1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_243 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051750.1 (Contig348.g4728)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1034_g233790.1 (Contig2522.g20580)
 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.94 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1054_g235920.1 (Contig2250.g18649)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1091_g240300.1 (Contig2884.g23031)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1153_g247080.1 (Contig4473.g33623)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1182_g250020.1 (Contig4113.g31399)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1186_g250260.1 (Contig3178.g25112)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1340_g264400.1 (Contig1391.g12822)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1369_g266880.1 (Contig3578.g27659)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1494_g277330.1 (Contig4003.g30796)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro152_g069560.1 (Contig69.g716)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1635_g287530.1 (Contig479.g6484)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.28 0.16 0.09 0.0 0.0 0.11 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0
Sro169_g074970.1 (Contig4412.g33117)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1801_g298510.1 (Contig3478.g26987)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro189_g081440.1 (Contig744.g8508)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1980_g309130.1 (Contig1397.g12854)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1992_g309870.1 (Contig129.g1456)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro199_g084350.1 (Contig257.g3173)
 0.39 0.23 0.09 0.06 0.25 0.0 0.33 0.05 0.29 0.52 0.16 0.3 0.0 0.1 0.13 0.12 0.22 0.03 0.03 0.2 1.67 0.06 0.09 0.16 0.71 0.1 0.22
Sro2056_g312850.1 (Contig4461.g33530)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2185_g318130.1 (Contig1553.g14128)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2186_g318150.1 (Contig1041.g10298)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2273_g321500.1 (Contig1841.g16143)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
Sro2313_g322880.1 (Contig2128.g17959)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro232_g093980.1 (Contig4063.g31163)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro233_g094220.1 (Contig310.g4083)
 0.2 0.23 0.14 0.1 0.07 0.5 0.26 3.7 2.52 2.21 0.91 0.95 10.0 0.71 1.19 1.75 0.06 3.63 11.35 4.1 13.46 1.93 0.42 0.01 0.0 0.11 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.37 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.53 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2567_g331470.1 (Contig1538.g13982)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro270_g104300.1 (Contig1617.g14614)
 0.55 0.0 0.64 0.0 0.55 0.0 0.59 0.77 0.19 2.56 0.0 1.71 1.07 0.65 0.46 0.76 0.0 0.54 0.38 0.61 8.01 0.22 1.72 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro276_g105930.1 (Contig2556.g20773)
 0.04 1.69 2.54 1.69 0.83 0.59 0.6 0.97 0.59 1.21 0.66 0.44 0.78 1.52 1.24 0.94 0.44 0.63 1.04 1.61 2.57 0.63 0.65 0.48 0.31 0.78 0.72
Sro2790_g337150.1 (Contig135.g1510)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2986_g341660.1 (Contig224.g2648)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3044_g342700.1 (Contig1018.g10184)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3060_g342990.1 (Contig602.g7498)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro317_g115830.1 (Contig519.g6854)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro323_g117390.1 (Contig364.g4920)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3294_g346310.1 (Contig1251.g11684)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro331_g119150.1 (Contig3186.g25152)
 0.0 1.23 1.65 1.07 1.58 0.36 1.17 2.01 1.27 2.33 0.65 0.54 0.28 0.44 0.84 2.2 0.61 1.5 0.59 1.12 10.85 0.84 0.52 0.64 1.46 0.85 0.7
Sro3418_g347790.1 (Contig3719.g28595)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3707_g350540.1 (Contig1727.g15424)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3887_g351710.1 (Contig3842.g29565)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro407_g136510.1 (Contig2478.g20242)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro418_g138900.1 (Contig289.g3795)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro464_g148340.1 (Contig363.g4882)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4743_g354560.1 (Contig3035.g24213)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro477_g150670.1 (Contig553.g7046)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro494_g154220.1 (Contig3119.g24787)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro501_g155410.1 (Contig1458.g13354)
 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 2.46 0.0 0.0 1.06 0.17 0.0 0.45 0.1 0.23 0.35 0.0 0.0 0.33 0.0 3.97 1.03 0.0 10.55 3.72 3.02 0.05
Sro501_g155420.1 (Contig1458.g13355)
 0.22 0.0 0.26 0.0 0.0 0.08 2.01 0.21 0.0 1.09 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.54 3.82 0.56 0.93 7.9 2.92 3.94 0.22
Sro517_g158710.1 (Contig741.g8492)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro526_g160310.1 (Contig842.g9276)
 0.11 0.04 0.03 0.09 0.0 0.01 0.42 0.27 0.21 0.49 0.15 0.06 0.44 0.0 0.04 0.05 0.01 0.06 0.4 0.35 1.93 0.24 0.0 0.75 0.71 0.0 0.37
Sro548_g164310.1 (Contig1714.g15311)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro640_g179830.1 (Contig454.g6117)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro7_g006070.1 (Contig389.g5260)
 0.03 1.11 0.63 0.0 0.24 0.0 0.22 0.12 0.15 0.65 0.17 0.37 0.4 0.08 0.21 0.23 0.05 0.48 1.01 0.49 2.08 0.02 0.07 0.08 0.34 0.11 0.5
Sro7_g006080.1 (Contig389.g5261)
 0.03 0.27 0.06 0.0 0.0 0.02 0.1 0.03 0.03 0.31 0.06 0.18 0.11 0.09 0.15 0.07 0.0 0.56 0.34 0.15 1.64 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.17
Sro812_g206000.1 (Contig1219.g11460)
 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.4 0.42 0.13 0.23 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.33 0.59 0.18 0.0 0.28 0.0 0.14
Sro89_g046750.1 (Contig3846.g29596)
 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.04 0.04 0.2 0.0 0.17 0.41 0.12 0.11 0.33 0.17 0.05 0.0 0.63 0.63 0.0 0.04 0.06 0.29 0.0 0.03
0.0 0.27 0.21 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.54 0.0 0.0 0.21 0.16 0.04 0.0 0.0 0.27 0.18 0.0 1.6 0.23 0.06 0.07 0.0 0.3 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)