1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 0.29 0.47 0.16 0.4 0.74 0.18 0.41 0.64 0.59 0.27 0.19 0.14 0.04 1.0 0.25 0.95 0.17 0.32 0.18 0.28 0.45 0.25 0.52 0.25 0.46 0.47 0.37 0.23 0.67 0.8 0.31 0.29 0.05 0.1
0.69 0.7 0.58 0.62 0.5 0.68 0.6 1.0 0.56 0.64 0.39 0.41 0.44 0.22 0.3 0.24 0.17 0.54 0.43 0.34 0.56 0.55 0.38 0.37 0.18 0.26 0.25 0.66 0.42 0.56 0.48 0.67 0.35 0.66 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0
1.0 0.72 0.66 0.35 0.13 0.93 0.41 0.46 0.38 0.5 0.22 0.27 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.21 0.0 0.12 0.02 0.0 0.22 0.33 0.07
0.91 0.84 0.7 0.63 0.2 0.74 0.46 1.0 0.48 0.53 0.01 0.01 0.03 0.0 0.13 0.16 0.14 0.18 0.02 0.1 0.01 0.02 0.01 0.24 0.09 0.07 0.04 0.34 0.02 0.42 0.74 0.3 0.01 0.08 0.01
0.65 0.8 0.82 0.99 0.43 0.84 1.0 0.74 0.89 0.95 0.28 0.34 0.26 0.24 0.32 0.39 0.56 0.47 0.53 0.47 0.28 0.29 0.23 0.75 0.6 0.59 0.62 0.69 0.64 0.66 0.8 0.43 0.38 0.49 0.47
0.71 1.0 0.5 0.84 0.36 0.86 0.84 0.39 0.75 0.83 0.13 0.18 0.48 0.1 0.05 0.13 0.0 0.46 0.48 0.1 0.1 0.3 0.02 0.14 0.04 0.13 0.08 0.36 0.5 0.27 0.26 0.41 0.22 0.35 0.07
1.0 0.86 0.66 0.48 0.18 0.74 0.37 0.44 0.43 0.81 0.4 0.61 0.53 0.35 0.12 0.07 0.07 0.26 0.19 0.16 0.3 0.19 0.37 0.32 0.23 0.03 0.01 0.97 0.3 0.35 0.22 0.47 0.7 0.26 0.31
0.47 1.0 0.44 0.7 0.13 0.38 0.57 0.37 0.27 0.36 0.04 0.05 0.05 0.05 0.06 0.2 0.06 0.38 0.42 0.22 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.26 0.09 0.5 0.27 0.12 0.19 0.09 0.05 0.11 0.2
0.49 0.83 0.31 1.0 0.44 0.53 0.5 0.7 0.35 0.58 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.23 0.01 0.05 0.0 0.0 0.07 0.04 0.18 0.13 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.26 0.28 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.19
1.0 0.93 0.7 0.72 0.45 0.81 0.72 0.66 0.65 0.82 0.11 0.13 0.37 0.06 0.45 0.31 0.39 0.51 0.41 0.33 0.77 0.58 0.47 0.55 0.26 0.62 0.48 0.91 0.45 0.7 0.71 0.72 0.13 0.2 0.27
0.58 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.01 0.0 0.0 0.06 0.25
0.48 0.54 0.37 0.58 0.28 0.55 0.64 0.36 0.6 0.93 0.3 0.27 0.21 0.06 0.18 0.14 0.01 0.33 0.34 0.13 0.16 0.36 0.17 0.17 0.09 0.13 0.37 1.0 0.23 0.25 0.29 0.25 0.31 0.26 0.21
1.0 0.37 0.7 0.31 0.05 0.62 0.03 0.88 0.15 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.17 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.72 0.6 0.58 0.61 0.5 0.5 1.0 0.4 0.46 0.06 0.04 0.0 0.0 0.08 0.03 0.03 0.23 0.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.0 0.0 0.23 0.01 0.63 0.24 0.58 0.06 0.03 0.0
0.35 0.32 0.35 0.28 0.12 0.47 0.23 1.0 0.28 0.35 0.08 0.07 0.03 0.08 0.09 0.11 0.02 0.29 0.17 0.03 0.23 0.27 0.12 0.15 0.04 0.12 0.1 0.03 0.12 0.37 0.29 0.46 0.09 0.1 0.03
0.91 0.74 0.55 0.59 0.53 0.75 0.61 0.54 0.51 0.56 0.33 0.36 0.3 0.16 0.44 0.22 0.18 0.43 0.49 0.26 0.2 0.38 0.15 0.3 0.09 0.51 0.73 1.0 0.3 0.65 0.45 0.51 0.48 0.61 0.58
0.54 0.35 0.34 0.29 0.32 0.6 0.37 0.23 0.63 0.52 0.26 0.12 0.11 0.02 0.64 0.36 1.0 0.28 0.27 0.17 0.21 0.35 0.21 0.94 0.58 0.36 0.45 0.8 0.14 0.56 0.83 0.23 0.15 0.25 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.48 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 1.0 0.29 0.22 0.26 0.98 0.46 0.07 0.2 0.65 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 1.0 0.23 0.22 0.58 0.27 0.08 0.2 0.09 0.17 0.05 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.04 0.03 0.03 0.17 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.61 0.77 0.64 0.74 0.31 0.61 1.0 0.28 0.94 0.67 0.09 0.09 0.11 0.07 0.08 0.13 0.03 0.37 0.39 0.07 0.01 0.03 0.01 0.05 0.01 0.26 0.2 0.23 0.18 0.18 0.25 0.12 0.16 0.35 0.18
0.66 0.4 0.45 0.28 0.41 0.72 0.33 0.4 0.57 0.52 0.26 0.22 0.44 0.13 0.41 0.24 0.85 0.31 0.36 0.23 0.12 0.25 0.12 1.0 0.36 0.3 0.4 0.26 0.32 0.61 0.53 0.54 0.33 0.27 0.32
0.0 0.07 0.0 0.15 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 1.0 0.28 0.84 0.06 0.27 0.76 0.19 0.68 0.39 0.1 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.93 0.48 0.75 0.2 0.01 0.54 0.12 0.18 0.35 1.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.1
0.59 0.49 0.38 0.23 0.06 0.4 0.21 0.14 0.23 1.0 0.04 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.12 0.09 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.49 0.02 0.04 0.05 0.03 0.07 0.04 0.05
0.36 0.44 0.42 0.5 0.1 0.46 0.42 0.14 1.0 0.93 0.16 0.08 0.16 0.02 0.11 0.3 0.05 0.24 0.13 0.54 0.07 0.11 0.08 0.15 0.06 0.28 0.19 0.34 0.08 0.08 0.2 0.01 0.12 0.25 0.03
1.0 0.56 0.99 0.5 0.0 0.64 0.22 0.29 0.01 0.74 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.14 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
1.0 0.71 0.63 0.39 0.44 0.76 0.31 0.8 0.41 0.55 0.04 0.06 0.04 0.0 0.0 0.1 0.07 0.15 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.35 0.01 0.11 0.01 0.0 0.06 0.17 0.01
0.59 0.82 0.57 0.78 0.23 0.61 0.65 0.52 0.63 1.0 0.24 0.29 0.23 0.09 0.09 0.16 0.06 0.17 0.17 0.17 0.02 0.1 0.03 0.21 0.2 0.42 0.2 0.86 0.19 0.24 0.33 0.19 0.32 0.31 0.29
0.32 0.38 0.35 0.29 0.03 1.0 0.42 0.24 0.65 0.96 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.11 0.06 0.03 0.08 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.49 0.56 0.52 0.51 0.06 1.0 0.52 0.8 0.55 0.51 0.03 0.03 0.46 0.02 0.11 0.11 0.03 0.07 0.22 0.01 0.45 0.23 0.05 0.06 0.18 0.04 0.03 0.04 0.08 0.02 0.02 0.01 0.02 0.12 0.06
0.46 0.66 0.67 0.64 0.01 0.97 0.54 1.0 0.41 0.7 0.01 0.01 0.31 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.09 0.0 0.07 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01
0.51 0.54 0.38 0.54 0.35 0.55 0.76 0.31 0.67 0.67 0.32 0.32 0.1 0.13 0.24 0.22 0.18 0.24 0.3 0.09 0.15 0.23 0.07 0.23 0.03 0.45 0.4 1.0 0.17 0.36 0.4 0.29 0.38 0.34 0.23
0.89 0.7 0.69 0.67 0.36 1.0 0.65 0.87 0.91 0.9 0.12 0.16 0.25 0.04 0.22 0.13 0.33 0.32 0.29 0.16 0.1 0.14 0.06 0.41 0.2 0.47 0.31 0.88 0.21 0.57 0.59 0.49 0.17 0.44 0.68
0.76 1.0 0.73 0.63 0.09 0.62 0.4 0.39 0.3 0.34 0.02 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 0.02 0.15 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.18 0.07 0.49 0.02 0.26 0.52 0.15 0.01 0.04 0.02
0.6 0.64 0.59 0.43 0.2 1.0 0.5 0.09 0.9 0.64 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.41 0.4 0.24 0.02 0.38 0.16 1.0 0.21 0.3 0.1 0.15 0.01 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.22 0.02 0.02 0.03 0.01 0.14 0.33 0.01
0.91 1.0 0.67 0.82 0.4 0.96 0.95 0.73 0.77 0.69 0.23 0.28 0.0 0.06 0.0 0.03 0.01 0.13 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.34 0.43 0.03 0.01 0.48 0.02 0.8 0.57 0.93 0.28 0.12 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.32 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.32 0.0 0.46 0.48 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.23 0.0 0.0 0.0 0.5 0.47 0.0
0.24 0.68 0.72 1.0 0.0 0.36 0.72 0.69 0.27 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.57 1.0 0.26 0.55 0.0 0.77 0.49 0.24 0.36 0.63 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.63 0.45 0.51 0.47 0.6 0.69 0.25 0.78 0.5 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.23 0.42 0.17 0.19 0.35 0.05 0.52 0.3 0.29 0.28 0.25 0.03 0.05 1.0 0.46 0.91 0.27 0.3 0.1 0.24 0.37 0.1 0.94 0.3 0.37 0.3 0.19 0.11 0.55 0.66 0.19 0.38 0.17 0.11
0.85 0.97 0.57 0.81 0.38 0.78 0.91 0.55 0.74 0.81 0.09 0.14 0.1 0.07 0.11 0.07 0.08 0.33 0.29 0.05 0.17 0.1 0.15 0.28 0.31 0.13 0.08 0.9 0.1 0.81 0.62 1.0 0.12 0.29 0.02
0.59 0.94 0.35 1.0 0.11 0.49 0.74 0.5 0.67 0.67 0.08 0.14 0.12 0.09 0.05 0.04 0.0 0.19 0.11 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.07 0.03 0.56 0.04 0.03 0.02 0.03 0.11 0.15 0.13
0.39 0.64 0.61 0.48 0.57 0.9 0.38 1.0 0.85 0.97 0.23 0.18 0.2 0.17 0.44 0.82 0.28 0.37 0.2 0.94 0.68 0.96 0.65 0.75 0.49 0.34 0.09 0.01 0.07 0.48 0.9 0.14 0.24 0.18 0.0
0.71 0.58 0.66 0.43 0.07 0.48 0.08 0.54 0.28 0.36 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06 0.09 0.05 0.16 0.09 1.0 0.02 0.07 0.02 0.18 0.04 0.26 0.29 0.26 0.06 0.07 0.16 0.01 0.02 0.07 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 0.8 0.48 0.77 0.43 0.75 1.0 0.88 0.73 0.8 0.53 0.83 0.28 0.16 0.21 0.09 0.13 0.27 0.3 0.15 0.05 0.26 0.07 0.67 0.31 0.25 0.35 0.36 0.19 0.83 0.64 0.63 0.76 0.47 0.29
0.44 0.61 0.39 0.61 0.22 0.5 1.0 0.57 0.73 0.71 0.29 0.36 0.0 0.1 0.06 0.01 0.06 0.14 0.12 0.06 0.13 0.46 0.14 0.62 0.34 0.0 0.0 0.94 0.21 0.51 0.27 0.66 0.34 0.2 0.14
0.44 0.39 0.49 0.67 0.19 0.52 0.64 0.5 0.7 0.92 0.48 0.73 0.0 0.19 0.02 0.02 0.1 0.12 0.19 0.05 0.2 0.44 0.19 0.86 0.88 0.0 0.0 1.0 0.25 0.23 0.23 0.04 0.72 0.19 0.24
0.95 1.0 0.74 0.82 0.31 0.84 0.81 0.69 0.64 0.76 0.28 0.42 0.34 0.23 0.16 0.15 0.23 0.32 0.34 0.17 0.06 0.15 0.05 0.42 0.12 0.29 0.28 0.51 0.2 0.44 0.44 0.42 0.41 0.78 0.81
0.12 0.21 0.12 0.22 0.13 0.15 1.0 0.16 0.14 0.11 0.06 0.06 0.01 0.04 0.06 0.03 0.05 0.08 0.03 0.03 0.1 0.18 0.09 0.06 0.06 0.02 0.02 0.15 0.03 0.03 0.03 0.04 0.07 0.03 0.07
0.77 0.69 0.63 0.59 0.64 1.0 0.7 0.56 0.84 0.82 0.45 0.37 0.28 0.21 0.59 0.49 0.57 0.52 0.43 0.44 0.3 0.52 0.31 0.77 0.67 0.67 0.51 0.99 0.49 0.61 0.95 0.48 0.4 0.48 0.78
0.71 0.41 0.59 0.27 0.47 0.69 0.18 0.69 0.59 0.45 0.68 0.51 0.22 0.08 0.63 0.61 0.82 0.51 0.62 0.33 0.4 0.56 0.39 0.61 0.31 0.55 0.48 0.72 0.35 0.34 0.48 0.26 0.77 0.94 1.0
0.97 0.83 0.82 0.73 0.32 0.72 0.53 1.0 0.39 0.56 0.28 0.36 0.22 0.23 0.17 0.16 0.06 0.56 0.28 0.19 0.44 0.49 0.21 0.29 0.08 0.23 0.23 0.41 0.28 0.74 0.56 0.9 0.32 0.56 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)