1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.41 0.26 0.24 0.0 1.39 0.2 0.13 0.22 0.13 0.13 0.04 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.1 0.78 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.01 0.65 0.02 0.29 0.16 0.0 0.11
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.52 1.56 0.89 1.1 1.5 0.56 0.32 0.39 0.72 0.66 0.15 0.2 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.13 0.93 0.17 1.24 0.0 0.0 0.0 0.12 1.68 0.02 0.6 0.06 0.43 0.05 0.04 0.02
0.03 0.06 0.01 0.08 0.3 0.03 0.04 0.25 0.09 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.11 0.1 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0
0.5 0.47 0.53 0.26 6.04 0.26 0.26 0.32 0.49 0.64 0.2 0.19 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.22 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 2.92 0.08 0.06 0.0 0.0 0.15 0.01 0.08
0.09 0.07 0.08 0.09 0.77 0.09 0.03 0.12 0.11 0.17 0.46 0.6 0.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.15 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02 0.45 0.01 0.15 0.0 0.11 0.51 0.1 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.34 0.63 0.39 0.45 7.77 0.41 0.35 0.26 0.3 0.24 0.02 0.02 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.08 0.46 0.22 0.25 0.02 0.02 0.01 0.0 2.96 0.15 0.06 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0
0.61 0.96 0.55 0.9 6.4 0.78 1.06 0.8 0.77 0.8 1.49 1.68 0.41 0.21 0.03 0.02 0.04 0.06 0.04 0.23 1.83 0.42 1.5 0.02 0.07 0.01 0.01 3.32 0.1 1.27 0.1 0.38 1.33 0.16 0.81
0.38 0.39 0.27 0.4 0.15 0.49 0.28 0.25 0.32 0.42 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.03 0.07 0.09 0.53 0.0 0.03 0.04 0.03 0.02 0.0 0.02
1.24 1.68 1.26 1.75 20.78 1.14 1.08 1.49 1.24 1.3 10.19 12.8 0.12 3.4 0.07 0.05 0.04 0.12 0.24 0.36 2.73 2.32 3.41 0.7 0.91 0.01 0.07 5.54 0.32 0.75 0.0 0.64 9.4 0.82 4.4
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.28 2.3 2.07 1.59 11.95 1.22 1.31 2.7 1.05 1.86 0.47 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.03 0.19 0.86 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74 0.75 0.3 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.08 0.19 0.15 0.39 0.33 0.0 0.2 0.0 0.0 0.19 1.51 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.09 0.0 0.31 0.44 0.09 0.0 0.44 0.15 0.0 0.95 0.31 0.0
0.31 0.4 0.28 0.61 0.18 0.34 0.53 0.24 0.42 0.34 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.01 0.16 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0
18.18 33.05 14.3 33.64 1.85 17.17 42.71 16.84 30.55 32.29 88.05 85.53 0.05 0.11 0.02 0.06 0.01 1.32 0.05 0.08 0.32 0.49 0.06 0.06 0.06 0.04 0.02 63.71 0.09 0.35 0.09 0.15 54.31 0.03 0.03
0.06 0.1 0.09 0.09 0.5 0.02 0.06 0.07 0.09 0.04 0.83 0.91 0.07 0.55 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.14 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.04 0.03 0.07 0.9 0.1 0.5
0.33 0.33 0.75 0.62 1.15 0.09 0.64 1.01 0.19 0.31 0.05 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.03 0.26 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.03 0.14 0.07 0.2 0.03 0.09 0.55
0.26 0.38 0.21 0.25 0.14 0.45 0.15 0.39 0.37 0.42 0.14 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 0.28 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
541.27 993.72 476.55 1002.6 75.71 488.85 1477.36 738.65 867.2 999.07 7777.81 7204.38 11.85 58.98 1.7 0.98 1.31 2.78 0.63 5.01 115.06 89.96 123.94 20.36 15.84 2.71 9.25 1653.0 7.65 13.33 10.59 12.29 2692.4 14.34 19.72
5.13 6.22 0.65 6.39 1.44 6.44 5.02 2.37 5.11 3.19 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 1.85 5.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.25 0.0
2.8 3.38 2.66 4.24 2.12 2.72 1.98 3.04 3.95 3.54 0.11 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.29 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 24.85 0.06 0.81 0.72 0.18 0.42 0.01 0.25
0.09 0.17 0.2 0.08 1.68 0.13 0.12 0.35 0.12 0.1 1.19 1.53 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.13 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.01 0.18 0.08 0.21 1.32 0.08 0.64
0.0 0.62 0.0 0.0 1.81 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.51 1.61 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.02 0.02 0.7 0.14 2.28 0.0 0.0 0.0 0.32 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.66
2.63 3.63 2.19 3.4 5.69 2.93 2.98 3.46 2.46 2.81 0.39 0.42 0.09 0.53 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.08 0.24 0.15 0.0 0.14 0.0 0.0 0.1 3.57 0.01 0.31 0.0 0.17 0.67 0.19 0.1
0.02 0.04 0.01 0.06 1.23 0.06 0.14 0.14 0.03 0.18 0.02 0.09 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.01 0.2 0.37 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0 0.17 0.12 0.27 0.06 0.0 0.0
0.47 0.55 0.37 0.5 3.56 0.64 0.47 0.39 0.52 0.16 0.16 0.33 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.75 0.37 0.4 0.0 0.05 0.0 0.0 1.95 0.0 0.18 0.15 0.19 0.2 0.25 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
88.62 163.16 74.77 162.99 5.05 88.36 211.51 76.46 158.33 159.55 229.93 222.43 0.97 0.51 0.0 0.03 0.0 0.84 0.04 0.15 0.3 1.2 0.43 0.0 0.03 0.07 0.07 341.23 0.1 0.25 0.03 0.02 152.93 0.01 0.05
0.08 0.08 0.04 0.09 1.45 0.17 0.0 0.11 0.09 0.0 1.91 2.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 2.63 0.08 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 0.36 0.3 0.37 2.41 0.5 0.56 1.1 0.84 1.65 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.63 0.42 0.74 0.0 0.0 0.12 0.0 1.9 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
1.06 0.94 1.11 0.68 2.31 0.76 0.46 0.9 0.67 0.91 0.08 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.08 0.76 0.38 0.24 0.05 0.08 1.11 0.31 1.84 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.14 0.08 0.29 0.17 0.08 0.09 0.13 0.17 0.32 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.04 0.05 0.16 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.3 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.26 0.42 0.18 0.22 0.51 0.15 0.11 0.42 0.25 0.21 0.13 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.31 0.01 0.28 0.0 0.3 0.12 0.07 0.0
2.54 2.35 2.5 1.86 3.29 2.0 2.1 2.39 2.3 2.31 9.64 10.19 0.34 2.33 0.18 0.06 0.17 0.2 0.17 0.24 0.01 0.05 0.07 0.16 0.08 0.56 3.6 2.94 0.06 6.85 0.46 1.6 9.03 3.75 1.27
1.24 0.99 0.75 0.97 0.56 0.77 1.02 0.64 1.04 1.09 3.16 3.04 0.09 0.27 0.34 0.12 0.06 0.37 0.49 0.18 0.32 0.97 0.06 0.12 0.06 0.1 0.18 1.01 0.02 1.18 0.16 0.2 2.92 0.51 0.5
0.05 0.12 0.0 0.1 0.22 0.05 0.03 0.09 0.03 0.09 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04
154.26 304.73 132.29 286.8 9.53 149.77 375.74 145.76 262.6 269.81 1045.87 1001.85 1.09 2.57 0.06 0.04 0.08 13.81 0.36 0.14 1.76 2.03 3.48 0.1 0.25 0.04 0.04 585.83 2.75 1.23 0.22 0.61 501.98 0.16 0.53
13.16 15.89 11.26 14.8 45.05 12.5 12.36 8.27 13.68 15.23 0.61 0.63 0.34 0.44 0.06 0.0 0.0 0.06 0.07 1.69 16.58 2.95 11.56 0.15 0.08 0.04 0.0 47.1 0.27 0.47 0.26 0.51 0.55 0.16 2.04
8.31 13.26 7.78 12.7 25.1 9.73 8.61 5.84 10.42 11.07 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.74 9.94 0.74 1.59 0.0 0.0 0.0 0.0 31.1 0.01 0.28 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.53 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.12 0.1 0.0 0.05 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.04 0.28 0.5 0.62 0.0 0.0 0.12
0.0 0.09 0.08 0.0 1.13 0.09 0.0 0.0 0.09 0.0 2.48 4.1 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.04 0.0 0.0 3.49 0.04 0.36
2.57 3.57 2.8 4.85 2.11 4.04 5.04 3.37 6.42 6.59 4.13 3.75 3.45 0.88 0.08 0.19 0.0 0.06 0.04 0.44 2.02 3.87 0.17 0.2 0.0 0.71 0.96 7.1 0.09 0.11 0.0 0.0 2.95 1.74 1.88
0.73 1.21 0.89 1.57 0.39 0.49 1.4 0.66 1.54 1.01 1.15 1.16 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.43 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.25 0.25
1.45 1.54 0.94 1.8 1.23 0.85 1.53 1.05 1.46 1.58 2.79 2.45 0.1 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.23 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.56 0.0 0.0 0.0 0.0 2.19 1.02 0.28
35.36 58.07 32.26 46.67 11.91 25.89 88.11 49.37 42.19 49.04 895.58 827.23 2.7 0.69 0.14 0.0 0.36 14.42 0.67 0.97 3.36 8.67 9.39 0.34 0.02 0.08 0.28 110.78 15.22 3.51 0.16 1.87 202.82 0.38 1.37
0.22 0.26 0.45 0.39 0.22 0.42 0.28 0.29 0.32 0.27 1.29 1.53 0.12 0.02 0.09 0.05 0.05 0.38 0.33 0.06 0.22 0.11 0.04 0.1 0.08 0.14 0.14 0.08 0.02 0.53 0.13 0.1 1.12 0.33 0.21
0.35 0.6 0.35 0.62 0.21 0.39 0.8 0.22 0.63 0.66 0.01 0.02 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.57 0.04 0.07 0.0 0.0 0.03 0.08 0.1
188.8 365.16 160.42 367.82 11.39 180.5 473.88 197.09 338.8 352.31 1362.48 1324.8 0.58 2.31 0.05 0.08 0.02 6.04 0.19 0.3 1.06 2.09 1.73 0.03 0.06 0.02 0.04 703.11 3.15 0.44 0.11 0.66 867.67 0.18 0.38
0.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
7.02 13.41 6.18 14.61 2.52 7.83 19.12 6.77 13.36 13.09 13.52 14.9 4.54 14.28 0.6 0.64 0.3 5.76 2.66 0.43 0.36 1.05 0.25 1.67 1.32 0.99 0.72 23.84 2.83 1.21 1.01 1.24 10.59 0.39 0.46
98.07 190.12 85.02 199.31 5.38 95.1 261.87 96.12 177.24 180.18 426.94 422.68 0.23 1.53 0.01 0.0 0.0 6.84 0.09 0.07 0.25 1.18 0.12 0.0 0.01 0.03 0.08 351.24 2.82 0.26 0.04 0.17 292.86 0.06 0.12
0.0 0.02 0.01 0.0 0.2 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.02 0.0
0.25 0.18 0.18 0.26 1.45 0.32 0.23 0.2 0.25 0.28 0.09 0.14 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.16 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.99 0.01 0.02 0.0 0.0 0.08 0.01 0.05
0.93 1.27 0.68 1.08 0.17 1.63 0.41 0.3 0.45 0.63 0.15 0.15 0.0 1.53 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.62 0.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.03 0.12
0.05 0.03 0.0 0.04 0.28 0.06 0.04 0.07 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.1 0.19 0.11 0.07 0.07 0.13 0.31 0.04 0.31 0.29 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)