Heatmap: Cluster_243 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051750.1 (Contig348.g4728)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1034_g233790.1 (Contig2522.g20580)
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1054_g235920.1 (Contig2250.g18649)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1091_g240300.1 (Contig2884.g23031)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1153_g247080.1 (Contig4473.g33623)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1182_g250020.1 (Contig4113.g31399)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1186_g250260.1 (Contig3178.g25112)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1340_g264400.1 (Contig1391.g12822)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1369_g266880.1 (Contig3578.g27659)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1494_g277330.1 (Contig4003.g30796)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro152_g069560.1 (Contig69.g716)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1635_g287530.1 (Contig479.g6484)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.59 0.34 0.19 0.0 0.0 0.24 0.03 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.3 0.0
Sro169_g074970.1 (Contig4412.g33117)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1801_g298510.1 (Contig3478.g26987)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro189_g081440.1 (Contig744.g8508)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1980_g309130.1 (Contig1397.g12854)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1992_g309870.1 (Contig129.g1456)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro199_g084350.1 (Contig257.g3173)
0.24 0.14 0.06 0.04 0.15 0.0 0.2 0.03 0.18 0.31 0.1 0.18 0.0 0.06 0.08 0.07 0.13 0.02 0.02 0.12 1.0 0.04 0.06 0.1 0.42 0.06 0.13
Sro2056_g312850.1 (Contig4461.g33530)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2185_g318130.1 (Contig1553.g14128)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2186_g318150.1 (Contig1041.g10298)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2273_g321500.1 (Contig1841.g16143)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.11 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0
Sro2313_g322880.1 (Contig2128.g17959)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro232_g093980.1 (Contig4063.g31163)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro233_g094220.1 (Contig310.g4083)
0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.27 0.19 0.16 0.07 0.07 0.74 0.05 0.09 0.13 0.0 0.27 0.84 0.3 1.0 0.14 0.03 0.0 0.0 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2567_g331470.1 (Contig1538.g13982)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro270_g104300.1 (Contig1617.g14614)
0.07 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.07 0.1 0.02 0.32 0.0 0.21 0.13 0.08 0.06 0.1 0.0 0.07 0.05 0.08 1.0 0.03 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro276_g105930.1 (Contig2556.g20773)
0.01 0.66 0.99 0.66 0.32 0.23 0.23 0.38 0.23 0.47 0.26 0.17 0.3 0.59 0.48 0.37 0.17 0.25 0.41 0.63 1.0 0.25 0.25 0.19 0.12 0.3 0.28
Sro2790_g337150.1 (Contig135.g1510)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2986_g341660.1 (Contig224.g2648)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3044_g342700.1 (Contig1018.g10184)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3060_g342990.1 (Contig602.g7498)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro317_g115830.1 (Contig519.g6854)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro323_g117390.1 (Contig364.g4920)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3294_g346310.1 (Contig1251.g11684)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro331_g119150.1 (Contig3186.g25152)
0.0 0.11 0.15 0.1 0.15 0.03 0.11 0.19 0.12 0.21 0.06 0.05 0.03 0.04 0.08 0.2 0.06 0.14 0.05 0.1 1.0 0.08 0.05 0.06 0.13 0.08 0.06
Sro3418_g347790.1 (Contig3719.g28595)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3707_g350540.1 (Contig1727.g15424)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3887_g351710.1 (Contig3842.g29565)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro407_g136510.1 (Contig2478.g20242)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro418_g138900.1 (Contig289.g3795)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro464_g148340.1 (Contig363.g4882)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4743_g354560.1 (Contig3035.g24213)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro477_g150670.1 (Contig553.g7046)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro494_g154220.1 (Contig3119.g24787)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro501_g155410.1 (Contig1458.g13354)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.04 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.38 0.1 0.0 1.0 0.35 0.29 0.01
Sro501_g155420.1 (Contig1458.g13355)
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.25 0.03 0.0 0.14 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.48 0.07 0.12 1.0 0.37 0.5 0.03
Sro517_g158710.1 (Contig741.g8492)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro526_g160310.1 (Contig842.g9276)
0.06 0.02 0.01 0.05 0.0 0.01 0.22 0.14 0.11 0.26 0.08 0.03 0.23 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.21 0.18 1.0 0.13 0.0 0.39 0.37 0.0 0.19
Sro548_g164310.1 (Contig1714.g15311)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro640_g179830.1 (Contig454.g6117)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro7_g006070.1 (Contig389.g5260)
0.02 0.53 0.3 0.0 0.11 0.0 0.11 0.06 0.07 0.31 0.08 0.18 0.19 0.04 0.1 0.11 0.02 0.23 0.49 0.24 1.0 0.01 0.03 0.04 0.17 0.05 0.24
Sro7_g006080.1 (Contig389.g5261)
0.02 0.16 0.04 0.0 0.0 0.01 0.06 0.02 0.02 0.19 0.03 0.11 0.07 0.06 0.09 0.04 0.0 0.34 0.21 0.09 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.1
Sro812_g206000.1 (Contig1219.g11460)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.3 0.32 0.09 0.17 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.44 0.13 0.0 0.21 0.0 0.11
Sro89_g046750.1 (Contig3846.g29596)
0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.25 0.06 0.06 0.31 0.0 0.27 0.65 0.18 0.17 0.52 0.26 0.08 0.0 1.0 0.99 0.0 0.07 0.1 0.45 0.0 0.04
0.0 0.17 0.13 0.17 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.34 0.0 0.0 0.13 0.1 0.03 0.0 0.0 0.17 0.11 0.0 1.0 0.14 0.03 0.04 0.0 0.19 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)