1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1028_g233160.1 (Contig2198.g18309)
 0.26 3.53 2.73 2.17 1.43 1.95 3.1 4.15 3.25 3.2 4.9 2.61 3.2 1.2 3.14 2.31 2.81 5.76 4.16 3.43 3.33 1.37 1.85 2.93 2.72 3.03 3.33
Sro10_g008300.1 (Contig1.g54)
 0.04 0.12 0.12 0.03 0.06 0.31 0.41 0.75 0.81 0.92 0.63 0.56 2.24 0.56 0.91 0.37 0.75 4.62 3.03 1.58 0.43 0.45 0.32 0.1 0.31 0.14 1.13
Sro1290_g259790.1 (Contig199.g2318)
 0.1 0.0 0.0 0.0 0.36 0.22 1.16 1.92 2.26 1.81 0.33 3.04 5.3 0.18 1.18 4.61 0.07 4.93 3.3 5.9 2.64 0.87 0.25 1.29 1.55 1.39 1.54
Sro1336_g264050.1 (Contig2079.g17765)
 0.0 0.13 0.04 0.0 0.07 2.28 4.0 3.28 0.69 1.93 1.36 0.95 1.24 0.02 3.46 3.33 2.12 13.03 6.32 1.96 0.09 0.22 0.15 0.24 0.05 0.28 4.66
Sro137_g064570.1 (Contig3969.g30472)
 4.33 34.93 32.56 26.39 24.34 40.44 94.33 92.12 67.61 49.99 60.66 41.52 155.85 31.51 61.21 85.31 33.15 105.45 58.54 119.86 64.99 23.22 23.51 85.44 61.6 37.8 43.43
Sro137_g064580.1 (Contig3969.g30473)
 5.62 9.23 11.05 10.78 5.02 25.61 65.65 70.11 35.88 53.36 77.61 59.4 125.88 42.19 86.26 96.46 46.19 78.44 37.72 80.91 90.29 10.38 13.74 93.51 64.58 40.9 52.98
Sro1414_g270670.1 (Contig3607.g27868)
 0.05 1.25 0.91 1.2 0.71 1.2 1.27 0.73 0.79 2.01 1.72 2.2 3.3 1.55 2.0 2.61 1.75 1.36 2.82 3.82 3.02 0.87 0.6 1.63 1.92 1.13 1.91
Sro1531_g280160.1 (Contig2576.g20922)
 0.21 0.29 0.43 0.26 0.23 4.16 0.41 0.88 0.29 3.79 7.23 0.68 10.81 1.23 14.18 26.18 12.39 5.98 0.89 17.03 0.68 0.04 0.35 2.11 2.59 2.83 14.45
Sro1536_g280610.1 (Contig2003.g17144)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.43 0.26 0.04 0.44 0.27 0.67 0.92 0.1 0.5 0.51 0.15 3.09 2.03 1.44 0.45 0.01 0.03 0.72 0.5 0.81 0.42
Sro1588_g284260.1 (Contig4233.g32096)
 10.52 35.28 35.89 27.26 22.64 78.53 151.71 123.5 89.45 99.09 130.43 97.58 261.18 73.66 151.7 178.81 80.31 169.01 86.14 181.7 145.87 23.43 39.26 160.41 133.77 72.59 96.07
Sro1700_g292120.1 (Contig4692.g34895)
 2.75 0.72 0.94 8.8 4.25 1.35 1.39 5.76 1.36 2.63 3.26 3.08 1.54 1.14 1.98 1.77 1.17 1.47 2.01 3.25 2.28 0.49 0.41 2.89 5.94 2.02 2.58
Sro1804_g298670.1 (Contig1312.g12133)
 0.12 0.06 0.09 0.0 0.0 0.01 0.1 0.96 0.72 0.23 0.31 0.22 0.73 0.19 0.21 0.13 0.08 0.2 0.4 1.0 0.24 0.11 0.12 0.04 0.05 0.08 0.1
Sro180_g078880.1 (Contig350.g4767)
 0.02 0.47 0.26 0.29 0.2 0.06 0.44 0.32 0.48 0.92 0.41 0.98 3.21 0.19 0.44 0.35 0.16 1.81 1.14 3.05 0.9 0.52 0.32 0.74 0.68 0.81 0.33
Sro183_g079580.1 (Contig3056.g24303)
 0.0 0.03 0.05 0.08 0.05 0.0 0.16 0.55 0.33 0.16 0.01 0.13 0.19 0.07 0.15 0.05 0.06 0.26 0.08 0.27 0.4 0.09 0.02 0.13 0.03 0.03 0.16
Sro1853_g301800.1 (Contig172.g1979)
 0.81 27.93 19.71 23.25 25.71 50.85 14.07 34.04 25.89 34.89 40.88 46.1 16.72 23.18 21.19 11.08 27.83 84.66 91.25 13.95 41.25 43.56 26.55 25.16 41.64 45.86 47.95
Sro1880_g303220.1 (Contig160.g1803)
 0.0 19.52 11.29 20.49 15.39 0.11 33.67 70.88 37.57 7.71 0.45 0.0 6.65 0.18 12.31 5.1 1.06 41.5 2.18 2.06 0.1 25.86 24.26 0.16 1.53 3.03 5.83
Sro1925_g305780.1 (Contig1431.g13198)
 0.08 0.12 0.0 0.02 0.1 0.02 0.12 1.0 0.11 0.53 0.02 0.62 0.47 0.06 0.03 0.0 0.0 1.71 1.45 1.53 0.49 0.28 0.12 0.04 0.0 0.1 0.1
0.22 0.75 0.61 0.65 0.56 0.26 2.78 9.27 4.34 1.92 4.34 0.17 2.77 0.11 2.06 0.99 0.68 2.89 2.77 2.16 4.1 1.62 0.83 2.83 2.98 2.03 0.91
Sro194_g082850.1 (Contig237.g2880)
 2.43 1.03 0.78 0.23 0.57 0.94 2.19 2.55 1.2 4.77 3.63 4.26 6.16 3.13 3.61 6.45 1.92 2.43 3.78 5.79 6.51 3.01 0.74 3.78 5.14 2.91 2.21
Sro1972_g308620.1 (Contig4628.g34529)
 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 17.63 17.69 60.02 17.88 20.89 38.48 20.03 42.79 4.71 43.28 21.92 35.18 64.74 36.05 32.5 21.96 0.81 3.13 23.55 27.79 20.07 27.47
Sro203_g085710.1 (Contig1270.g11865)
 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.97 0.45 0.43 0.01 0.03 1.91 0.05 0.19 0.03 0.0 2.15 2.36 2.26 0.09 0.4 0.49 0.02 0.06 0.02 0.04
Sro218_g090140.1 (Contig1136.g10915)
 0.04 0.57 0.66 0.43 0.36 0.04 0.32 0.34 0.14 0.87 0.68 0.75 1.42 0.16 0.38 0.51 0.46 2.16 1.23 2.6 0.72 0.12 0.13 0.41 0.53 0.42 1.55
Sro21_g014540.1 (Contig813.g9044)
 0.06 1.27 2.31 1.42 2.01 2.61 4.72 5.85 4.53 9.02 8.92 9.1 32.13 5.99 10.57 12.36 4.67 8.12 9.07 24.42 14.07 2.22 2.24 3.96 6.05 7.24 11.07
Sro241_g096250.1 (Contig4317.g32543)
 0.02 0.67 1.35 0.84 0.58 0.98 4.27 14.32 1.76 5.96 5.55 3.08 6.0 0.04 9.67 9.36 2.32 29.5 19.63 13.61 6.59 0.1 0.23 8.65 6.74 6.7 8.61
Sro241_g096420.1 (Contig4317.g32560)
 0.05 0.04 0.09 0.11 0.13 0.08 0.24 0.03 0.01 0.35 0.23 0.43 0.11 0.08 0.37 0.5 0.54 0.05 0.14 0.19 0.62 0.24 0.02 0.28 0.29 0.46 0.33
Sro2520_g330170.1 (Contig2879.g23003)
 0.18 0.1 0.42 0.49 0.48 0.68 2.18 0.78 1.39 0.98 0.36 0.3 8.06 0.25 1.54 0.42 0.89 6.55 4.85 7.63 0.39 0.07 0.9 2.37 2.71 2.82 0.56
Sro253_g099840.1 (Contig3900.g29902)
 0.03 0.05 0.06 0.07 0.03 1.87 2.76 3.99 2.35 2.07 0.86 0.58 5.31 0.06 2.64 1.95 0.65 14.27 12.48 8.46 0.42 0.72 0.77 0.09 0.01 0.25 3.59
Sro2547_g330850.1 (Contig1238.g11599)
 0.0 0.07 0.16 0.03 0.0 0.0 0.27 0.99 0.27 0.24 0.13 0.06 0.71 0.0 0.18 0.22 0.0 1.28 1.15 1.27 0.1 0.02 0.06 0.08 0.39 0.13 0.2
Sro265_g102840.1 (Contig1806.g15914)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.71 0.01 0.24 0.09 0.08 0.9 0.0 0.38 0.17 0.0 0.67 0.35 0.7 0.18 0.0 0.01 0.03 0.05 0.14 0.16
Sro265_g102850.1 (Contig1806.g15915)
 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 1.29 0.57 0.27 0.0 0.18 0.89 0.05 0.48 0.06 0.0 0.93 0.63 0.61 0.23 0.01 0.01 0.14 0.35 0.23 0.19
Sro2747_g336140.1 (Contig3196.g25268)
 0.06 0.13 0.18 0.19 0.23 0.22 0.45 1.14 0.5 1.46 0.89 1.37 1.49 0.08 0.84 0.73 0.62 5.42 4.72 2.36 0.21 0.39 0.27 0.48 0.67 0.3 0.97
0.03 0.3 0.05 0.25 0.1 0.08 0.23 0.33 0.13 0.5 0.18 0.38 0.4 0.13 0.22 0.37 0.28 1.74 1.58 0.56 0.39 0.03 0.21 0.38 0.37 0.45 0.23
Sro30_g019830.1 (Contig3962.g30383)
 2.45 2.08 3.43 0.92 1.75 0.08 3.69 11.12 7.16 3.25 2.06 2.2 7.99 1.2 2.32 2.73 4.57 8.3 5.12 9.04 4.81 3.02 2.05 3.79 0.54 0.16 2.95
Sro3120_g344210.1 (Contig3392.g26508)
 0.46 0.25 0.86 1.04 0.63 4.26 0.69 0.76 0.03 3.68 11.24 0.91 8.24 1.27 16.18 27.43 20.83 1.29 0.28 15.74 1.04 0.24 0.29 2.2 7.74 8.26 16.47
Sro341_g121400.1 (Contig3952.g30272)
 0.01 0.23 0.23 0.14 0.05 0.36 0.59 0.48 0.39 1.45 1.57 0.84 2.3 0.33 1.15 0.67 0.69 3.45 5.23 3.99 1.91 0.13 0.04 0.73 0.73 1.68 1.27
Sro3606_g349640.1 (Contig3093.g24655)
 2.74 2.24 5.21 13.38 3.02 4.43 2.36 0.03 0.0 4.7 3.02 2.68 62.77 2.27 5.15 0.21 5.62 18.16 17.93 23.65 2.07 0.02 0.14 0.72 0.42 2.44 3.03
Sro385_g131700.1 (Contig3292.g25852)
 0.0 0.1 0.04 0.0 0.05 0.1 0.48 5.08 1.02 1.17 0.8 0.17 4.84 0.02 2.43 0.85 0.21 10.31 2.87 2.71 0.21 0.0 0.01 0.05 0.15 0.23 1.72
Sro393_g133470.1 (Contig2258.g18678)
 0.04 1.48 0.26 0.13 0.15 0.03 0.11 0.66 0.99 0.64 0.05 0.14 2.78 0.32 0.07 0.02 0.0 2.81 2.06 3.66 0.11 0.69 0.68 0.03 0.0 0.04 0.04
Sro435_g142270.1 (Contig492.g6633)
 0.55 5.85 10.98 6.24 6.4 15.1 33.13 40.21 21.18 26.15 27.66 31.07 38.53 10.47 28.65 33.08 10.23 34.27 16.27 43.83 38.09 7.15 8.77 32.64 49.71 26.5 15.34
Sro465_g148590.1 (Contig3955.g30304)
 0.02 2.6 4.71 3.18 3.16 1.1 2.33 4.04 2.62 3.25 2.88 5.79 3.39 3.4 3.78 3.31 3.01 2.25 2.47 2.99 3.41 2.1 1.32 4.01 2.03 1.69 2.44
Sro46_g027330.1 (Contig1636.g14723)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 4.49 1.53 0.77 0.14 0.0 2.17 0.0 0.45 0.0 0.02 6.19 2.03 6.23 0.03 0.05 0.04 0.01 0.0 0.04 0.48
Sro534_g161750.1 (Contig3269.g25740)
 0.08 1.87 2.49 1.53 2.31 2.71 3.5 3.26 5.02 3.78 14.14 3.29 12.14 3.39 5.12 6.55 6.39 5.65 6.94 11.96 4.43 1.63 3.94 3.86 3.36 3.33 6.52
Sro573_g168960.1 (Contig1565.g14210)
 0.13 0.12 0.15 0.29 0.23 0.13 0.25 0.36 0.16 0.54 0.36 0.59 1.91 0.22 0.32 0.47 0.18 0.59 1.22 2.34 0.71 0.05 0.11 0.27 0.16 0.07 0.25
0.03 0.28 0.08 0.05 0.21 0.19 0.56 0.36 0.53 0.6 0.11 0.74 1.46 0.18 0.56 0.68 0.52 0.37 0.43 1.34 1.06 0.3 0.31 0.43 0.16 0.62 0.56
Sro603_g174030.1 (Contig4246.g32162)
 0.03 0.47 0.26 0.08 0.28 0.04 1.47 3.71 1.0 1.44 2.38 2.01 4.1 0.67 0.91 0.74 0.59 1.17 1.27 5.16 2.13 0.27 0.27 2.53 3.35 1.54 0.83
Sro605_g174310.1 (Contig514.g6797)
 0.22 0.33 0.24 0.11 0.05 2.06 3.37 2.59 1.81 4.58 3.56 5.88 6.6 3.67 5.43 6.7 1.38 2.16 2.05 6.19 6.71 1.79 0.71 5.8 5.74 5.27 3.33
Sro607_g174630.1 (Contig3533.g27321)
 0.05 0.13 0.05 0.31 0.34 0.39 1.03 0.19 0.14 0.93 0.61 0.6 0.28 0.16 0.94 1.12 1.32 3.29 1.52 1.18 0.61 0.17 0.2 0.48 1.63 0.82 1.59
Sro608_g174800.1 (Contig3978.g30563)
 0.0 0.05 0.07 0.15 0.09 0.06 0.07 0.03 0.01 0.15 0.12 0.18 0.47 0.03 0.15 0.04 0.04 0.75 0.59 0.93 0.37 0.06 0.01 0.23 1.25 0.48 0.2
Sro652_g181850.1 (Contig2024.g17338)
 14.49 0.18 0.35 0.1 0.12 2.94 10.16 7.47 4.17 9.28 7.97 4.86 31.47 2.0 6.23 7.8 4.86 30.51 9.49 27.35 9.75 1.86 3.08 10.9 11.38 5.16 6.01
Sro67_g037500.1 (Contig495.g6666)
 0.08 0.0 0.34 0.48 0.55 0.31 2.0 1.71 1.58 2.51 1.1 0.05 44.04 4.24 6.14 0.81 0.77 4.48 5.56 29.3 0.0 0.98 0.3 10.3 18.01 13.68 1.57
Sro694_g188460.1 (Contig4437.g33299)
 0.0 0.22 0.12 0.09 0.13 0.05 0.15 1.21 0.44 0.31 0.53 0.35 0.47 0.18 0.27 0.13 0.08 0.4 0.63 1.05 0.3 0.24 0.07 0.22 0.38 0.22 0.24
Sro776_g200900.1 (Contig1926.g16615)
 0.08 0.45 0.4 0.16 0.0 0.82 0.23 4.09 1.68 1.96 2.12 1.31 0.11 1.75 1.74 3.91 2.26 5.04 2.92 0.56 2.52 0.67 0.47 0.03 0.62 0.78 2.35
Sro808_g205420.1 (Contig630.g7651)
 0.04 0.17 0.15 0.32 0.07 0.55 0.58 1.05 0.72 2.11 0.39 2.33 3.73 1.49 0.85 1.24 0.66 2.07 5.02 5.1 3.63 1.05 0.35 0.54 1.95 1.06 0.78
Sro819_g207110.1 (Contig8.g97)
 0.02 0.04 0.05 0.09 0.08 0.11 0.79 0.46 0.54 1.16 0.57 1.07 1.44 0.14 1.09 1.25 0.39 2.42 2.04 2.32 1.95 0.3 0.2 0.56 0.48 0.38 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.44 0.64 0.24 0.19 1.24 0.78 0.19 2.95 0.23 2.5 1.13 1.58 10.66 7.82 5.63 0.47 0.45 0.19 0.19 0.12 0.13 2.78
Sro898_g217580.1 (Contig2959.g23514)
 4.0 4.16 5.39 1.76 3.73 2.07 15.38 26.27 17.06 9.26 6.94 8.21 22.92 5.36 7.86 7.65 3.54 18.12 15.24 25.26 7.92 5.44 9.04 12.05 7.1 2.86 5.21
Sro906_g218680.1 (Contig1704.g15267)
 1.73 11.05 14.65 24.65 19.6 9.09 17.2 58.02 22.14 29.66 29.36 13.74 83.71 4.35 81.76 45.23 20.48 223.68 68.04 98.54 21.35 4.59 4.7 55.2 94.31 51.01 49.75
6.34 0.58 0.0 0.85 0.6 6.44 9.81 13.2 11.19 7.96 6.62 4.87 27.09 5.75 6.69 4.96 7.47 21.58 17.42 26.61 8.33 5.11 4.4 10.59 6.8 3.15 4.36
Sro907_g218760.1 (Contig3495.g27123)
 5.37 1.05 1.47 0.62 0.72 1.09 5.42 11.76 7.72 4.86 4.25 3.99 17.77 2.93 4.19 4.35 4.82 18.02 11.69 19.59 5.02 2.59 3.29 8.21 5.16 1.19 5.23
Sro907_g218770.1 (Contig3495.g27124)
 5.0 2.47 2.57 0.89 0.8 0.73 8.37 13.97 8.88 6.65 6.11 4.86 28.4 3.48 6.82 7.18 4.28 23.72 16.92 30.73 6.56 4.56 4.26 9.29 6.69 1.49 6.59
Sro907_g218780.1 (Contig3495.g27125)
 3.28 1.31 1.47 0.35 0.84 0.35 6.16 7.83 7.96 4.72 3.29 4.17 13.77 2.93 3.72 3.82 3.37 13.46 9.04 18.34 4.15 1.79 3.48 5.49 4.29 0.96 3.39
Sro946_g223230.1 (Contig2147.g18083)
 0.74 14.32 12.74 22.94 25.23 55.02 26.45 26.26 19.79 36.69 38.18 8.09 90.52 16.21 58.49 55.52 32.19 141.55 130.73 70.49 21.86 44.19 18.58 30.15 41.14 45.78 68.88
Sro999_g229690.1 (Contig4042.g31046)
 3.43 0.78 1.33 1.74 1.19 1.59 1.66 3.8 1.58 3.18 3.04 3.17 3.46 1.81 2.56 3.95 1.31 3.22 6.89 7.94 2.65 0.82 0.67 1.79 1.25 0.99 3.87

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)