Heatmap: Cluster_265 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051610.1 (Contig348.g4714)
0.01 0.73 1.0 0.64 0.59 0.46 0.46 0.61 0.75 0.56 0.76 0.79 0.43 0.44 0.53 0.39 0.68 0.56 0.71 0.49 0.51 0.87 0.49 0.23 0.29 0.36 0.56
Sro1055_g236080.1 (Contig2523.g20596)
0.01 0.54 1.0 0.6 0.31 0.29 0.17 0.09 0.45 0.56 0.49 0.65 0.59 0.49 0.44 0.21 0.54 0.56 0.77 0.78 0.9 0.69 0.53 0.14 0.07 0.22 0.27
Sro1090_g240120.1 (Contig48.g340)
0.0 0.71 1.0 0.44 0.43 0.16 0.36 0.58 0.91 0.3 0.23 0.31 0.49 0.32 0.31 0.19 0.4 0.32 0.66 0.32 0.29 0.77 0.72 0.18 0.1 0.21 0.2
Sro1222_g253810.1 (Contig1750.g15573)
0.0 0.54 0.7 0.65 0.45 0.26 0.4 0.24 0.36 0.55 0.7 0.68 0.6 0.78 0.52 0.38 0.59 0.69 1.0 0.61 0.69 0.43 0.47 0.68 0.32 0.55 0.48
Sro123_g059520.1 (Contig66.g641)
0.02 0.82 1.0 0.29 0.27 0.13 0.18 0.25 0.5 0.35 0.39 0.54 0.12 0.12 0.22 0.27 0.45 0.26 0.26 0.16 0.57 0.81 0.39 0.17 0.21 0.27 0.25
Sro1258_g256860.1 (Contig3284.g25823)
0.02 0.61 0.41 0.33 0.38 0.11 0.21 0.32 0.53 0.25 0.2 0.18 0.26 0.18 0.16 0.08 0.14 0.63 1.0 0.59 0.21 0.5 0.39 0.12 0.04 0.1 0.27
Sro1268_g257740.1 (Contig4283.g32362)
0.0 0.67 1.0 0.39 0.34 0.07 0.26 0.33 0.46 0.2 0.31 0.24 0.3 0.14 0.21 0.22 0.49 0.27 0.38 0.18 0.16 0.43 0.33 0.22 0.09 0.14 0.18
0.01 0.42 0.53 0.18 0.16 0.03 0.25 0.32 1.0 0.17 0.26 0.11 0.17 0.17 0.17 0.1 0.38 0.17 0.19 0.18 0.16 0.42 0.51 0.05 0.07 0.11 0.11
Sro1321_g262520.1 (Contig4512.g33828)
0.0 0.57 0.55 0.39 0.38 0.79 0.59 0.61 0.8 0.48 0.48 0.28 0.5 0.42 0.5 0.47 0.54 0.37 0.66 0.61 0.59 0.92 1.0 0.28 0.54 0.45 0.45
Sro1411_g270440.1 (Contig2736.g22026)
0.07 0.24 0.88 0.32 0.29 0.13 0.15 0.87 0.17 0.31 0.44 0.16 0.15 0.2 0.3 0.46 0.3 0.23 0.56 0.1 0.34 0.33 0.4 1.0 0.65 0.36 0.21
0.01 0.75 0.91 0.6 0.66 0.02 0.1 0.55 0.39 0.23 0.2 0.04 0.8 0.06 0.07 0.05 0.15 1.0 0.96 0.97 0.15 0.39 0.35 0.11 0.1 0.08 0.23
Sro145_g067220.1 (Contig3646.g28168)
0.0 0.62 1.0 0.68 0.52 0.41 0.18 0.24 0.36 0.24 0.56 0.13 0.51 0.14 0.44 0.28 0.64 0.62 0.49 0.36 0.16 0.46 0.4 0.32 0.29 0.3 0.39
Sro147_g068000.1 (Contig246.g3023)
0.03 0.7 0.58 0.66 0.68 0.38 0.49 0.25 0.78 0.69 0.63 0.85 0.42 0.55 0.49 0.62 0.32 0.35 0.56 0.68 0.64 1.0 0.47 0.33 0.67 0.56 0.44
Sro1515_g279010.1 (Contig1412.g12973)
0.09 1.0 0.79 0.81 0.73 0.15 0.3 0.52 0.85 0.4 0.25 0.36 0.24 0.24 0.24 0.15 0.18 0.27 0.73 0.52 0.33 0.58 0.5 0.29 0.48 0.37 0.21
Sro1630_g287170.1 (Contig19.g146)
0.12 0.37 0.46 0.19 0.32 0.35 0.24 0.28 0.78 0.57 0.5 0.84 0.84 0.43 0.32 0.37 0.34 0.37 0.77 0.89 0.62 1.0 0.69 0.22 0.19 0.57 0.45
Sro1647_g288410.1 (Contig41.g287)
0.11 0.23 0.17 0.1 0.06 0.15 0.16 0.09 0.4 0.56 0.27 0.65 0.64 0.37 0.37 0.18 0.45 0.52 0.99 0.81 1.0 0.76 0.5 0.24 0.16 0.25 0.3
Sro1700_g292080.1 (Contig4692.g34891)
0.0 0.56 0.52 0.66 0.92 1.0 0.0 0.11 0.24 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.51 0.55 0.04 0.05 0.0 0.0
Sro1733_g294230.1 (Contig4341.g32749)
0.03 0.68 1.0 0.37 0.58 0.09 0.16 0.22 0.47 0.3 0.17 0.28 0.37 0.1 0.18 0.26 0.18 0.14 0.44 0.34 0.19 0.28 0.41 0.18 0.18 0.25 0.17
Sro1733_g294240.1 (Contig4341.g32750)
0.03 0.37 0.71 0.52 0.61 0.14 0.34 0.45 0.71 0.64 0.46 0.88 0.76 0.39 0.38 0.47 0.4 0.31 1.0 0.71 0.36 0.24 0.72 0.5 0.26 0.47 0.41
Sro1830_g300290.1 (Contig662.g7832)
0.13 0.78 1.0 0.3 0.25 0.11 0.21 0.12 0.32 0.26 0.21 0.33 0.2 0.27 0.22 0.2 0.29 0.16 0.51 0.1 0.35 0.51 0.42 0.2 0.07 0.14 0.18
Sro1851_g301650.1 (Contig3358.g26292)
0.09 0.27 0.75 0.16 0.13 0.05 0.07 0.03 0.23 0.27 0.33 0.32 0.2 0.32 0.3 0.23 0.46 0.5 1.0 0.58 0.17 0.56 0.17 0.13 0.24 0.33 0.17
Sro190_g081790.1 (Contig3488.g27054)
0.26 0.91 0.96 1.0 0.96 0.46 0.23 0.26 0.58 0.47 0.29 0.62 0.34 0.36 0.25 0.04 0.46 0.16 0.32 0.46 0.47 0.52 0.55 0.27 0.22 0.35 0.22
Sro193_g082600.1 (Contig826.g9159)
0.0 0.39 0.59 0.29 0.33 0.05 0.17 0.14 0.8 0.3 1.0 0.35 0.12 0.07 0.32 0.13 0.93 0.05 0.02 0.11 0.33 0.77 0.27 0.15 0.24 0.12 0.18
Sro2024_g311590.1 (Contig4632.g34550)
0.05 0.88 0.95 0.51 0.45 0.2 0.23 0.41 0.75 0.34 0.36 0.33 0.85 0.29 0.31 0.32 0.34 0.39 1.0 0.54 0.17 0.43 0.55 0.37 0.22 0.52 0.35
Sro2053_g312670.1 (Contig2326.g19186)
0.01 1.0 0.49 0.56 0.28 0.11 0.35 0.28 0.62 0.43 0.55 0.37 0.48 0.29 0.52 0.53 0.4 0.23 0.31 0.41 0.56 0.71 0.42 0.54 0.35 0.46 0.49
Sro2053_g312680.1 (Contig2326.g19187)
0.07 0.65 0.36 0.4 0.26 0.24 0.13 0.24 0.76 0.46 0.9 0.64 0.25 0.56 0.38 0.23 1.0 0.2 0.48 0.43 0.54 0.64 0.48 0.26 0.18 0.33 0.5
Sro205_g086270.1 (Contig2217.g18440)
0.0 0.77 0.91 0.54 0.58 0.02 0.01 0.01 0.36 0.12 0.02 0.08 0.22 0.01 0.02 0.01 0.05 0.24 1.0 0.12 0.03 0.14 0.11 0.0 0.0 0.02 0.02
Sro2098_g314420.1 (Contig3059.g24359)
0.01 0.64 0.69 0.32 0.35 0.24 0.25 0.31 0.3 0.3 0.19 0.24 0.58 0.26 0.24 0.3 0.24 0.67 1.0 0.6 0.31 0.17 0.27 0.22 0.27 0.19 0.2
Sro2185_g318140.1 (Contig1553.g14129)
0.82 0.5 1.0 0.28 0.17 0.16 0.44 0.19 0.45 0.29 0.24 0.23 0.44 0.37 0.29 0.12 0.61 0.13 0.32 0.32 0.2 0.93 0.68 0.26 0.08 0.15 0.18
Sro222_g091260.1 (Contig3134.g24889)
0.0 0.37 1.0 0.24 0.2 0.06 0.12 0.16 0.34 0.11 0.07 0.28 0.31 0.1 0.08 0.09 0.14 0.12 0.42 0.09 0.06 0.35 0.34 0.15 0.05 0.08 0.06
Sro2263_g321260.1 (Contig1877.g16381)
0.03 0.41 0.45 0.47 0.42 0.45 0.3 0.53 0.72 0.38 0.74 0.35 0.56 0.11 0.52 0.62 1.0 0.37 0.72 0.46 0.3 0.6 0.52 0.5 0.15 0.44 0.62
Sro234_g094540.1 (Contig3223.g25501)
0.03 0.3 0.19 0.26 0.34 0.35 0.37 0.69 0.62 0.55 1.0 0.63 0.51 0.72 0.67 0.66 1.0 0.5 0.65 0.41 0.54 0.7 0.42 0.43 0.35 0.45 0.63
Sro2485_g329040.1 (Contig802.g8991)
0.03 0.73 0.66 0.48 0.4 0.2 0.28 0.29 0.74 0.39 0.3 0.42 0.4 0.25 0.31 0.38 0.38 0.4 0.41 0.59 0.43 1.0 0.59 0.27 0.49 0.2 0.32
Sro2717_g335410.1 (Contig3434.g26741)
0.77 0.55 0.55 0.36 0.38 0.19 0.48 0.3 0.62 0.54 0.47 0.63 0.84 0.18 0.32 0.32 0.33 0.53 0.63 0.89 0.49 1.0 0.87 0.36 0.35 0.34 0.38
Sro2853_g338680.1 (Contig1140.g10945)
0.03 0.8 0.84 0.65 0.74 0.24 0.29 0.27 0.8 0.38 0.68 0.3 0.57 0.12 0.54 0.51 0.76 0.51 0.84 0.51 0.28 1.0 0.61 0.53 0.26 0.45 0.51
Sro313_g114750.1 (Contig1770.g15650)
0.02 0.89 1.0 0.76 0.67 0.12 0.32 0.34 0.81 0.31 0.31 0.28 0.32 0.15 0.21 0.21 0.28 0.19 0.27 0.31 0.3 0.7 0.51 0.11 0.08 0.17 0.17
0.0 0.6 1.0 0.22 0.12 0.06 0.15 0.14 0.45 0.22 0.11 0.18 0.11 0.14 0.18 0.18 0.28 0.09 0.19 0.36 0.2 0.54 0.44 0.12 0.18 0.14 0.1
Sro3312_g346620.1 (Contig3273.g25766)
0.01 0.71 0.42 0.32 0.81 0.54 0.04 0.51 1.0 0.24 0.31 0.19 0.05 0.18 0.12 0.02 0.11 0.01 0.09 0.16 0.21 0.62 0.28 0.05 0.13 0.16 0.18
Sro3402_g347620.1 (Contig611.g7534)
0.0 0.54 0.42 0.34 0.39 0.06 0.02 0.02 0.76 0.12 0.06 0.1 0.03 0.0 0.08 0.02 0.06 0.05 0.1 0.01 0.03 1.0 0.93 0.29 0.1 0.19 0.06
Sro369_g128180.1 (Contig1690.g15141)
0.03 0.65 1.0 0.97 0.58 0.2 0.32 0.3 0.58 0.27 0.25 0.18 0.44 0.09 0.29 0.15 0.38 0.4 0.53 0.43 0.18 0.72 0.93 0.45 0.27 0.24 0.19
Sro380_g130690.1 (Contig3948.g30261)
0.0 0.28 0.37 0.28 0.27 0.19 0.26 0.5 0.56 0.37 0.28 0.13 0.33 0.1 0.44 0.44 0.3 0.53 1.0 0.34 0.36 0.79 0.8 0.45 0.26 0.32 0.33
Sro381_g130770.1 (Contig161.g1810)
0.35 0.48 1.0 0.68 0.62 0.17 0.47 0.69 0.83 0.33 0.51 0.29 0.49 0.28 0.34 0.31 0.47 0.54 0.41 0.61 0.39 1.0 0.7 0.42 0.42 0.37 0.31
Sro381_g130890.1 (Contig161.g1822)
0.16 0.74 1.0 0.64 0.59 0.36 0.53 0.56 0.84 0.45 0.61 0.5 0.61 0.54 0.58 0.53 0.79 0.59 0.71 0.56 0.34 0.75 0.82 0.36 0.14 0.3 0.45
Sro391_g133030.1 (Contig2759.g22204)
0.01 0.47 0.61 0.23 0.24 0.13 0.3 0.44 1.0 0.4 0.41 0.45 0.21 0.22 0.26 0.14 0.33 0.22 0.27 0.25 0.45 0.96 0.51 0.14 0.05 0.16 0.21
Sro3_g002580.1 (Contig3832.g29443)
0.0 0.94 0.88 0.88 0.64 0.18 0.27 0.17 0.37 0.29 0.32 0.2 0.8 0.26 0.38 0.35 0.4 0.47 1.0 0.61 0.23 0.39 0.43 0.96 0.28 0.29 0.22
Sro427_g140720.1 (Contig2653.g21443)
0.03 0.53 0.61 0.91 0.9 0.52 0.47 1.0 0.92 0.6 0.87 0.57 0.78 0.83 0.7 0.86 0.68 0.87 0.81 0.54 0.5 0.75 0.79 0.17 0.15 0.56 0.76
Sro4464_g354050.1 (Contig2863.g22960)
0.0 0.41 1.0 0.17 0.14 0.04 0.06 0.14 0.38 0.07 0.03 0.1 0.07 0.04 0.05 0.04 0.05 0.02 0.08 0.02 0.04 0.37 0.23 0.1 0.05 0.03 0.02
0.0 0.76 0.63 0.38 0.36 0.01 0.12 0.46 0.66 0.2 0.3 0.05 0.07 0.28 0.31 0.18 0.61 0.22 0.14 0.05 0.26 1.0 0.48 0.16 0.15 0.36 0.16
Sro479_g151130.1 (Contig1858.g16248)
0.0 0.49 0.55 0.1 0.14 0.01 0.04 0.07 0.09 0.31 0.19 0.36 0.38 0.3 0.19 0.21 0.23 0.59 1.0 0.93 0.38 0.56 0.21 0.02 0.03 0.15 0.11
Sro507_g156480.1 (Contig4452.g33450)
0.19 0.77 0.77 0.69 0.7 0.05 0.17 0.47 1.0 0.27 0.07 0.24 0.1 0.07 0.11 0.02 0.05 0.15 0.27 0.17 0.25 0.52 0.8 0.52 0.15 0.11 0.06
Sro509_g157120.1 (Contig4289.g32405)
0.01 0.84 0.86 0.54 0.44 0.24 0.17 0.48 1.0 0.27 0.25 0.32 0.47 0.37 0.27 0.14 0.39 0.14 0.32 0.29 0.28 0.7 0.61 0.31 0.14 0.2 0.15
Sro525_g160240.1 (Contig3147.g24972)
0.01 0.74 1.0 0.54 0.54 0.54 0.34 0.34 0.73 0.4 0.23 0.35 0.86 0.23 0.28 0.42 0.17 0.36 0.4 0.69 0.41 0.46 0.67 0.4 0.44 0.24 0.28
Sro52_g031180.1 (Contig3190.g25201)
0.01 0.64 0.83 0.54 0.54 0.13 0.36 0.53 0.63 0.26 0.41 0.21 0.24 0.28 0.32 0.28 0.61 0.34 0.38 0.2 0.24 1.0 0.5 0.23 0.19 0.24 0.35
Sro548_g164390.1 (Contig1714.g15319)
0.44 0.77 1.0 0.47 0.38 0.12 0.19 0.34 0.46 0.44 0.31 0.53 0.6 0.2 0.36 0.29 0.41 0.44 0.78 0.51 0.45 0.77 0.51 0.27 0.16 0.24 0.26
Sro574_g169210.1 (Contig281.g3640)
0.03 0.52 1.0 0.5 0.37 0.11 0.23 0.44 0.55 0.27 0.27 0.21 0.17 0.15 0.26 0.22 0.27 0.19 0.32 0.17 0.28 0.53 0.54 0.46 0.22 0.3 0.23
Sro609_g175060.1 (Contig285.g3738)
0.06 1.0 0.73 0.73 0.67 0.17 0.23 0.69 0.55 0.41 0.62 0.41 0.35 0.45 0.38 0.45 0.69 0.44 0.73 0.93 0.57 0.62 0.53 0.19 0.23 0.35 0.46
Sro666_g183940.1 (Contig1358.g12513)
0.0 0.61 0.51 0.47 0.3 0.01 0.11 0.33 0.43 0.18 0.07 0.07 0.78 0.11 0.05 0.03 0.05 0.6 1.0 0.63 0.09 0.31 0.26 0.18 0.18 0.13 0.06
Sro684_g186780.1 (Contig2085.g17782)
0.03 0.71 0.51 0.35 0.37 0.19 0.42 0.78 0.89 0.31 0.55 0.33 0.48 0.4 0.38 0.31 0.58 0.42 0.62 0.3 0.29 1.0 0.58 0.18 0.17 0.16 0.33
Sro688_g187440.1 (Contig1782.g15790)
0.01 0.55 1.0 0.42 0.32 0.42 0.16 0.15 0.45 0.27 0.38 0.18 0.56 0.25 0.38 0.32 0.83 0.26 0.56 0.43 0.22 0.55 0.45 0.23 0.17 0.32 0.33
Sro736_g195010.1 (Contig1047.g10323)
0.01 1.0 0.92 0.55 0.56 0.04 0.03 0.11 0.77 0.12 0.09 0.1 0.06 0.01 0.09 0.0 0.14 0.04 0.05 0.03 0.05 0.84 0.29 0.01 0.0 0.04 0.03
0.0 0.93 1.0 0.46 0.31 0.13 0.34 0.22 0.58 0.24 0.23 0.18 0.23 0.23 0.26 0.17 0.26 0.19 0.26 0.32 0.22 0.72 0.51 0.14 0.12 0.17 0.22
Sro94_g049060.1 (Contig150.g1696)
0.01 0.93 0.48 0.58 0.53 0.28 0.34 0.78 1.0 0.41 0.62 0.46 0.51 0.25 0.37 0.23 0.58 0.64 0.75 0.64 0.34 0.97 0.72 0.41 0.36 0.48 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)