Heatmap: Cluster_287 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1118_g243100.1 (Contig728.g8388)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.67 0.0 0.02 0.0 0.01 0.23 0.63 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1193_g251180.1 (Contig4499.g33741)
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.11 0.0 0.0 0.69 0.0 0.01 0.0 0.0 0.63 1.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.07 0.29 0.12 0.2 0.02 0.03 0.0 0.01 0.17 0.07 0.14 0.42 0.14 0.08 0.07 0.03 0.97 1.0 0.88 0.08 0.0 0.02 0.08 0.01 0.22 0.06
Sro1290_g259750.1 (Contig199.g2314)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.65 0.0 0.01 0.0 0.15 0.31 0.34 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0
Sro129_g061440.1 (Contig1945.g16718)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.17 0.06 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.78 0.0 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1366_g266640.1 (Contig4192.g31926)
1.0 0.26 0.38 0.19 0.25 0.06 0.28 0.61 0.31 0.23 0.13 0.24 0.89 0.06 0.17 0.22 0.09 1.0 0.42 0.79 0.29 0.23 0.15 0.22 0.32 0.13 0.08
Sro136_g063940.1 (Contig2000.g17105)
0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.08 0.09 0.13 0.09 0.46 0.05 0.01 0.03 0.0 0.19 0.42 1.0 0.06 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02
Sro13_g010010.1 (Contig337.g4542)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1415_g270760.1 (Contig16.g137)
0.1 0.05 0.04 0.01 0.0 0.02 0.06 0.03 0.02 0.18 0.03 0.22 0.68 0.08 0.06 0.02 0.04 0.64 0.66 1.0 0.18 0.11 0.05 0.09 0.17 0.08 0.04
Sro1524_g279630.1 (Contig122.g1376)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro154_g070270.1 (Contig2716.g21905)
0.0 0.04 0.12 0.08 0.04 0.01 0.02 0.05 0.05 0.09 0.04 0.05 1.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.5 0.59 0.94 0.06 0.18 0.06 0.02 0.03 0.03 0.03
Sro1601_g285150.1 (Contig4269.g32299)
0.03 0.14 0.17 0.15 0.16 0.05 0.08 0.41 0.2 0.14 0.05 0.08 0.46 0.02 0.03 0.02 0.04 0.81 1.0 0.91 0.07 0.19 0.06 0.01 0.02 0.01 0.03
Sro1654_g288930.1 (Contig4624.g34513)
0.0 0.05 0.11 0.17 0.16 0.05 0.12 0.07 0.02 0.23 0.1 0.36 0.72 0.13 0.11 0.06 0.12 0.71 0.74 1.0 0.2 0.16 0.01 0.17 0.31 0.19 0.09
Sro166_g074270.1 (Contig1709.g15306)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro191_g082250.1 (Contig2614.g21218)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Sro191_g082330.1 (Contig2614.g21226)
0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.01 0.1 0.03 0.01 0.48 0.01 0.01 0.01 0.0 0.77 0.94 1.0 0.01 0.17 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01
Sro1928_g305980.1 (Contig2945.g23380)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.14 0.0 0.09 0.79 0.1 0.0 0.05 0.0 1.0 0.66 0.81 0.11 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.03
Sro1935_g306390.1 (Contig2530.g20676)
0.41 0.13 0.16 0.16 0.25 0.11 0.31 0.66 0.31 0.39 0.29 0.51 0.38 0.1 0.21 0.42 0.21 0.83 1.0 0.52 0.79 0.19 0.2 0.6 0.68 0.37 0.22
Sro1957_g307780.1 (Contig1421.g13106)
0.04 0.06 0.1 0.07 0.06 0.0 0.08 0.02 0.15 0.13 0.06 0.07 0.88 0.07 0.05 0.04 0.05 0.39 0.59 1.0 0.07 0.21 0.12 0.02 0.04 0.02 0.05
Sro197_g083790.1 (Contig3509.g27184)
1.0 0.01 0.13 0.11 0.1 0.0 0.07 0.79 0.22 0.04 0.01 0.03 0.25 0.0 0.04 0.04 0.03 0.38 0.32 0.17 0.02 0.04 0.16 0.1 0.21 0.09 0.03
Sro1_g000100.1 (Contig3007.g23925)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.84 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2010_g310840.1 (Contig3241.g25612)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.08 1.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.88 0.53 0.82 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
Sro2043_g312320.1 (Contig3576.g27644)
0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.19 0.15 0.1 0.33 0.01 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.33 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro2088_g313920.1 (Contig1224.g11486)
0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.43 0.0 0.01 0.0 0.0 0.49 1.0 0.95 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2245_g320540.1 (Contig1093.g10561)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.38 0.53 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro238_g095640.1 (Contig99.g1210)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro241_g096310.1 (Contig4317.g32549)
0.09 0.17 0.23 0.17 0.21 0.09 0.09 0.05 0.04 0.19 0.09 0.12 0.49 0.09 0.09 0.01 0.11 0.65 1.0 0.77 0.16 0.22 0.1 0.15 0.16 0.15 0.06
Sro249_g098850.1 (Contig4691.g34889)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.89 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2501_g329440.1 (Contig1317.g12159)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2545_g330820.1 (Contig2769.g22290)
0.0 0.24 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.43 0.0 0.02 0.0 0.0 0.29 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 0.1 0.12 0.06 0.03 0.14 0.23 0.23 0.18 0.16 0.13 0.4 0.09 0.12 0.18 0.23 0.28 0.39 1.0 0.18 0.24 0.13 0.11 0.17 0.12 0.16
Sro266_g103050.1 (Contig1823.g16036)
0.01 0.08 0.04 0.03 0.04 0.0 0.01 0.01 0.03 0.1 0.0 0.02 0.51 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.79 0.63 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
Sro2699_g335020.1 (Contig2762.g22250)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.06 1.0 0.04 0.07 0.06 0.0 0.19 0.5 0.88 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.13 0.05
Sro2760_g336420.1 (Contig2754.g22185)
0.0 0.04 0.09 0.08 0.07 0.0 0.06 0.01 0.01 0.09 0.06 0.04 0.24 0.0 0.04 0.01 0.15 0.39 1.0 0.48 0.14 0.0 0.01 0.08 0.16 0.0 0.04
Sro2868_g339020.1 (Contig4519.g33861)
0.01 0.21 0.26 0.29 0.24 0.04 0.12 0.23 0.01 0.19 0.0 0.12 0.64 0.02 0.12 0.07 0.03 0.6 0.83 1.0 0.31 0.16 0.01 0.14 0.21 0.11 0.11
Sro3071_g343160.1 (Contig3920.g30038)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.62 0.62 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3125_g344270.1 (Contig85.g913)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.97 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3125_g344280.1 (Contig85.g914)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3170_g344740.1 (Contig1272.g11869)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.67 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro317_g115740.1 (Contig519.g6845)
0.0 0.02 0.04 0.02 0.04 0.0 0.11 0.16 0.06 0.07 0.0 0.01 0.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.84 1.0 0.67 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3309_g346530.1 (Contig1835.g16130)
0.05 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.08 0.01 0.07 0.0 0.0 0.64 0.0 0.01 0.0 0.0 0.57 0.35 1.0 0.04 0.0 0.01 0.03 0.49 0.14 0.0
Sro3466_g348320.1 (Contig1929.g16629)
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3525_g348930.1 (Contig1800.g15880)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.79 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3741_g350760.1 (Contig4511.g33820)
0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.02 0.06 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.92 0.47 0.0 0.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.09 0.12 0.17 0.16 0.01 0.04 0.03 0.01 0.14 0.02 0.12 0.88 0.05 0.02 0.03 0.02 1.0 0.63 0.94 0.18 0.02 0.01 0.07 0.07 0.04 0.03
Sro3841_g351380.1 (Contig1390.g12818)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro389_g132530.1 (Contig669.g7870)
0.01 0.14 0.05 0.05 0.11 0.0 0.02 0.25 0.25 0.1 0.01 0.04 0.89 0.01 0.03 0.02 0.03 1.0 0.67 0.83 0.09 0.33 0.15 0.02 0.02 0.06 0.03
Sro4224_g353440.1 (Contig1725.g15423)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.05 0.07 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro455_g146550.1 (Contig189.g2198)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.36 1.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0
Sro45_g027040.1 (Contig2311.g19086)
0.44 0.16 0.22 0.13 0.12 0.03 0.13 0.14 0.08 0.3 0.17 0.29 0.74 0.24 0.28 0.45 0.17 0.82 1.0 0.87 0.34 0.24 0.1 0.23 0.45 0.2 0.13
Sro520_g159180.1 (Contig2679.g21674)
0.07 0.16 0.24 0.24 0.21 0.08 0.04 0.55 0.36 0.18 0.15 0.19 0.33 0.11 0.16 0.14 0.19 0.95 1.0 0.33 0.25 0.42 0.12 0.03 0.03 0.05 0.14
Sro564_g167450.1 (Contig73.g783)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.52 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro564_g167490.1 (Contig73.g787)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro605_g174220.1 (Contig514.g6788)
0.0 0.01 0.05 0.06 0.01 0.0 0.0 0.15 0.1 0.07 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.6 1.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro634_g179050.1 (Contig3030.g24196)
0.01 0.09 0.07 0.07 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.09 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.7 0.72 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro666_g183910.1 (Contig1358.g12510)
0.0 0.2 0.04 0.08 0.09 0.0 0.05 0.01 0.09 0.08 0.01 0.03 0.51 0.06 0.02 0.03 0.02 0.66 1.0 0.77 0.01 0.09 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01
Sro676_g185660.1 (Contig2032.g17443)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.15 0.06 0.02 0.02 0.24 0.01 0.01 0.02 0.01 0.22 1.0 0.46 0.02 0.06 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01
Sro696_g188990.1 (Contig116.g1339)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro881_g215180.1 (Contig4286.g32371)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.09 0.01 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.6 0.83 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Sro8_g006920.1 (Contig89.g1005)
0.1 0.59 0.81 0.85 0.69 0.38 0.15 1.0 0.88 0.4 0.19 0.37 0.4 0.09 0.26 0.16 0.47 0.99 0.98 0.4 0.93 0.68 0.4 0.04 0.11 0.12 0.23
Sro92_g048170.1 (Contig486.g6577)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.1 0.06 0.07 0.49 0.01 0.01 0.04 0.02 0.58 0.93 1.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.1 0.06 0.06
Sro934_g221900.1 (Contig2403.g19677)
0.0 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 0.02 0.05 0.09 0.06 0.03 0.01 0.28 0.03 0.03 0.03 0.02 1.0 0.61 0.38 0.04 0.17 0.08 0.01 0.01 0.04 0.03
Sro93_g048430.1 (Contig3841.g29531)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.15 0.07 0.07 0.0 0.0 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.72 0.66 1.0 0.0 0.27 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)