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Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.44 0.12 0.23 -0.21 -0.27 0.43 0.08 0.04 0.52 0.47 -1.25 -1.04 -4.19 0.59 0.66 -0.36 1.25 -0.05 0.46 -0.23 -3.8 -1.75 -4.28 0.37 -1.28 0.3 0.67 -0.11 -0.38 0.55 0.53 0.13 -0.98 0.57 -1.19
-0.48 -0.06 -0.32 0.22 -0.09 0.37 0.16 -0.16 0.85 0.58 -0.04 0.24 -0.53 -1.76 -0.67 -0.49 -1.15 -1.06 -0.37 1.1 -2.69 -1.24 -2.21 -0.52 -1.76 1.45 0.51 -0.05 -0.19 -0.07 0.49 -1.7 0.61 -0.15 1.38
0.13 0.59 0.51 0.83 -0.52 0.61 0.85 0.39 0.58 0.79 0.47 0.97 -0.9 -0.68 -0.65 -0.92 0.27 -0.46 0.53 0.44 -2.58 -1.14 -2.24 -0.61 -2.65 -0.98 -1.6 -1.54 0.42 -0.28 -0.31 -0.7 1.03 0.34 -0.95
-0.01 -0.16 0.1 -0.06 0.0 0.34 -0.09 0.19 0.01 1.24 0.32 1.56 -1.32 0.65 -0.73 -0.66 0.18 -0.56 0.69 1.02 -3.01 -0.83 -3.24 -1.51 -3.17 -1.29 -1.85 -0.62 1.18 -1.23 -0.58 -2.0 0.63 1.41 -3.56
0.5 -0.06 0.12 -0.76 -0.3 0.4 -0.79 -0.12 -0.86 1.02 0.86 2.32 -1.72 0.7 -1.37 -1.63 -1.14 -0.13 -0.2 1.13 -2.3 0.21 -2.06 -2.4 -3.54 -1.19 -1.01 -1.26 0.12 -0.97 -0.52 -1.02 1.45 0.97 -2.6
-0.07 0.39 -0.19 0.44 -0.37 0.03 0.82 -0.24 0.04 0.07 -0.18 -0.89 0.05 -1.57 -0.86 -0.77 -1.21 0.1 0.45 0.61 -1.47 -0.76 -1.45 -0.08 -0.74 0.14 0.24 0.61 -0.05 0.81 0.44 0.97 -0.86 0.14 0.41
0.1 0.18 0.03 0.08 -0.27 0.2 0.23 -0.67 0.68 0.46 0.75 1.06 -1.98 -0.33 -0.12 -0.7 -0.07 -0.32 0.21 -0.15 -0.21 0.88 -0.51 -0.5 -1.85 0.6 -0.54 -0.48 -1.61 -0.48 0.05 -1.1 1.26 0.55 -3.73
0.13 -0.37 -0.22 -0.66 0.66 0.4 -0.79 -0.39 0.38 -0.04 0.36 0.19 -0.4 -1.87 -0.08 -0.77 0.74 -0.35 -0.53 -0.09 -1.73 -1.04 -1.51 0.63 -0.84 0.46 0.29 0.28 -0.36 0.49 0.74 -0.45 0.52 0.73 0.4
0.7 -1.38 -0.02 -1.91 -0.75 -0.18 -2.47 -0.06 -1.05 -0.82 -0.64 -0.44 -0.52 -4.3 0.7 -0.55 0.39 -0.73 -1.1 -1.21 -1.3 -1.04 -2.35 1.41 0.91 1.02 0.71 0.19 -0.15 0.75 1.12 0.0 -0.59 1.3 0.59
-0.02 0.09 -0.02 -0.08 0.15 0.13 0.25 -0.57 0.52 0.53 -0.77 -0.2 -0.65 -1.43 0.03 -0.23 -0.72 0.14 0.33 0.61 0.04 0.43 -0.1 0.24 -0.94 -0.73 -0.93 -0.05 -0.5 0.27 -0.09 0.48 -0.32 0.73 0.52
-0.08 -0.54 -1.1 -1.04 0.25 0.48 -0.89 -0.65 1.26 0.54 -0.18 -1.24 -0.69 -4.85 -1.55 -2.11 -3.02 -2.22 -1.82 1.02 -1.45 -0.94 -1.7 -0.08 0.43 0.8 1.4 1.98 0.07 -1.05 -0.76 -3.32 -1.19 -1.27 2.24
0.61 0.39 0.41 -0.41 -0.27 0.44 -0.56 -0.04 0.02 0.25 0.83 0.75 -1.59 -1.23 0.62 -0.43 0.85 0.01 0.13 -0.69 -3.13 -1.75 -3.74 0.05 -1.22 -0.06 -0.18 -0.98 -0.77 0.12 0.18 -0.62 1.04 1.23 -0.22
0.3 0.35 0.06 0.15 -0.02 0.26 -0.12 -0.15 0.52 0.45 -0.74 -0.84 -0.18 -1.73 0.21 0.03 0.19 0.07 -0.33 0.4 -1.12 -1.09 -1.02 0.51 0.17 0.53 -0.03 0.3 0.5 -0.2 0.37 -0.75 -0.57 0.38 -0.11
-0.51 -0.45 -0.29 -0.58 -0.47 -0.45 -1.15 0.92 -0.46 -0.63 0.11 0.1 -0.55 -1.62 0.06 0.19 -0.44 -0.1 0.87 -1.92 -1.28 -0.33 -1.84 1.58 -0.79 -0.14 0.47 -0.34 -1.01 0.74 0.88 -0.25 -0.36 1.7 -0.34
-0.11 -0.88 -0.08 -0.9 -0.08 0.21 -1.0 -0.07 -0.28 -0.3 0.05 0.12 -0.82 0.34 -0.06 -1.12 -1.1 0.06 0.27 -0.12 -0.65 -0.79 -0.46 0.63 0.34 -0.11 0.21 0.59 0.13 -0.1 -0.07 0.07 0.37 0.54 1.44
0.11 0.3 -0.08 0.01 -0.43 0.29 -0.05 0.32 -0.11 0.08 -0.35 -0.11 0.09 -1.04 0.14 -0.49 0.14 0.04 0.62 0.32 0.08 0.05 -0.86 -0.11 -1.88 0.06 0.01 0.09 -0.05 0.58 0.53 0.12 -0.02 -0.16 -0.41
-0.84 0.11 -0.3 0.19 -0.47 -0.27 0.51 0.43 0.09 -0.06 -0.08 0.45 0.01 -1.43 -0.28 -0.36 0.13 -0.46 0.74 -0.59 -1.57 -0.6 -2.0 0.61 -1.57 0.11 0.69 -0.12 -0.19 0.86 0.95 -0.58 0.06 1.02 -0.88
-0.7 0.29 -0.13 0.27 0.34 -0.1 -0.02 -0.13 -0.16 0.21 -0.34 -0.02 -0.33 1.03 -0.49 0.32 0.08 -0.26 0.5 0.75 -1.01 -0.43 -0.74 0.19 -0.65 0.18 -0.9 -0.93 0.37 0.43 0.59 0.29 -0.1 -0.11 -1.66
0.6 0.43 0.33 0.26 -0.05 0.55 -0.06 0.32 1.22 0.93 0.25 -0.09 -2.24 -1.86 0.54 0.2 -0.13 -0.51 0.5 -1.35 -2.06 -0.06 -2.5 0.78 -1.27 -1.38 -1.05 0.66 -0.47 0.61 -0.02 -0.22 -0.3 0.14 -2.32
0.4 0.5 0.13 0.05 0.4 0.81 -0.07 -0.66 0.61 0.58 0.11 -0.07 -2.12 -2.6 0.99 -0.01 1.67 0.04 0.29 0.37 -4.03 -2.01 -4.14 -0.41 -2.38 0.17 -0.09 -0.93 -0.7 0.17 0.72 -1.01 0.21 0.38 -3.6
-0.55 -0.49 -0.51 -0.53 0.14 -0.36 -0.3 -0.91 -0.47 -0.3 -0.01 0.48 -0.04 0.86 -1.0 -1.26 -0.05 -0.95 0.03 -0.01 -0.6 0.22 -0.78 -0.05 -1.7 0.28 0.38 -0.49 0.39 1.0 0.47 1.29 0.4 0.34 0.31
0.1 0.2 -0.38 -0.05 -0.18 0.06 0.08 -0.4 0.15 -0.0 -0.3 0.52 -0.21 -0.78 -0.35 -0.7 -0.17 -0.14 0.55 -0.09 -0.19 0.56 -0.34 0.22 -1.61 -0.6 -0.69 0.36 -0.61 1.01 0.38 0.25 0.17 0.61 -0.17
0.03 0.16 -0.09 0.32 -0.04 0.01 0.28 -0.26 -0.06 0.08 -0.49 -0.2 -0.9 -0.58 0.1 -0.69 0.24 -0.11 0.34 -0.08 0.38 0.81 -0.28 0.26 -1.34 0.1 -0.5 0.01 -0.58 0.18 0.32 -0.28 -0.28 0.85 0.09
-0.45 0.53 0.13 0.41 0.5 0.93 0.3 -0.33 0.49 0.6 -0.23 -0.42 0.07 -2.16 0.51 0.27 1.26 -0.11 -0.29 1.13 -4.38 -2.71 -3.66 -0.49 -1.27 -0.3 0.05 -2.04 -1.26 0.35 1.19 -2.96 0.54 -0.6 -0.82
0.05 0.06 -0.09 0.05 0.28 0.3 -0.14 -0.62 0.38 0.41 -1.51 -1.19 -1.0 -2.44 0.24 0.06 0.04 0.06 0.09 1.19 -0.71 -0.49 -0.64 0.17 0.0 0.59 0.42 -0.54 -0.79 0.64 0.34 0.83 -0.99 0.13 -0.35
-1.03 -0.24 -0.45 -0.28 1.04 0.72 -0.53 -1.27 1.68 0.9 -0.22 -0.34 0.43 -0.71 -0.07 -0.89 0.6 -0.01 -0.18 1.09 -1.54 -0.81 -0.8 0.68 0.23 0.41 -0.52 -0.14 -0.04 -1.22 -0.38 -2.16 0.06 -1.13 -0.92
-0.08 0.26 0.28 0.37 -0.2 0.38 -0.06 1.41 0.02 0.31 -1.46 -1.25 -0.51 -0.09 0.4 0.17 0.74 -0.0 0.64 0.42 -1.21 -0.29 -1.76 0.07 -1.6 0.37 0.3 -1.36 -0.61 0.3 0.75 -0.44 -1.14 0.02 -2.01
0.26 -0.17 -0.06 -0.24 0.63 0.6 -0.04 -0.36 1.02 0.54 -0.84 -0.83 -0.51 -2.46 0.42 0.22 0.95 -0.06 0.13 -0.11 -2.9 -1.53 -2.07 0.13 -0.22 0.21 0.18 0.66 -0.03 -0.27 0.41 -1.79 -0.51 0.3 0.56
-0.0 0.37 -0.26 0.3 0.05 0.22 0.67 -0.47 0.41 0.39 -0.74 -0.32 0.3 -0.55 -0.61 -1.1 -0.48 -0.14 0.23 0.3 0.31 0.77 0.31 0.31 -0.89 -0.93 -1.13 -0.02 -0.74 0.15 -0.16 0.49 -0.64 0.94 -0.93
-0.17 0.25 -0.39 0.18 0.17 0.25 0.63 0.04 0.45 0.48 -0.11 0.14 -0.44 -1.42 -0.26 -0.83 0.64 -0.12 0.54 -1.16 -5.38 -2.15 -4.63 0.03 -1.53 0.23 0.3 0.06 -0.02 0.88 0.99 0.54 0.15 0.34 -0.47
-0.89 -0.66 -0.17 0.07 -0.76 -0.13 0.31 0.42 0.41 0.48 -1.58 -1.36 -0.91 -0.87 0.11 0.53 0.28 -0.49 0.45 0.3 -0.17 -0.46 -1.05 0.96 0.5 0.98 0.28 -0.92 -0.09 0.39 0.7 -0.03 -1.06 -0.67 0.13
-0.5 -0.21 -0.45 -0.18 -0.18 -0.12 -0.12 -0.37 -0.07 -0.24 -0.25 -0.09 -0.47 1.08 -0.09 -0.99 -0.36 -0.02 0.1 0.27 -1.95 -1.09 -1.21 1.03 0.78 0.26 0.85 -1.56 -0.05 0.84 0.82 0.58 -0.36 0.16 -2.07
-1.46 -0.95 -0.94 -0.61 0.3 -0.09 -0.57 -1.09 0.2 0.39 1.28 0.8 -2.8 0.24 0.36 -1.11 -0.77 0.05 -0.82 0.02 -1.54 -1.52 0.26 0.01 0.67 -1.23 -3.15 1.28 -0.32 -1.76 -1.41 -2.34 1.07 -1.28 2.36
0.5 -0.59 0.04 -1.3 -0.66 -0.07 -1.45 -0.87 -0.42 -0.37 -0.3 0.34 -0.96 -2.67 0.24 -1.22 1.1 -0.61 -1.11 -1.38 -2.19 -1.2 -2.75 1.01 -0.39 1.28 1.36 -0.51 -0.52 0.92 1.19 0.51 0.14 1.43 -3.36
0.24 0.55 0.29 0.53 -0.46 0.21 0.04 -0.46 0.73 0.64 -0.1 -0.19 -1.19 -1.56 -0.19 -0.09 -0.55 -0.18 -0.14 -0.48 -0.82 -0.71 -0.9 0.36 -0.47 0.14 0.46 0.45 0.06 0.07 0.35 -0.22 0.33 0.15 0.12
0.66 0.25 0.29 -0.15 0.15 0.81 -0.19 -0.16 0.81 0.59 -0.44 -0.01 0.07 -1.18 -0.43 -1.75 0.1 -0.56 -0.25 -0.38 -1.26 -0.38 -1.65 0.06 -1.55 0.74 0.39 -0.48 -0.25 0.23 0.44 -0.24 -0.04 1.07 -0.44
-0.02 0.21 -0.14 0.22 -0.38 0.39 0.17 -0.07 0.4 0.48 0.36 0.49 -0.45 -0.77 -0.17 -0.19 -2.4 0.16 0.11 -0.41 -0.24 0.21 0.01 -0.11 -0.65 -1.0 -1.43 0.66 -0.74 -0.44 -0.56 -0.45 0.55 0.44 1.27
0.29 0.01 0.6 0.33 -0.2 0.14 -0.26 -0.76 0.43 0.29 -0.5 -0.13 -2.25 -1.11 0.48 0.26 0.14 -0.06 0.39 0.24 -1.86 -0.93 -1.72 0.44 -0.56 0.13 -0.26 0.04 -0.04 -0.16 0.17 -0.4 0.59 1.05 0.23
0.34 0.18 0.63 0.18 0.04 0.73 -0.12 0.55 0.47 0.48 -0.02 -0.29 -0.34 -2.45 0.6 -0.25 0.92 -0.47 -0.44 0.2 -3.52 -1.9 -4.27 -0.37 -1.8 0.21 -0.24 0.72 -0.71 -0.37 -0.17 -1.34 0.46 0.77 0.65
-0.29 0.27 -0.39 0.26 -0.41 -0.01 0.39 -0.88 0.46 0.47 0.55 0.58 -0.79 -1.35 0.08 0.26 -1.18 0.16 0.32 0.52 -1.18 0.08 -0.77 -0.4 -1.33 0.22 -0.26 0.32 -0.33 -0.71 0.05 -1.33 1.11 1.2 -1.17
-0.47 -0.31 -0.46 -0.21 -0.06 -0.09 -0.22 -0.05 -0.01 -0.03 -0.05 0.14 -0.47 0.47 0.13 -0.36 0.31 -0.05 0.37 0.76 -2.55 -1.18 -2.1 0.24 -0.15 -0.37 -0.01 -0.13 0.29 0.65 0.58 0.46 0.1 0.43 0.31
-0.11 0.57 -0.31 0.29 -0.2 0.04 -0.13 -0.86 0.16 0.44 -0.35 -0.45 -0.18 -1.75 -0.1 0.16 -0.19 -0.43 -0.59 0.72 -2.74 -2.19 -2.72 -0.11 -0.34 1.73 1.13 0.54 0.06 -0.84 0.08 -1.6 -0.11 0.13 0.87
-0.1 -0.28 -0.31 -0.33 -0.29 0.16 -0.34 -0.36 0.6 0.38 -1.02 -0.8 0.1 -1.65 0.05 -0.83 -0.98 0.45 0.34 0.94 -0.18 -0.52 -0.07 0.79 0.85 -0.91 -0.74 -0.93 0.11 0.48 -0.2 0.67 -0.8 0.9 0.14
-0.01 0.13 0.26 0.53 -0.48 -0.12 0.19 -0.68 0.74 1.0 0.26 0.72 -3.34 -1.86 -0.45 -0.7 -0.5 -0.58 -0.72 -0.91 -2.35 -0.37 -2.69 -0.34 -1.6 0.77 0.81 1.23 -0.54 0.68 0.46 0.07 1.0 -0.16 -1.15
0.5 0.41 0.42 0.4 -0.42 0.65 0.17 0.02 0.27 0.64 -0.68 -0.57 -1.84 -1.06 0.48 -0.51 0.97 -0.13 -0.31 0.26 -0.63 -0.09 -0.85 1.22 -2.21 0.24 -0.7 -1.41 -0.71 0.73 0.99 -0.47 -0.27 -0.78 -3.31
0.14 -0.44 0.11 -0.44 0.03 0.18 -1.19 -0.52 -0.28 -0.4 -0.19 -0.73 -0.29 -2.94 -0.15 -1.75 -1.92 -0.07 -1.04 0.66 1.25 -0.01 1.23 0.45 1.21 0.86 0.58 -1.24 0.31 -0.16 0.41 -0.45 -0.28 -0.56 -0.45
0.14 0.05 -0.32 -0.28 0.0 0.97 0.24 -0.03 0.12 0.59 -0.43 -0.15 -2.61 -2.76 -0.46 -2.15 -0.18 -0.36 0.4 0.82 -1.21 0.39 -1.43 -0.49 -1.73 -0.08 0.5 -0.32 0.42 1.4 1.49 0.6 0.02 -2.16 -4.34
0.06 -0.32 0.1 -0.54 0.36 0.57 -0.6 -0.1 0.76 0.43 -0.14 -0.84 -1.47 -2.28 0.25 -0.6 0.71 -0.42 0.41 -0.03 0.31 0.69 0.04 0.57 -0.23 -0.18 -0.55 -0.2 -0.42 0.39 0.44 -0.04 -0.56 0.26 -0.97
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-0.8 -0.31 -1.19 -0.32 -0.58 -0.32 -0.35 -0.64 -0.51 -0.39 1.88 1.99 -0.19 -0.0 -0.79 -0.25 -3.41 0.15 0.2 1.24 -0.51 0.39 -0.53 -2.11 -3.05 -1.78 -1.72 -0.66 -0.19 -1.5 -1.76 -1.03 1.22 1.51 -0.21
-0.25 -0.06 -0.16 -0.02 0.33 0.05 -0.19 0.26 0.12 -0.0 -0.04 -0.1 -0.42 -1.64 0.1 -0.11 0.49 -0.5 0.19 -0.3 -1.21 0.17 -1.25 0.21 0.27 0.36 0.14 -0.11 -0.52 0.38 0.5 0.09 -0.12 0.22 0.7
-0.36 -0.0 -0.05 0.31 -0.25 -0.15 0.58 -0.33 0.19 0.19 -0.58 -0.19 -0.97 -1.32 0.1 0.17 0.12 -0.0 0.41 0.3 -1.16 -0.19 -0.92 0.91 -0.33 -0.76 -1.16 0.11 0.13 0.77 0.46 0.96 0.07 -0.07 -0.64
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-0.36 -0.31 -0.91 -0.58 -0.02 0.34 0.03 -0.28 0.28 0.24 -1.4 -1.28 1.26 -0.87 -0.56 -1.09 -2.55 0.44 0.59 0.23 0.87 -0.07 1.22 0.65 0.35 -1.36 -1.47 -0.84 0.28 0.49 -0.42 0.99 -1.17 0.12 -1.0
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.