1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_276 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1087_g239830.1 (Contig998.g10090)
 0.81 6.41 6.64 5.42 3.76 7.1 4.48 8.88 12.14 10.21 3.42 9.94 42.34 13.95 5.66 2.29 5.27 5.86 7.52 97.49 10.42 8.44 5.75 7.14 4.99 11.31 8.81
Sro1173_g248950.1 (Contig4697.g34914)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1173_g248960.1 (Contig4697.g34915)
 0.0 0.11 0.51 0.1 0.07 0.04 0.02 0.08 0.03 0.28 0.13 0.05 2.34 0.02 0.14 0.2 0.0 0.27 0.72 5.47 0.14 0.19 0.05 0.05 0.06 0.0 0.09
Sro117_g057310.1 (Contig3937.g30175)
 0.13 2.18 1.79 1.78 1.28 0.98 2.61 1.56 1.63 8.01 2.05 3.08 64.52 1.52 2.23 1.59 1.03 0.96 1.58 147.88 4.67 0.89 0.7 3.34 3.35 2.28 1.3
Sro1210_g252720.1 (Contig2015.g17238)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 2.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.85 2.09 6.35 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro12_g009520.1 (Contig2293.g18972)
 0.09 0.5 0.71 0.46 0.33 0.01 0.05 0.22 0.15 2.89 0.15 0.63 30.21 0.05 0.09 0.04 0.01 0.04 0.09 67.31 0.17 0.12 0.11 0.05 0.11 0.18 0.02
Sro1339_g264320.1 (Contig2212.g18357)
 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.59 0.0 0.07 62.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 139.76 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1398_g269210.1 (Contig4711.g35033)
 0.05 0.17 0.24 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 1.12 0.0 0.1 19.06 0.03 0.0 0.11 0.0 0.07 0.04 29.36 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1398_g269240.1 (Contig4711.g35036)
 0.02 0.22 0.27 0.0 0.03 1.1 0.25 0.04 0.06 0.84 0.63 0.34 6.97 0.07 0.57 0.66 0.25 0.05 0.03 10.45 0.65 0.07 0.05 0.2 0.37 0.01 0.78
Sro14_g010430.1 (Contig1128.g10792)
 0.0 0.33 0.68 0.3 0.15 0.04 0.05 0.12 0.38 0.89 0.17 0.12 11.63 0.19 0.08 0.01 0.17 0.4 0.14 18.74 0.2 0.15 0.08 0.0 0.16 0.09 0.12
Sro155_g070390.1 (Contig395.g5346)
 89.67 3.69 6.35 4.34 2.8 5.2 7.7 4.75 9.83 25.18 7.17 7.71 176.83 1.24 5.16 3.02 6.62 3.84 13.13 506.22 5.9 3.24 4.32 9.15 11.89 4.2 5.77
Sro1697_g291910.1 (Contig3875.g29820)
 0.46 0.41 0.0 0.48 0.0 2.19 0.71 1.41 0.54 4.2 1.87 1.43 36.25 0.64 1.25 1.36 0.62 4.5 8.81 66.61 2.4 4.05 0.55 1.92 1.48 4.24 1.64
Sro16_g011740.1 (Contig916.g9611)
 0.08 0.0 0.05 0.04 0.0 0.08 0.05 0.02 0.07 0.34 0.05 0.19 2.15 0.03 0.02 0.03 0.0 0.32 0.1 5.4 0.28 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro1715_g293050.1 (Contig3682.g28415)
 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.75 0.13 0.44 0.11 0.03 5.21 0.06 0.11 0.19 0.0 0.15 0.2 9.67 0.15 0.68 0.18 0.14 0.33 0.1 0.16
Sro1741_g294700.1 (Contig4311.g32516)
 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.0 0.02 0.0 0.29 0.4 0.0 0.0 7.81 0.1 0.09 0.04 0.0 0.04 0.04 11.12 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1770_g296550.1 (Contig2654.g21450)
 0.5 3.05 2.43 2.29 3.44 2.72 6.18 3.91 2.23 11.77 8.86 8.89 53.3 4.07 9.21 11.73 5.6 7.13 9.51 112.74 10.13 3.74 1.15 6.03 8.17 6.3 6.98
Sro189_g081370.1 (Contig744.g8501)
 0.09 0.47 0.25 0.25 0.21 0.23 0.14 0.04 0.04 22.36 0.53 0.15 211.73 0.52 0.2 0.0 0.06 0.09 0.5 554.57 0.27 0.15 0.11 0.02 0.01 0.15 0.15
0.0 0.39 0.09 0.57 0.66 0.33 0.49 0.41 0.06 1.77 0.05 0.62 17.43 0.26 0.31 0.52 0.0 0.41 0.39 33.89 0.55 0.26 0.26 0.0 0.16 0.34 0.41
Sro1928_g306010.1 (Contig2945.g23383)
 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.45 0.0 0.02 3.51 0.0 0.01 0.0 0.0 0.25 0.08 8.5 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2923_g340330.1 (Contig1756.g15590)
 0.09 0.19 0.23 0.19 0.08 0.02 0.01 0.0 0.08 21.45 0.34 0.07 232.68 0.09 0.03 0.01 0.0 0.05 0.16 602.11 0.21 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro3150_g344480.1 (Contig1700.g15238)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 3.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.89 6.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3158_g344610.1 (Contig2445.g20022)
 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.25 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 3.44 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.01
Sro337_g120530.1 (Contig2800.g22511)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.1 0.23 0.24 0.01 0.03 2.59 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 5.42 0.09 0.1 0.07 0.01 0.03 0.0 0.0
Sro4013_g352520.1 (Contig4264.g32273)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro412_g137800.1 (Contig2922.g23252)
 0.0 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.04 1.2 0.19 0.22 17.85 0.14 0.17 0.0 0.09 0.0 0.31 33.33 0.43 0.04 0.2 0.1 0.27 0.05 0.15
0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.08 0.7 0.9 0.05 0.05 7.07 0.0 0.05 0.05 0.17 0.05 0.23 22.09 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro442_g143860.1 (Contig509.g6757)
 0.71 0.04 0.08 0.04 0.18 0.17 0.31 0.98 0.78 3.25 0.18 4.38 21.47 0.38 0.09 0.25 0.27 0.59 0.07 47.18 2.53 2.19 0.53 0.02 0.13 0.13 0.26
Sro507_g156420.1 (Contig4452.g33444)
 0.0 0.06 0.0 0.03 0.01 0.19 0.83 0.32 0.16 1.68 1.15 0.91 6.88 0.79 1.59 1.45 0.46 2.28 1.42 19.12 1.76 0.33 0.07 0.88 0.89 0.51 0.9
Sro527_g160710.1 (Contig1568.g14253)
 0.0 1.63 0.26 1.24 0.97 0.35 0.0 0.05 0.0 30.28 0.17 0.1 444.66 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.96 961.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14
Sro527_g160720.1 (Contig1568.g14254)
 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 1.06 0.0 0.07 21.03 0.02 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 29.29 0.08 0.03 0.11 0.02 0.0 0.0 0.02
Sro551_g164980.1 (Contig4706.g35019)
 0.04 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 1.89 0.0 0.0 22.12 0.02 0.01 0.0 0.0 1.04 2.78 40.41 0.0 0.29 0.2 0.0 0.0 0.03 0.04
Sro562_g167040.1 (Contig149.g1656)
 0.07 1.25 1.07 1.15 0.34 0.05 0.16 0.28 0.27 45.86 0.36 0.51 671.66 0.0 0.23 0.1 0.0 0.45 1.31 1248.61 1.05 2.5 0.76 0.0 0.38 0.21 0.19
Sro595_g172710.1 (Contig4483.g33689)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.02 0.01 13.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 22.77 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro67_g037600.1 (Contig495.g6676)
 0.05 2.07 2.4 0.63 0.53 0.0 0.0 0.02 0.06 8.48 0.0 0.07 107.28 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.23 241.78 0.0 0.23 0.04 0.13 0.0 0.0 0.04
Sro68_g037850.1 (Contig2027.g17366)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 8.39 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 18.36 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro6_g004820.1 (Contig175.g1987)
 0.67 0.21 0.42 0.23 0.11 0.15 0.78 0.92 0.6 8.63 0.7 1.9 84.16 1.0 1.1 2.65 0.58 1.31 1.32 229.97 1.42 0.58 0.46 0.24 0.48 0.04 0.84
Sro716_g191870.1 (Contig2471.g20211)
 0.05 0.04 0.11 0.09 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02 2.88 0.0 0.1 32.7 0.03 0.01 0.08 0.02 0.03 0.05 78.11 0.36 0.01 0.02 0.38 0.82 0.28 0.01
Sro731_g194160.1 (Contig3971.g30476)
 0.31 0.17 0.1 0.11 0.21 0.11 0.01 0.0 0.0 7.78 0.52 1.16 93.28 0.53 0.33 0.3 0.22 0.14 0.1 211.36 1.24 0.03 0.0 0.03 0.32 0.22 0.35
Sro734_g194610.1 (Contig3769.g28939)
 0.47 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 1.23 0.09 1.22 7.42 0.43 0.11 0.0 0.95 0.12 0.63 15.7 0.77 0.16 0.0 0.0 0.0 0.07 0.29
Sro820_g207210.1 (Contig34.g203)
 0.07 0.29 0.71 0.22 0.42 0.05 0.03 0.01 0.01 18.49 0.22 0.02 220.77 0.12 0.11 0.26 0.0 0.04 0.23 507.95 0.09 0.22 0.01 0.0 0.16 0.0 0.09
Sro86_g045620.1 (Contig2999.g23840)
 0.02 0.0 0.11 0.0 0.05 0.01 0.02 0.06 0.0 0.35 0.0 0.03 2.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 7.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro928_g221260.1 (Contig3234.g25582)
 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.1 0.48 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 2.53 0.04 0.1 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)