1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_276 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1087_g239830.1 (Contig998.g10090)
 0.01 0.07 0.07 0.06 0.04 0.07 0.05 0.09 0.12 0.1 0.04 0.1 0.43 0.14 0.06 0.02 0.05 0.06 0.08 1.0 0.11 0.09 0.06 0.07 0.05 0.12 0.09
Sro1173_g248950.1 (Contig4697.g34914)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1173_g248960.1 (Contig4697.g34915)
 0.0 0.02 0.09 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.43 0.0 0.03 0.04 0.0 0.05 0.13 1.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02
Sro117_g057310.1 (Contig3937.g30175)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.01 0.02 0.44 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01
Sro1210_g252720.1 (Contig2015.g17238)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.33 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro12_g009520.1 (Contig2293.g18972)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1339_g264320.1 (Contig2212.g18357)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1398_g269210.1 (Contig4711.g35033)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1398_g269240.1 (Contig4711.g35036)
 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.01 0.08 0.06 0.03 0.67 0.01 0.05 0.06 0.02 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.02 0.04 0.0 0.08
Sro14_g010430.1 (Contig1128.g10792)
 0.0 0.02 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.62 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
Sro155_g070390.1 (Contig395.g5346)
 0.18 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.05 0.01 0.02 0.35 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 1.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01
Sro1697_g291910.1 (Contig3875.g29820)
 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.06 0.03 0.02 0.54 0.01 0.02 0.02 0.01 0.07 0.13 1.0 0.04 0.06 0.01 0.03 0.02 0.06 0.02
Sro16_g011740.1 (Contig916.g9611)
 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.06 0.01 0.03 0.4 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.02 1.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro1715_g293050.1 (Contig3682.g28415)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.05 0.01 0.0 0.54 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 1.0 0.02 0.07 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02
Sro1741_g294700.1 (Contig4311.g32516)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.7 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1770_g296550.1 (Contig2654.g21450)
 0.0 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.05 0.03 0.02 0.1 0.08 0.08 0.47 0.04 0.08 0.1 0.05 0.06 0.08 1.0 0.09 0.03 0.01 0.05 0.07 0.06 0.06
Sro189_g081370.1 (Contig744.g8501)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.51 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
Sro1928_g306010.1 (Contig2945.g23383)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2923_g340330.1 (Contig1756.g15590)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3150_g344480.1 (Contig1700.g15238)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3158_g344610.1 (Contig2445.g20022)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0
Sro337_g120530.1 (Contig2800.g22511)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.01 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro4013_g352520.1 (Contig4264.g32273)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro412_g137800.1 (Contig2922.g23252)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.54 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro442_g143860.1 (Contig509.g6757)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.0 0.09 0.46 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.05 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro507_g156420.1 (Contig4452.g33444)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.09 0.06 0.05 0.36 0.04 0.08 0.08 0.02 0.12 0.07 1.0 0.09 0.02 0.0 0.05 0.05 0.03 0.05
Sro527_g160710.1 (Contig1568.g14253)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro527_g160720.1 (Contig1568.g14254)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro551_g164980.1 (Contig4706.g35019)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro562_g167040.1 (Contig149.g1656)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro595_g172710.1 (Contig4483.g33689)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro67_g037600.1 (Contig495.g6676)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro68_g037850.1 (Contig2027.g17366)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro6_g004820.1 (Contig175.g1987)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.37 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro716_g191870.1 (Contig2471.g20211)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro731_g194160.1 (Contig3971.g30476)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro734_g194610.1 (Contig3769.g28939)
 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.01 0.08 0.47 0.03 0.01 0.0 0.06 0.01 0.04 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro820_g207210.1 (Contig34.g203)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro86_g045620.1 (Contig2999.g23840)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro928_g221260.1 (Contig3234.g25582)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)