Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1028_g233160.1 (Contig2198.g18309)
0.05 0.61 0.47 0.38 0.25 0.34 0.54 0.72 0.56 0.55 0.85 0.45 0.56 0.21 0.54 0.4 0.49 1.0 0.72 0.6 0.58 0.24 0.32 0.51 0.47 0.53 0.58
Sro10_g008300.1 (Contig1.g54)
0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.07 0.09 0.16 0.17 0.2 0.14 0.12 0.48 0.12 0.2 0.08 0.16 1.0 0.65 0.34 0.09 0.1 0.07 0.02 0.07 0.03 0.24
Sro1290_g259790.1 (Contig199.g2318)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.2 0.33 0.38 0.31 0.06 0.51 0.9 0.03 0.2 0.78 0.01 0.84 0.56 1.0 0.45 0.15 0.04 0.22 0.26 0.24 0.26
Sro1336_g264050.1 (Contig2079.g17765)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.18 0.31 0.25 0.05 0.15 0.1 0.07 0.1 0.0 0.27 0.26 0.16 1.0 0.48 0.15 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.36
Sro137_g064570.1 (Contig3969.g30472)
0.03 0.22 0.21 0.17 0.16 0.26 0.61 0.59 0.43 0.32 0.39 0.27 1.0 0.2 0.39 0.55 0.21 0.68 0.38 0.77 0.42 0.15 0.15 0.55 0.4 0.24 0.28
Sro137_g064580.1 (Contig3969.g30473)
0.04 0.07 0.09 0.09 0.04 0.2 0.52 0.56 0.29 0.42 0.62 0.47 1.0 0.34 0.69 0.77 0.37 0.62 0.3 0.64 0.72 0.08 0.11 0.74 0.51 0.32 0.42
Sro1414_g270670.1 (Contig3607.g27868)
0.01 0.33 0.24 0.31 0.18 0.31 0.33 0.19 0.21 0.53 0.45 0.58 0.87 0.41 0.52 0.68 0.46 0.36 0.74 1.0 0.79 0.23 0.16 0.43 0.5 0.3 0.5
Sro1531_g280160.1 (Contig2576.g20922)
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.16 0.02 0.03 0.01 0.14 0.28 0.03 0.41 0.05 0.54 1.0 0.47 0.23 0.03 0.65 0.03 0.0 0.01 0.08 0.1 0.11 0.55
Sro1536_g280610.1 (Contig2003.g17144)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.08 0.01 0.14 0.09 0.22 0.3 0.03 0.16 0.16 0.05 1.0 0.66 0.47 0.14 0.0 0.01 0.23 0.16 0.26 0.14
Sro1588_g284260.1 (Contig4233.g32096)
0.04 0.14 0.14 0.1 0.09 0.3 0.58 0.47 0.34 0.38 0.5 0.37 1.0 0.28 0.58 0.68 0.31 0.65 0.33 0.7 0.56 0.09 0.15 0.61 0.51 0.28 0.37
Sro1700_g292120.1 (Contig4692.g34895)
0.31 0.08 0.11 1.0 0.48 0.15 0.16 0.65 0.15 0.3 0.37 0.35 0.17 0.13 0.23 0.2 0.13 0.17 0.23 0.37 0.26 0.06 0.05 0.33 0.68 0.23 0.29
Sro1804_g298670.1 (Contig1312.g12133)
0.12 0.06 0.09 0.0 0.0 0.01 0.1 0.96 0.71 0.23 0.31 0.22 0.73 0.19 0.21 0.13 0.08 0.2 0.4 1.0 0.24 0.11 0.12 0.04 0.05 0.08 0.1
Sro180_g078880.1 (Contig350.g4767)
0.01 0.15 0.08 0.09 0.06 0.02 0.14 0.1 0.15 0.29 0.13 0.3 1.0 0.06 0.14 0.11 0.05 0.56 0.35 0.95 0.28 0.16 0.1 0.23 0.21 0.25 0.1
Sro183_g079580.1 (Contig3056.g24303)
0.0 0.06 0.09 0.14 0.08 0.0 0.28 1.0 0.6 0.28 0.03 0.23 0.34 0.12 0.27 0.1 0.1 0.47 0.14 0.49 0.73 0.17 0.04 0.24 0.05 0.05 0.29
Sro1853_g301800.1 (Contig172.g1979)
0.01 0.31 0.22 0.25 0.28 0.56 0.15 0.37 0.28 0.38 0.45 0.51 0.18 0.25 0.23 0.12 0.3 0.93 1.0 0.15 0.45 0.48 0.29 0.28 0.46 0.5 0.53
Sro1880_g303220.1 (Contig160.g1803)
0.0 0.28 0.16 0.29 0.22 0.0 0.48 1.0 0.53 0.11 0.01 0.0 0.09 0.0 0.17 0.07 0.01 0.59 0.03 0.03 0.0 0.36 0.34 0.0 0.02 0.04 0.08
Sro1925_g305780.1 (Contig1431.g13198)
0.05 0.07 0.0 0.01 0.06 0.01 0.07 0.59 0.06 0.31 0.01 0.36 0.28 0.04 0.02 0.0 0.0 1.0 0.85 0.89 0.28 0.17 0.07 0.02 0.0 0.06 0.06
0.02 0.08 0.07 0.07 0.06 0.03 0.3 1.0 0.47 0.21 0.47 0.02 0.3 0.01 0.22 0.11 0.07 0.31 0.3 0.23 0.44 0.17 0.09 0.3 0.32 0.22 0.1
Sro194_g082850.1 (Contig237.g2880)
0.37 0.16 0.12 0.04 0.09 0.14 0.34 0.39 0.18 0.73 0.56 0.65 0.95 0.48 0.56 0.99 0.3 0.37 0.58 0.89 1.0 0.46 0.11 0.58 0.79 0.45 0.34
Sro1972_g308620.1 (Contig4628.g34529)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.27 0.93 0.28 0.32 0.59 0.31 0.66 0.07 0.67 0.34 0.54 1.0 0.56 0.5 0.34 0.01 0.05 0.36 0.43 0.31 0.42
Sro203_g085710.1 (Contig1270.g11865)
0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.41 0.19 0.18 0.01 0.01 0.81 0.02 0.08 0.01 0.0 0.91 1.0 0.96 0.04 0.17 0.21 0.01 0.02 0.01 0.01
Sro218_g090140.1 (Contig1136.g10915)
0.02 0.22 0.26 0.16 0.14 0.02 0.12 0.13 0.05 0.33 0.26 0.29 0.55 0.06 0.15 0.2 0.18 0.83 0.47 1.0 0.28 0.05 0.05 0.16 0.2 0.16 0.6
Sro21_g014540.1 (Contig813.g9044)
0.0 0.04 0.07 0.04 0.06 0.08 0.15 0.18 0.14 0.28 0.28 0.28 1.0 0.19 0.33 0.38 0.15 0.25 0.28 0.76 0.44 0.07 0.07 0.12 0.19 0.23 0.34
Sro241_g096250.1 (Contig4317.g32543)
0.0 0.02 0.05 0.03 0.02 0.03 0.14 0.49 0.06 0.2 0.19 0.1 0.2 0.0 0.33 0.32 0.08 1.0 0.67 0.46 0.22 0.0 0.01 0.29 0.23 0.23 0.29
Sro241_g096420.1 (Contig4317.g32560)
0.07 0.06 0.14 0.19 0.21 0.13 0.39 0.04 0.01 0.57 0.37 0.7 0.19 0.13 0.6 0.8 0.88 0.07 0.23 0.31 1.0 0.39 0.03 0.45 0.47 0.75 0.54
Sro2520_g330170.1 (Contig2879.g23003)
0.02 0.01 0.05 0.06 0.06 0.08 0.27 0.1 0.17 0.12 0.04 0.04 1.0 0.03 0.19 0.05 0.11 0.81 0.6 0.95 0.05 0.01 0.11 0.29 0.34 0.35 0.07
Sro253_g099840.1 (Contig3900.g29902)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 0.28 0.16 0.14 0.06 0.04 0.37 0.0 0.18 0.14 0.05 1.0 0.87 0.59 0.03 0.05 0.05 0.01 0.0 0.02 0.25
Sro2547_g330850.1 (Contig1238.g11599)
0.0 0.05 0.13 0.03 0.0 0.0 0.21 0.77 0.21 0.19 0.1 0.05 0.55 0.0 0.14 0.18 0.0 1.0 0.9 0.99 0.07 0.02 0.05 0.06 0.3 0.1 0.16
Sro265_g102840.1 (Contig1806.g15914)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.79 0.01 0.26 0.09 0.09 1.0 0.0 0.42 0.19 0.0 0.75 0.39 0.78 0.2 0.0 0.01 0.03 0.05 0.16 0.17
Sro265_g102850.1 (Contig1806.g15915)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 1.0 0.44 0.21 0.0 0.14 0.69 0.04 0.38 0.04 0.0 0.72 0.49 0.47 0.18 0.01 0.01 0.11 0.27 0.18 0.15
Sro2747_g336140.1 (Contig3196.g25268)
0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.08 0.21 0.09 0.27 0.16 0.25 0.27 0.02 0.15 0.13 0.11 1.0 0.87 0.43 0.04 0.07 0.05 0.09 0.12 0.06 0.18
0.02 0.17 0.03 0.14 0.06 0.04 0.13 0.19 0.07 0.29 0.11 0.22 0.23 0.08 0.12 0.21 0.16 1.0 0.91 0.32 0.22 0.02 0.12 0.22 0.21 0.26 0.13
Sro30_g019830.1 (Contig3962.g30383)
0.22 0.19 0.31 0.08 0.16 0.01 0.33 1.0 0.64 0.29 0.19 0.2 0.72 0.11 0.21 0.25 0.41 0.75 0.46 0.81 0.43 0.27 0.18 0.34 0.05 0.01 0.27
Sro3120_g344210.1 (Contig3392.g26508)
0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.16 0.03 0.03 0.0 0.13 0.41 0.03 0.3 0.05 0.59 1.0 0.76 0.05 0.01 0.57 0.04 0.01 0.01 0.08 0.28 0.3 0.6
Sro341_g121400.1 (Contig3952.g30272)
0.0 0.04 0.04 0.03 0.01 0.07 0.11 0.09 0.07 0.28 0.3 0.16 0.44 0.06 0.22 0.13 0.13 0.66 1.0 0.76 0.36 0.03 0.01 0.14 0.14 0.32 0.24
Sro3606_g349640.1 (Contig3093.g24655)
0.04 0.04 0.08 0.21 0.05 0.07 0.04 0.0 0.0 0.07 0.05 0.04 1.0 0.04 0.08 0.0 0.09 0.29 0.29 0.38 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.05
Sro385_g131700.1 (Contig3292.g25852)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.49 0.1 0.11 0.08 0.02 0.47 0.0 0.24 0.08 0.02 1.0 0.28 0.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.17
Sro393_g133470.1 (Contig2258.g18678)
0.01 0.4 0.07 0.04 0.04 0.01 0.03 0.18 0.27 0.17 0.01 0.04 0.76 0.09 0.02 0.01 0.0 0.77 0.56 1.0 0.03 0.19 0.19 0.01 0.0 0.01 0.01
Sro435_g142270.1 (Contig492.g6633)
0.01 0.12 0.22 0.13 0.13 0.3 0.67 0.81 0.43 0.53 0.56 0.62 0.78 0.21 0.58 0.67 0.21 0.69 0.33 0.88 0.77 0.14 0.18 0.66 1.0 0.53 0.31
Sro465_g148590.1 (Contig3955.g30304)
0.0 0.45 0.81 0.55 0.55 0.19 0.4 0.7 0.45 0.56 0.5 1.0 0.59 0.59 0.65 0.57 0.52 0.39 0.43 0.52 0.59 0.36 0.23 0.69 0.35 0.29 0.42
Sro46_g027330.1 (Contig1636.g14723)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.72 0.25 0.12 0.02 0.0 0.35 0.0 0.07 0.0 0.0 0.99 0.33 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08
Sro534_g161750.1 (Contig3269.g25740)
0.01 0.13 0.18 0.11 0.16 0.19 0.25 0.23 0.36 0.27 1.0 0.23 0.86 0.24 0.36 0.46 0.45 0.4 0.49 0.85 0.31 0.12 0.28 0.27 0.24 0.24 0.46
Sro573_g168960.1 (Contig1565.g14210)
0.06 0.05 0.06 0.12 0.1 0.05 0.11 0.16 0.07 0.23 0.15 0.25 0.82 0.09 0.14 0.2 0.08 0.25 0.52 1.0 0.3 0.02 0.05 0.12 0.07 0.03 0.11
0.02 0.19 0.05 0.03 0.14 0.13 0.38 0.25 0.36 0.41 0.08 0.5 1.0 0.13 0.38 0.46 0.35 0.25 0.29 0.91 0.73 0.2 0.21 0.29 0.11 0.43 0.38
Sro603_g174030.1 (Contig4246.g32162)
0.01 0.09 0.05 0.02 0.05 0.01 0.28 0.72 0.19 0.28 0.46 0.39 0.79 0.13 0.18 0.14 0.11 0.23 0.25 1.0 0.41 0.05 0.05 0.49 0.65 0.3 0.16
Sro605_g174310.1 (Contig514.g6797)
0.03 0.05 0.04 0.02 0.01 0.31 0.5 0.39 0.27 0.68 0.53 0.88 0.98 0.55 0.81 1.0 0.21 0.32 0.31 0.92 1.0 0.27 0.11 0.86 0.86 0.78 0.5
Sro607_g174630.1 (Contig3533.g27321)
0.01 0.04 0.02 0.09 0.1 0.12 0.31 0.06 0.04 0.28 0.19 0.18 0.09 0.05 0.29 0.34 0.4 1.0 0.46 0.36 0.19 0.05 0.06 0.15 0.5 0.25 0.48
Sro608_g174800.1 (Contig3978.g30563)
0.0 0.04 0.06 0.12 0.07 0.05 0.05 0.03 0.01 0.12 0.09 0.15 0.38 0.03 0.12 0.04 0.03 0.6 0.47 0.74 0.29 0.05 0.01 0.18 1.0 0.39 0.16
Sro652_g181850.1 (Contig2024.g17338)
0.46 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.32 0.24 0.13 0.29 0.25 0.15 1.0 0.06 0.2 0.25 0.15 0.97 0.3 0.87 0.31 0.06 0.1 0.35 0.36 0.16 0.19
Sro67_g037500.1 (Contig495.g6666)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.04 0.06 0.02 0.0 1.0 0.1 0.14 0.02 0.02 0.1 0.13 0.67 0.0 0.02 0.01 0.23 0.41 0.31 0.04
Sro694_g188460.1 (Contig4437.g33299)
0.0 0.18 0.1 0.07 0.1 0.04 0.13 1.0 0.36 0.26 0.44 0.29 0.38 0.15 0.22 0.1 0.06 0.33 0.52 0.86 0.25 0.2 0.06 0.19 0.31 0.18 0.2
Sro776_g200900.1 (Contig1926.g16615)
0.02 0.09 0.08 0.03 0.0 0.16 0.05 0.81 0.33 0.39 0.42 0.26 0.02 0.35 0.35 0.78 0.45 1.0 0.58 0.11 0.5 0.13 0.09 0.01 0.12 0.15 0.47
Sro808_g205420.1 (Contig630.g7651)
0.01 0.03 0.03 0.06 0.01 0.11 0.11 0.21 0.14 0.41 0.08 0.46 0.73 0.29 0.17 0.24 0.13 0.41 0.98 1.0 0.71 0.21 0.07 0.11 0.38 0.21 0.15
Sro819_g207110.1 (Contig8.g97)
0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.04 0.32 0.19 0.22 0.48 0.23 0.44 0.59 0.06 0.45 0.52 0.16 1.0 0.84 0.96 0.81 0.12 0.08 0.23 0.2 0.16 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.06 0.02 0.02 0.12 0.07 0.02 0.28 0.02 0.23 0.11 0.15 1.0 0.73 0.53 0.04 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.26
Sro898_g217580.1 (Contig2959.g23514)
0.15 0.16 0.21 0.07 0.14 0.08 0.59 1.0 0.65 0.35 0.26 0.31 0.87 0.2 0.3 0.29 0.13 0.69 0.58 0.96 0.3 0.21 0.34 0.46 0.27 0.11 0.2
Sro906_g218680.1 (Contig1704.g15267)
0.01 0.05 0.07 0.11 0.09 0.04 0.08 0.26 0.1 0.13 0.13 0.06 0.37 0.02 0.37 0.2 0.09 1.0 0.3 0.44 0.1 0.02 0.02 0.25 0.42 0.23 0.22
0.23 0.02 0.0 0.03 0.02 0.24 0.36 0.49 0.41 0.29 0.24 0.18 1.0 0.21 0.25 0.18 0.28 0.8 0.64 0.98 0.31 0.19 0.16 0.39 0.25 0.12 0.16
Sro907_g218760.1 (Contig3495.g27123)
0.27 0.05 0.07 0.03 0.04 0.06 0.28 0.6 0.39 0.25 0.22 0.2 0.91 0.15 0.21 0.22 0.25 0.92 0.6 1.0 0.26 0.13 0.17 0.42 0.26 0.06 0.27
Sro907_g218770.1 (Contig3495.g27124)
0.16 0.08 0.08 0.03 0.03 0.02 0.27 0.45 0.29 0.22 0.2 0.16 0.92 0.11 0.22 0.23 0.14 0.77 0.55 1.0 0.21 0.15 0.14 0.3 0.22 0.05 0.21
Sro907_g218780.1 (Contig3495.g27125)
0.18 0.07 0.08 0.02 0.05 0.02 0.34 0.43 0.43 0.26 0.18 0.23 0.75 0.16 0.2 0.21 0.18 0.73 0.49 1.0 0.23 0.1 0.19 0.3 0.23 0.05 0.19
Sro946_g223230.1 (Contig2147.g18083)
0.01 0.1 0.09 0.16 0.18 0.39 0.19 0.19 0.14 0.26 0.27 0.06 0.64 0.11 0.41 0.39 0.23 1.0 0.92 0.5 0.15 0.31 0.13 0.21 0.29 0.32 0.49
Sro999_g229690.1 (Contig4042.g31046)
0.43 0.1 0.17 0.22 0.15 0.2 0.21 0.48 0.2 0.4 0.38 0.4 0.44 0.23 0.32 0.5 0.17 0.41 0.87 1.0 0.33 0.1 0.08 0.23 0.16 0.12 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)