25 1.38 0.95 2.03 1.99 2.1 6.05 5.19 1.94 11.42 10.09 12.59 8.11 10.34 10.97 16.81 8.37 11.25 10.26 18.04 14.9 5.01 2.17 6.83 13.02 7.38 10.04
Sro287_g108650.1 (Contig252.g3106)
1.38 7.43 5.37 8.48 6.14 2.32 10.39 11.01 5.12 29.43 31.57 29.59 14.94 26.73 31.12 61.11 30.75 29.2 31.82 31.49 33.52 8.86 5.14 21.53 46.65 21.85 30.91
Sro312_g114630.1 (Contig2832.g22708)
0.5 0.57 0.58 0.61 0.25 3.95 4.84 3.41 1.46 9.19 9.39 10.71 9.44 3.64 6.34 8.92 5.43 8.7 11.74 13.15 11.18 3.08 1.22 8.26 11.31 8.09 8.44
Sro312_g114640.1 (Contig2832.g22709)
0.19 0.47 0.45 0.66 0.79 2.34 2.59 1.86 1.85 4.6 4.76 5.84 8.0 2.97 3.89 6.75 3.64 5.95 6.5 9.89 4.13 1.4 1.37 5.06 7.07 4.04 3.31
Sro328_g118730.1 (Contig3574.g27628)
1.19 4.98 3.68 12.46 7.54 15.62 17.27 10.33 3.19 36.72 29.8 42.18 16.73 17.88 27.24 43.34 35.07 37.03 30.63 34.46 50.42 4.02 1.87 30.2 51.76 27.59 29.87
Sro351_g123890.1 (Contig4381.g32943)
0.0 1.79 1.03 1.09 2.12 1.03 1.86 0.76 0.66 6.27 5.1 7.02 5.57 4.56 3.35 7.14 7.46 2.84 4.64 9.2 6.44 0.85 0.36 2.06 4.18 2.25 5.83
Sro352_g124290.1 (Contig2645.g21405)
0.57 10.66 7.26 8.78 12.24 18.94 29.39 19.3 7.7 37.51 22.23 47.79 5.0 16.39 32.57 45.11 33.08 32.89 20.02 16.96 37.49 1.11 4.54 34.96 44.16 23.94 43.56
Sro357_g125560.1 (Contig708.g8184)
0.25 3.26 2.77 3.21 2.08 2.45 5.09 3.9 2.7 10.14 10.99 10.39 6.06 6.76 5.18 5.38 5.94 6.18 17.14 14.81 11.91 4.75 2.03 6.62 9.23 9.76 10.14
Sro361_g126550.1 (Contig1094.g10580)
0.74 1.97 1.12 0.89 1.45 23.69 22.69 16.34 3.94 37.97 34.84 44.04 12.14 31.22 38.56 32.94 28.5 45.86 56.37 41.59 43.14 26.05 9.12 53.25 43.68 41.37 44.91
Sro400_g135210.1 (Contig1256.g11764)
4.1 1.31 1.02 0.75 0.97 1.23 5.46 4.31 2.02 7.34 7.33 6.03 6.75 3.72 7.59 7.52 5.53 8.6 8.01 13.44 10.25 4.0 2.29 9.43 11.89 7.05 5.4
Sro404_g135830.1 (Contig4176.g31843)
0.18 2.39 3.09 2.69 2.58 7.12 15.34 13.68 6.49 16.29 13.11 26.13 8.59 5.77 13.77 12.38 7.74 13.65 13.18 13.62 19.05 13.09 7.28 13.54 20.91 15.93 14.51
Sro404_g135940.1 (Contig4176.g31854)
0.88 21.31 15.57 19.11 29.1 17.37 32.39 31.56 8.56 46.06 31.0 57.93 4.26 12.72 27.72 37.27 35.39 28.35 33.2 24.21 39.33 3.79 10.01 36.79 23.86 29.19 55.64
Sro457_g146930.1 (Contig1832.g16122)
2.15 18.82 13.86 17.22 14.65 38.64 41.48 40.09 12.4 52.81 66.48 59.84 8.19 23.46 50.08 45.96 37.68 42.06 91.28 37.33 46.56 6.57 12.22 76.25 56.14 36.88 68.84
Sro460_g147590.1 (Contig3843.g29584)
0.0 0.4 0.21 0.11 0.24 1.82 1.37 1.02 0.41 3.1 3.63 3.04 5.5 1.03 2.24 2.64 2.05 4.46 6.52 4.74 4.83 1.47 1.16 3.12 3.93 3.99 5.13
Sro470_g149420.1 (Contig850.g9336)
0.48 2.59 1.49 0.84 2.98 2.01 7.06 5.8 1.34 20.9 11.56 22.6 3.16 24.93 15.86 30.17 19.06 24.53 14.49 24.02 34.72 5.36 2.21 16.08 25.54 15.45 16.83
Sro490_g153610.1 (Contig328.g4381)
0.17 2.6 3.06 2.67 1.9 2.77 3.84 1.87 1.87 6.0 5.87 7.2 8.92 4.51 5.61 7.64 5.87 4.89 6.32 8.29 9.38 3.42 2.3 3.96 4.41 3.7 4.77
Sro503_g155800.1 (Contig635.g7692)
0.64 3.88 3.59 1.79 2.62 19.74 19.83 13.23 13.06 37.87 30.16 52.13 32.6 37.2 30.19 27.06 23.44 33.8 36.94 44.84 45.64 24.28 17.12 30.07 34.75 31.24 25.58
Sro54_g031960.1 (Contig2430.g19884)
0.12 4.89 2.4 2.39 2.84 2.9 2.87 1.29 0.75 4.58 5.17 6.63 0.9 3.15 4.2 4.87 3.46 3.42 4.05 2.06 4.36 2.53 0.79 2.86 3.15 3.37 6.23
Sro554_g165470.1 (Contig3803.g29146)
0.21 0.87 1.95 0.89 0.38 2.7 3.15 1.99 1.43 6.01 4.28 7.05 3.58 5.33 4.96 6.15 4.7 2.47 4.41 6.74 10.11 4.39 1.73 3.92 4.63 5.05 5.96
Sro55_g032340.1 (Contig4458.g33508)
0.02 0.19 0.25 0.15 0.19 1.22 1.47 0.85 0.66 2.19 2.35 2.88 1.23 1.49 1.69 2.31 1.84 2.55 4.53 2.32 3.57 0.97 0.45 1.95 1.87 1.9 1.46
Sro562_g167140.1 (Contig149.g1666)
0.06 0.42 0.4 0.25 0.15 0.92 1.67 1.49 1.6 3.55 3.26 4.34 3.29 2.59 2.78 3.32 1.94 2.11 4.06 4.42 5.62 1.71 1.17 2.46 2.45 2.47 2.87
Sro607_g174610.1 (Contig3533.g27319)
0.67 1.27 1.19 0.56 0.68 13.5 10.71 8.91 1.92 16.98 13.4 20.48 4.47 19.08 14.05 16.85 17.49 20.07 13.14 10.4 18.77 3.97 2.58 16.83 14.22 9.85 14.27
Sro658_g182730.1 (Contig1438.g13223)
0.0 1.27 0.91 0.4 0.59 1.37 1.78 0.73 0.76 2.71 3.91 3.7 3.2 1.81 2.08 1.68 1.58 2.26 2.85 4.52 4.49 1.66 0.61 2.67 2.26 2.49 2.07
Sro666_g184000.1 (Contig1358.g12519)
0.04 0.15 0.31 0.0 0.0 0.5 1.54 0.54 0.04 3.23 1.54 2.58 0.18 1.29 1.5 1.65 0.56 1.8 3.56 1.86 4.85 1.13 0.48 1.67 1.79 3.55 3.25
Sro697_g189020.1 (Contig3345.g26201)
0.31 1.12 0.52 0.69 1.21 6.77 4.64 4.52 4.96 14.78 14.78 21.91 5.83 12.79 11.47 13.85 11.16 12.17 8.25 8.4 18.19 8.58 5.76 12.05 13.32 11.99 12.54
Sro70_g038770.1 (Contig3352.g26224)
0.35 1.49 1.4 1.29 0.44 5.81 7.8 6.07 3.15 15.17 14.31 18.33 10.5 8.92 8.36 5.44 10.51 10.9 13.89 25.28 20.39 3.6 2.61 12.69 24.04 11.38 10.32
Sro70_g038970.1 (Contig3352.g26244)
2.26 67.21 39.2 49.58 38.17 37.62 62.85 70.01 15.04 90.14 90.22 105.94 14.85 29.86 67.81 108.55 91.71 93.22 102.49 50.26 86.04 4.53 13.58 110.48 109.87 70.22 102.98
Sro70_g039120.1 (Contig3352.g26259)
0.21 2.5 1.29 1.59 2.23 1.46 7.06 3.66 1.54 13.85 5.63 20.87 8.37 12.34 7.08 8.94 6.42 8.73 7.08 17.18 19.18 7.71 3.08 8.82 16.18 7.63 6.15
Sro722_g192820.1 (Contig2490.g20402)
0.06 0.27 0.2 0.38 0.14 0.59 1.43 0.61 0.53 3.83 1.97 5.1 2.65 2.52 2.52 3.04 1.4 3.04 4.36 5.83 4.42 1.06 1.07 1.47 1.87 2.6 2.5
Sro73_g040520.1 (Contig3929.g30153)
0.15 10.27 8.6 7.48 9.52 7.25 9.04 5.38 6.35 20.16 24.8 20.68 3.93 14.77 17.99 21.57 17.73 15.79 25.53 19.64 20.67 6.51 5.46 8.64 14.62 16.68 19.93
Sro749_g196800.1 (Contig2460.g20137)
0.37 1.87 0.95 1.49 1.11 5.49 10.25 9.28 3.79 12.87 11.09 11.88 2.82 4.37 12.27 14.24 11.79 14.85 14.39 12.15 13.72 5.54 3.83 13.15 16.46 15.0 14.52
Sro778_g201190.1 (Contig2552.g20764)
0.06 0.28 0.23 0.25 0.14 0.82 2.5 2.58 1.56 3.91 3.07 5.14 3.01 1.29 3.2 3.68 1.74 3.98 4.21 5.36 4.74 1.34 0.66 2.66 3.73 2.37 2.71
Sro78_g042530.1 (Contig1698.g15229)
3.9 35.84 24.88 18.97 16.17 25.39 29.92 32.08 12.77 41.28 33.69 39.44 6.07 9.79 33.96 48.95 37.24 34.97 36.11 17.06 38.04 5.68 8.94 37.32 40.51 49.07 75.63
Sro851_g210870.1 (Contig461.g6213)
0.27 3.75 3.59 1.73 1.59 3.05 5.1 4.64 2.97 9.82 8.06 10.62 4.43 7.84 7.89 10.33 7.78 9.23 11.22 10.61 16.07 6.23 3.17 5.85 6.15 9.12 8.83
Sro98_g050600.1 (Contig3362.g26352)
0.04 0.26 0.15 0.3 0.28 0.84 1.43 1.66 0.69 4.78 4.83 5.57 4.18 3.28 3.36 5.44 2.87 5.01 6.53 7.54 4.64 1.58 0.65 1.81 1.9 2.39 5.65

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)