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Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
-0.86 0.6 0.28 -0.22 0.16 -0.15 0.25 -0.09 0.11 -0.11 -0.15 -0.46 0.1
-2.27 0.89 0.68 -0.26 0.24 0.2 -1.22 0.69 -2.28 0.88 -2.06 0.52 -1.28
-1.14 0.63 0.71 -0.61 0.05 -0.07 0.07 0.32 -0.33 0.29 -0.88 0.26 -0.58
-1.39 0.4 0.49 -0.4 0.13 0.06 -0.16 0.16 -0.05 0.22 -0.05 0.02 -0.19
-1.27 0.57 0.29 -0.34 0.22 -0.01 0.02 0.16 -0.1 0.06 -0.23 -0.08 0.03
-0.7 0.98 0.84 -0.26 -0.17 0.14 -0.67 0.19 -0.66 0.03 -0.64 -0.12 -0.33
-0.82 1.07 1.24 -0.01 -0.79 -0.64 -0.36 -0.78 -0.58 0.48 -0.54 -0.15 -0.44
-1.67 0.8 0.48 -0.11 0.64 -0.05 -0.21 0.19 -0.53 0.21 -0.61 -0.39 -0.29
-2.61 0.72 1.0 -1.27 0.01 -0.71 -0.59 -0.34 -0.63 0.22 0.23 -0.08 0.83
-0.23 0.58 0.34 -0.36 -0.11 0.15 -0.52 0.23 -0.08 -0.48 -0.37 0.29 0.05
-2.4 0.62 0.67 -0.64 -0.56 0.17 -0.75 0.25 -0.27 0.02 0.25 -0.06 0.54
-1.31 1.07 0.96 -0.47 0.03 0.21 -1.34 0.34 -1.31 0.32 -1.16 0.12 -0.33
-1.38 0.79 0.82 -0.46 -0.44 0.2 -0.78 0.32 -0.83 0.4 -0.81 0.41 -0.15
-1.43 0.71 0.36 -0.36 0.09 0.04 -0.2 0.19 -0.09 0.14 -0.25 -0.07 -0.02
-1.91 0.57 0.53 -0.42 1.12 -0.02 -0.48 0.34 -1.28 0.4 -1.11 -0.02 -0.44
-1.17 1.02 0.88 -0.71 0.13 -0.46 -0.05 -0.21 -0.29 0.07 -0.62 0.33 -0.66
-0.88 0.77 0.46 -0.22 -0.07 -0.15 -0.21 -0.1 -0.16 0.2 -0.11 -0.05 -0.09
-0.79 0.64 0.59 -0.08 -0.03 0.13 -0.82 0.32 -1.08 0.37 -0.59 0.23 -0.13
-1.17 1.01 0.58 -0.48 0.78 -0.61 0.02 -0.6 -0.05 -0.28 -0.03 -0.76 -0.1
-0.62 0.75 0.58 -0.12 -0.47 0.36 -0.73 0.48 -0.73 0.12 -0.91 0.29 -0.32
-1.11 0.73 0.63 -0.35 -0.33 0.22 -0.7 0.41 -0.92 0.44 -1.06 0.66 -0.52
-0.6 0.82 0.74 -0.31 -0.1 0.11 -0.42 0.11 -0.4 -0.26 -0.41 -0.11 -0.02
-1.41 0.67 0.4 -0.99 0.07 -0.6 0.07 -0.41 0.19 0.02 -0.04 0.73 -0.14
-1.98 0.61 0.79 -0.37 0.07 -0.11 0.03 -0.15 -0.26 0.34 -0.16 -0.0 -0.27
-0.83 0.92 0.97 -0.49 0.01 -0.42 0.15 -0.32 -0.39 0.02 -0.49 -0.21 -0.24
-1.44 0.86 0.66 -0.32 -0.32 0.08 -0.41 -0.01 -0.43 0.39 -0.5 0.15 -0.06
-1.48 1.03 0.68 -0.94 -0.54 0.23 -0.8 0.47 -0.86 0.11 -1.24 0.98 -0.67
-0.89 0.92 0.74 -0.05 -0.41 0.19 -0.96 0.43 -1.13 0.39 -1.08 0.41 -0.75
-1.13 0.7 0.68 -0.21 -0.02 0.1 -0.36 0.13 -0.6 0.4 -0.87 0.29 -0.41
-1.3 0.9 0.44 -0.3 0.29 0.07 -0.84 0.41 -1.16 0.44 -1.18 0.59 -0.61
-0.4 0.74 0.69 -0.02 -0.36 0.26 -0.78 0.24 -0.51 0.03 -0.45 -0.15 -0.2
-0.76 0.43 0.55 -0.25 0.57 0.05 -0.53 0.19 -0.41 0.19 -0.44 -0.13 -0.24
-0.35 0.62 0.48 -0.06 -0.22 0.32 -0.59 0.17 -0.5 0.12 -0.63 0.1 -0.12
-1.91 1.0 0.99 -0.92 -0.19 -0.29 -0.48 0.04 -0.24 0.15 -0.65 0.39 -0.17
-1.26 0.85 0.69 -0.51 0.17 -0.0 -0.15 -0.11 -0.34 0.15 -0.43 -0.06 -0.14
-0.8 0.75 0.55 -0.26 -0.39 0.09 -0.26 0.12 0.06 -0.21 -0.23 0.08 -0.2
-0.47 0.6 0.62 -0.38 -0.24 -0.07 0.04 0.09 -0.12 -0.03 -0.17 -0.25 -0.09
-1.27 0.45 0.43 -0.67 0.6 -0.5 0.21 0.0 0.03 0.08 -0.04 -0.18 -0.11
-0.97 0.64 0.45 -0.17 0.01 -0.32 0.28 -0.39 0.23 0.04 -0.04 -0.3 -0.15
-1.19 0.63 0.48 -0.31 0.2 -0.26 0.18 -0.15 0.07 -0.06 0.03 -0.38 -0.0
-1.34 0.7 0.45 -0.49 0.2 0.03 -0.78 0.11 -0.88 0.2 -0.11 0.17 0.42
-1.32 0.57 0.43 -0.26 0.43 -0.26 0.14 -0.02 0.02 0.05 0.01 -0.41 -0.23
-0.44 0.6 0.39 -0.35 -0.28 0.06 -0.2 0.17 0.09 -0.28 -0.2 -0.01 0.06
-0.84 0.79 0.82 -0.14 -0.49 0.14 -0.78 0.23 -0.57 0.2 -0.7 0.35 -0.42
-2.08 0.79 0.57 -1.07 0.4 -0.29 -0.08 0.1 -0.39 0.15 -0.73 0.32 0.24
-1.15 0.38 0.38 -0.01 1.01 0.09 -0.32 0.17 -0.73 0.24 -0.73 -0.32 -0.38
-1.77 0.72 0.61 -0.63 0.19 -0.06 -0.06 0.16 -0.34 0.34 -0.66 0.24 -0.26
-0.42 0.43 0.46 0.32 0.68 -0.31 -0.06 -0.39 -0.31 0.08 -0.1 -0.88 -0.3
-0.98 0.58 0.54 -0.0 -0.52 0.24 -0.52 0.23 -0.49 0.63 -0.82 0.23 -0.32
-1.15 0.54 0.22 -0.35 0.63 -0.12 0.08 0.07 -0.16 0.06 -0.37 -0.06 -0.16
-0.77 0.51 0.36 -0.15 0.15 -0.31 0.06 -0.38 0.08 0.07 0.27 -0.5 0.1
-1.6 0.39 0.29 -0.46 0.28 -0.16 0.28 -0.05 0.15 0.01 -0.13 -0.03 0.16
-1.49 0.58 0.39 -0.3 0.72 -0.32 0.34 -0.34 -0.03 -0.1 0.04 -0.63 -0.13
-0.68 0.6 0.53 -0.19 -0.44 0.31 -0.79 0.44 -0.98 0.5 -0.76 0.44 -0.41
-1.02 0.74 0.59 -0.44 -0.25 0.07 -0.54 0.13 -0.25 -0.06 -0.1 -0.16 0.37
-1.71 0.57 0.13 -0.13 0.2 -0.24 0.2 -0.16 -0.02 0.43 -0.09 -0.24 0.05
-1.94 0.54 0.4 -0.52 0.86 -0.17 -0.3 -0.02 -0.38 0.31 -0.3 -0.06 -0.02
-0.62 0.47 0.39 -0.07 -0.37 0.01 -0.34 0.14 -0.35 0.38 -0.52 0.57 -0.4
-0.61 0.74 0.5 -0.85 0.11 -0.07 -0.2 0.12 -0.05 -0.13 -0.27 -0.3 0.27
-1.24 0.8 0.41 -0.12 -0.4 0.26 -0.76 0.49 -0.96 0.87 -1.19 0.33 -0.74
-1.76 0.95 0.92 -0.76 -0.24 -0.0 -0.6 0.1 -0.4 -0.25 -0.22 -0.3 0.53
-0.73 0.57 0.59 -0.48 -0.04 0.22 -0.89 0.37 -0.77 0.29 -1.01 0.74 -0.41
-3.01 0.69 0.82 -1.04 -0.13 -0.13 -0.28 0.27 0.02 -0.14 0.08 -0.24 0.4
-0.91 1.09 0.73 -0.37 -0.26 0.09 -0.4 0.17 -0.74 0.14 -0.99 0.22 -0.39
-0.74 0.36 0.18 -0.04 0.53 -0.3 0.27 -0.23 0.04 0.06 -0.05 -0.43 -0.13
-0.93 0.65 0.74 -0.17 -0.59 0.13 -0.66 0.12 -0.3 -0.03 -0.13 -0.15 0.32
-0.73 0.27 0.33 -0.19 0.62 -0.17 0.17 -0.15 -0.02 -0.1 -0.01 -0.65 0.07
-1.43 0.77 0.53 -1.23 0.4 -0.66 0.2 -0.57 0.18 -0.22 -0.3 0.59 -0.05
-1.94 0.54 0.4 -0.52 0.86 -0.17 -0.3 -0.02 -0.38 0.31 -0.3 -0.06 -0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.