1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_93 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.13 0.24 0.16 0.29 0.23 0.17 0.29 0.23 0.18 0.25 0.44 0.52 0.56 1.0 0.09 0.18 0.03 0.5 0.52 0.34 0.73 0.57 0.73 0.2 0.19 0.12 0.06 0.35 0.89 0.2 0.13 0.35 0.49 0.3 0.58
0.13 0.24 0.16 0.29 0.23 0.17 0.29 0.23 0.18 0.25 0.44 0.52 0.56 1.0 0.09 0.18 0.03 0.5 0.52 0.34 0.73 0.57 0.73 0.2 0.19 0.12 0.06 0.35 0.89 0.2 0.13 0.35 0.49 0.3 0.58
0.11 0.19 0.08 0.2 0.14 0.15 0.35 0.12 0.17 0.17 0.44 0.44 0.4 1.0 0.07 0.09 0.07 0.43 0.38 0.1 0.12 0.21 0.27 0.15 0.15 0.05 0.05 0.08 0.27 0.27 0.16 0.46 0.4 0.25 0.18
0.2 0.22 0.04 0.12 0.09 0.19 0.2 0.1 0.24 0.2 0.28 0.24 1.0 0.24 0.12 0.12 0.06 0.14 0.33 0.16 0.39 0.29 0.36 0.23 0.09 0.11 0.06 0.53 0.48 0.09 0.07 0.08 0.26 0.35 0.97
0.13 0.13 0.14 0.13 0.19 0.15 0.08 0.44 0.13 0.12 0.84 0.55 1.0 0.61 0.08 0.1 0.03 0.36 0.55 0.24 0.84 0.68 0.28 0.3 0.1 0.19 0.1 0.31 0.92 0.24 0.17 0.34 0.55 0.71 0.5
0.38 0.33 0.29 0.27 0.45 0.4 0.34 0.29 0.46 0.39 0.27 0.32 0.29 0.38 0.34 0.18 0.39 0.31 0.38 0.48 0.26 0.45 0.23 0.57 0.17 0.28 0.24 0.38 0.65 0.26 0.32 0.33 0.35 0.48 1.0
0.14 0.22 0.16 0.28 0.14 0.17 0.32 0.27 0.18 0.23 0.22 0.39 0.35 1.0 0.07 0.16 0.05 0.31 0.27 0.28 0.02 0.07 0.03 0.21 0.16 0.09 0.28 0.34 0.48 0.19 0.19 0.27 0.34 0.34 0.88
0.25 0.23 0.24 0.22 0.41 0.32 0.28 0.31 0.44 0.36 0.38 0.25 0.2 0.31 0.37 0.24 0.11 0.4 0.3 0.2 0.2 0.28 0.17 0.67 0.38 0.54 0.75 0.19 0.36 0.76 0.47 1.0 0.21 0.8 0.63
0.34 0.49 0.35 0.51 0.6 0.62 0.6 0.38 0.58 0.56 0.37 0.49 0.4 1.0 0.16 0.17 0.11 0.37 0.67 0.32 0.07 0.2 0.1 0.33 0.15 0.37 0.32 0.4 0.35 0.66 0.61 0.58 0.52 0.34 0.69
0.24 0.31 0.28 0.31 0.4 0.39 0.49 0.27 0.44 0.51 0.55 0.64 0.14 0.56 0.15 0.45 0.12 0.42 0.29 0.33 0.64 0.88 0.53 1.0 0.41 0.1 0.09 0.23 0.26 0.26 0.28 0.33 0.63 0.44 0.43
0.06 0.08 0.1 0.09 0.05 0.09 0.13 0.07 0.11 0.12 0.06 0.08 0.19 1.0 0.07 0.07 0.09 0.11 0.34 0.37 0.1 0.12 0.08 0.11 0.03 0.1 0.07 0.07 0.45 0.21 0.07 0.35 0.07 0.11 0.06
0.18 0.52 0.19 0.6 0.19 0.28 0.74 0.27 0.38 0.29 0.54 0.46 1.0 0.98 0.06 0.12 0.07 0.32 0.37 0.24 0.18 0.32 0.22 0.4 0.17 0.15 0.17 0.07 0.63 0.56 0.34 0.85 0.35 0.53 0.43
0.15 0.2 0.12 0.2 0.21 0.16 0.26 0.33 0.2 0.23 0.41 0.55 0.7 1.0 0.09 0.15 0.02 0.45 0.33 0.28 0.46 0.54 0.66 0.47 0.27 0.14 0.45 0.4 0.74 0.55 0.46 0.63 0.51 0.5 0.64
0.07 0.11 0.07 0.12 0.1 0.07 0.2 0.07 0.08 0.09 0.09 0.13 0.22 1.0 0.06 0.07 0.04 0.26 0.32 0.69 0.01 0.03 0.02 0.24 0.15 0.03 0.02 0.02 0.26 0.21 0.13 0.35 0.11 0.21 0.26
0.17 0.21 0.21 0.27 0.28 0.24 0.37 0.35 0.32 0.31 0.55 0.5 0.32 0.56 0.15 0.21 0.13 0.44 0.51 0.76 0.16 0.38 0.17 0.4 0.52 0.76 1.0 0.38 0.75 0.74 0.73 0.67 0.52 0.35 0.77
0.27 0.45 0.52 0.7 0.13 0.26 0.8 0.33 0.29 0.3 0.27 0.36 0.29 1.0 0.08 0.13 0.07 0.44 0.54 0.17 0.14 0.39 0.11 0.42 0.06 0.39 0.23 0.42 0.19 0.46 0.4 0.49 0.34 0.59 0.5
0.14 0.28 0.18 0.39 0.22 0.23 0.55 0.34 0.41 0.4 0.34 0.29 0.74 0.98 0.07 0.2 0.04 0.34 0.49 0.47 0.33 0.31 0.23 0.41 0.21 0.11 0.17 0.34 1.0 0.54 0.33 0.73 0.29 0.64 0.92
0.21 0.28 0.18 0.37 0.3 0.27 0.4 0.38 0.29 0.35 0.56 0.58 1.0 1.0 0.13 0.22 0.03 0.45 0.47 0.43 0.43 0.35 0.68 0.4 0.22 0.08 0.03 0.51 0.76 0.26 0.12 0.43 0.51 0.5 0.46
0.11 0.2 0.1 0.24 0.36 0.15 0.28 0.19 0.18 0.24 1.0 0.59 0.64 0.63 0.14 0.18 0.06 0.33 0.62 0.69 0.6 0.57 0.64 0.22 0.31 0.11 0.11 0.29 0.67 0.21 0.19 0.25 0.5 0.07 0.15
0.01 0.13 0.03 0.19 0.09 0.05 0.28 0.05 0.19 0.17 0.09 0.12 0.42 1.0 0.14 0.2 0.25 0.29 0.44 0.34 0.12 0.14 0.13 0.49 0.09 0.06 0.03 0.06 0.1 0.22 0.1 0.26 0.11 0.2 0.48
0.23 0.37 0.2 0.41 0.3 0.33 0.56 0.6 0.33 0.4 0.36 0.54 0.48 1.0 0.26 0.2 0.29 0.63 0.67 0.33 0.28 0.27 0.28 0.46 0.52 0.26 0.21 0.34 0.76 0.83 0.69 0.92 0.55 0.47 0.72
0.19 0.23 0.24 0.3 0.27 0.25 0.32 0.26 0.29 0.35 0.4 0.33 0.23 0.36 0.12 0.13 0.04 0.3 0.52 0.35 0.69 0.45 1.0 0.18 0.27 0.08 0.04 0.5 0.65 0.24 0.17 0.4 0.31 0.15 0.52
0.07 0.09 0.07 0.1 0.11 0.09 0.17 0.06 0.11 0.14 0.13 0.15 0.14 1.0 0.02 0.04 0.0 0.18 0.22 0.16 0.2 0.17 0.45 0.08 0.08 0.02 0.01 0.16 0.17 0.11 0.05 0.21 0.13 0.08 0.29
0.27 0.48 0.28 0.54 0.2 0.32 0.73 0.39 0.37 0.51 0.74 0.72 0.45 0.71 0.09 0.16 0.06 0.47 0.35 0.3 0.4 0.51 0.35 0.15 0.16 0.07 0.16 0.59 0.91 0.53 0.31 0.73 0.67 0.6 1.0
0.05 0.1 0.1 0.13 0.17 0.06 0.18 0.13 0.12 0.15 0.12 0.14 0.21 1.0 0.04 0.04 0.03 0.14 0.18 0.2 0.19 0.19 0.39 0.18 0.2 0.02 0.01 0.16 0.29 0.33 0.16 0.42 0.17 0.08 0.18
0.03 0.04 0.03 0.05 0.19 0.04 0.06 0.04 0.07 0.06 0.24 0.4 0.3 1.0 0.02 0.03 0.0 0.1 0.11 0.31 0.38 0.16 0.35 0.06 0.04 0.05 0.03 0.08 0.18 0.08 0.04 0.1 0.2 0.43 0.45
0.18 0.27 0.23 0.34 0.21 0.21 0.39 0.23 0.34 0.33 0.36 0.46 0.28 1.0 0.1 0.19 0.03 0.38 0.32 0.35 0.48 0.48 0.67 0.29 0.27 0.13 0.15 0.62 0.32 0.69 0.58 0.58 0.43 0.29 0.65
0.12 0.16 0.21 0.26 0.14 0.1 0.27 0.2 0.23 0.25 0.45 0.34 0.54 1.0 0.07 0.12 0.05 0.29 0.23 0.44 0.41 0.35 0.61 0.14 0.24 0.09 0.05 0.36 0.43 0.23 0.11 0.32 0.22 0.18 0.15
0.08 0.16 0.03 0.1 0.32 0.07 0.31 0.05 0.16 0.15 0.3 0.23 0.32 0.66 0.12 0.07 0.07 0.71 0.67 0.03 0.35 0.49 0.25 0.03 0.03 0.01 0.01 1.0 0.19 0.24 0.04 0.43 0.18 0.13 0.03
0.11 0.15 0.17 0.21 0.25 0.16 0.26 0.15 0.27 0.25 0.2 0.26 0.58 1.0 0.1 0.1 0.07 0.44 0.29 0.59 0.29 0.29 0.29 0.45 0.41 0.2 0.22 0.18 0.86 0.58 0.41 0.74 0.23 0.34 0.31
0.2 0.3 0.11 0.25 0.08 0.2 0.51 0.16 0.3 0.25 0.07 0.12 0.07 0.84 0.03 0.07 0.01 0.33 0.32 0.39 0.53 0.24 0.32 0.08 0.02 0.02 0.03 0.35 1.0 0.17 0.07 0.35 0.08 0.15 0.02
0.04 0.04 0.03 0.06 0.17 0.05 0.09 0.06 0.07 0.06 0.34 0.52 0.29 1.0 0.05 0.05 0.02 0.27 0.15 0.18 0.57 0.26 0.58 0.23 0.22 0.03 0.01 0.14 0.27 0.17 0.05 0.27 0.33 0.24 0.47
0.09 0.3 0.07 0.32 0.11 0.28 0.9 0.11 0.34 0.3 0.05 0.04 0.33 0.76 0.03 0.09 0.01 1.0 0.51 0.33 0.32 0.23 0.23 0.09 0.03 0.1 0.08 0.06 0.64 0.17 0.13 0.3 0.04 0.06 0.02
0.07 0.28 0.08 0.3 0.18 0.16 0.43 0.14 0.22 0.2 0.49 0.45 0.32 1.0 0.04 0.06 0.03 0.25 0.27 0.2 0.17 0.25 0.2 0.11 0.09 0.04 0.03 0.2 0.21 0.16 0.1 0.25 0.39 0.17 0.35
0.15 0.25 0.18 0.34 0.25 0.28 0.47 0.34 0.35 0.37 0.26 0.31 0.89 0.67 0.1 0.12 0.07 0.28 0.34 0.27 0.25 0.36 0.28 0.42 0.2 0.04 0.04 0.21 0.5 0.42 0.34 0.46 0.3 0.33 1.0
0.18 0.3 0.15 0.31 0.14 0.18 0.34 0.15 0.19 0.22 0.32 0.54 0.4 1.0 0.13 0.14 0.06 0.48 0.4 0.2 0.34 0.29 0.22 0.18 0.05 0.06 0.03 0.34 0.1 0.28 0.19 0.38 0.42 0.26 0.24
0.18 0.3 0.32 0.32 0.21 0.28 0.43 0.24 0.42 0.52 0.16 0.18 0.1 0.15 0.08 0.27 0.04 0.27 0.26 0.21 0.87 0.37 1.0 0.23 0.38 0.1 0.06 0.1 0.28 0.14 0.13 0.15 0.16 0.24 0.08
0.3 0.39 0.29 0.34 0.27 0.31 0.45 0.22 0.35 0.37 0.55 0.61 0.29 0.4 0.28 0.24 0.21 0.38 0.46 0.29 0.17 0.37 0.15 0.24 0.09 0.23 0.18 0.28 0.41 0.34 0.33 0.44 0.57 0.75 1.0
0.38 0.57 0.43 0.55 0.57 0.59 0.6 0.41 0.72 0.72 0.58 0.48 0.9 0.29 0.16 0.28 0.08 0.54 0.36 0.45 0.24 0.5 0.29 0.45 0.27 0.23 0.21 0.83 0.75 0.74 0.59 1.0 0.53 0.86 0.79
0.3 0.5 0.32 0.57 0.24 0.42 0.75 0.44 0.58 0.63 0.29 0.31 1.0 0.45 0.18 0.29 0.08 0.48 0.52 0.42 0.53 0.4 0.59 0.67 0.4 0.19 0.15 0.3 0.77 0.55 0.35 0.81 0.31 0.67 0.67
0.27 0.46 0.25 0.53 0.22 0.35 0.64 0.37 0.4 0.5 0.46 0.59 0.56 0.46 0.17 0.29 0.14 0.46 0.52 0.19 0.17 0.28 0.17 0.31 0.18 0.09 0.08 0.32 0.53 0.34 0.38 0.46 0.62 0.48 1.0
0.13 0.13 0.07 0.12 0.43 0.11 0.14 0.1 0.13 0.16 0.47 0.31 1.0 0.43 0.15 0.2 0.05 0.2 0.47 0.17 0.06 0.13 0.09 0.09 0.16 0.05 0.04 0.72 0.71 0.09 0.07 0.16 0.34 0.28 0.36
0.11 0.21 0.14 0.29 0.28 0.16 0.45 0.3 0.23 0.23 0.34 0.39 0.26 1.0 0.08 0.09 0.08 0.36 0.53 0.23 0.15 0.21 0.24 0.32 0.32 0.18 0.18 0.35 0.35 0.53 0.39 0.47 0.33 0.31 0.58
0.29 0.47 0.31 0.49 0.33 0.32 0.54 0.28 0.34 0.51 0.58 0.77 0.37 1.0 0.14 0.28 0.08 0.47 0.41 0.5 0.44 0.71 0.63 0.29 0.22 0.04 0.09 0.45 0.63 0.49 0.26 0.81 0.74 0.32 0.36
0.08 0.19 0.06 0.12 0.12 0.11 0.29 0.09 0.13 0.12 0.08 0.11 0.16 1.0 0.04 0.02 0.06 0.54 0.29 0.04 0.16 0.12 0.14 0.22 0.14 0.0 0.0 0.14 0.22 0.21 0.11 0.3 0.07 0.17 0.03
0.14 0.2 0.2 0.28 0.16 0.13 0.31 0.41 0.15 0.2 0.38 0.44 0.44 1.0 0.13 0.13 0.13 0.33 0.52 0.31 0.19 0.26 0.18 0.25 0.2 0.1 0.09 0.39 0.74 0.28 0.18 0.36 0.4 0.13 0.44
0.03 0.05 0.06 0.09 0.04 0.03 0.07 0.08 0.08 0.09 0.21 0.2 0.11 0.1 0.04 0.04 0.01 0.18 0.15 0.06 0.74 0.3 1.0 0.12 0.18 0.01 0.01 0.05 0.25 0.1 0.02 0.19 0.17 0.19 0.23
0.19 0.39 0.23 0.54 0.58 0.39 0.69 0.32 0.55 0.53 0.76 0.34 0.43 0.37 0.1 0.18 0.1 0.32 0.43 0.19 0.39 0.6 0.46 0.32 0.42 0.48 0.42 0.15 0.54 0.73 0.45 1.0 0.28 0.89 0.64
0.31 0.38 0.28 0.34 0.3 0.31 0.31 0.22 0.33 0.35 0.57 0.62 0.38 0.49 0.26 0.29 0.1 0.47 0.34 0.25 1.0 0.66 0.83 0.32 0.29 0.22 0.12 0.2 0.2 0.18 0.17 0.24 0.51 0.62 0.37
0.1 0.12 0.11 0.14 0.19 0.16 0.18 0.21 0.19 0.24 0.35 0.27 1.0 0.74 0.05 0.09 0.03 0.34 0.23 0.6 0.17 0.29 0.22 0.37 0.11 0.2 0.19 0.05 0.76 0.39 0.4 0.36 0.26 0.21 0.37
0.07 0.09 0.08 0.12 0.08 0.08 0.18 0.06 0.19 0.17 0.05 0.05 0.09 0.32 0.05 0.08 0.03 0.26 0.13 0.28 0.65 0.21 1.0 0.15 0.29 0.1 0.17 0.19 0.39 0.18 0.11 0.24 0.05 0.06 0.19
0.15 0.22 0.23 0.27 0.09 0.17 0.23 0.75 0.17 0.21 0.25 0.17 1.0 0.78 0.04 0.08 0.01 0.19 0.41 0.14 0.18 0.15 0.19 0.1 0.04 0.09 0.03 0.1 0.69 0.14 0.1 0.16 0.15 0.32 0.15
0.02 0.02 0.05 0.04 0.15 0.04 0.05 0.07 0.03 0.06 0.09 0.13 0.54 1.0 0.02 0.01 0.01 0.09 0.12 0.18 0.04 0.1 0.07 0.09 0.04 0.02 0.01 0.0 0.22 0.15 0.04 0.26 0.09 0.13 0.0
0.02 0.03 0.01 0.03 0.04 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.15 0.19 0.34 1.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.13 0.18 0.11 0.02 0.11 0.02 0.04 0.03 0.01 0.01 0.08 0.04 0.01 0.11 0.1 0.18 0.19
0.17 0.25 0.19 0.36 0.21 0.19 0.39 0.24 0.24 0.35 0.53 0.55 0.8 0.31 0.11 0.15 0.14 0.27 0.41 0.32 0.19 0.37 0.17 0.26 0.15 0.22 0.13 0.51 1.0 0.33 0.24 0.42 0.58 0.5 0.93
0.05 0.11 0.06 0.12 0.35 0.11 0.17 0.14 0.17 0.19 0.78 0.94 0.9 0.54 0.06 0.09 0.02 0.43 0.44 0.18 0.2 0.26 0.25 0.28 0.28 0.26 0.17 0.15 0.34 0.19 0.23 0.18 1.0 0.42 0.94
0.08 0.12 0.08 0.14 0.25 0.09 0.16 0.07 0.17 0.13 0.19 0.25 0.75 1.0 0.03 0.05 0.01 0.11 0.15 0.4 0.42 0.3 0.78 0.13 0.07 0.15 0.12 0.26 0.2 0.15 0.05 0.27 0.22 0.12 0.19
0.11 0.21 0.08 0.26 0.33 0.14 0.44 0.17 0.2 0.19 0.22 0.31 0.94 1.0 0.09 0.12 0.09 0.32 0.34 0.35 0.15 0.27 0.23 0.33 0.35 0.3 0.27 0.28 0.23 0.38 0.21 0.55 0.37 0.11 0.31
0.1 0.14 0.08 0.14 0.21 0.12 0.18 0.13 0.15 0.15 0.68 0.87 1.0 0.78 0.08 0.08 0.03 0.34 0.38 0.23 0.32 0.42 0.29 0.3 0.16 0.28 0.57 0.12 0.36 0.45 0.33 0.64 0.78 0.42 0.6
0.05 0.13 0.06 0.19 0.1 0.08 0.29 0.11 0.13 0.12 0.49 0.4 0.31 0.29 0.03 0.07 0.02 0.24 0.31 0.35 0.08 0.19 0.11 0.19 0.14 0.96 1.0 0.17 0.34 0.41 0.34 0.43 0.41 0.22 0.32
0.06 0.13 0.08 0.17 0.19 0.12 0.28 0.16 0.23 0.28 0.59 0.68 0.67 0.56 0.11 0.28 0.02 0.52 0.48 0.45 1.0 0.5 0.99 0.22 0.19 0.14 0.08 0.2 0.36 0.09 0.09 0.11 0.69 0.38 0.74
0.07 0.16 0.07 0.22 0.41 0.12 0.27 0.16 0.18 0.29 0.9 1.0 0.73 0.16 0.11 0.12 0.06 0.31 0.45 0.25 0.43 0.5 0.49 0.3 0.12 0.32 0.17 0.32 0.31 0.12 0.14 0.08 0.91 0.15 0.46
0.09 0.22 0.22 0.37 0.2 0.23 0.45 0.46 0.28 0.33 0.42 0.38 0.48 1.0 0.06 0.11 0.05 0.3 0.34 0.46 0.2 0.41 0.32 0.29 0.25 0.09 0.39 0.23 0.56 0.53 0.35 0.66 0.44 0.35 0.84
0.14 0.28 0.13 0.34 0.23 0.21 0.55 0.19 0.28 0.27 0.39 0.49 0.58 1.0 0.11 0.1 0.14 0.4 0.47 0.44 0.1 0.12 0.13 0.25 0.24 0.14 0.11 0.18 0.4 0.43 0.25 0.58 0.55 0.26 0.37
0.36 0.43 0.35 0.49 0.54 0.44 0.49 0.37 0.51 0.52 0.63 0.73 1.0 1.0 0.11 0.23 0.04 0.42 0.6 0.48 0.36 0.46 0.97 0.27 0.45 0.15 0.17 0.63 0.8 0.37 0.27 0.56 0.71 0.71 0.92
0.14 0.28 0.12 0.27 0.32 0.18 0.32 0.13 0.21 0.23 0.63 0.57 0.44 0.3 0.12 0.2 0.18 0.29 0.47 0.52 0.4 0.43 0.45 0.48 0.64 0.07 0.07 0.1 0.96 0.36 0.31 0.39 0.49 0.39 1.0
0.06 0.14 0.09 0.2 0.12 0.09 0.21 0.14 0.1 0.1 0.56 0.4 0.33 1.0 0.05 0.15 0.04 0.44 0.57 0.13 0.45 0.51 0.45 0.22 0.15 0.02 0.02 0.04 0.56 0.38 0.19 0.57 0.26 0.67 0.19
0.19 0.3 0.15 0.3 0.28 0.16 0.33 0.09 0.2 0.25 0.45 0.52 0.63 0.88 0.07 0.23 0.09 0.17 0.48 0.4 0.07 0.22 0.07 0.14 0.18 0.08 0.04 0.27 1.0 0.29 0.24 0.56 0.52 0.5 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)