Heatmap: Cluster_320 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1074_g238290.1 (Contig4290.g32413)
0.05 0.31 0.09 0.13 0.13 0.13 0.33 0.73 0.44 0.24 0.5 0.08 0.21 0.04 0.53 0.45 0.29 0.59 0.27 0.3 0.42 0.08 0.26 0.25 1.0 0.6 0.43
Sro1085_g239590.1 (Contig3663.g28271)
0.02 0.6 0.44 0.58 0.62 0.16 0.35 1.0 0.41 0.33 0.39 0.37 0.48 0.22 0.42 0.51 0.26 0.43 0.46 0.48 0.37 0.46 0.22 0.27 0.32 0.29 0.33
Sro108_g054320.1 (Contig2294.g19012)
0.03 0.33 0.26 0.31 0.33 0.27 0.79 1.0 0.61 0.75 0.91 0.96 0.77 0.61 0.87 0.91 0.76 0.5 0.6 0.93 0.95 0.39 0.39 0.44 0.5 0.47 0.8
0.01 0.31 0.37 0.24 0.21 0.4 0.53 0.46 0.45 0.56 0.5 0.83 0.98 0.38 0.45 0.37 0.37 0.32 0.44 0.76 0.88 1.0 0.24 0.37 0.56 0.53 0.41
Sro1118_g243050.1 (Contig728.g8383)
0.01 0.25 0.16 0.01 0.05 0.21 0.36 0.41 0.28 0.47 0.51 0.48 0.32 0.21 0.5 0.68 0.3 1.0 1.0 0.68 0.57 0.24 0.11 0.19 0.41 0.29 0.62
Sro115_g056790.1 (Contig88.g945)
0.71 0.46 0.46 0.34 0.32 0.27 0.51 0.36 0.4 0.54 0.54 0.59 0.89 0.44 0.55 0.67 0.35 0.46 0.54 0.81 0.69 0.48 0.34 0.65 1.0 0.45 0.45
Sro1190_g250860.1 (Contig1320.g12206)
0.01 0.13 0.2 0.09 0.16 0.3 0.35 0.33 0.26 0.46 0.43 0.55 0.78 0.38 0.43 0.41 0.27 0.66 0.64 1.0 0.62 0.41 0.19 0.32 0.68 0.42 0.35
Sro128_g061190.1 (Contig1654.g14895)
0.0 0.04 0.07 0.0 0.08 0.14 0.36 0.08 0.1 0.41 0.15 0.39 1.0 0.53 0.47 0.72 0.07 0.31 0.52 0.89 0.57 0.38 0.18 0.27 0.66 0.4 0.26
Sro1312_g261870.1 (Contig2711.g21816)
0.01 0.11 0.08 0.08 0.03 0.32 0.51 1.0 0.33 0.5 0.52 0.57 0.72 0.36 0.48 0.42 0.37 0.35 0.51 0.87 0.57 0.61 0.31 0.44 0.48 0.41 0.42
Sro1386_g268300.1 (Contig1512.g13813)
0.0 0.18 0.33 0.16 0.15 0.03 0.79 1.0 0.45 0.31 0.38 0.19 0.43 0.03 0.65 0.82 0.12 0.91 0.38 0.6 0.34 0.54 0.35 0.6 0.45 0.47 0.72
Sro138_g064900.1 (Contig2021.g17312)
0.02 0.62 0.64 0.42 0.37 0.22 0.46 0.5 0.38 0.46 0.65 0.42 0.71 0.36 0.54 0.64 0.55 0.82 0.84 1.0 0.57 0.41 0.28 0.27 0.28 0.28 0.5
Sro1390_g268720.1 (Contig2158.g18128)
0.06 0.08 0.05 0.05 0.06 0.17 0.34 0.48 0.27 0.58 0.46 0.69 0.29 0.33 0.56 0.97 0.16 1.0 0.96 0.47 0.63 0.3 0.2 0.4 0.35 0.3 0.46
Sro1395_g269060.1 (Contig847.g9323)
0.06 0.0 0.03 0.02 0.0 0.08 0.37 0.75 0.37 0.54 0.26 0.64 0.49 0.24 0.53 0.56 0.49 0.58 0.49 1.0 0.74 0.67 0.05 0.4 0.67 0.5 0.4
Sro1397_g269160.1 (Contig4502.g33753)
0.0 0.15 0.13 0.09 0.1 0.71 0.25 1.0 0.24 0.38 0.57 0.35 0.22 0.32 0.64 0.46 0.56 0.16 0.25 0.29 0.69 0.25 0.13 0.17 0.36 0.42 0.58
Sro1443_g273160.1 (Contig745.g8537)
0.0 0.31 0.53 0.45 0.33 0.38 0.5 0.67 0.42 0.29 0.63 0.26 0.32 0.52 0.87 0.84 0.48 1.0 0.34 0.23 0.25 0.17 0.27 0.38 0.4 0.27 0.65
Sro1474_g275680.1 (Contig1848.g16173)
0.02 0.43 0.22 0.31 0.14 0.22 0.46 0.61 0.3 0.5 0.85 0.44 0.88 0.26 0.65 0.5 0.52 0.44 0.51 1.0 0.5 0.4 0.28 0.68 0.39 0.34 0.47
Sro1495_g277420.1 (Contig2585.g20991)
0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.08 0.63 0.47 0.75 0.43 0.59 0.5 0.37 0.1 0.4 0.32 0.47 0.42 0.37 0.7 0.66 0.39 0.13 0.53 1.0 0.51 0.45
Sro1536_g280630.1 (Contig2003.g17146)
0.01 0.39 0.2 0.2 0.26 0.14 0.49 0.83 0.52 0.5 0.69 0.59 0.7 0.46 0.64 0.6 0.49 0.56 0.67 1.0 0.69 0.65 0.2 0.65 0.69 0.57 0.41
Sro1580_g283770.1 (Contig1595.g14505)
0.47 0.1 0.15 0.21 0.1 0.12 0.36 0.57 0.19 0.51 0.53 0.66 0.67 0.32 0.43 0.47 0.43 0.7 0.68 1.0 0.87 0.43 0.12 0.39 0.38 0.35 0.4
Sro164_g073540.1 (Contig4339.g32728)
0.02 0.18 0.31 0.17 0.13 0.18 0.25 0.28 0.19 0.32 0.55 0.28 0.81 0.23 0.4 0.51 0.36 0.6 0.57 1.0 0.43 0.2 0.15 0.62 0.34 0.23 0.34
Sro166_g074170.1 (Contig1709.g15296)
0.0 0.48 0.37 0.27 0.33 0.18 0.4 0.56 0.32 0.38 0.66 0.41 0.26 0.31 0.49 0.7 0.67 0.45 0.3 0.36 0.61 0.18 0.23 0.52 1.0 0.5 0.43
Sro1747_g295020.1 (Contig3590.g27744)
0.03 0.06 0.07 0.07 0.07 0.19 0.82 0.91 0.86 0.65 1.0 0.85 0.15 0.3 0.7 0.63 0.49 0.38 0.28 0.53 0.8 0.7 0.71 0.41 0.35 0.33 0.68
Sro174_g076570.1 (Contig4298.g32441)
0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.4 0.73 0.28 0.39 0.29 0.43 0.05 0.15 0.24 0.25 0.23 0.08 0.08 0.13 1.0 0.67 0.19 0.11 0.11 0.11 0.26
Sro178_g078030.1 (Contig275.g3528)
0.04 0.27 0.16 0.1 0.09 0.24 0.35 0.19 0.17 0.47 0.31 0.67 0.7 0.26 0.39 0.46 0.32 0.53 0.61 1.0 0.44 0.19 0.13 0.27 0.32 0.19 0.41
Sro178_g078040.1 (Contig275.g3529)
0.07 0.62 0.39 0.22 0.2 0.25 0.41 0.35 0.36 0.5 0.44 0.65 0.78 0.29 0.42 0.43 0.25 0.54 0.68 1.0 0.51 0.45 0.22 0.26 0.33 0.17 0.41
Sro2159_g317030.1 (Contig1250.g11682)
0.02 0.22 0.12 0.12 0.08 0.19 0.32 0.25 0.15 0.37 0.45 0.44 0.86 0.25 0.4 0.44 0.29 0.36 0.44 1.0 0.42 0.6 0.16 0.31 0.54 0.42 0.33
Sro215_g089070.1 (Contig4439.g33331)
0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.26 0.47 0.31 0.18 0.2 0.68 0.03 0.27 0.04 0.79 1.0 0.64 0.58 0.21 0.1 0.09 0.22 0.12 0.43 0.28 0.14 0.48
Sro23_g015970.1 (Contig2259.g18747)
0.04 0.32 0.24 0.2 0.16 0.08 0.42 0.44 0.31 0.45 0.42 0.44 0.9 0.31 0.4 0.52 0.2 0.76 0.67 1.0 0.64 0.53 0.2 0.39 0.93 0.38 0.25
Sro242_g096630.1 (Contig554.g7081)
0.0 0.34 0.3 0.21 0.27 0.09 0.37 1.0 0.59 0.35 0.55 0.53 0.26 0.34 0.45 0.51 0.53 0.33 0.51 0.27 0.41 0.4 0.34 0.24 0.26 0.22 0.46
Sro2467_g328540.1 (Contig2706.g21796)
0.0 0.18 0.15 0.11 0.14 0.05 0.35 0.69 0.46 0.51 0.58 0.51 0.6 0.42 0.43 0.66 0.36 0.66 0.56 0.74 1.0 0.66 0.28 0.51 0.73 0.58 0.45
Sro24_g016520.1 (Contig40.g262)
0.01 0.22 0.26 0.13 0.12 0.24 0.28 0.18 0.07 0.39 0.25 0.41 0.31 0.16 0.42 0.57 0.29 0.98 1.0 0.73 0.8 0.03 0.09 0.24 0.39 0.34 0.52
Sro2690_g334700.1 (Contig4527.g33906)
0.01 0.11 0.07 0.05 0.04 0.17 0.39 0.61 0.26 0.61 0.82 0.78 0.15 0.19 0.8 0.86 0.21 0.86 0.82 0.29 1.0 0.2 0.16 0.6 0.39 0.41 0.76
Sro26_g017910.1 (Contig2432.g19962)
0.02 0.31 0.13 0.15 0.18 0.04 0.49 0.44 0.26 0.42 0.26 0.41 0.51 0.28 0.29 0.28 0.12 0.59 0.57 1.0 0.65 0.35 0.23 0.3 0.25 0.22 0.28
Sro3044_g342730.1 (Contig1018.g10187)
0.01 0.31 0.36 0.2 0.15 0.15 0.42 0.61 0.41 0.43 0.41 0.35 0.8 0.3 0.48 0.46 0.26 0.57 0.73 1.0 0.58 0.51 0.29 0.34 0.45 0.35 0.46
Sro326_g118010.1 (Contig1080.g10489)
0.02 0.04 0.08 0.05 0.08 0.19 0.49 0.42 0.3 0.42 0.28 0.43 0.57 0.28 0.38 0.37 0.31 0.48 0.65 0.85 0.65 0.47 0.24 0.37 1.0 0.44 0.25
Sro3461_g348270.1 (Contig2163.g18139)
0.03 0.0 0.63 0.0 0.24 0.0 0.38 0.64 0.68 0.38 1.0 0.57 0.56 0.35 0.45 0.34 0.97 1.0 0.05 0.12 0.25 0.01 0.26 0.15 0.17 0.09 0.67
Sro357_g125600.1 (Contig708.g8188)
0.01 0.13 0.13 0.14 0.21 0.35 0.32 0.05 0.21 0.33 0.41 0.27 0.54 0.23 0.36 0.42 0.08 0.15 0.38 1.0 0.52 0.5 0.12 0.34 0.32 0.21 0.23
0.04 0.22 0.21 0.14 0.11 0.02 0.17 0.38 0.28 0.12 0.37 0.03 0.06 0.01 0.15 0.32 0.4 0.39 0.42 0.09 0.15 0.02 0.16 0.27 1.0 0.42 0.35
Sro395_g133990.1 (Contig4272.g32318)
0.02 0.07 0.03 0.04 0.16 0.02 0.34 0.29 0.15 0.29 0.19 0.5 0.84 0.0 0.17 0.19 0.13 0.25 0.2 1.0 0.22 0.82 0.09 0.14 0.13 0.2 0.13
Sro42_g025530.1 (Contig312.g4130)
0.01 0.14 0.05 0.02 0.05 0.11 0.4 0.24 0.18 0.46 0.24 0.34 0.41 0.25 0.49 0.44 0.19 0.63 1.0 0.97 0.97 0.84 0.27 0.24 0.5 0.42 0.34
Sro435_g142330.1 (Contig492.g6639)
0.03 0.02 0.03 0.05 0.07 0.32 0.43 1.0 0.25 0.3 0.24 0.25 0.13 0.12 0.51 0.53 0.1 0.48 0.2 0.28 0.55 0.25 0.07 0.3 0.3 0.4 0.36
Sro446_g144750.1 (Contig1578.g14344)
0.03 0.5 1.0 0.57 0.59 0.03 0.4 0.55 0.46 0.39 0.32 0.33 0.19 0.1 0.39 0.45 0.15 0.4 0.16 0.5 0.75 0.34 0.08 0.45 0.91 0.58 0.48
Sro511_g157390.1 (Contig3003.g23880)
0.05 0.13 0.17 0.21 0.17 0.2 0.73 0.44 0.32 0.5 0.41 0.37 0.78 0.62 0.56 0.66 0.37 0.72 0.97 0.81 0.67 0.71 0.35 0.47 0.93 1.0 0.58
Sro534_g161790.1 (Contig3269.g25744)
0.01 0.26 0.14 0.08 0.07 0.14 0.35 0.39 0.17 0.6 0.95 0.47 0.72 0.56 0.59 0.39 0.37 0.73 0.93 0.93 1.0 0.58 0.13 0.66 0.55 0.9 0.65
Sro575_g169320.1 (Contig1981.g16950)
0.03 0.08 0.06 0.02 0.02 0.32 0.33 0.59 0.35 0.52 0.95 0.4 0.18 0.14 0.72 0.76 0.6 1.0 0.65 0.58 0.81 0.27 0.2 0.29 0.2 0.36 0.82
0.0 0.18 0.07 0.06 0.01 0.14 0.55 0.47 0.33 0.37 0.48 0.31 0.28 0.23 0.42 0.39 0.33 0.35 0.25 0.38 0.62 0.78 0.09 0.42 1.0 0.61 0.42
Sro602_g173660.1 (Contig490.g6592)
0.07 0.28 0.18 0.08 0.09 0.13 0.36 0.45 0.21 0.45 0.41 0.48 0.59 0.24 0.39 0.47 0.14 0.3 0.45 1.0 0.6 0.55 0.13 0.53 0.76 0.46 0.4
Sro603_g174040.1 (Contig4246.g32163)
0.01 0.13 0.11 0.14 0.15 0.2 0.57 0.86 0.34 0.48 0.81 0.51 0.42 0.43 0.86 1.0 0.41 0.75 0.47 0.52 0.54 0.4 0.23 0.57 0.24 0.28 0.82
Sro604_g174060.1 (Contig2463.g20160)
0.04 0.19 0.21 0.11 0.16 0.09 0.61 1.0 0.47 0.38 0.51 0.42 0.41 0.28 0.49 0.67 0.3 0.59 0.52 0.6 0.53 0.56 0.3 0.39 0.51 0.43 0.53
Sro616_g176030.1 (Contig2621.g21295)
0.01 0.44 0.4 0.41 0.39 0.2 0.65 1.0 0.52 0.23 0.47 0.14 0.29 0.18 0.63 0.52 0.47 0.61 0.11 0.25 0.26 0.08 0.21 0.34 0.61 0.43 0.45
Sro62_g035530.1 (Contig2718.g21934)
0.0 0.48 0.45 0.66 0.64 0.18 0.67 0.63 0.76 0.62 0.84 0.65 0.81 0.35 0.66 0.7 0.46 0.55 0.6 0.88 0.76 1.0 0.28 0.32 0.86 0.72 0.66
Sro631_g178560.1 (Contig3194.g25261)
0.06 0.45 0.22 0.3 0.33 0.11 0.75 0.52 0.44 0.7 0.55 0.81 0.78 0.43 0.72 0.87 0.4 0.43 0.63 0.93 0.8 0.77 0.34 0.62 1.0 0.59 0.5
Sro649_g181160.1 (Contig1362.g12542)
0.42 0.2 0.22 0.18 0.13 0.23 0.43 0.38 0.22 0.58 0.55 0.7 0.4 0.19 0.62 1.0 0.5 0.66 0.69 0.72 0.6 0.15 0.15 0.32 0.23 0.27 0.45
Sro670_g184740.1 (Contig318.g4226)
0.0 0.09 0.1 0.17 0.07 0.23 0.46 1.0 0.36 0.42 0.49 0.34 0.73 0.09 0.53 0.27 0.58 1.0 0.68 0.74 0.59 0.68 0.19 0.41 0.37 0.55 0.4
Sro684_g186790.1 (Contig2085.g17783)
0.07 0.15 0.1 0.12 0.07 0.15 0.52 0.75 0.48 0.68 1.0 0.7 0.27 0.29 0.81 1.0 0.35 0.81 0.62 0.56 1.0 0.19 0.29 0.66 0.49 0.42 0.71
Sro75_g041030.1 (Contig2656.g21475)
0.01 0.18 0.18 0.1 0.14 0.27 0.42 0.65 0.3 0.55 0.46 0.66 0.78 0.49 0.61 1.0 0.36 0.47 0.57 0.79 0.64 0.3 0.15 0.28 0.17 0.29 0.53
Sro770_g200020.1 (Contig300.g3967)
0.1 0.61 0.28 0.44 0.48 0.47 0.45 0.98 0.46 0.62 1.0 0.65 0.9 0.5 0.89 0.96 0.61 0.54 0.58 0.85 0.88 0.86 0.22 0.84 0.54 0.39 0.71
Sro794_g203440.1 (Contig1634.g14713)
0.03 0.11 0.1 0.08 0.08 0.19 0.53 0.62 0.35 0.55 0.69 0.5 0.72 0.22 0.54 0.59 0.5 0.9 0.8 1.0 0.73 0.72 0.26 0.35 0.54 0.38 0.47
Sro881_g215210.1 (Contig4286.g32374)
0.0 0.27 0.25 0.19 0.19 0.33 0.57 1.0 0.77 0.49 0.89 0.53 0.26 0.36 0.68 0.65 0.63 0.42 0.18 0.28 0.62 0.34 0.43 0.42 0.47 0.42 0.57
Sro926_g221070.1 (Contig4614.g34432)
0.16 0.26 0.22 0.27 0.13 0.09 0.46 0.79 0.47 0.54 0.53 0.49 0.4 0.11 0.46 0.4 0.33 0.96 1.0 0.62 0.94 0.67 0.21 0.81 0.79 0.7 0.46
Sro935_g221970.1 (Contig1126.g10777)
0.61 0.28 0.09 0.0 0.14 0.18 0.35 0.43 0.27 0.7 0.61 0.66 0.47 0.29 0.64 0.68 0.18 0.7 0.53 0.98 1.0 0.61 0.1 0.35 0.36 0.4 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)