Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G04200.1	0.57	0.46	0.49	0.36	0.35	0.57	0.44	0.43	0.6	0.58	0.18	0.2	0.02	0.63	0.66	0.33	1.0	0.41	0.58	0.36	0.03	0.13	0.02	0.54	0.17	0.52	0.67	0.39	0.32	0.61	0.61	0.46	0.21	0.62	0.18
PTI_01G00660.1	0.26	0.35	0.29	0.43	0.34	0.47	0.41	0.33	0.66	0.55	0.36	0.43	0.25	0.11	0.23	0.26	0.16	0.18	0.28	0.78	0.06	0.15	0.08	0.26	0.11	1.0	0.52	0.35	0.32	0.35	0.51	0.11	0.56	0.33	0.96
PTI_01G04720.1	0.54	0.74	0.7	0.87	0.34	0.75	0.89	0.64	0.73	0.85	0.68	0.96	0.26	0.31	0.31	0.26	0.59	0.36	0.71	0.67	0.08	0.22	0.1	0.32	0.08	0.25	0.16	0.17	0.65	0.41	0.4	0.3	1.0	0.62	0.25
PTI_01G06400.1	0.34	0.3	0.36	0.32	0.34	0.43	0.32	0.39	0.34	0.8	0.42	1.0	0.14	0.53	0.2	0.21	0.38	0.23	0.55	0.68	0.04	0.19	0.04	0.12	0.04	0.14	0.09	0.22	0.77	0.14	0.23	0.08	0.52	0.9	0.03
PTI_01G06410.1	0.28	0.19	0.22	0.12	0.16	0.26	0.12	0.18	0.11	0.41	0.36	1.0	0.06	0.33	0.08	0.06	0.09	0.18	0.17	0.44	0.04	0.23	0.05	0.04	0.02	0.09	0.1	0.08	0.22	0.1	0.14	0.1	0.55	0.39	0.03
PTI_02G00460.1	0.49	0.67	0.45	0.69	0.4	0.52	0.91	0.43	0.53	0.54	0.45	0.28	0.53	0.17	0.28	0.3	0.22	0.55	0.7	0.78	0.18	0.3	0.19	0.49	0.31	0.56	0.6	0.78	0.49	0.9	0.7	1.0	0.28	0.56	0.68
PTI_02G00820.1	0.45	0.47	0.43	0.44	0.35	0.48	0.49	0.26	0.67	0.57	0.7	0.87	0.11	0.33	0.38	0.26	0.4	0.34	0.48	0.38	0.36	0.77	0.29	0.3	0.12	0.63	0.29	0.3	0.14	0.3	0.43	0.2	1.0	0.61	0.03
PTI_02G05760.1	0.66	0.46	0.51	0.38	0.95	0.79	0.35	0.46	0.78	0.58	0.77	0.68	0.46	0.16	0.57	0.35	1.0	0.47	0.41	0.56	0.18	0.29	0.21	0.93	0.33	0.82	0.73	0.73	0.47	0.84	1.0	0.44	0.86	0.99	0.79
PTI_02G06330.1	0.61	0.15	0.37	0.1	0.22	0.33	0.07	0.36	0.18	0.21	0.24	0.28	0.26	0.02	0.61	0.26	0.49	0.23	0.18	0.16	0.15	0.18	0.07	1.0	0.71	0.77	0.62	0.43	0.34	0.63	0.82	0.38	0.25	0.93	0.57
PTI_02G06440.1	0.6	0.64	0.59	0.57	0.67	0.66	0.72	0.41	0.86	0.87	0.35	0.52	0.39	0.22	0.62	0.51	0.37	0.67	0.76	0.92	0.62	0.81	0.56	0.71	0.31	0.36	0.32	0.58	0.43	0.73	0.57	0.84	0.48	1.0	0.87
PTI_04G00490.1	0.2	0.15	0.1	0.1	0.25	0.3	0.11	0.13	0.51	0.31	0.19	0.09	0.13	0.01	0.07	0.05	0.03	0.05	0.06	0.43	0.08	0.11	0.07	0.2	0.29	0.37	0.56	0.84	0.22	0.1	0.12	0.02	0.09	0.09	1.0
PTI_04G01050.1	0.65	0.56	0.57	0.32	0.35	0.58	0.29	0.41	0.43	0.51	0.75	0.71	0.14	0.18	0.66	0.32	0.77	0.43	0.47	0.26	0.05	0.13	0.03	0.44	0.18	0.41	0.38	0.22	0.25	0.46	0.48	0.28	0.87	1.0	0.36
PTI_04G03980.1	0.85	0.88	0.72	0.77	0.68	0.83	0.63	0.62	0.99	0.95	0.41	0.38	0.61	0.21	0.8	0.71	0.79	0.72	0.55	0.91	0.32	0.33	0.34	0.98	0.78	1.0	0.67	0.85	0.98	0.6	0.89	0.41	0.47	0.9	0.64
PTI_06G01860.1	0.22	0.22	0.25	0.21	0.22	0.22	0.14	0.58	0.22	0.2	0.33	0.33	0.21	0.1	0.32	0.35	0.23	0.29	0.56	0.08	0.13	0.24	0.09	0.92	0.18	0.28	0.42	0.24	0.15	0.51	0.56	0.26	0.24	1.0	0.24
PTI_06G02310.1	0.34	0.2	0.35	0.2	0.35	0.43	0.18	0.35	0.3	0.3	0.38	0.4	0.21	0.47	0.35	0.17	0.17	0.38	0.44	0.34	0.23	0.21	0.27	0.57	0.47	0.34	0.42	0.55	0.4	0.34	0.35	0.39	0.47	0.53	1.0
PTI_07G00810.1	0.7	0.8	0.62	0.66	0.49	0.79	0.63	0.81	0.61	0.69	0.51	0.6	0.69	0.32	0.72	0.46	0.72	0.67	1.0	0.81	0.69	0.68	0.36	0.6	0.18	0.68	0.66	0.7	0.63	0.98	0.94	0.71	0.64	0.58	0.49
PTI_07G02670.1	0.28	0.53	0.4	0.56	0.36	0.41	0.7	0.66	0.52	0.47	0.47	0.68	0.5	0.18	0.41	0.38	0.54	0.36	0.83	0.33	0.17	0.33	0.12	0.75	0.17	0.53	0.8	0.45	0.43	0.89	0.95	0.33	0.51	1.0	0.27
PTI_08G01630.1	0.3	0.6	0.45	0.59	0.62	0.46	0.48	0.45	0.44	0.57	0.39	0.48	0.39	1.0	0.35	0.61	0.52	0.41	0.69	0.83	0.24	0.36	0.29	0.56	0.31	0.55	0.26	0.26	0.63	0.66	0.74	0.6	0.46	0.45	0.16
PTI_08G04290.1	0.65	0.58	0.54	0.51	0.42	0.63	0.41	0.54	1.0	0.82	0.51	0.4	0.09	0.12	0.63	0.49	0.39	0.3	0.61	0.17	0.1	0.41	0.08	0.74	0.18	0.17	0.21	0.68	0.31	0.65	0.42	0.37	0.35	0.47	0.09
PTI_09G01080.1	0.42	0.45	0.34	0.33	0.42	0.55	0.3	0.2	0.48	0.47	0.34	0.3	0.07	0.05	0.62	0.31	1.0	0.32	0.38	0.41	0.02	0.08	0.02	0.24	0.06	0.35	0.29	0.17	0.19	0.35	0.52	0.16	0.36	0.41	0.03
PTI_09G01090.1	0.28	0.29	0.29	0.28	0.45	0.32	0.33	0.22	0.3	0.33	0.41	0.57	0.4	0.74	0.2	0.17	0.4	0.21	0.42	0.41	0.27	0.48	0.24	0.4	0.13	0.5	0.53	0.29	0.54	0.82	0.57	1.0	0.54	0.52	0.51
PTI_09G03100.1	0.53	0.57	0.38	0.48	0.44	0.52	0.53	0.38	0.55	0.5	0.4	0.71	0.43	0.29	0.39	0.3	0.44	0.45	0.73	0.47	0.44	0.73	0.39	0.58	0.16	0.33	0.31	0.64	0.33	1.0	0.65	0.59	0.56	0.76	0.44
PTI_09G03540.1	0.57	0.62	0.52	0.69	0.54	0.56	0.68	0.46	0.53	0.59	0.4	0.48	0.3	0.37	0.59	0.35	0.66	0.52	0.7	0.53	0.73	0.98	0.46	0.67	0.22	0.6	0.39	0.56	0.37	0.63	0.69	0.46	0.46	1.0	0.59
PTI_09G03850.1	0.31	0.6	0.46	0.55	0.59	0.79	0.51	0.33	0.59	0.63	0.36	0.31	0.44	0.09	0.59	0.5	1.0	0.39	0.34	0.91	0.02	0.06	0.03	0.3	0.17	0.34	0.43	0.1	0.17	0.53	0.95	0.05	0.61	0.28	0.24
PTI_09G03990.1	0.45	0.46	0.41	0.45	0.53	0.54	0.4	0.29	0.57	0.58	0.15	0.19	0.22	0.08	0.52	0.46	0.45	0.46	0.46	1.0	0.27	0.31	0.28	0.49	0.44	0.66	0.59	0.3	0.25	0.68	0.55	0.78	0.22	0.48	0.34
PTI_10G00990.1	0.15	0.26	0.23	0.26	0.64	0.52	0.22	0.13	1.0	0.58	0.27	0.25	0.42	0.19	0.3	0.17	0.47	0.31	0.28	0.66	0.11	0.18	0.18	0.5	0.37	0.42	0.22	0.28	0.3	0.13	0.24	0.07	0.33	0.14	0.17
PTI_10G03790.1	0.36	0.45	0.46	0.49	0.33	0.49	0.36	1.0	0.38	0.47	0.14	0.16	0.27	0.36	0.5	0.42	0.63	0.38	0.59	0.5	0.16	0.31	0.11	0.4	0.12	0.49	0.46	0.15	0.25	0.46	0.64	0.28	0.17	0.38	0.09
PTI_11G03490.1	0.59	0.44	0.47	0.42	0.77	0.75	0.48	0.39	1.0	0.72	0.28	0.28	0.35	0.09	0.66	0.58	0.95	0.47	0.54	0.46	0.07	0.17	0.12	0.54	0.42	0.57	0.56	0.78	0.48	0.41	0.66	0.14	0.35	0.61	0.73
PTI_11G03530.1	0.52	0.67	0.44	0.64	0.54	0.61	0.83	0.38	0.69	0.68	0.31	0.42	0.64	0.36	0.34	0.24	0.37	0.47	0.61	0.64	0.64	0.89	0.65	0.65	0.28	0.27	0.24	0.51	0.31	0.58	0.47	0.73	0.33	1.0	0.27
PTI_11G03840.1	0.45	0.6	0.38	0.57	0.56	0.6	0.77	0.52	0.69	0.7	0.47	0.55	0.37	0.19	0.42	0.28	0.78	0.46	0.73	0.22	0.01	0.11	0.02	0.51	0.17	0.59	0.62	0.52	0.49	0.92	1.0	0.73	0.56	0.63	0.36
PTI_12G01630.1	0.27	0.32	0.45	0.53	0.3	0.46	0.63	0.68	0.67	0.7	0.17	0.2	0.27	0.28	0.54	0.73	0.61	0.36	0.69	0.62	0.45	0.37	0.24	0.99	0.72	1.0	0.61	0.27	0.47	0.66	0.82	0.49	0.24	0.32	0.55
PTI_13G03690.1	0.33	0.41	0.35	0.42	0.42	0.44	0.44	0.37	0.45	0.4	0.4	0.45	0.34	1.0	0.44	0.24	0.37	0.47	0.51	0.57	0.12	0.22	0.2	0.97	0.81	0.57	0.85	0.16	0.46	0.85	0.84	0.71	0.37	0.53	0.11
PTI_15G00800.1	0.07	0.1	0.1	0.13	0.24	0.18	0.13	0.09	0.22	0.26	0.47	0.34	0.03	0.23	0.25	0.09	0.11	0.2	0.11	0.2	0.07	0.07	0.23	0.2	0.31	0.08	0.02	0.47	0.16	0.06	0.07	0.04	0.41	0.08	1.0
PTI_15G03140.1	0.53	0.25	0.38	0.15	0.23	0.35	0.14	0.2	0.28	0.29	0.3	0.47	0.19	0.06	0.44	0.16	0.8	0.24	0.17	0.14	0.08	0.16	0.05	0.75	0.28	0.9	0.95	0.26	0.26	0.7	0.84	0.53	0.41	1.0	0.04
PTI_15G03340.1	0.71	0.88	0.74	0.87	0.44	0.7	0.62	0.44	1.0	0.94	0.56	0.53	0.26	0.2	0.53	0.57	0.41	0.53	0.54	0.43	0.34	0.37	0.32	0.77	0.43	0.67	0.83	0.82	0.63	0.63	0.77	0.52	0.76	0.67	0.65
PTI_16G02980.1	0.75	0.57	0.58	0.43	0.53	0.83	0.42	0.43	0.84	0.72	0.35	0.47	0.5	0.21	0.35	0.14	0.51	0.32	0.4	0.37	0.2	0.37	0.15	0.5	0.16	0.79	0.62	0.34	0.4	0.56	0.65	0.4	0.46	1.0	0.35
PTI_16G02990.1	0.41	0.48	0.38	0.49	0.32	0.55	0.47	0.4	0.55	0.58	0.53	0.59	0.3	0.24	0.37	0.36	0.08	0.46	0.45	0.31	0.35	0.48	0.42	0.39	0.27	0.21	0.15	0.66	0.25	0.31	0.28	0.3	0.61	0.57	1.0
PTI_17G01690.1	0.59	0.49	0.73	0.61	0.42	0.53	0.4	0.28	0.65	0.59	0.34	0.44	0.1	0.22	0.67	0.58	0.53	0.46	0.63	0.57	0.13	0.25	0.15	0.66	0.33	0.53	0.4	0.5	0.47	0.43	0.54	0.37	0.73	1.0	0.57
PTI_18G02210.1	0.67	0.6	0.82	0.6	0.54	0.88	0.49	0.77	0.73	0.74	0.52	0.43	0.42	0.1	0.8	0.45	1.0	0.38	0.39	0.61	0.05	0.14	0.03	0.41	0.15	0.61	0.45	0.87	0.32	0.41	0.47	0.21	0.73	0.9	0.83
PTI_18G02560.1	0.35	0.52	0.33	0.52	0.33	0.43	0.57	0.24	0.6	0.6	0.64	0.65	0.25	0.17	0.46	0.52	0.19	0.49	0.54	0.62	0.19	0.46	0.25	0.33	0.17	0.5	0.36	0.54	0.34	0.27	0.45	0.17	0.93	1.0	0.19
PTI_18G02760.1	0.42	0.48	0.43	0.51	0.57	0.55	0.51	0.57	0.59	0.58	0.57	0.65	0.43	0.82	0.65	0.46	0.73	0.57	0.76	1.0	0.1	0.26	0.14	0.69	0.53	0.46	0.59	0.54	0.72	0.93	0.88	0.81	0.63	0.79	0.73
PTI_19G02140.1	0.28	0.45	0.24	0.37	0.26	0.31	0.28	0.17	0.34	0.41	0.24	0.22	0.27	0.09	0.28	0.34	0.26	0.22	0.2	0.5	0.05	0.07	0.05	0.28	0.24	1.0	0.66	0.44	0.31	0.17	0.32	0.1	0.28	0.33	0.55
PTI_19G02790.1	0.49	0.43	0.42	0.41	0.43	0.58	0.41	0.41	0.79	0.68	0.26	0.3	0.56	0.17	0.54	0.29	0.26	0.71	0.66	1.0	0.46	0.37	0.5	0.9	0.94	0.28	0.31	0.27	0.56	0.73	0.46	0.83	0.3	0.97	0.58
PTI_20G01940.1	0.42	0.47	0.51	0.62	0.31	0.39	0.49	0.27	0.72	0.85	0.51	0.7	0.04	0.12	0.31	0.26	0.3	0.28	0.26	0.23	0.08	0.33	0.07	0.34	0.14	0.73	0.75	1.0	0.29	0.68	0.59	0.45	0.86	0.38	0.19
PTI_20G01970.1	0.61	0.57	0.58	0.57	0.32	0.67	0.48	0.44	0.52	0.67	0.27	0.29	0.12	0.21	0.6	0.3	0.84	0.39	0.35	0.51	0.28	0.4	0.24	1.0	0.09	0.51	0.26	0.16	0.26	0.71	0.85	0.31	0.36	0.25	0.04
PTI_21G00480.1	0.46	0.31	0.45	0.31	0.43	0.48	0.18	0.29	0.35	0.32	0.37	0.25	0.34	0.05	0.38	0.13	0.11	0.4	0.21	0.66	1.0	0.42	0.98	0.57	0.97	0.77	0.63	0.18	0.52	0.38	0.56	0.31	0.34	0.29	0.31
PTI_21G02320.1	0.39	0.37	0.29	0.29	0.36	0.7	0.42	0.35	0.39	0.54	0.26	0.32	0.06	0.05	0.26	0.08	0.31	0.28	0.47	0.63	0.15	0.47	0.13	0.25	0.11	0.34	0.5	0.29	0.48	0.94	1.0	0.54	0.36	0.08	0.02
PTI_22G00240.1	0.61	0.47	0.63	0.41	0.76	0.88	0.39	0.55	1.0	0.8	0.54	0.33	0.21	0.12	0.7	0.39	0.96	0.44	0.78	0.58	0.73	0.95	0.61	0.88	0.5	0.52	0.4	0.51	0.44	0.77	0.8	0.58	0.4	0.71	0.3
PTI_23G00050.1	0.34	0.22	0.24	0.15	0.75	0.56	0.16	0.23	0.48	0.31	0.48	0.31	0.54	0.19	1.0	0.36	0.59	0.24	0.28	0.5	0.48	0.27	0.43	0.36	0.41	0.92	0.75	0.51	0.25	0.31	0.41	0.19	0.61	0.21	0.26
PTI_23G02200.1	0.14	0.2	0.11	0.2	0.17	0.2	0.2	0.16	0.18	0.19	0.93	1.0	0.22	0.25	0.15	0.21	0.02	0.28	0.29	0.59	0.18	0.33	0.17	0.06	0.03	0.07	0.08	0.16	0.22	0.09	0.07	0.12	0.59	0.71	0.22
PTI_25G00450.1	0.52	0.59	0.55	0.61	0.77	0.64	0.54	0.74	0.67	0.62	0.6	0.58	0.46	0.2	0.66	0.57	0.87	0.44	0.71	0.5	0.27	0.69	0.26	0.72	0.74	0.8	0.68	0.57	0.43	0.8	0.88	0.66	0.57	0.72	1.0
PTI_27G00280.1	0.4	0.51	0.5	0.64	0.43	0.46	0.77	0.41	0.59	0.59	0.34	0.45	0.26	0.21	0.55	0.58	0.56	0.51	0.68	0.63	0.23	0.45	0.27	0.96	0.41	0.3	0.23	0.56	0.56	0.88	0.71	1.0	0.54	0.49	0.33
PTI_28G01000.1	0.44	0.53	0.48	0.59	0.39	0.53	0.71	0.66	0.53	0.6	0.28	0.39	0.3	0.28	0.6	0.42	0.85	0.49	0.89	0.64	0.32	0.5	0.2	0.8	0.32	0.65	0.74	0.82	0.64	0.75	0.65	0.72	0.41	0.6	1.0
PTI_28G01370.1	0.33	0.34	0.22	0.28	0.41	0.53	0.43	0.35	0.51	0.49	0.16	0.17	1.0	0.23	0.28	0.2	0.07	0.57	0.63	0.49	0.76	0.4	0.97	0.66	0.53	0.16	0.15	0.23	0.51	0.59	0.31	0.83	0.19	0.46	0.21
PTI_29G00200.1	0.54	0.38	0.36	0.21	0.23	0.29	0.1	0.11	0.18	0.24	0.41	1.0	0.11	0.2	0.56	0.5	0.56	0.3	0.31	0.41	0.13	0.29	0.14	0.16	0.07	0.13	0.11	0.68	0.52	0.15	0.27	0.07	0.8	0.61	0.05
PTI_30G00380.1	0.29	0.27	0.29	0.25	0.5	0.38	0.28	0.37	0.39	0.35	0.43	0.59	0.41	0.29	0.36	0.35	0.71	0.22	0.35	0.54	0.03	0.14	0.04	0.6	0.21	0.62	0.52	0.32	0.56	0.52	0.55	0.32	0.56	0.72	1.0
PTI_31G00240.1	0.36	0.24	0.29	0.13	0.27	0.61	0.08	0.23	0.24	0.26	0.24	0.27	0.3	0.04	1.0	0.25	0.95	0.36	0.27	0.48	0.13	0.18	0.1	0.4	0.11	0.37	0.25	0.01	0.28	0.52	0.87	0.14	0.39	0.57	0.04
PTI_32G00250.1	0.36	0.39	0.4	0.33	0.49	0.42	0.28	0.44	0.38	0.33	0.34	0.44	0.18	0.21	0.28	0.16	0.46	0.17	0.27	0.17	0.3	0.46	0.22	0.56	0.28	0.93	1.0	0.35	0.55	0.88	0.83	0.64	0.42	0.97	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)