1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1049_g235400.1 (Contig3572.g27595)
 3.86 6.98 2.66 0.39 0.35 0.21 0.44 1.06 0.38 1.19 0.24 0.63 4.03 0.36 0.45 0.54 0.08 0.58 0.16 5.25 0.85 0.73 1.11 2.07 3.18 0.24 0.26
Sro1059_g236540.1 (Contig822.g9130)
 0.01 1.34 1.62 0.2 0.08 0.01 0.08 0.08 0.14 0.34 0.04 0.17 1.9 0.01 0.05 0.01 0.0 0.14 0.18 3.22 0.07 0.22 0.11 0.01 0.0 0.05 0.02
Sro1068_g237500.1 (Contig852.g9369)
 0.0 0.69 0.7 0.03 0.03 0.0 0.02 0.01 0.04 0.11 0.0 0.07 0.42 0.04 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.7 0.04 0.13 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01
Sro1074_g238240.1 (Contig4290.g32408)
 0.0 0.9 1.53 0.41 0.57 0.0 0.02 0.02 0.07 0.22 0.07 0.07 0.47 0.22 0.09 0.06 0.02 0.02 0.21 0.39 0.18 0.24 0.13 0.07 0.13 0.06 0.02
Sro1129_g244420.1 (Contig2187.g18235)
 0.0 2.23 2.19 0.62 0.48 0.0 0.03 0.66 0.19 0.33 0.0 0.0 0.42 0.0 0.08 0.35 0.0 0.38 0.0 0.47 0.0 0.05 0.03 0.03 0.14 0.14 0.24
Sro119_g058270.1 (Contig2194.g18300)
 0.11 1.35 0.14 0.87 0.55 0.0 0.12 0.25 0.13 0.36 0.85 0.27 0.32 0.74 0.28 0.04 0.4 0.32 0.2 1.43 0.13 0.07 0.18 0.17 0.12 0.08 0.34
Sro11_g008450.1 (Contig724.g8319)
 0.22 0.65 1.4 0.34 0.47 0.01 0.06 0.16 0.07 0.26 0.07 0.24 0.61 0.13 0.13 0.15 0.05 0.09 0.26 1.04 0.21 0.02 0.04 0.07 0.02 0.03 0.06
Sro11_g008770.1 (Contig724.g8351)
 0.09 1.23 6.24 1.57 1.24 0.06 0.13 0.15 0.15 0.82 0.23 0.43 3.24 0.15 0.19 0.48 0.21 0.32 0.57 5.27 1.53 0.23 0.17 0.28 0.02 0.16 0.37
Sro1320_g262350.1 (Contig4115.g31414)
 0.0 1.17 14.02 0.77 0.23 0.0 0.28 0.0 0.2 0.81 0.21 0.0 10.84 0.0 0.01 0.09 0.0 1.17 1.49 10.38 0.38 0.89 1.88 0.75 1.57 4.73 0.12
Sro1336_g263980.1 (Contig2079.g17758)
 0.04 17.89 6.63 9.87 4.72 0.21 0.81 1.48 2.36 1.49 1.24 0.0 3.94 0.21 0.98 0.0 3.63 0.83 0.95 4.83 0.15 0.6 0.61 1.28 0.94 1.15 1.83
Sro1370_g267050.1 (Contig2356.g19365)
 0.54 8.87 30.28 10.79 2.83 0.44 3.03 2.59 2.87 5.28 3.07 3.68 18.87 1.41 2.06 3.01 1.93 1.91 5.75 33.11 5.63 3.19 1.91 6.34 8.95 3.33 2.64
Sro1380_g267750.1 (Contig4344.g32784)
 0.0 6.02 1.68 0.0 0.0 0.03 0.12 0.08 0.1 0.45 0.02 0.08 1.13 0.07 0.13 0.18 0.02 1.24 0.56 1.85 0.46 0.01 0.05 0.11 0.56 0.76 0.13
Sro1521_g279450.1 (Contig1605.g14549)
 0.02 14.91 9.8 0.28 0.2 0.22 0.89 2.29 0.9 2.11 0.45 0.13 7.78 2.43 1.93 0.76 0.46 4.2 4.53 11.94 0.37 1.6 1.1 1.6 2.97 1.86 1.14
Sro159_g071780.1 (Contig500.g6718)
 3.72 12.47 31.05 7.26 6.46 0.99 7.79 10.37 13.52 6.34 3.52 6.15 25.94 3.97 4.21 5.18 4.3 6.03 7.77 34.97 5.76 14.04 8.54 1.89 1.86 2.44 3.02
Sro1600_g285100.1 (Contig3444.g26796)
 1.94 8.06 11.22 5.91 3.49 1.13 1.69 0.88 0.57 3.57 2.3 3.84 8.73 2.1 2.87 2.76 3.41 0.49 0.84 15.37 3.37 0.85 0.18 2.56 2.9 1.47 1.82
Sro1637_g287680.1 (Contig4007.g30816)
 0.07 1.08 0.1 0.53 0.31 0.0 0.03 0.29 0.0 0.22 0.57 0.16 0.7 0.41 0.08 0.03 0.16 0.35 0.35 0.72 0.06 0.04 0.04 0.19 0.18 0.0 0.13
Sro1650_g288720.1 (Contig3263.g25714)
 0.02 3.16 4.42 1.63 0.84 0.27 0.84 0.66 0.58 0.86 0.57 0.36 1.49 0.86 0.82 0.67 0.57 0.31 0.43 1.93 1.06 0.73 1.05 0.94 1.3 1.02 0.84
Sro171_g075710.1 (Contig113.g1280)
 0.01 10.64 2.24 0.22 0.24 0.23 0.18 0.31 0.18 1.18 0.49 0.07 10.95 0.37 0.7 1.13 0.2 0.4 0.46 5.65 0.03 0.12 0.31 0.07 0.05 0.16 0.87
Sro176_g077590.1 (Contig203.g2446)
 0.0 6.22 17.94 3.66 3.52 0.13 0.26 0.12 1.33 1.58 0.16 0.38 11.55 0.18 0.34 0.17 0.0 0.22 1.12 9.73 0.48 4.32 1.36 0.47 0.19 0.56 0.32
Sro1777_g296930.1 (Contig3318.g26034)
 7.52 8.04 9.73 8.27 8.11 0.74 3.54 2.32 2.73 3.92 2.47 3.13 9.46 2.41 2.86 2.34 1.83 3.51 5.32 14.32 4.35 6.41 4.64 1.48 2.75 1.22 1.91
Sro207_g086890.1 (Contig755.g8592)
 0.0 5.18 1.56 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.56 0.01 0.04 3.51 0.92 0.34 0.1 0.15 0.34 0.01 2.93 0.05 0.0 0.0 0.01 0.17 0.01 0.11
Sro207_g086960.1 (Contig755.g8599)
 0.13 17.11 18.44 11.82 16.98 2.86 5.04 4.66 5.94 7.97 6.67 8.83 24.21 7.64 6.6 7.28 7.55 8.42 10.1 28.88 7.39 5.83 4.21 5.63 7.5 5.22 5.36
Sro2094_g314140.1 (Contig1203.g11328)
 0.0 2.42 8.87 3.0 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.02 6.8 0.0 0.0 0.0 0.0 1.45 1.66 12.51 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro212_g088230.1 (Contig3756.g28806)
 0.01 7.48 5.72 0.0 0.02 0.03 0.08 0.43 0.63 0.7 0.65 0.67 0.72 0.02 0.34 0.3 0.95 1.22 0.79 0.82 0.16 0.2 0.19 0.15 0.61 0.3 0.33
Sro220_g090700.1 (Contig3599.g27832)
 1.39 26.0 16.44 16.04 6.2 0.05 1.76 1.81 1.98 2.84 0.56 2.1 2.95 1.11 1.63 2.78 2.33 3.36 2.61 3.26 2.96 1.13 1.38 1.59 1.68 0.66 0.34
0.02 2.06 2.3 0.65 0.02 0.06 0.03 0.78 0.04 0.37 0.08 0.05 0.54 0.01 0.05 0.08 0.04 0.09 0.33 0.78 0.02 0.06 0.03 0.07 0.05 0.01 0.04
Sro2291_g322200.1 (Contig4085.g31266)
 0.08 38.71 23.1 0.46 0.2 0.1 0.73 0.16 0.1 2.26 0.37 0.62 1.9 0.14 0.26 0.39 0.11 0.36 0.39 3.32 0.26 0.04 0.17 2.67 4.09 0.73 0.25
Sro2396_g325970.1 (Contig3316.g26022)
 0.0 2.86 1.44 0.05 0.0 0.0 0.05 0.16 0.01 0.24 0.02 0.01 1.12 0.0 0.02 0.02 0.0 0.2 0.16 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
Sro23_g015600.1 (Contig2259.g18710)
 0.06 0.03 3.5 0.2 0.09 0.03 0.13 0.31 0.52 0.75 0.25 1.08 2.05 0.63 0.35 0.49 0.45 0.49 0.5 5.26 0.92 0.41 0.57 0.05 0.35 0.45 0.37
Sro279_g106910.1 (Contig3140.g24930)
 0.41 5.53 7.86 4.7 4.32 1.48 1.98 1.7 1.9 2.67 1.62 2.23 5.47 1.62 1.87 2.6 1.69 2.5 3.28 5.93 3.48 2.29 2.45 0.73 1.17 1.02 1.36
Sro280_g107030.1 (Contig1076.g10463)
 0.0 2.29 2.86 0.0 0.02 0.04 0.04 0.06 0.03 0.24 0.01 0.03 0.02 0.0 0.13 0.05 0.0 0.08 0.04 0.07 0.08 0.0 0.0 0.06 0.02 0.11 0.07
Sro2865_g338930.1 (Contig3459.g26846)
 0.0 1.56 1.77 1.28 1.29 0.08 0.38 0.14 0.04 0.38 0.12 0.14 0.49 0.41 0.06 0.16 0.63 0.0 0.14 0.58 0.15 0.23 0.1 0.13 0.0 0.17 0.33
Sro2935_g340540.1 (Contig676.g7902)
 1.11 6.53 13.94 6.81 2.94 5.93 3.97 1.31 0.88 4.54 5.15 4.04 9.27 2.06 5.57 5.54 0.54 2.44 1.67 10.01 4.01 0.74 0.22 6.08 9.89 5.51 3.49
Sro2935_g340550.1 (Contig676.g7903)
 3.16 7.56 21.4 6.52 6.63 1.47 6.06 3.35 2.81 6.01 8.23 6.64 14.54 2.66 6.19 5.94 4.23 4.77 3.86 19.17 5.6 2.87 0.13 11.67 13.47 7.86 5.92
Sro2935_g340560.1 (Contig676.g7904)
 1.32 11.73 37.86 10.35 6.97 1.79 4.4 1.38 0.58 6.18 8.51 5.03 23.12 1.52 5.77 5.6 5.44 6.99 11.49 23.88 5.29 2.27 0.66 6.8 10.21 7.77 5.5
Sro2_g001110.1 (Contig467.g6269)
 0.04 2.09 2.88 0.57 0.25 0.01 0.23 0.25 0.21 0.48 0.5 0.33 0.89 0.41 0.17 0.04 0.15 0.27 0.37 1.31 0.11 0.09 0.16 0.14 0.06 0.1 0.27
Sro314_g115150.1 (Contig2448.g20041)
 0.0 0.13 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro314_g115160.1 (Contig2448.g20042)
 0.0 0.36 0.03 0.16 0.16 0.0 0.01 0.02 0.07 0.04 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.0 0.04 0.05 0.03 0.47 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro31_g020250.1 (Contig420.g5620)
 0.01 6.68 3.84 2.87 4.49 0.51 1.42 0.64 1.82 1.72 0.96 1.29 4.4 1.25 1.32 1.96 0.87 1.09 1.12 4.29 1.79 1.13 2.08 0.48 0.11 0.59 0.9
Sro3255_g345900.1 (Contig1804.g15886)
 0.0 0.27 0.66 0.17 0.0 0.02 0.0 0.11 0.18 0.21 0.0 0.0 0.32 0.0 0.01 0.23 0.02 0.04 0.34 1.33 0.02 0.07 0.06 0.0 0.0 0.05 0.05
Sro326_g117930.1 (Contig1080.g10481)
 0.0 1.25 0.97 0.36 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.12 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro350_g123790.1 (Contig1556.g14149)
 0.4 4.33 14.06 2.47 2.4 0.21 2.79 2.62 7.37 1.67 0.42 0.79 13.12 1.17 1.42 0.91 1.59 2.28 1.56 7.19 1.62 4.74 5.16 0.65 0.76 0.42 0.99
Sro41_g025000.1 (Contig169.g1906)
 0.15 8.24 13.33 4.88 3.82 0.06 0.25 0.11 0.73 1.22 0.16 0.45 0.13 0.85 0.6 0.14 0.08 0.0 0.0 0.44 0.34 0.28 0.86 0.35 0.24 0.59 0.25
Sro420_g139410.1 (Contig1861.g16284)
 0.06 7.7 4.24 4.84 3.61 0.18 0.24 0.69 0.34 1.55 1.21 1.36 1.97 2.65 1.12 0.52 1.34 0.22 0.29 1.37 0.34 0.57 0.43 0.81 0.47 1.25 0.91
Sro441_g143770.1 (Contig470.g6391)
 1.2 74.9 55.0 29.21 19.6 4.96 4.92 7.2 7.08 13.87 2.39 8.13 65.21 7.59 4.29 4.14 4.48 23.8 32.17 99.47 7.07 13.19 6.52 4.77 1.73 2.21 5.67
0.0 0.94 4.28 0.47 0.79 0.0 0.0 0.07 0.07 0.13 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 1.35 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro482_g151870.1 (Contig232.g2797)
 0.14 48.99 37.92 20.94 24.46 3.12 8.94 5.19 12.21 8.69 7.05 6.08 15.67 5.16 7.28 8.03 4.47 4.25 6.85 19.82 4.71 13.43 12.3 5.0 4.26 5.03 5.55
Sro53_g031350.1 (Contig1592.g14475)
 0.01 18.72 26.53 0.04 0.03 0.02 0.15 0.03 0.31 1.46 0.06 0.08 0.13 0.04 0.22 0.24 0.02 0.05 0.12 0.2 0.4 0.19 0.18 0.13 0.75 0.1 0.16
Sro53_g031360.1 (Contig1592.g14476)
 0.04 16.53 14.71 1.11 0.94 0.9 2.14 2.45 2.51 3.44 2.89 3.0 4.0 2.52 3.01 4.7 2.15 3.41 3.1 5.49 4.76 3.76 1.94 2.61 8.33 1.95 2.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro616_g175980.1 (Contig2621.g21290)
 0.11 6.72 9.0 2.85 3.73 1.88 1.31 1.73 1.4 2.89 3.67 2.28 10.46 1.9 2.62 2.17 3.99 3.16 3.68 8.87 2.19 2.18 1.39 1.85 1.48 1.53 2.63
Sro630_g178340.1 (Contig456.g6164)
 0.0 0.6 0.34 0.19 0.23 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro63_g035630.1 (Contig2778.g22328)
 0.01 8.78 6.86 4.33 2.3 2.55 0.65 1.51 2.09 3.41 3.01 2.87 14.98 0.84 3.2 3.15 1.32 1.32 3.21 7.84 2.77 2.48 1.85 0.83 0.59 2.66 2.46
Sro63_g036080.1 (Contig2778.g22373)
 0.3 9.09 14.81 7.43 5.09 2.84 3.63 1.56 2.0 5.54 6.13 4.9 19.71 5.65 4.24 2.13 4.23 2.79 5.57 22.6 5.65 2.34 2.23 6.17 5.31 4.04 3.31
1.66 26.12 36.01 15.31 14.91 3.31 5.67 8.99 13.33 8.93 7.55 5.6 42.42 3.67 4.71 3.4 3.19 6.69 9.47 56.52 4.84 19.92 10.09 6.8 8.31 7.63 4.74
Sro708_g190780.1 (Contig4523.g33882)
 0.42 6.89 8.16 4.66 3.74 0.2 1.45 1.4 0.58 2.48 1.61 2.12 10.9 0.85 2.23 1.42 1.69 0.86 1.36 15.45 2.86 0.83 1.74 2.22 1.16 1.3 1.49
Sro725_g193360.1 (Contig3530.g27288)
 5.94 19.04 18.13 35.85 24.4 2.46 2.25 3.53 5.25 4.31 3.66 1.12 19.06 1.66 2.48 0.85 5.63 1.85 1.58 29.27 2.29 1.66 5.24 3.66 3.31 1.02 1.64
0.25 2.13 1.77 3.75 3.72 0.15 0.41 0.19 0.54 0.52 0.14 0.66 1.0 0.49 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 2.2 0.6 0.03 0.35 0.29 0.75 0.13 0.07
0.58 8.53 11.89 4.98 6.16 0.52 0.99 0.37 0.29 2.78 1.36 2.83 10.13 1.74 2.06 0.96 0.51 1.05 3.44 9.29 2.23 1.04 1.02 0.67 1.3 0.81 1.58
0.0 9.16 2.95 0.0 0.0 3.27 0.36 0.31 1.19 0.95 0.0 0.0 0.08 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0
Sro808_g205340.1 (Contig630.g7643)
 2.39 23.06 36.42 16.55 14.13 1.38 5.81 13.26 12.29 11.07 5.57 9.37 38.67 6.84 5.69 5.43 6.59 6.5 10.7 48.2 10.43 11.04 7.02 6.4 5.02 4.15 5.7
0.1 2.4 5.83 1.2 1.52 1.14 0.83 2.09 1.53 1.09 0.57 0.74 6.0 0.22 0.39 1.59 0.66 0.39 0.48 10.37 0.91 2.41 1.29 0.2 0.04 0.67 0.41
Sro832_g208490.1 (Contig3251.g25665)
 0.0 0.56 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.29 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro871_g213770.1 (Contig1188.g11247)
 0.13 289.85 116.19 78.35 27.65 51.9 24.18 9.82 1.69 26.29 7.52 1.31 35.92 0.47 26.37 0.57 6.59 25.24 3.9 34.38 2.62 1.45 1.2 75.21 84.52 15.8 26.86
Sro873_g214030.1 (Contig3883.g29841)
 7.45 275.76 155.95 177.01 118.95 34.31 20.63 21.51 36.95 45.88 72.41 85.71 38.1 48.27 42.95 25.88 43.9 10.19 15.84 25.65 18.77 7.84 20.65 33.6 14.44 28.02 45.06
Sro876_g214510.1 (Contig165.g1866)
 0.06 2.29 0.99 0.96 0.65 0.0 0.03 0.37 0.26 0.16 0.0 0.03 1.47 0.18 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.99 0.01 0.04 0.07 0.03 0.0 0.0 0.01
Sro876_g214560.1 (Contig165.g1871)
 0.0 5.5 0.92 0.5 0.99 0.0 0.01 0.43 0.34 0.22 0.0 0.04 3.25 0.12 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 1.22 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro877_g214650.1 (Contig139.g1546)
 0.08 5.69 7.73 3.28 3.15 1.17 1.72 1.85 1.9 3.16 1.53 3.11 6.85 3.48 3.19 2.22 2.9 1.81 3.91 7.37 4.15 1.7 1.68 1.55 1.17 1.82 1.73

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)