1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_320 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1074_g238290.1 (Contig4290.g32413)
 0.25 1.58 0.47 0.66 0.68 0.67 1.66 3.7 2.21 1.22 2.53 0.4 1.05 0.22 2.69 2.27 1.46 2.99 1.37 1.53 2.13 0.42 1.34 1.29 5.07 3.06 2.18
Sro1085_g239590.1 (Contig3663.g28271)
 0.31 10.2 7.51 9.82 10.53 2.64 5.91 16.97 6.89 5.58 6.61 6.29 8.1 3.69 7.15 8.71 4.38 7.24 7.87 8.12 6.32 7.85 3.8 4.57 5.5 4.95 5.56
Sro108_g054320.1 (Contig2294.g19012)
 0.16 1.9 1.47 1.75 1.91 1.57 4.51 5.72 3.51 4.27 5.19 5.51 4.38 3.5 5.0 5.2 4.38 2.87 3.45 5.34 5.46 2.23 2.21 2.5 2.88 2.72 4.56
0.04 1.29 1.54 1.01 0.87 1.68 2.2 1.9 1.86 2.34 2.08 3.47 4.07 1.58 1.86 1.55 1.52 1.32 1.83 3.15 3.68 4.16 0.99 1.55 2.32 2.23 1.69
Sro1118_g243050.1 (Contig728.g8383)
 0.13 2.36 1.47 0.05 0.47 1.9 3.3 3.77 2.6 4.32 4.71 4.41 3.0 1.91 4.63 6.31 2.77 9.23 9.25 6.32 5.32 2.21 1.06 1.73 3.8 2.69 5.77
Sro115_g056790.1 (Contig88.g945)
 27.12 17.44 17.69 13.07 12.19 10.42 19.32 13.78 15.35 20.76 20.77 22.4 33.83 16.95 21.16 25.46 13.43 17.36 20.78 31.07 26.17 18.39 12.83 24.62 38.15 17.36 17.23
Sro1190_g250860.1 (Contig1320.g12206)
 1.0 14.82 23.26 10.89 18.11 34.46 40.96 38.64 30.27 52.81 49.23 63.49 90.51 43.98 49.62 47.46 31.42 75.89 73.89 115.4 71.41 47.21 21.61 36.67 78.82 48.77 39.97
Sro128_g061190.1 (Contig1654.g14895)
 0.0 0.25 0.46 0.0 0.51 0.9 2.27 0.48 0.64 2.53 0.94 2.4 6.21 3.27 2.89 4.47 0.47 1.92 3.25 5.56 3.54 2.35 1.13 1.66 4.08 2.48 1.64
Sro1312_g261870.1 (Contig2711.g21816)
 0.11 0.97 0.74 0.69 0.25 2.92 4.7 9.24 3.04 4.64 4.85 5.3 6.69 3.32 4.4 3.88 3.43 3.23 4.68 8.04 5.28 5.67 2.82 4.05 4.48 3.76 3.84
Sro1386_g268300.1 (Contig1512.g13813)
 0.02 1.67 3.12 1.47 1.44 0.33 7.44 9.47 4.29 2.9 3.58 1.79 4.08 0.3 6.16 7.8 1.09 8.66 3.62 5.73 3.23 5.1 3.34 5.69 4.27 4.46 6.84
Sro138_g064900.1 (Contig2021.g17312)
 0.31 9.24 9.53 6.28 5.6 3.35 6.81 7.48 5.67 6.82 9.67 6.32 10.64 5.39 8.06 9.65 8.3 12.31 12.51 14.97 8.54 6.09 4.12 3.99 4.12 4.26 7.48
Sro1390_g268720.1 (Contig2158.g18128)
 1.18 1.44 0.96 0.83 1.08 3.14 6.18 8.72 4.87 10.52 8.36 12.58 5.22 6.07 10.22 17.71 2.91 18.26 17.44 8.55 11.56 5.41 3.66 7.31 6.36 5.49 8.45
Sro1395_g269060.1 (Contig847.g9323)
 0.36 0.0 0.17 0.11 0.0 0.47 2.14 4.28 2.1 3.11 1.49 3.68 2.79 1.38 3.02 3.2 2.83 3.31 2.82 5.73 4.22 3.84 0.3 2.29 3.82 2.89 2.31
Sro1397_g269160.1 (Contig4502.g33753)
 0.0 0.69 0.61 0.42 0.46 3.24 1.15 4.55 1.1 1.72 2.58 1.57 1.02 1.45 2.89 2.08 2.53 0.74 1.12 1.34 3.12 1.14 0.58 0.77 1.63 1.9 2.65
Sro1443_g273160.1 (Contig745.g8537)
 0.18 11.85 20.38 17.18 12.68 14.75 19.3 25.93 16.28 11.28 24.27 9.93 12.41 19.98 33.49 32.18 18.35 38.42 13.02 8.66 9.49 6.39 10.32 14.43 15.33 10.53 24.86
Sro1474_g275680.1 (Contig1848.g16173)
 0.19 4.71 2.45 3.35 1.58 2.39 5.07 6.65 3.31 5.49 9.25 4.77 9.65 2.87 7.14 5.49 5.65 4.84 5.58 10.92 5.41 4.42 3.09 7.48 4.23 3.72 5.13
Sro1495_g277420.1 (Contig2585.g20991)
 0.0 0.06 0.04 0.04 0.09 0.19 1.57 1.16 1.86 1.07 1.46 1.23 0.9 0.24 1.0 0.79 1.15 1.04 0.9 1.72 1.62 0.96 0.32 1.32 2.48 1.26 1.12
Sro1536_g280630.1 (Contig2003.g17146)
 0.1 2.83 1.46 1.47 1.89 1.02 3.58 5.99 3.78 3.61 4.97 4.29 5.04 3.37 4.66 4.36 3.54 4.03 4.83 7.24 4.97 4.7 1.48 4.72 4.99 4.15 2.95
Sro1580_g283770.1 (Contig1595.g14505)
 1.25 0.26 0.39 0.56 0.28 0.33 0.96 1.52 0.51 1.35 1.42 1.76 1.78 0.86 1.15 1.24 1.14 1.88 1.8 2.67 2.33 1.14 0.31 1.05 1.02 0.94 1.07
Sro164_g073540.1 (Contig4339.g32728)
 0.14 1.01 1.72 0.95 0.73 1.01 1.39 1.52 1.05 1.75 3.01 1.53 4.48 1.26 2.19 2.83 1.98 3.3 3.12 5.5 2.36 1.11 0.85 3.41 1.88 1.27 1.9
Sro166_g074170.1 (Contig1709.g15296)
 0.06 19.95 15.53 11.46 13.87 7.34 16.58 23.63 13.46 16.1 27.57 17.24 10.77 13.04 20.54 29.37 28.21 18.81 12.66 15.1 25.66 7.71 9.54 21.7 41.85 20.89 17.96
Sro1747_g295020.1 (Contig3590.g27744)
 0.77 1.51 1.62 1.78 1.76 4.49 19.54 21.7 20.45 15.58 23.83 20.27 3.65 7.13 16.62 15.01 11.6 9.05 6.67 12.67 18.97 16.59 16.97 9.8 8.41 7.97 16.23
Sro174_g076570.1 (Contig4298.g32441)
 1.62 0.18 0.07 0.0 0.09 1.17 9.83 18.0 6.87 9.63 7.26 10.6 1.19 3.65 5.87 6.28 5.74 1.98 2.05 3.12 24.64 16.43 4.67 2.82 2.73 2.76 6.3
Sro178_g078030.1 (Contig275.g3528)
 0.57 4.03 2.38 1.44 1.3 3.56 5.25 2.93 2.5 7.16 4.73 10.1 10.52 3.98 5.9 6.87 4.76 8.02 9.15 15.09 6.58 2.91 2.01 4.06 4.76 2.87 6.24
Sro178_g078040.1 (Contig275.g3529)
 1.71 14.75 9.46 5.2 4.71 6.0 9.73 8.33 8.74 11.94 10.6 15.53 18.71 6.89 10.13 10.37 5.98 12.85 16.19 23.97 12.13 10.72 5.34 6.17 7.81 4.07 9.82
Sro2159_g317030.1 (Contig1250.g11682)
 0.4 4.91 2.64 2.7 1.79 4.19 7.22 5.51 3.38 8.35 10.19 9.89 19.41 5.73 8.98 9.88 6.51 8.02 9.95 22.5 9.46 13.44 3.63 7.02 12.18 9.36 7.47
Sro215_g089070.1 (Contig4439.g33331)
 4.78 3.01 2.49 4.09 4.71 32.8 59.44 38.84 23.11 25.19 86.48 4.32 33.76 5.44 99.19 126.28 81.45 73.79 26.38 12.36 11.59 27.63 14.7 54.07 35.55 17.84 60.84
Sro23_g015970.1 (Contig2259.g18747)
 1.07 8.15 6.16 5.01 3.97 2.06 10.63 11.27 7.99 11.54 10.74 11.2 23.14 7.93 10.31 13.37 5.1 19.36 17.18 25.62 16.28 13.46 5.09 9.86 23.77 9.77 6.44
Sro242_g096630.1 (Contig554.g7081)
 0.01 1.3 1.17 0.83 1.02 0.35 1.43 3.86 2.27 1.35 2.12 2.05 1.02 1.32 1.72 1.97 2.05 1.27 1.95 1.05 1.58 1.56 1.3 0.94 1.0 0.85 1.77
Sro2467_g328540.1 (Contig2706.g21796)
 0.02 1.57 1.36 0.95 1.26 0.48 3.13 6.16 4.14 4.59 5.17 4.56 5.38 3.8 3.85 5.86 3.23 5.86 5.05 6.63 8.94 5.92 2.48 4.53 6.53 5.23 3.99
Sro24_g016520.1 (Contig40.g262)
 0.05 0.78 0.89 0.44 0.42 0.83 0.95 0.63 0.24 1.34 0.85 1.43 1.09 0.56 1.46 1.96 1.0 3.39 3.46 2.51 2.77 0.1 0.32 0.83 1.35 1.18 1.79
Sro2690_g334700.1 (Contig4527.g33906)
 0.01 0.3 0.19 0.14 0.11 0.44 1.02 1.58 0.69 1.58 2.14 2.04 0.38 0.5 2.09 2.26 0.54 2.25 2.14 0.75 2.61 0.51 0.41 1.57 1.01 1.07 1.97
Sro26_g017910.1 (Contig2432.g19962)
 0.14 2.05 0.84 0.96 1.17 0.26 3.26 2.89 1.69 2.76 1.76 2.69 3.38 1.84 1.9 1.88 0.82 3.89 3.79 6.62 4.28 2.33 1.53 1.97 1.69 1.43 1.85
Sro3044_g342730.1 (Contig1018.g10187)
 0.11 5.21 6.02 3.33 2.53 2.51 7.12 10.28 6.91 7.24 6.82 5.97 13.43 5.07 8.0 7.76 4.45 9.55 12.34 16.83 9.77 8.64 4.84 5.69 7.55 5.82 7.78
Sro326_g118010.1 (Contig1080.g10489)
 0.74 1.61 2.95 1.82 2.97 7.03 17.98 15.34 11.09 15.28 10.14 15.66 20.99 10.13 13.94 13.41 11.25 17.44 23.66 31.24 24.0 17.16 8.71 13.49 36.66 16.01 9.0
Sro3461_g348270.1 (Contig2163.g18139)
 0.09 0.0 1.91 0.0 0.73 0.0 1.17 1.95 2.08 1.14 3.05 1.73 1.7 1.07 1.38 1.05 2.97 3.05 0.14 0.36 0.76 0.03 0.78 0.47 0.52 0.28 2.03
Sro357_g125600.1 (Contig708.g8188)
 0.04 1.08 1.1 1.23 1.76 2.98 2.72 0.43 1.8 2.83 3.55 2.28 4.61 2.0 3.07 3.57 0.67 1.3 3.27 8.55 4.42 4.25 1.02 2.93 2.71 1.78 1.98
2.21 14.1 13.47 9.01 6.95 0.96 10.6 24.01 17.67 7.72 23.15 1.79 3.82 0.49 9.59 20.02 25.19 24.6 26.5 5.83 9.63 1.37 10.16 17.07 63.05 26.71 22.25
Sro395_g133990.1 (Contig4272.g32318)
 0.19 0.61 0.23 0.35 1.37 0.21 2.98 2.54 1.33 2.48 1.63 4.31 7.28 0.0 1.45 1.64 1.11 2.14 1.7 8.68 1.91 7.16 0.79 1.22 1.11 1.77 1.1
Sro42_g025530.1 (Contig312.g4130)
 0.06 1.59 0.58 0.18 0.6 1.24 4.52 2.73 1.99 5.19 2.64 3.82 4.6 2.76 5.5 4.95 2.08 7.08 11.22 10.92 10.83 9.48 2.98 2.74 5.63 4.66 3.76
Sro435_g142330.1 (Contig492.g6639)
 1.29 1.05 1.32 2.25 3.11 14.12 19.22 44.33 11.08 13.37 10.55 11.2 5.75 5.43 22.54 23.31 4.65 21.26 8.82 12.31 24.19 11.22 3.12 13.44 13.28 17.64 16.04
Sro446_g144750.1 (Contig1578.g14344)
 0.09 1.79 3.55 2.01 2.11 0.12 1.43 1.96 1.65 1.4 1.14 1.17 0.66 0.36 1.39 1.58 0.52 1.44 0.57 1.78 2.67 1.22 0.29 1.59 3.25 2.07 1.7
Sro511_g157390.1 (Contig3003.g23880)
 1.71 4.44 5.85 7.49 5.79 7.03 25.56 15.5 11.12 17.27 14.18 12.87 27.04 21.73 19.46 22.89 12.75 25.19 33.81 28.4 23.32 24.92 12.13 16.31 32.4 34.87 20.32
Sro534_g161790.1 (Contig3269.g25744)
 0.02 0.46 0.23 0.14 0.12 0.25 0.61 0.68 0.3 1.03 1.65 0.81 1.25 0.97 1.02 0.67 0.65 1.26 1.6 1.61 1.73 1.01 0.23 1.14 0.94 1.56 1.12
Sro575_g169320.1 (Contig1981.g16950)
 0.11 0.31 0.25 0.1 0.07 1.25 1.32 2.32 1.4 2.07 3.75 1.57 0.71 0.54 2.85 2.99 2.38 3.96 2.59 2.3 3.21 1.07 0.79 1.14 0.79 1.42 3.24
0.0 0.69 0.29 0.22 0.06 0.54 2.15 1.86 1.28 1.45 1.89 1.21 1.09 0.89 1.66 1.54 1.31 1.36 0.99 1.48 2.43 3.05 0.36 1.64 3.93 2.39 1.65
Sro602_g173660.1 (Contig490.g6592)
 0.66 2.7 1.73 0.79 0.9 1.2 3.45 4.27 2.0 4.3 3.9 4.53 5.58 2.24 3.72 4.49 1.36 2.83 4.24 9.51 5.69 5.25 1.23 5.0 7.19 4.38 3.76
Sro603_g174040.1 (Contig4246.g32163)
 0.22 3.14 2.49 3.26 3.6 4.62 13.33 20.23 7.87 11.28 19.06 11.89 9.77 10.06 20.1 23.42 9.5 17.59 11.09 12.07 12.58 9.45 5.31 13.29 5.65 6.58 19.13
Sro604_g174060.1 (Contig2463.g20160)
 0.38 1.62 1.81 0.98 1.35 0.76 5.23 8.63 4.06 3.3 4.41 3.65 3.56 2.46 4.25 5.81 2.63 5.05 4.47 5.14 4.62 4.81 2.62 3.36 4.38 3.69 4.56
Sro616_g176030.1 (Contig2621.g21295)
 0.72 23.7 21.91 22.4 21.07 11.0 35.47 54.42 28.04 12.54 25.81 7.61 15.6 9.6 34.03 28.51 25.39 33.36 6.21 13.52 13.94 4.6 11.68 18.74 33.09 23.19 24.36
Sro62_g035530.1 (Contig2718.g21934)
 0.0 6.49 6.1 8.97 8.66 2.47 9.1 8.53 10.36 8.4 11.4 8.84 11.02 4.74 8.9 9.5 6.3 7.4 8.13 11.96 10.23 13.54 3.85 4.37 11.63 9.76 8.92
Sro631_g178560.1 (Contig3194.g25261)
 0.38 2.71 1.35 1.81 1.98 0.66 4.49 3.12 2.67 4.24 3.34 4.87 4.7 2.56 4.36 5.26 2.44 2.61 3.8 5.58 4.8 4.64 2.08 3.74 6.03 3.56 3.03
Sro649_g181160.1 (Contig1362.g12542)
 4.32 2.13 2.28 1.82 1.4 2.37 4.44 3.95 2.27 6.04 5.7 7.26 4.15 1.96 6.43 10.39 5.23 6.87 7.17 7.47 6.2 1.6 1.59 3.38 2.34 2.8 4.66
Sro670_g184740.1 (Contig318.g4226)
 0.0 0.65 0.71 1.17 0.51 1.6 3.21 7.01 2.49 2.93 3.43 2.36 5.09 0.64 3.69 1.88 4.07 7.0 4.74 5.19 4.14 4.76 1.3 2.84 2.61 3.83 2.81
Sro684_g186790.1 (Contig2085.g17783)
 1.19 2.64 1.82 2.04 1.19 2.64 9.17 13.24 8.5 12.0 17.52 12.32 4.7 5.02 14.15 17.56 6.16 14.14 10.89 9.81 17.57 3.42 5.11 11.55 8.66 7.33 12.5
Sro75_g041030.1 (Contig2656.g21475)
 0.09 2.34 2.4 1.36 1.9 3.56 5.64 8.65 4.04 7.37 6.1 8.8 10.34 6.51 8.06 13.29 4.82 6.21 7.55 10.55 8.49 4.04 2.01 3.78 2.28 3.85 7.11
Sro770_g200020.1 (Contig300.g3967)
 0.63 3.94 1.83 2.83 3.1 3.05 2.89 6.34 2.94 4.01 6.46 4.17 5.83 3.26 5.77 6.2 3.95 3.49 3.73 5.46 5.72 5.57 1.41 5.41 3.51 2.5 4.58
Sro794_g203440.1 (Contig1634.g14713)
 0.2 0.68 0.63 0.51 0.47 1.17 3.24 3.76 2.12 3.34 4.21 3.06 4.4 1.34 3.25 3.6 3.04 5.45 4.83 6.07 4.42 4.36 1.57 2.15 3.25 2.3 2.83
Sro881_g215210.1 (Contig4286.g32374)
 0.11 6.59 6.23 4.71 4.68 8.24 14.0 24.75 19.04 12.07 21.99 13.16 6.49 8.93 16.88 16.01 15.47 10.38 4.48 6.97 15.34 8.41 10.76 10.28 11.53 10.3 14.17
Sro926_g221070.1 (Contig4614.g34432)
 1.87 3.09 2.56 3.16 1.57 1.01 5.49 9.33 5.59 6.35 6.29 5.77 4.74 1.28 5.43 4.68 3.87 11.35 11.81 7.33 11.08 7.96 2.46 9.61 9.37 8.31 5.46
Sro935_g221970.1 (Contig1126.g10777)
 5.37 2.46 0.84 0.0 1.2 1.6 3.12 3.83 2.36 6.13 5.35 5.82 4.11 2.59 5.61 5.98 1.6 6.17 4.67 8.61 8.81 5.41 0.92 3.08 3.14 3.5 3.94

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)