Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1015_g231480.1 (Contig1632.g14685)
- - - - - - - - - 0.27 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
Sro1016_g231600.1 (Contig3563.g27519)
- - - - - - - - - 1.66 - - - - - 3.19 - - - 3.08 - 2.64 - - - - -
Sro1082_g239210.1 (Contig1844.g16166)
- - - - - - - - - 2.27 - - - - - 3.58 - - - - - 3.02 1.05 - - - -
Sro1139_g245490.1 (Contig125.g1425)
-0.87 - - - - - -1.03 0.02 - 0.08 - - 2.6 - - - - 1.15 - 3.85 0.06 - -2.58 - - - -
Sro116_g057070.1 (Contig2228.g18483)
- 2.2 - 2.75 -0.7 - - 0.43 - 0.91 - - 2.29 - - - - 0.58 - 0.72 - 1.16 0.65 - - - -
Sro116_g057080.1 (Contig2228.g18484)
- - - - - - - - - 0.16 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
Sro1201_g251980.1 (Contig377.g5065)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro1364_g266500.1 (Contig3679.g28413)
- - - - - - - - - -0.12 - - 3.12 - - - - 0.68 0.77 3.81 - - - - - - -
Sro1379_g267710.1 (Contig3127.g24826)
- - - - - - - - - 0.01 - - - 2.02 - - - - - 3.95 - 1.8 - - - 1.59 -
- - 0.55 2.51 - - - -1.83 -0.63 -0.85 -0.17 -0.84 -0.56 - -0.48 - 0.36 -0.68 2.54 2.92 - - -1.95 - - - -
Sro1465_g274990.1 (Contig1516.g13832)
- - - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - 4.62 - - - - - - -
- - - - - - -1.26 2.82 0.77 -0.98 1.14 1.24 - - -0.92 1.16 - 0.47 - - 1.82 1.33 -1.84 -0.04 -0.74 - -0.54
Sro1553_g281910.1 (Contig1252.g11686)
- - - - - - - 1.7 - 1.57 - - - - - - - - - - - 4.38 - - - - -
Sro1578_g283650.1 (Contig1633.g14698)
-0.42 0.05 0.25 -1.79 - -2.86 -1.77 - -0.51 -0.63 1.03 -1.05 1.09 -1.16 -0.59 - - 2.15 1.95 2.68 -1.99 -0.94 -1.8 - - - -1.23
Sro1590_g284420.1 (Contig1504.g13752)
- - - - - - - - - -1.06 - - 2.77 - - - - 2.65 2.24 3.12 - - - - - - -
Sro1605_g285420.1 (Contig4243.g32127)
- - - - - - - - - -1.41 - - 2.97 - - - - 0.88 1.98 3.6 -0.24 - - - - - -
Sro16_g011560.1 (Contig916.g9593)
- - - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - -
- -14.49 -23.03 3.23 3.9 -22.79 -13.13 -25.4 -19.29 -4.37 - -2.76 - - -13.29 -24.66 -13.79 -4.3 - -25.19 -12.98 0.44 -10.66 -23.4 0.04 - -5.74
Sro1821_g299750.1 (Contig1361.g12537)
- - - - - - - - - 2.09 - 3.57 - - - - - - - - - 3.45 - - - - -
Sro1837_g300750.1 (Contig1447.g13266)
-1.88 0.35 -2.63 -2.25 -0.63 - -1.07 -1.03 -0.91 -0.03 -1.26 -1.22 1.07 -1.01 -1.12 - -3.33 2.16 1.81 2.13 -0.3 0.66 0.14 -0.55 -1.33 -0.45 -1.9
Sro1924_g305720.1 (Contig3525.g27252)
- -1.07 0.43 -0.4 -1.13 -3.0 -0.67 0.84 2.31 -1.14 - -2.32 1.49 -4.86 -1.49 -4.85 - -4.72 -2.58 2.04 -2.14 2.16 1.61 -2.66 -3.94 -2.24 -3.51
Sro1966_g308300.1 (Contig1903.g16494)
- - - - - - - - - -0.24 - - - - - - - - - 4.71 - - - - - - -
Sro2008_g310670.1 (Contig2501.g20499)
- - - - - - - - - 0.26 - 1.68 1.95 - - - - 3.43 - - 2.76 - - - - - 0.29
Sro2056_g312860.1 (Contig4461.g33531)
- - - - - - - - 1.63 0.92 - - - - - - - - - - 3.62 3.28 - - - - -
Sro223_g091490.1 (Contig370.g5018)
- - - - - - - - - 0.28 - - - - - - - 3.37 - - - 3.95 - - - - -
Sro2306_g322730.1 (Contig2093.g17837)
- - - - - - - - - 1.22 - 2.43 - - - - - - - 4.27 - - - - - - -
Sro2340_g324010.1 (Contig867.g9412)
- - - - - - - - - 2.37 - - - - - - - - - - - 4.45 - - - - -
Sro2363_g324910.1 (Contig4191.g31917)
- - 2.18 - 1.22 - - 3.68 - -1.32 - -0.51 0.77 - - - - - - - - 2.18 - - - - -
Sro237_g095170.1 (Contig1864.g16288)
- 3.95 - - - - - - - -1.76 - - - - - - - - - - - 3.49 - - - - -
Sro238_g095700.1 (Contig99.g1216)
- 3.0 - 2.54 - - - - - 1.02 - - - - 0.13 2.5 - - - - 1.3 0.95 - - - - -
Sro242_g096660.1 (Contig554.g7084)
- - - - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - 2.54 3.86 1.93 - - - - -
Sro2545_g330780.1 (Contig2769.g22286)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
- - - - - - - - 2.67 -0.15 - - - - 0.78 - - - - - - 4.07 0.38 - - - -
Sro2725_g335630.1 (Contig2516.g20570)
- -1.1 0.39 -2.11 -1.36 -2.63 -4.99 0.96 1.01 -0.22 0.88 -1.88 -0.03 - -1.69 0.28 0.42 1.57 1.96 0.61 -3.75 2.15 -1.72 - - - -1.12
Sro278_g106570.1 (Contig1952.g16772)
- - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - -
Sro2867_g339010.1 (Contig317.g4212)
- - - - - - - - - -2.09 - - 2.41 - - - - - - 4.42 - - - - - - -
Sro295_g110310.1 (Contig4342.g32754)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - -
Sro3097_g343650.1 (Contig3182.g25137)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
- - - - - - - - - 1.24 - 2.04 - - - - - 2.13 0.56 2.89 2.01 1.7 - - - - -
Sro3270_g346060.1 (Contig1524.g13884)
-0.62 1.28 - - - - -0.72 -2.53 1.96 0.23 - 0.26 2.58 -1.4 -1.06 - - - - - - 2.07 1.1 1.6 - -1.0 -2.74
Sro347_g122880.1 (Contig477.g6456)
- - - - - - - - - 0.31 - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - -
-1.5 -1.72 -5.6 0.2 1.93 - -2.88 1.87 -1.22 -0.62 -9.32 -2.33 -0.82 -1.0 0.58 -10.56 -17.37 -3.16 -5.99 -12.27 -16.04 2.79 1.94 -1.97 -1.23 0.96 -2.25
Sro3535_g349050.1 (Contig4371.g32904)
- - - - - - - - -0.32 1.92 - 1.28 - 1.51 - - 0.17 - - 1.77 3.04 1.99 -2.22 - - - -2.4
Sro3545_g349120.1 (Contig844.g9300)
-2.75 -1.19 0.91 -0.53 -0.14 -3.21 -2.83 - 1.95 -0.55 -0.21 -0.81 1.67 -2.48 -2.28 - -0.01 0.58 0.85 1.77 -3.33 2.08 -0.71 - - - -0.97
Sro3567_g349230.1 (Contig1355.g12498)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 2.64 3.82 - - - - - - -
Sro3684_g350250.1 (Contig2767.g22280)
- - - - - - - - - 0.91 - - - - - - - - - - 4.17 2.83 - - - - -
Sro3797_g351120.1 (Contig2993.g23789)
- - - - - - - - - 2.05 - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - -
Sro404_g135920.1 (Contig4176.g31852)
- - - - - - - - - 1.52 - - - 2.57 - - - - - - 3.7 2.36 - - - - -
Sro412_g137850.1 (Contig2922.g23257)
- - - - - - - - - 1.37 - - - - 1.34 - - - - 4.45 - - - - - - -
Sro4229_g353460.1 (Contig3503.g27152)
- - - - - - - - - -1.18 - - 3.33 - - - - - - 4.05 - - - - - - -
- -0.36 - - - - -4.11 - -2.01 0.33 - - 2.38 - -2.15 0.07 - 2.78 - 3.01 0.09 1.05 -3.57 - - - -
- - - - - - - - - 0.57 - - - - 2.75 - - - - - - 4.23 - - - - -
- - 3.65 - - - - - - -2.54 - - - - 0.2 - - - 1.13 - 1.0 3.01 -0.26 - - - -
Sro62_g035590.1 (Contig2718.g21940)
- - - - - - - - - -0.8 - - - - - - - - - 4.72 - - - - - - -
Sro642_g180090.1 (Contig442.g5927)
- - - - - - - - 3.17 1.36 - - - - - - - - - 3.16 - 2.7 - - - - -
Sro703_g190190.1 (Contig314.g4187)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - -
Sro745_g196320.1 (Contig210.g2502)
- - - - - - - - - 0.74 - - - - - - - 3.74 - 3.58 - - - - - - -
Sro768_g199580.1 (Contig2130.g17963)
- - - - - - - - - 0.75 - 2.96 - - - - - - - 4.13 - - - - - - -
- - - - - 1.42 - - - -3.49 - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - -
Sro781_g201680.1 (Contig678.g7951)
- - - - - - - - - 0.84 - - - - 1.34 - - - - 4.36 - - 1.11 - - - -
Sro783_g201890.1 (Contig1778.g15740)
- - - - - - - - - 0.68 - - - - - - - - - 4.67 - - - - - - -
- - 2.88 - - - 1.3 - - 0.9 - - - - - - - - - - 0.97 2.3 - 2.58 - 1.28 -
Sro845_g210080.1 (Contig2192.g18260)
- - - - - - - - - 0.13 - - - - - - - - 3.03 4.15 - - - - - - -
Sro8_g006720.1 (Contig89.g985)
- - 3.26 - - - - - - 0.08 - - 1.69 - - - 1.51 - - 3.2 - - 0.15 - - - -
Sro92_g048150.1 (Contig486.g6575)
- - - - - - - - - 0.86 - - 2.0 - - - - 2.8 - 2.57 2.38 0.45 - 0.77 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.