Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G00770.1	0.3	0.19	0.17	0.0	1.0	0.14	0.09	0.16	0.09	0.09	0.03	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.07	0.56	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.01	0.47	0.02	0.21	0.11	0.0	0.08
PTI_00G00850.1	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.46
PTI_00G01090.1	0.9	0.93	0.53	0.65	0.89	0.33	0.19	0.23	0.43	0.39	0.09	0.12	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.55	0.1	0.74	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.01	0.36	0.03	0.26	0.03	0.02	0.01
PTI_00G01210.1	0.08	0.22	0.04	0.26	1.0	0.09	0.15	0.83	0.31	0.06	0.12	0.14	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.06	0.12	0.06	0.38	0.34	0.0	0.23	0.01	0.09	0.0	0.32	0.01	0.18	0.04	0.0	0.18	0.0	0.0
PTI_00G01680.1	0.08	0.08	0.09	0.04	1.0	0.04	0.04	0.05	0.08	0.11	0.03	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.48	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01
PTI_00G01850.1	0.12	0.1	0.11	0.12	1.0	0.11	0.04	0.16	0.14	0.22	0.59	0.78	0.13	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.2	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.03	0.59	0.01	0.19	0.0	0.14	0.67	0.13	0.66
PTI_00G01860.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.37	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17
PTI_00G01910.1	0.04	0.08	0.05	0.06	1.0	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_00G02260.1	0.09	0.15	0.09	0.14	1.0	0.12	0.17	0.13	0.12	0.13	0.23	0.26	0.06	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04	0.29	0.07	0.23	0.0	0.01	0.0	0.0	0.52	0.02	0.2	0.02	0.06	0.21	0.02	0.13
PTI_00G02780.1	0.72	0.74	0.51	0.76	0.29	0.92	0.52	0.48	0.6	0.79	0.03	0.04	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.06	0.0	0.04	0.05	0.14	0.16	1.0	0.0	0.05	0.08	0.05	0.04	0.0	0.04
PTI_00G03310.1	0.06	0.08	0.06	0.08	1.0	0.05	0.05	0.07	0.06	0.06	0.49	0.62	0.01	0.16	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.13	0.11	0.16	0.03	0.04	0.0	0.0	0.27	0.02	0.04	0.0	0.03	0.45	0.04	0.21
PTI_00G03360.1	0.0	0.4	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.14	0.18
PTI_00G03760.1	0.11	0.19	0.17	0.13	1.0	0.1	0.11	0.23	0.09	0.16	0.04	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.06	0.03	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
PTI_01G05510.1	0.05	0.12	0.1	0.26	0.22	0.0	0.13	0.0	0.0	0.13	1.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.12	0.0	0.06	0.0	0.2	0.29	0.06	0.0	0.29	0.1	0.0	0.63	0.2	0.0
PTI_01G11820.1	0.52	0.66	0.46	1.0	0.3	0.56	0.87	0.39	0.7	0.56	0.0	0.0	0.31	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.01	0.26	0.0	0.28	0.0	0.02	0.0
PTI_02G04470.1	0.21	0.38	0.16	0.38	0.02	0.19	0.49	0.19	0.35	0.37	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0
PTI_03G00410.1	0.07	0.12	0.1	0.1	0.55	0.02	0.07	0.08	0.1	0.04	0.92	1.0	0.08	0.61	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.1	0.15	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.22	0.01	0.04	0.03	0.07	0.99	0.11	0.55
PTI_03G04570.1	0.29	0.29	0.66	0.54	1.0	0.08	0.56	0.89	0.16	0.27	0.04	0.02	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.02	0.23	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.02	0.12	0.06	0.18	0.03	0.08	0.48
PTI_04G01010.1	0.58	0.86	0.46	0.57	0.32	1.0	0.33	0.87	0.83	0.93	0.32	0.13	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.13	0.11	0.0	0.0	0.03	0.04	0.63	0.57	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0
PTI_05G01690.1	0.07	0.13	0.06	0.13	0.01	0.06	0.19	0.09	0.11	0.13	1.0	0.93	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0
PTI_05G02830.1	0.8	0.97	0.1	0.99	0.22	1.0	0.78	0.37	0.79	0.5	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0
PTI_06G00010.1	0.11	0.14	0.11	0.17	0.09	0.11	0.08	0.12	0.16	0.14	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.03	0.01	0.02	0.0	0.01
PTI_06G03560.1	0.05	0.1	0.12	0.05	1.0	0.08	0.07	0.21	0.07	0.06	0.71	0.91	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.01	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.1	0.05	0.13	0.79	0.05	0.38
PTI_06G03630.1	0.0	0.27	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.22	0.71	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.01	0.01	0.31	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.29
PTI_06G05170.1	0.46	0.64	0.38	0.6	1.0	0.51	0.52	0.61	0.43	0.49	0.07	0.07	0.02	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.04	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.63	0.0	0.05	0.0	0.03	0.12	0.03	0.02
PTI_07G03200.1	0.01	0.03	0.01	0.05	1.0	0.05	0.11	0.11	0.03	0.15	0.02	0.07	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.01	0.17	0.3	0.09	0.0	0.08	0.0	0.0	0.05	0.0	0.14	0.1	0.22	0.05	0.0	0.0
PTI_07G04550.1	0.13	0.15	0.1	0.14	1.0	0.18	0.13	0.11	0.15	0.04	0.05	0.09	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.21	0.1	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.55	0.0	0.05	0.04	0.05	0.06	0.07	0.15
PTI_08G04550.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_10G00130.1	0.26	0.48	0.22	0.48	0.01	0.26	0.62	0.22	0.46	0.47	0.67	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0
PTI_11G00080.1	0.03	0.03	0.01	0.03	0.55	0.06	0.0	0.04	0.03	0.0	0.73	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.28
PTI_11G00120.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_11G00160.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_11G00170.1	0.56	0.15	0.13	0.15	1.0	0.21	0.23	0.46	0.35	0.69	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.26	0.17	0.31	0.0	0.0	0.05	0.0	0.79	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
PTI_11G00180.1	0.46	0.41	0.48	0.29	1.0	0.33	0.2	0.39	0.29	0.39	0.03	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.33	0.17	0.1	0.02	0.03	0.48	0.13	0.8	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
PTI_11G04460.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.19	0.24	0.12	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.37	0.25	0.0	0.42	0.0	0.13
PTI_11G04490.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_12G02260.1	0.47	0.44	0.25	0.91	0.53	0.25	0.29	0.42	0.53	1.0	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.24	0.12	0.15	0.5	0.0	0.0	0.12	0.0	0.12	0.96	0.08	0.06	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0
PTI_13G00190.1	0.51	0.81	0.35	0.42	1.0	0.28	0.21	0.81	0.48	0.42	0.25	0.12	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.02	0.0	0.04	0.0	0.1	0.09	0.0	0.0	0.6	0.03	0.54	0.0	0.58	0.22	0.14	0.0
PTI_13G02360.1	0.25	0.23	0.25	0.18	0.32	0.2	0.21	0.23	0.23	0.23	0.95	1.0	0.03	0.23	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	0.35	0.29	0.01	0.67	0.05	0.16	0.89	0.37	0.12
PTI_13G02370.1	0.39	0.31	0.24	0.31	0.18	0.24	0.32	0.2	0.33	0.35	1.0	0.96	0.03	0.09	0.11	0.04	0.02	0.12	0.15	0.06	0.1	0.31	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.32	0.01	0.37	0.05	0.06	0.93	0.16	0.16
PTI_14G01290.1	0.24	0.52	0.0	0.46	1.0	0.22	0.13	0.39	0.12	0.39	0.17	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.65	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.19
PTI_14G02130.1	0.15	0.29	0.13	0.27	0.01	0.14	0.36	0.14	0.25	0.26	1.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0
PTI_14G02440.1	0.28	0.34	0.24	0.31	0.96	0.27	0.26	0.18	0.29	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.35	0.06	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.04
PTI_14G02450.1	0.27	0.43	0.25	0.41	0.81	0.31	0.28	0.19	0.34	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.32	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_17G00230.1	0.0	0.64	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.15	0.12	0.0	0.06	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.04	0.34	0.62	0.76	0.0	0.0	0.14
PTI_18G00040.1	0.0	0.02	0.02	0.0	0.28	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.6	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.0	0.0	0.85	0.01	0.09
PTI_18G00110.1	0.36	0.5	0.39	0.68	0.3	0.57	0.71	0.47	0.9	0.93	0.58	0.53	0.49	0.12	0.01	0.03	0.0	0.01	0.01	0.06	0.28	0.54	0.02	0.03	0.0	0.1	0.13	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.42	0.24	0.27
PTI_18G02880.1	0.46	0.77	0.57	1.0	0.25	0.31	0.89	0.42	0.98	0.64	0.73	0.74	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.16	0.16
PTI_18G02890.1	0.52	0.55	0.34	0.65	0.44	0.3	0.55	0.38	0.52	0.57	1.0	0.88	0.04	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.08	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.36	0.1
PTI_24G01610.1	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.03	0.1	0.06	0.05	0.05	1.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.02	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0
PTI_25G01050.1	0.14	0.17	0.29	0.25	0.14	0.27	0.18	0.19	0.21	0.18	0.84	1.0	0.08	0.01	0.06	0.03	0.03	0.25	0.21	0.04	0.15	0.07	0.03	0.07	0.05	0.09	0.09	0.05	0.01	0.35	0.09	0.07	0.73	0.22	0.14
PTI_27G00060.1	0.44	0.75	0.44	0.77	0.27	0.48	1.0	0.27	0.79	0.83	0.01	0.02	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.01	0.71	0.04	0.09	0.0	0.0	0.04	0.1	0.12
PTI_27G00290.1	0.14	0.27	0.12	0.27	0.01	0.13	0.35	0.14	0.25	0.26	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0
PTI_29G00630.1	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.15	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.17
PTI_29G01330.1	0.29	0.56	0.26	0.61	0.11	0.33	0.8	0.28	0.56	0.55	0.57	0.62	0.19	0.6	0.03	0.03	0.01	0.24	0.11	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.06	0.04	0.03	1.0	0.12	0.05	0.04	0.05	0.44	0.02	0.02
PTI_30G00050.1	0.23	0.45	0.2	0.47	0.01	0.22	0.61	0.23	0.42	0.42	1.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.01	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0
PTI_30G00070.1	0.0	0.07	0.05	0.0	1.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.06	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.21	0.08	0.16	0.13	0.01	0.17	0.13	0.19	0.0	0.07	0.0
PTI_30G00090.1	0.17	0.13	0.13	0.18	1.0	0.22	0.16	0.14	0.17	0.2	0.07	0.09	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.11	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.01	0.04
PTI_31G00110.1	0.57	0.78	0.42	0.66	0.1	1.0	0.25	0.18	0.28	0.38	0.09	0.09	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.38	0.0	0.02	0.0	0.0	0.09	0.02	0.07
PTI_31G00150.1	0.19	0.12	0.0	0.13	1.0	0.22	0.13	0.24	0.22	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.01	0.02	0.03	0.17	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.34	0.0	0.28	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
PTI_31G00960.1	0.3	0.54	0.3	0.21	0.2	0.38	0.87	0.11	0.88	0.83	0.01	0.03	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)