Heatmap: Cluster_265 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051610.1 (Contig348.g4714)
0.15 8.34 11.38 7.24 6.68 5.27 5.22 6.98 8.55 6.36 8.61 9.01 4.87 4.98 5.98 4.41 7.78 6.36 8.11 5.59 5.79 9.96 5.53 2.61 3.28 4.12 6.36
Sro1055_g236080.1 (Contig2523.g20596)
0.02 1.76 3.27 1.98 1.02 0.93 0.56 0.3 1.46 1.83 1.61 2.11 1.93 1.59 1.44 0.69 1.76 1.84 2.53 2.55 2.94 2.25 1.72 0.45 0.24 0.71 0.89
Sro1090_g240120.1 (Contig48.g340)
0.03 13.95 19.7 8.64 8.56 3.08 7.11 11.39 17.94 5.81 4.54 6.13 9.69 6.36 6.07 3.66 7.92 6.36 13.02 6.35 5.74 15.25 14.21 3.51 2.01 4.21 3.88
Sro1222_g253810.1 (Contig1750.g15573)
0.09 11.54 15.07 13.83 9.66 5.5 8.49 5.24 7.65 11.86 14.94 14.52 12.92 16.72 11.06 8.08 12.74 14.69 21.41 13.0 14.73 9.1 10.08 14.66 6.95 11.79 10.33
Sro123_g059520.1 (Contig66.g641)
0.19 7.33 8.89 2.57 2.38 1.13 1.58 2.22 4.48 3.11 3.46 4.77 1.1 1.03 1.98 2.4 4.0 2.35 2.28 1.44 5.03 7.18 3.5 1.52 1.83 2.38 2.21
Sro1258_g256860.1 (Contig3284.g25823)
0.27 10.86 7.2 5.78 6.79 1.92 3.67 5.61 9.45 4.35 3.59 3.18 4.66 3.19 2.81 1.41 2.44 11.09 17.74 10.46 3.67 8.8 6.94 2.11 0.69 1.71 4.8
Sro1268_g257740.1 (Contig4283.g32362)
0.02 11.4 17.09 6.67 5.84 1.25 4.45 5.67 7.82 3.34 5.26 4.18 5.14 2.32 3.61 3.68 8.35 4.57 6.5 3.01 2.69 7.37 5.58 3.72 1.61 2.32 3.05
0.31 14.28 18.01 5.97 5.43 1.11 8.46 10.72 33.81 5.58 8.82 3.64 5.58 5.67 5.88 3.42 12.98 5.59 6.35 6.14 5.5 14.1 17.08 1.57 2.27 3.82 3.78
Sro1321_g262520.1 (Contig4512.g33828)
0.05 7.26 7.07 4.99 4.9 10.06 7.54 7.79 10.22 6.13 6.14 3.58 6.36 5.4 6.4 6.05 6.94 4.77 8.36 7.85 7.55 11.78 12.76 3.62 6.86 5.73 5.71
Sro1411_g270440.1 (Contig2736.g22026)
0.23 0.78 2.86 1.03 0.93 0.41 0.48 2.83 0.54 1.0 1.44 0.51 0.48 0.65 0.97 1.51 0.97 0.74 1.81 0.34 1.11 1.08 1.31 3.25 2.11 1.18 0.69
0.01 1.02 1.23 0.81 0.9 0.03 0.13 0.74 0.53 0.31 0.28 0.05 1.08 0.08 0.1 0.07 0.2 1.36 1.3 1.31 0.2 0.53 0.48 0.15 0.14 0.11 0.31
Sro145_g067220.1 (Contig3646.g28168)
0.24 52.24 83.65 56.71 43.69 34.05 15.39 19.83 30.38 20.03 46.88 10.72 42.97 12.06 36.95 23.56 53.58 51.84 40.76 30.04 13.16 38.46 33.76 26.94 24.19 25.04 32.5
Sro147_g068000.1 (Contig246.g3023)
0.27 6.87 5.67 6.49 6.7 3.76 4.85 2.45 7.67 6.77 6.14 8.3 4.08 5.37 4.84 6.06 3.1 3.39 5.45 6.69 6.27 9.81 4.59 3.26 6.6 5.52 4.35
Sro1515_g279010.1 (Contig1412.g12973)
2.87 33.2 26.18 26.89 24.2 4.93 9.83 17.12 28.16 13.28 8.32 12.04 8.05 7.86 8.1 4.89 6.04 9.05 24.14 17.37 11.03 19.18 16.51 9.67 16.07 12.33 7.13
Sro1630_g287170.1 (Contig19.g146)
0.79 2.41 3.05 1.26 2.09 2.3 1.61 1.83 5.15 3.73 3.32 5.53 5.54 2.81 2.09 2.42 2.23 2.42 5.07 5.84 4.09 6.59 4.52 1.46 1.27 3.78 2.96
Sro1647_g288410.1 (Contig41.g287)
0.74 1.5 1.11 0.68 0.4 1.0 1.09 0.62 2.65 3.73 1.78 4.33 4.22 2.45 2.43 1.2 2.96 3.46 6.55 5.36 6.64 5.01 3.32 1.58 1.09 1.68 2.0
Sro1700_g292080.1 (Contig4692.g34891)
0.0 6.67 6.12 7.74 10.83 11.81 0.06 1.26 2.81 1.58 0.77 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 6.03 6.44 0.53 0.64 0.0 0.02
Sro1733_g294230.1 (Contig4341.g32749)
0.54 14.05 20.76 7.6 12.11 1.95 3.31 4.6 9.82 6.13 3.52 5.86 7.58 2.09 3.64 5.3 3.77 2.87 9.18 6.97 3.91 5.77 8.41 3.75 3.74 5.14 3.45
Sro1733_g294240.1 (Contig4341.g32750)
0.2 2.24 4.29 3.15 3.65 0.81 2.06 2.72 4.28 3.84 2.76 5.28 4.58 2.36 2.3 2.83 2.4 1.89 6.01 4.27 2.19 1.45 4.33 3.02 1.58 2.83 2.49
Sro1830_g300290.1 (Contig662.g7832)
1.39 8.64 11.15 3.37 2.83 1.24 2.29 1.33 3.59 2.93 2.3 3.72 2.27 3.06 2.43 2.19 3.24 1.73 5.65 1.07 3.94 5.65 4.66 2.19 0.84 1.59 1.97
Sro1851_g301650.1 (Contig3358.g26292)
1.24 3.85 10.83 2.36 1.84 0.77 0.96 0.48 3.28 3.84 4.82 4.7 2.93 4.65 4.29 3.25 6.68 7.23 14.46 8.39 2.43 8.14 2.46 1.92 3.5 4.73 2.39
Sro190_g081790.1 (Contig3488.g27054)
24.67 84.9 89.68 93.76 89.83 42.93 21.98 24.13 54.71 44.49 26.96 58.52 31.61 33.33 23.34 4.16 43.54 14.65 30.13 42.93 43.78 48.74 51.44 25.54 21.06 32.79 20.35
Sro193_g082600.1 (Contig826.g9159)
0.0 0.11 0.16 0.08 0.09 0.01 0.05 0.04 0.22 0.08 0.27 0.1 0.03 0.02 0.09 0.04 0.25 0.01 0.01 0.03 0.09 0.21 0.07 0.04 0.06 0.03 0.05
Sro2024_g311590.1 (Contig4632.g34550)
1.07 20.7 22.2 11.96 10.48 4.59 5.36 9.56 17.7 7.96 8.41 7.85 19.89 6.74 7.34 7.39 7.89 9.24 23.46 12.62 4.06 10.16 12.95 8.66 5.24 12.24 8.22
Sro2053_g312670.1 (Contig2326.g19186)
0.03 4.82 2.36 2.68 1.36 0.54 1.7 1.36 2.96 2.05 2.67 1.79 2.29 1.41 2.49 2.57 1.94 1.11 1.51 1.95 2.69 3.4 2.02 2.62 1.67 2.21 2.38
Sro2053_g312680.1 (Contig2326.g19187)
0.44 3.94 2.19 2.41 1.58 1.47 0.78 1.43 4.64 2.81 5.43 3.88 1.52 3.41 2.33 1.39 6.06 1.22 2.92 2.59 3.26 3.89 2.93 1.6 1.12 1.98 3.05
Sro205_g086270.1 (Contig2217.g18440)
0.12 24.87 29.4 17.42 18.73 0.66 0.28 0.35 11.48 3.96 0.51 2.5 7.11 0.36 0.71 0.26 1.53 7.87 32.22 3.96 0.91 4.37 3.41 0.13 0.13 0.7 0.59
Sro2098_g314420.1 (Contig3059.g24359)
0.16 10.33 11.08 5.08 5.61 3.88 3.98 4.94 4.83 4.75 3.08 3.92 9.29 4.15 3.81 4.87 3.85 10.84 16.08 9.69 4.97 2.66 4.33 3.59 4.36 3.09 3.18
Sro2185_g318140.1 (Contig1553.g14129)
20.97 12.72 25.42 7.21 4.34 4.11 11.25 4.75 11.49 7.27 6.04 5.76 11.09 9.38 7.31 2.95 15.52 3.31 8.13 8.12 4.96 23.53 17.36 6.65 2.12 3.89 4.55
Sro222_g091260.1 (Contig3134.g24889)
0.15 34.88 94.36 23.02 18.46 5.21 11.1 15.39 32.0 10.3 7.02 26.09 29.4 9.15 7.21 8.31 13.51 11.24 39.73 8.71 5.6 33.26 32.08 14.09 4.61 7.23 5.39
Sro2263_g321260.1 (Contig1877.g16381)
0.18 2.61 2.9 3.03 2.71 2.87 1.9 3.4 4.63 2.44 4.77 2.26 3.62 0.72 3.34 3.97 6.42 2.37 4.64 2.93 1.94 3.87 3.32 3.2 0.98 2.85 3.95
Sro234_g094540.1 (Contig3223.g25501)
0.71 6.5 4.16 5.57 7.26 7.52 7.89 14.87 13.25 11.84 21.31 13.46 10.99 15.44 14.28 14.16 21.39 10.63 13.99 8.68 11.52 14.96 8.95 9.3 7.55 9.63 13.51
Sro2485_g329040.1 (Contig802.g8991)
1.41 30.7 27.53 20.07 16.85 8.35 11.92 12.19 31.01 16.57 12.4 17.68 16.9 10.42 13.2 15.87 16.01 16.93 17.36 24.77 17.96 42.01 24.87 11.54 20.71 8.32 13.29
Sro2717_g335410.1 (Contig3434.g26741)
7.3 5.19 5.15 3.43 3.61 1.81 4.55 2.82 5.85 5.13 4.47 5.96 7.9 1.66 3.05 3.05 3.08 5.01 5.95 8.43 4.59 9.45 8.25 3.38 3.27 3.2 3.63
Sro2853_g338680.1 (Contig1140.g10945)
0.25 7.66 7.98 6.2 7.08 2.29 2.72 2.61 7.61 3.62 6.5 2.89 5.41 1.13 5.16 4.82 7.27 4.82 8.01 4.85 2.67 9.53 5.85 5.01 2.5 4.33 4.83
Sro313_g114750.1 (Contig1770.g15650)
0.18 9.35 10.55 8.02 7.06 1.21 3.42 3.59 8.58 3.22 3.25 2.93 3.35 1.57 2.27 2.18 2.91 2.01 2.81 3.28 3.17 7.37 5.38 1.13 0.84 1.85 1.83
0.02 6.84 11.4 2.55 1.41 0.74 1.69 1.63 5.1 2.46 1.23 2.05 1.29 1.62 2.05 2.08 3.2 1.03 2.15 4.15 2.3 6.15 5.0 1.4 2.03 1.65 1.17
Sro3312_g346620.1 (Contig3273.g25766)
0.05 3.41 2.02 1.55 3.89 2.61 0.21 2.45 4.82 1.15 1.49 0.92 0.26 0.87 0.57 0.11 0.55 0.03 0.41 0.78 1.0 2.97 1.33 0.26 0.6 0.75 0.87
Sro3402_g347620.1 (Contig611.g7534)
0.0 2.68 2.11 1.67 1.96 0.32 0.09 0.08 3.77 0.6 0.31 0.51 0.15 0.0 0.39 0.1 0.31 0.24 0.5 0.06 0.15 4.98 4.61 1.42 0.47 0.93 0.29
Sro369_g128180.1 (Contig1690.g15141)
0.77 16.09 24.64 23.97 14.21 4.97 7.82 7.37 14.33 6.55 6.07 4.4 10.96 2.33 7.23 3.62 9.24 9.75 12.94 10.7 4.37 17.62 22.99 11.12 6.53 5.99 4.7
Sro380_g130690.1 (Contig3948.g30261)
0.04 3.82 4.99 3.8 3.67 2.52 3.5 6.75 7.56 5.03 3.75 1.83 4.44 1.42 6.04 5.95 4.11 7.16 13.58 4.55 4.88 10.68 10.81 6.17 3.48 4.37 4.48
Sro381_g130770.1 (Contig161.g1810)
53.7 73.96 152.72 104.11 94.54 25.37 71.6 104.72 126.68 49.93 77.71 44.91 75.17 42.83 51.54 47.92 71.67 82.33 62.8 93.07 60.3 152.82 106.54 63.51 64.73 56.99 47.56
Sro381_g130890.1 (Contig161.g1822)
11.74 55.84 75.35 48.23 44.52 27.14 39.68 42.32 63.38 33.72 46.15 37.7 45.88 40.75 43.42 40.11 59.67 44.44 53.74 41.87 25.92 56.75 61.84 27.1 10.78 22.85 33.56
Sro391_g133030.1 (Contig2759.g22204)
0.04 2.39 3.08 1.18 1.24 0.64 1.51 2.26 5.09 2.02 2.09 2.29 1.09 1.13 1.35 0.72 1.67 1.11 1.37 1.27 2.31 4.9 2.61 0.74 0.25 0.8 1.05
Sro3_g002580.1 (Contig3832.g29443)
0.03 9.02 8.44 8.51 6.16 1.71 2.57 1.67 3.55 2.84 3.08 1.93 7.69 2.47 3.67 3.39 3.88 4.51 9.64 5.84 2.19 3.78 4.17 9.22 2.71 2.79 2.07
Sro427_g140720.1 (Contig2653.g21443)
2.48 45.28 51.82 77.63 76.68 43.86 40.19 85.12 78.37 50.88 73.93 48.91 66.37 70.64 59.7 73.58 58.0 73.78 69.09 46.05 42.7 64.01 66.89 14.8 12.46 47.44 64.36
Sro4464_g354050.1 (Contig2863.g22960)
0.32 66.08 162.74 27.89 22.39 7.22 10.17 23.15 62.17 11.33 4.27 16.32 11.35 6.4 7.86 6.21 8.41 3.26 13.22 3.17 6.82 59.41 38.08 16.04 8.35 5.51 2.69
0.0 6.06 5.03 2.98 2.9 0.1 0.98 3.63 5.26 1.56 2.41 0.4 0.53 2.26 2.47 1.42 4.81 1.79 1.1 0.43 2.09 7.94 3.8 1.3 1.22 2.9 1.25
Sro479_g151130.1 (Contig1858.g16248)
1.07 113.79 127.87 23.7 31.45 1.72 8.86 15.12 21.85 71.26 43.61 83.79 87.76 68.83 44.4 48.04 53.49 138.0 231.97 216.88 87.77 129.55 49.85 4.92 7.43 35.71 24.76
Sro507_g156480.1 (Contig4452.g33450)
3.48 14.45 14.35 12.82 13.02 1.0 3.09 8.8 18.65 5.09 1.29 4.46 1.86 1.22 1.97 0.4 1.0 2.83 5.05 3.18 4.6 9.74 14.98 9.7 2.72 2.09 1.14
Sro509_g157120.1 (Contig4289.g32405)
0.15 11.25 11.42 7.13 5.85 3.24 2.31 6.36 13.32 3.56 3.34 4.26 6.24 4.88 3.56 1.82 5.13 1.92 4.26 3.92 3.74 9.29 8.14 4.11 1.93 2.69 2.04
Sro525_g160240.1 (Contig3147.g24972)
0.11 7.86 10.61 5.7 5.69 5.69 3.58 3.65 7.7 4.29 2.46 3.74 9.17 2.43 3.01 4.48 1.82 3.77 4.21 7.33 4.35 4.87 7.1 4.27 4.68 2.56 2.98
Sro52_g031180.1 (Contig3190.g25201)
0.5 27.32 35.4 23.15 23.11 5.61 15.42 22.7 26.84 11.25 17.64 9.1 10.18 11.91 13.72 11.96 26.29 14.35 16.07 8.34 10.2 42.78 21.21 10.02 8.16 10.09 14.77
Sro548_g164390.1 (Contig1714.g15319)
4.23 7.39 9.58 4.49 3.66 1.19 1.87 3.24 4.37 4.25 2.95 5.04 5.72 1.96 3.44 2.82 3.9 4.18 7.44 4.85 4.33 7.35 4.85 2.61 1.58 2.26 2.46
Sro574_g169210.1 (Contig281.g3640)
1.09 17.93 34.35 17.14 12.65 3.63 7.78 15.16 18.83 9.39 9.39 7.09 5.86 5.24 8.77 7.69 9.11 6.62 10.9 5.8 9.45 18.32 18.59 15.69 7.4 10.32 7.81
Sro609_g175060.1 (Contig285.g3738)
0.58 9.62 7.04 6.98 6.42 1.62 2.18 6.62 5.34 3.96 5.93 3.98 3.35 4.33 3.62 4.33 6.64 4.24 7.07 8.91 5.51 5.98 5.08 1.86 2.25 3.41 4.41
Sro666_g183940.1 (Contig1358.g12513)
0.0 4.37 3.66 3.35 2.18 0.1 0.76 2.34 3.11 1.31 0.53 0.53 5.64 0.78 0.36 0.22 0.39 4.31 7.19 4.5 0.68 2.23 1.86 1.31 1.28 0.93 0.45
Sro684_g186780.1 (Contig2085.g17782)
0.49 13.84 9.86 6.85 7.22 3.75 8.09 15.19 17.29 6.02 10.67 6.4 9.42 7.78 7.47 5.98 11.26 8.19 12.04 5.79 5.74 19.5 11.3 3.5 3.22 3.12 6.53
Sro688_g187440.1 (Contig1782.g15790)
0.22 16.68 30.53 12.7 9.69 12.85 4.99 4.54 13.6 8.16 11.66 5.48 17.05 7.72 11.5 9.86 25.21 8.0 16.97 13.14 6.85 16.93 13.74 6.9 5.11 9.87 10.11
Sro736_g195010.1 (Contig1047.g10323)
0.84 68.69 63.09 37.62 38.33 3.01 2.29 7.58 53.23 8.29 5.9 6.7 4.01 0.4 6.12 0.28 9.43 2.6 3.09 2.32 3.22 57.79 20.11 0.38 0.0 2.85 2.22
0.03 21.03 22.72 10.37 6.96 2.89 7.79 5.0 13.26 5.38 5.12 4.07 5.23 5.2 5.94 3.93 5.94 4.3 5.97 7.17 4.92 16.46 11.61 3.1 2.62 3.86 5.05
Sro94_g049060.1 (Contig150.g1696)
0.1 11.51 5.86 7.2 6.55 3.39 4.21 9.66 12.33 5.05 7.68 5.71 6.3 3.07 4.52 2.82 7.1 7.89 9.19 7.9 4.17 11.95 8.91 5.05 4.45 5.94 6.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)