Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1049_g235400.1 (Contig3572.g27595)
0.55 1.0 0.38 0.06 0.05 0.03 0.06 0.15 0.05 0.17 0.03 0.09 0.58 0.05 0.06 0.08 0.01 0.08 0.02 0.75 0.12 0.1 0.16 0.3 0.46 0.03 0.04
Sro1059_g236540.1 (Contig822.g9130)
0.0 0.42 0.5 0.06 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.11 0.01 0.05 0.59 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 1.0 0.02 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro1068_g237500.1 (Contig852.g9369)
0.0 0.98 1.0 0.04 0.04 0.0 0.03 0.01 0.06 0.16 0.0 0.1 0.6 0.05 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.06 0.18 0.02 0.02 0.04 0.0 0.01
Sro1074_g238240.1 (Contig4290.g32408)
0.0 0.59 1.0 0.27 0.38 0.0 0.01 0.01 0.05 0.15 0.05 0.05 0.31 0.14 0.06 0.04 0.01 0.01 0.14 0.26 0.12 0.16 0.08 0.05 0.08 0.04 0.01
Sro1129_g244420.1 (Contig2187.g18235)
0.0 1.0 0.98 0.28 0.21 0.0 0.01 0.3 0.09 0.15 0.0 0.0 0.19 0.0 0.04 0.16 0.0 0.17 0.0 0.21 0.0 0.02 0.01 0.01 0.06 0.06 0.11
Sro119_g058270.1 (Contig2194.g18300)
0.08 0.94 0.1 0.61 0.38 0.0 0.08 0.18 0.09 0.25 0.59 0.19 0.22 0.52 0.19 0.03 0.28 0.22 0.14 1.0 0.09 0.05 0.12 0.12 0.08 0.05 0.24
Sro11_g008450.1 (Contig724.g8319)
0.16 0.46 1.0 0.24 0.34 0.01 0.04 0.11 0.05 0.19 0.05 0.17 0.44 0.1 0.09 0.11 0.04 0.07 0.19 0.75 0.15 0.02 0.03 0.05 0.01 0.02 0.04
Sro11_g008770.1 (Contig724.g8351)
0.01 0.2 1.0 0.25 0.2 0.01 0.02 0.02 0.02 0.13 0.04 0.07 0.52 0.02 0.03 0.08 0.03 0.05 0.09 0.85 0.24 0.04 0.03 0.04 0.0 0.03 0.06
Sro1320_g262350.1 (Contig4115.g31414)
0.0 0.08 1.0 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.77 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.11 0.74 0.03 0.06 0.13 0.05 0.11 0.34 0.01
Sro1336_g263980.1 (Contig2079.g17758)
0.0 1.0 0.37 0.55 0.26 0.01 0.05 0.08 0.13 0.08 0.07 0.0 0.22 0.01 0.05 0.0 0.2 0.05 0.05 0.27 0.01 0.03 0.03 0.07 0.05 0.06 0.1
Sro1370_g267050.1 (Contig2356.g19365)
0.02 0.27 0.91 0.33 0.09 0.01 0.09 0.08 0.09 0.16 0.09 0.11 0.57 0.04 0.06 0.09 0.06 0.06 0.17 1.0 0.17 0.1 0.06 0.19 0.27 0.1 0.08
Sro1380_g267750.1 (Contig4344.g32784)
0.0 1.0 0.28 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.07 0.0 0.01 0.19 0.01 0.02 0.03 0.0 0.21 0.09 0.31 0.08 0.0 0.01 0.02 0.09 0.13 0.02
Sro1521_g279450.1 (Contig1605.g14549)
0.0 1.0 0.66 0.02 0.01 0.01 0.06 0.15 0.06 0.14 0.03 0.01 0.52 0.16 0.13 0.05 0.03 0.28 0.3 0.8 0.02 0.11 0.07 0.11 0.2 0.12 0.08
Sro159_g071780.1 (Contig500.g6718)
0.11 0.36 0.89 0.21 0.18 0.03 0.22 0.3 0.39 0.18 0.1 0.18 0.74 0.11 0.12 0.15 0.12 0.17 0.22 1.0 0.16 0.4 0.24 0.05 0.05 0.07 0.09
Sro1600_g285100.1 (Contig3444.g26796)
0.13 0.52 0.73 0.38 0.23 0.07 0.11 0.06 0.04 0.23 0.15 0.25 0.57 0.14 0.19 0.18 0.22 0.03 0.05 1.0 0.22 0.06 0.01 0.17 0.19 0.1 0.12
Sro1637_g287680.1 (Contig4007.g30816)
0.06 1.0 0.09 0.49 0.29 0.0 0.03 0.27 0.0 0.21 0.53 0.15 0.65 0.38 0.07 0.03 0.14 0.33 0.33 0.67 0.06 0.04 0.03 0.18 0.16 0.0 0.12
Sro1650_g288720.1 (Contig3263.g25714)
0.0 0.72 1.0 0.37 0.19 0.06 0.19 0.15 0.13 0.2 0.13 0.08 0.34 0.19 0.19 0.15 0.13 0.07 0.1 0.44 0.24 0.17 0.24 0.21 0.29 0.23 0.19
Sro171_g075710.1 (Contig113.g1280)
0.0 0.97 0.2 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.11 0.05 0.01 1.0 0.03 0.06 0.1 0.02 0.04 0.04 0.52 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.08
Sro176_g077590.1 (Contig203.g2446)
0.0 0.35 1.0 0.2 0.2 0.01 0.01 0.01 0.07 0.09 0.01 0.02 0.64 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.54 0.03 0.24 0.08 0.03 0.01 0.03 0.02
Sro1777_g296930.1 (Contig3318.g26034)
0.53 0.56 0.68 0.58 0.57 0.05 0.25 0.16 0.19 0.27 0.17 0.22 0.66 0.17 0.2 0.16 0.13 0.24 0.37 1.0 0.3 0.45 0.32 0.1 0.19 0.08 0.13
Sro207_g086890.1 (Contig755.g8592)
0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.68 0.18 0.07 0.02 0.03 0.07 0.0 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02
Sro207_g086960.1 (Contig755.g8599)
0.0 0.59 0.64 0.41 0.59 0.1 0.17 0.16 0.21 0.28 0.23 0.31 0.84 0.26 0.23 0.25 0.26 0.29 0.35 1.0 0.26 0.2 0.15 0.19 0.26 0.18 0.19
Sro2094_g314140.1 (Contig1203.g11328)
0.0 0.19 0.71 0.24 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro212_g088230.1 (Contig3756.g28806)
0.0 1.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.09 0.09 0.09 0.1 0.0 0.05 0.04 0.13 0.16 0.11 0.11 0.02 0.03 0.03 0.02 0.08 0.04 0.04
Sro220_g090700.1 (Contig3599.g27832)
0.05 1.0 0.63 0.62 0.24 0.0 0.07 0.07 0.08 0.11 0.02 0.08 0.11 0.04 0.06 0.11 0.09 0.13 0.1 0.13 0.11 0.04 0.05 0.06 0.06 0.03 0.01
0.01 0.89 1.0 0.28 0.01 0.03 0.01 0.34 0.02 0.16 0.03 0.02 0.23 0.01 0.02 0.03 0.02 0.04 0.14 0.34 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.0 0.02
Sro2291_g322200.1 (Contig4085.g31266)
0.0 1.0 0.6 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 0.02 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.01 0.0 0.0 0.07 0.11 0.02 0.01
Sro2396_g325970.1 (Contig3316.g26022)
0.0 1.0 0.51 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.08 0.01 0.0 0.39 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.06 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Sro23_g015600.1 (Contig2259.g18710)
0.01 0.01 0.67 0.04 0.02 0.01 0.02 0.06 0.1 0.14 0.05 0.21 0.39 0.12 0.07 0.09 0.09 0.09 0.1 1.0 0.18 0.08 0.11 0.01 0.07 0.09 0.07
Sro279_g106910.1 (Contig3140.g24930)
0.05 0.7 1.0 0.6 0.55 0.19 0.25 0.22 0.24 0.34 0.21 0.28 0.7 0.21 0.24 0.33 0.21 0.32 0.42 0.75 0.44 0.29 0.31 0.09 0.15 0.13 0.17
Sro280_g107030.1 (Contig1076.g10463)
0.0 0.8 1.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.08 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.02 0.0 0.03 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02
Sro2865_g338930.1 (Contig3459.g26846)
0.0 0.88 1.0 0.72 0.73 0.05 0.22 0.08 0.02 0.21 0.07 0.08 0.28 0.23 0.03 0.09 0.36 0.0 0.08 0.33 0.08 0.13 0.06 0.07 0.0 0.1 0.19
Sro2935_g340540.1 (Contig676.g7902)
0.08 0.47 1.0 0.49 0.21 0.43 0.28 0.09 0.06 0.33 0.37 0.29 0.66 0.15 0.4 0.4 0.04 0.18 0.12 0.72 0.29 0.05 0.02 0.44 0.71 0.39 0.25
Sro2935_g340550.1 (Contig676.g7903)
0.15 0.35 1.0 0.3 0.31 0.07 0.28 0.16 0.13 0.28 0.38 0.31 0.68 0.12 0.29 0.28 0.2 0.22 0.18 0.9 0.26 0.13 0.01 0.55 0.63 0.37 0.28
Sro2935_g340560.1 (Contig676.g7904)
0.03 0.31 1.0 0.27 0.18 0.05 0.12 0.04 0.02 0.16 0.22 0.13 0.61 0.04 0.15 0.15 0.14 0.18 0.3 0.63 0.14 0.06 0.02 0.18 0.27 0.21 0.15
Sro2_g001110.1 (Contig467.g6269)
0.02 0.72 1.0 0.2 0.09 0.0 0.08 0.09 0.07 0.17 0.17 0.11 0.31 0.14 0.06 0.01 0.05 0.09 0.13 0.45 0.04 0.03 0.06 0.05 0.02 0.04 0.09
Sro314_g115150.1 (Contig2448.g20041)
0.0 0.74 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.35 0.2 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro314_g115160.1 (Contig2448.g20042)
0.0 0.76 0.06 0.33 0.34 0.0 0.02 0.04 0.14 0.09 0.0 0.0 0.53 0.0 0.02 0.0 0.09 0.1 0.06 1.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro31_g020250.1 (Contig420.g5620)
0.0 1.0 0.58 0.43 0.67 0.08 0.21 0.1 0.27 0.26 0.14 0.19 0.66 0.19 0.2 0.29 0.13 0.16 0.17 0.64 0.27 0.17 0.31 0.07 0.02 0.09 0.13
Sro3255_g345900.1 (Contig1804.g15886)
0.0 0.2 0.5 0.13 0.0 0.02 0.0 0.08 0.13 0.16 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01 0.17 0.02 0.03 0.25 1.0 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.03
Sro326_g117930.1 (Contig1080.g10481)
0.0 1.0 0.77 0.29 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro350_g123790.1 (Contig1556.g14149)
0.03 0.31 1.0 0.18 0.17 0.01 0.2 0.19 0.52 0.12 0.03 0.06 0.93 0.08 0.1 0.06 0.11 0.16 0.11 0.51 0.12 0.34 0.37 0.05 0.05 0.03 0.07
Sro41_g025000.1 (Contig169.g1906)
0.01 0.62 1.0 0.37 0.29 0.0 0.02 0.01 0.05 0.09 0.01 0.03 0.01 0.06 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.06 0.03 0.02 0.04 0.02
Sro420_g139410.1 (Contig1861.g16284)
0.01 1.0 0.55 0.63 0.47 0.02 0.03 0.09 0.04 0.2 0.16 0.18 0.26 0.34 0.15 0.07 0.17 0.03 0.04 0.18 0.04 0.07 0.06 0.1 0.06 0.16 0.12
Sro441_g143770.1 (Contig470.g6391)
0.01 0.75 0.55 0.29 0.2 0.05 0.05 0.07 0.07 0.14 0.02 0.08 0.66 0.08 0.04 0.04 0.04 0.24 0.32 1.0 0.07 0.13 0.07 0.05 0.02 0.02 0.06
0.0 0.22 1.0 0.11 0.19 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.32 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro482_g151870.1 (Contig232.g2797)
0.0 1.0 0.77 0.43 0.5 0.06 0.18 0.11 0.25 0.18 0.14 0.12 0.32 0.11 0.15 0.16 0.09 0.09 0.14 0.4 0.1 0.27 0.25 0.1 0.09 0.1 0.11
Sro53_g031350.1 (Contig1592.g14475)
0.0 0.71 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01
Sro53_g031360.1 (Contig1592.g14476)
0.0 1.0 0.89 0.07 0.06 0.05 0.13 0.15 0.15 0.21 0.17 0.18 0.24 0.15 0.18 0.28 0.13 0.21 0.19 0.33 0.29 0.23 0.12 0.16 0.5 0.12 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro616_g175980.1 (Contig2621.g21290)
0.01 0.64 0.86 0.27 0.36 0.18 0.13 0.17 0.13 0.28 0.35 0.22 1.0 0.18 0.25 0.21 0.38 0.3 0.35 0.85 0.21 0.21 0.13 0.18 0.14 0.15 0.25
Sro630_g178340.1 (Contig456.g6164)
0.0 1.0 0.57 0.32 0.39 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro63_g035630.1 (Contig2778.g22328)
0.0 0.59 0.46 0.29 0.15 0.17 0.04 0.1 0.14 0.23 0.2 0.19 1.0 0.06 0.21 0.21 0.09 0.09 0.21 0.52 0.19 0.17 0.12 0.06 0.04 0.18 0.16
Sro63_g036080.1 (Contig2778.g22373)
0.01 0.4 0.66 0.33 0.23 0.13 0.16 0.07 0.09 0.24 0.27 0.22 0.87 0.25 0.19 0.09 0.19 0.12 0.25 1.0 0.25 0.1 0.1 0.27 0.24 0.18 0.15
0.03 0.46 0.64 0.27 0.26 0.06 0.1 0.16 0.24 0.16 0.13 0.1 0.75 0.06 0.08 0.06 0.06 0.12 0.17 1.0 0.09 0.35 0.18 0.12 0.15 0.13 0.08
Sro708_g190780.1 (Contig4523.g33882)
0.03 0.45 0.53 0.3 0.24 0.01 0.09 0.09 0.04 0.16 0.1 0.14 0.71 0.06 0.14 0.09 0.11 0.06 0.09 1.0 0.19 0.05 0.11 0.14 0.07 0.08 0.1
Sro725_g193360.1 (Contig3530.g27288)
0.17 0.53 0.51 1.0 0.68 0.07 0.06 0.1 0.15 0.12 0.1 0.03 0.53 0.05 0.07 0.02 0.16 0.05 0.04 0.82 0.06 0.05 0.15 0.1 0.09 0.03 0.05
0.07 0.57 0.47 1.0 0.99 0.04 0.11 0.05 0.14 0.14 0.04 0.18 0.27 0.13 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.59 0.16 0.01 0.09 0.08 0.2 0.04 0.02
0.05 0.72 1.0 0.42 0.52 0.04 0.08 0.03 0.02 0.23 0.11 0.24 0.85 0.15 0.17 0.08 0.04 0.09 0.29 0.78 0.19 0.09 0.09 0.06 0.11 0.07 0.13
0.0 1.0 0.32 0.0 0.0 0.36 0.04 0.03 0.13 0.1 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro808_g205340.1 (Contig630.g7643)
0.05 0.48 0.76 0.34 0.29 0.03 0.12 0.28 0.26 0.23 0.12 0.19 0.8 0.14 0.12 0.11 0.14 0.13 0.22 1.0 0.22 0.23 0.15 0.13 0.1 0.09 0.12
0.01 0.23 0.56 0.12 0.15 0.11 0.08 0.2 0.15 0.11 0.06 0.07 0.58 0.02 0.04 0.15 0.06 0.04 0.05 1.0 0.09 0.23 0.12 0.02 0.0 0.06 0.04
Sro832_g208490.1 (Contig3251.g25665)
0.0 0.43 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05
Sro871_g213770.1 (Contig1188.g11247)
0.0 1.0 0.4 0.27 0.1 0.18 0.08 0.03 0.01 0.09 0.03 0.0 0.12 0.0 0.09 0.0 0.02 0.09 0.01 0.12 0.01 0.0 0.0 0.26 0.29 0.05 0.09
Sro873_g214030.1 (Contig3883.g29841)
0.03 1.0 0.57 0.64 0.43 0.12 0.07 0.08 0.13 0.17 0.26 0.31 0.14 0.18 0.16 0.09 0.16 0.04 0.06 0.09 0.07 0.03 0.07 0.12 0.05 0.1 0.16
Sro876_g214510.1 (Contig165.g1866)
0.03 1.0 0.43 0.42 0.29 0.0 0.01 0.16 0.11 0.07 0.0 0.01 0.64 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.43 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro876_g214560.1 (Contig165.g1871)
0.0 1.0 0.17 0.09 0.18 0.0 0.0 0.08 0.06 0.04 0.0 0.01 0.59 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro877_g214650.1 (Contig139.g1546)
0.01 0.74 1.0 0.42 0.41 0.15 0.22 0.24 0.25 0.41 0.2 0.4 0.89 0.45 0.41 0.29 0.38 0.23 0.51 0.95 0.54 0.22 0.22 0.2 0.15 0.24 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)