Heatmap: Cluster_287 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1118_g243100.1 (Contig728.g8388)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.11 0.03 0.0 0.0 0.52 0.1 0.0 4.7 0.0 0.11 0.0 0.07 1.61 4.45 7.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro1193_g251180.1 (Contig4499.g33741)
0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.14 0.23 0.08 1.28 0.0 0.0 8.12 0.0 0.07 0.0 0.0 7.43 11.72 9.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.5 2.1 0.88 1.42 0.12 0.22 0.0 0.06 1.25 0.54 1.03 3.02 0.98 0.58 0.5 0.25 7.04 7.25 6.35 0.55 0.0 0.16 0.57 0.1 1.57 0.46
Sro1290_g259750.1 (Contig199.g2314)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.93 0.0 0.02 0.0 0.21 0.44 0.48 1.43 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0
Sro129_g061440.1 (Contig1945.g16718)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.51 0.19 0.0 0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 2.97 0.92 2.33 0.0 0.64 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1366_g266640.1 (Contig4192.g31926)
19.17 4.93 7.24 3.59 4.7 1.14 5.33 11.75 5.93 4.44 2.55 4.67 17.02 1.24 3.31 4.24 1.68 19.11 7.99 15.18 5.65 4.49 2.78 4.13 6.14 2.44 1.6
Sro136_g063940.1 (Contig2000.g17105)
0.0 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.09 0.11 0.16 0.11 0.56 0.06 0.02 0.04 0.0 0.23 0.51 1.22 0.07 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.03
Sro13_g010010.1 (Contig337.g4542)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.07 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1415_g270760.1 (Contig16.g137)
2.24 1.17 0.95 0.17 0.0 0.4 1.49 0.67 0.53 4.27 0.78 5.25 16.0 1.84 1.38 0.51 0.89 14.89 15.34 23.41 4.31 2.69 1.13 2.01 3.97 1.83 0.93
Sro1524_g279630.1 (Contig122.g1376)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.67 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro154_g070270.1 (Contig2716.g21905)
0.06 0.92 2.86 1.81 1.07 0.24 0.59 1.25 1.19 2.1 1.05 1.15 23.8 1.0 0.9 0.69 0.66 12.0 14.02 22.36 1.35 4.39 1.41 0.54 0.69 0.76 0.76
Sro1601_g285150.1 (Contig4269.g32299)
0.19 0.84 1.01 0.95 0.99 0.33 0.48 2.51 1.2 0.87 0.28 0.52 2.81 0.11 0.18 0.15 0.24 4.98 6.13 5.6 0.45 1.15 0.35 0.08 0.14 0.05 0.17
Sro1654_g288930.1 (Contig4624.g34513)
0.06 1.5 3.61 5.41 5.12 1.7 3.91 2.25 0.48 7.33 3.29 11.43 22.65 4.16 3.44 1.99 3.7 22.51 23.34 31.66 6.38 4.95 0.42 5.43 9.69 6.04 2.77
Sro166_g074270.1 (Contig1709.g15306)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 5.61 0.0 0.0 0.0 0.0 14.02 8.02 6.37 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro191_g082250.1 (Contig2614.g21218)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.55 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Sro191_g082330.1 (Contig2614.g21226)
0.06 0.15 0.29 0.21 0.33 0.03 0.05 0.6 0.11 1.14 0.3 0.12 5.27 0.09 0.12 0.07 0.04 8.39 10.29 10.96 0.11 1.82 0.79 0.08 0.0 0.02 0.16
Sro1928_g305980.1 (Contig2945.g23380)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.73 0.8 0.0 0.54 4.61 0.56 0.02 0.31 0.0 5.85 3.87 4.76 0.64 0.11 0.12 0.0 0.0 0.44 0.19
Sro1935_g306390.1 (Contig2530.g20676)
1.79 0.55 0.67 0.7 1.09 0.48 1.34 2.85 1.35 1.67 1.25 2.2 1.65 0.42 0.93 1.83 0.89 3.61 4.33 2.25 3.41 0.82 0.89 2.58 2.95 1.6 0.94
Sro1957_g307780.1 (Contig1421.g13106)
0.67 1.04 1.74 1.28 1.12 0.08 1.31 0.35 2.58 2.32 1.1 1.16 15.36 1.23 0.92 0.75 0.92 6.83 10.39 17.48 1.27 3.63 2.05 0.33 0.73 0.4 0.84
Sro197_g083790.1 (Contig3509.g27184)
35.47 0.25 4.74 3.76 3.66 0.0 2.47 28.02 7.69 1.43 0.25 1.14 8.9 0.0 1.37 1.47 1.18 13.43 11.51 6.16 0.7 1.3 5.52 3.57 7.46 3.18 1.16
Sro1_g000100.1 (Contig3007.g23925)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 1.1 0.0 0.0 6.44 0.0 0.01 0.0 0.02 13.97 10.08 11.74 0.01 0.85 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2010_g310840.1 (Contig3241.g25612)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.15 0.0 0.12 1.46 0.09 0.03 0.0 0.0 1.28 0.77 1.2 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Sro2043_g312320.1 (Contig3576.g27644)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.01 0.05 0.04 0.03 0.09 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2088_g313920.1 (Contig1224.g11486)
0.0 0.1 0.07 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.07 1.35 0.0 0.02 0.0 0.0 1.55 3.17 2.99 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2245_g320540.1 (Contig1093.g10561)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.58 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.31 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro238_g095640.1 (Contig99.g1210)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.03 0.0 0.0 2.34 0.0 0.0 0.0 0.0 7.46 4.68 5.75 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro241_g096310.1 (Contig4317.g32549)
4.33 8.1 10.7 7.86 9.83 4.1 4.02 2.48 2.0 8.97 4.04 5.5 23.07 3.99 4.14 0.33 5.34 30.63 46.9 36.11 7.72 10.36 4.74 7.22 7.62 6.92 3.01
Sro249_g098850.1 (Contig4691.g34889)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 2.72 2.42 1.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2501_g329440.1 (Contig1317.g12159)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 5.05 0.0 0.0 0.0 0.0 3.12 12.11 11.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2545_g330820.1 (Contig2769.g22290)
0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.4 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.25 0.23 0.28 0.14 0.07 0.35 0.56 0.57 0.44 0.39 0.32 0.96 0.22 0.3 0.45 0.55 0.68 0.95 2.43 0.45 0.58 0.31 0.27 0.4 0.29 0.4
Sro266_g103050.1 (Contig1823.g16036)
0.4 2.34 1.2 0.99 1.2 0.04 0.29 0.16 0.88 2.73 0.0 0.55 14.48 0.0 0.33 0.4 0.0 28.32 22.4 17.85 1.58 0.12 0.24 0.29 0.0 0.04 0.15
Sro2699_g335020.1 (Contig2762.g22250)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.34 0.0 0.22 3.84 0.14 0.26 0.23 0.0 0.73 1.93 3.37 0.0 0.0 0.01 0.17 0.31 0.49 0.19
Sro2760_g336420.1 (Contig2754.g22185)
0.0 0.11 0.28 0.23 0.21 0.0 0.19 0.04 0.03 0.28 0.18 0.1 0.7 0.0 0.12 0.02 0.46 1.16 2.98 1.44 0.4 0.0 0.04 0.23 0.48 0.0 0.12
Sro2868_g339020.1 (Contig4519.g33861)
0.03 0.86 1.09 1.22 1.01 0.18 0.51 0.95 0.06 0.8 0.0 0.51 2.7 0.09 0.49 0.3 0.11 2.51 3.51 4.21 1.3 0.66 0.05 0.59 0.9 0.48 0.47
Sro3071_g343160.1 (Contig3920.g30038)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.05 0.22 0.0 0.0 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0 3.37 2.08 2.09 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3125_g344270.1 (Contig85.g913)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.99 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3125_g344280.1 (Contig85.g914)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.62 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3170_g344740.1 (Contig1272.g11869)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.21 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro317_g115740.1 (Contig519.g6845)
0.03 0.51 0.94 0.48 0.91 0.0 2.5 3.74 1.46 1.54 0.06 0.21 9.87 0.02 0.02 0.02 0.17 19.6 23.42 15.63 0.1 1.97 1.27 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro3309_g346530.1 (Contig1835.g16130)
0.14 0.0 0.0 0.11 0.14 0.0 0.0 0.24 0.02 0.21 0.0 0.0 1.97 0.0 0.04 0.0 0.0 1.74 1.08 3.08 0.12 0.0 0.04 0.09 1.5 0.43 0.0
Sro3466_g348320.1 (Contig1929.g16629)
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.8 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3525_g348930.1 (Contig1800.g15880)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 2.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 2.77 3.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3741_g350760.1 (Contig4511.g33820)
0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.02 0.07 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 1.07 0.98 0.5 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.77 1.08 1.45 1.38 0.07 0.32 0.3 0.06 1.21 0.14 1.02 7.68 0.47 0.21 0.28 0.14 8.73 5.5 8.17 1.6 0.15 0.07 0.61 0.59 0.36 0.27
Sro3841_g351380.1 (Contig1390.g12818)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.24 1.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro389_g132530.1 (Contig669.g7870)
0.02 0.41 0.15 0.14 0.32 0.0 0.07 0.76 0.75 0.29 0.03 0.11 2.7 0.02 0.09 0.05 0.09 3.03 2.02 2.5 0.26 1.0 0.47 0.05 0.05 0.17 0.08
Sro4224_g353440.1 (Contig1725.g15423)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.04 0.06 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.86 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro455_g146550.1 (Contig189.g2198)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.15 0.0 0.0 1.97 0.01 0.0 0.0 0.0 0.78 1.08 3.01 0.0 0.14 0.18 0.06 0.0 0.0 0.0
Sro45_g027040.1 (Contig2311.g19086)
53.55 18.9 26.99 15.54 14.26 3.66 15.45 16.83 9.63 36.08 20.59 35.23 90.21 29.04 34.59 55.29 20.99 99.65 121.6 105.88 41.45 28.87 12.0 28.45 54.27 24.24 15.35
Sro520_g159180.1 (Contig2679.g21674)
0.17 0.4 0.58 0.59 0.5 0.19 0.1 1.34 0.87 0.43 0.37 0.46 0.81 0.26 0.39 0.35 0.46 2.32 2.44 0.8 0.62 1.04 0.3 0.07 0.07 0.11 0.33
Sro564_g167450.1 (Contig73.g783)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.87 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro564_g167490.1 (Contig73.g787)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.91 2.47 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro605_g174220.1 (Contig514.g6788)
0.0 0.07 0.23 0.29 0.05 0.0 0.0 0.71 0.47 0.33 0.0 0.0 4.45 0.0 0.0 0.0 0.0 2.09 2.84 4.75 0.0 0.9 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro634_g179050.1 (Contig3030.g24196)
0.02 0.19 0.14 0.14 0.04 0.0 0.0 0.26 0.0 0.18 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 2.1 1.47 1.5 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro666_g183910.1 (Contig1358.g12510)
0.16 7.13 1.37 2.84 3.19 0.06 1.92 0.54 3.11 2.91 0.23 0.99 18.45 2.08 0.59 0.97 0.78 24.23 36.49 28.22 0.49 3.19 1.17 0.37 0.44 0.82 0.25
Sro676_g185660.1 (Contig2032.g17443)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.43 0.59 0.23 0.07 0.08 0.95 0.02 0.04 0.09 0.05 0.89 3.98 1.83 0.09 0.25 0.16 0.01 0.06 0.07 0.04
Sro696_g188990.1 (Contig116.g1339)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 1.83 0.0 0.0 0.0 0.0 5.9 4.72 3.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro881_g215180.1 (Contig4286.g32371)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 1.88 0.71 1.24 0.13 0.0 6.9 0.0 0.02 0.0 0.0 13.45 8.11 11.22 0.02 0.25 0.0 0.04 0.0 0.08 0.02
Sro8_g006920.1 (Contig89.g1005)
0.18 1.07 1.46 1.52 1.24 0.68 0.28 1.8 1.58 0.72 0.33 0.66 0.71 0.16 0.48 0.29 0.84 1.79 1.77 0.73 1.68 1.22 0.73 0.07 0.2 0.22 0.41
Sro92_g048170.1 (Contig486.g6577)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.23 0.15 0.16 1.18 0.01 0.02 0.1 0.05 1.39 2.23 2.4 0.17 0.03 0.03 0.0 0.23 0.14 0.14
Sro934_g221900.1 (Contig2403.g19677)
0.01 0.13 0.54 0.46 0.27 0.19 0.28 0.64 1.21 0.83 0.45 0.2 3.72 0.37 0.42 0.45 0.28 13.28 8.08 5.09 0.52 2.2 1.11 0.18 0.11 0.56 0.45
Sro93_g048430.1 (Contig3841.g29531)
0.07 0.48 0.32 0.19 0.36 0.05 3.21 5.85 2.76 2.59 0.08 0.02 22.39 0.48 0.09 0.05 0.0 28.73 26.32 39.83 0.02 10.68 3.05 0.0 0.04 0.06 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)