1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1015_g231480.1 (Contig1632.g14685)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1016_g231600.1 (Contig3563.g27519)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1082_g239210.1 (Contig1844.g16166)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1139_g245490.1 (Contig125.g1425)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.56 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro116_g057070.1 (Contig2228.g18483)
 0.0 0.12 0.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro116_g057080.1 (Contig2228.g18484)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1201_g251980.1 (Contig377.g5065)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1364_g266500.1 (Contig3679.g28413)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1379_g267710.1 (Contig3127.g24826)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.71 2.76 0.0 0.0 0.0 0.14 0.31 0.27 0.43 0.27 0.33 0.0 0.35 0.0 0.62 0.3 2.8 3.65 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1465_g274990.1 (Contig1516.g13832)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 2.36 0.57 0.17 0.74 0.79 0.0 0.0 0.18 0.74 0.0 0.46 0.0 0.0 1.18 0.84 0.09 0.32 0.2 0.0 0.23
Sro1553_g281910.1 (Contig1252.g11686)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1578_g283650.1 (Contig1633.g14698)
 0.3 0.42 0.49 0.12 0.0 0.06 0.12 0.0 0.29 0.26 0.83 0.2 0.87 0.18 0.27 0.0 0.0 1.8 1.57 2.61 0.1 0.21 0.12 0.0 0.0 0.0 0.17
Sro1590_g284420.1 (Contig1504.g13752)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.21 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1605_g285420.1 (Contig4243.g32127)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.55 1.71 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro16_g011560.1 (Contig916.g9593)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 3.08 4.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.34 0.0 0.01
Sro1821_g299750.1 (Contig1361.g12537)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1837_g300750.1 (Contig1447.g13266)
 0.11 0.53 0.07 0.09 0.27 0.0 0.2 0.21 0.22 0.41 0.17 0.18 0.88 0.21 0.19 0.0 0.04 1.88 1.47 1.84 0.34 0.66 0.46 0.29 0.17 0.31 0.11
Sro1924_g305720.1 (Contig3525.g27252)
 0.0 0.85 2.39 1.34 0.81 0.22 1.11 3.17 8.75 0.8 0.0 0.36 4.96 0.06 0.63 0.06 0.0 0.07 0.3 7.25 0.4 7.93 5.41 0.28 0.11 0.37 0.15
Sro1966_g308300.1 (Contig1903.g16494)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2008_g310670.1 (Contig2501.g20499)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro2056_g312860.1 (Contig4461.g33531)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro223_g091490.1 (Contig370.g5018)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2306_g322730.1 (Contig2093.g17837)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2340_g324010.1 (Contig867.g9412)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2363_g324910.1 (Contig4191.g31917)
 0.0 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.0 0.48 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro237_g095170.1 (Contig1864.g16288)
 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro238_g095700.1 (Contig99.g1216)
 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro242_g096660.1 (Contig554.g7084)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.3 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2545_g330780.1 (Contig2769.g22286)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2725_g335630.1 (Contig2516.g20570)
 0.0 0.17 0.49 0.09 0.15 0.06 0.01 0.73 0.75 0.32 0.69 0.1 0.37 0.0 0.12 0.46 0.5 1.11 1.45 0.57 0.03 1.66 0.11 0.0 0.0 0.0 0.17
Sro278_g106570.1 (Contig1952.g16772)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2867_g339010.1 (Contig317.g4212)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro295_g110310.1 (Contig4342.g32754)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3097_g343650.1 (Contig3182.g25137)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.15 0.74 0.4 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3270_g346060.1 (Contig1524.g13884)
 0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.2 0.06 0.0 0.06 0.31 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.11 0.15 0.0 0.03 0.01
Sro347_g122880.1 (Contig477.g6456)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.49 0.03 1.86 6.19 0.0 0.22 5.94 0.69 1.06 0.0 0.32 0.92 0.81 2.42 0.0 0.0 0.18 0.03 0.0 0.0 11.23 6.2 0.41 0.69 3.16 0.34
Sro3535_g349050.1 (Contig4371.g32904)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.0 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.29 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro3545_g349120.1 (Contig844.g9300)
 0.08 0.25 1.06 0.39 0.51 0.06 0.08 0.0 2.2 0.39 0.49 0.32 1.81 0.1 0.12 0.0 0.57 0.85 1.02 1.93 0.06 2.4 0.35 0.0 0.0 0.0 0.29
Sro3567_g349230.1 (Contig1355.g12498)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 1.04 2.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3684_g350250.1 (Contig2767.g22280)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3797_g351120.1 (Contig2993.g23789)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro404_g135920.1 (Contig4176.g31852)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro412_g137850.1 (Contig2922.g23257)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4229_g353460.1 (Contig3503.g27152)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.86 0.0 0.04 0.17 0.0 1.14 0.0 1.34 0.18 0.34 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro62_g035590.1 (Contig2718.g21940)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro642_g180090.1 (Contig442.g5927)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro703_g190190.1 (Contig314.g4187)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro745_g196320.1 (Contig210.g2502)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro768_g199580.1 (Contig2130.g17963)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro781_g201680.1 (Contig678.g7951)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro783_g201890.1 (Contig1778.g15740)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.27 0.0 0.33 0.0 0.13 0.0
Sro845_g210080.1 (Contig2192.g18260)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro8_g006720.1 (Contig89.g985)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro92_g048150.1 (Contig486.g6575)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.09 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)