Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.2 0.11 0.0 0.53 0.2 0.27 0.21 0.17 0.25 0.39 0.24 0.1 0.23 0.22 0.26 0.12 0.28 0.34 0.07 0.29 1.0 0.08 0.58 0.12 0.16 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.72 0.03 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14 0.05 0.05 0.09 0.05 0.19 0.07 0.17 0.12 0.15 0.23 0.15 0.48 0.18 0.15 1.0 0.19 0.12 0.09 0.06 0.01
0.03 0.0 0.0 0.18 0.18 0.12 0.06 0.16 0.13 0.14 0.1 0.05 0.08 0.05 0.01 0.1 0.25 0.51 0.11 0.0 1.0 0.12 0.36 0.12 0.26 0.09
0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.35 0.45 0.0 1.0 0.0 0.74 0.02 0.21 0.22
0.11 0.0 0.08 0.23 0.03 0.08 0.09 0.0 0.02 0.11 0.01 0.06 0.03 0.1 0.02 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.2 0.16 0.07 0.15 0.33 0.05 0.05 0.03 0.05 0.22 0.0 0.17 0.18 0.27 0.15 1.0 0.0 0.36 0.13 0.17 0.04
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.13 0.11 0.11 1.0 0.0 0.08 0.08 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.27 0.03 0.25 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.04 0.04 0.0 0.23 0.17 0.18 0.14 0.38 1.0 0.0 0.27 0.08 0.15 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.13 0.14 0.2 0.33 0.1 0.03 0.03 0.03 0.17 0.23 0.69 0.0 0.27 0.46 1.0 0.0 0.72 0.18 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.12 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.14 0.0 0.0 0.15 0.1 0.0 0.06 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.15 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.35 0.21 0.24 0.11 0.15 0.12 0.09 0.07 0.27 0.46 0.23 0.12 0.0 0.21 1.0 0.0 0.24 0.17 0.14 0.08
0.07 0.0 0.0 0.26 0.06 0.0 0.03 0.04 0.04 0.19 0.03 0.03 0.09 0.04 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 1.0 0.16 0.21 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.29 0.09 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.17
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.77 0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.25 0.0 0.0 0.1 0.05 0.03 0.07 0.05 0.36 0.09 0.05 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.17
0.03 0.15 0.0 0.19 0.07 0.08 0.15 0.11 0.12 0.23 0.08 0.03 0.08 0.06 0.07 0.18 0.24 0.51 0.1 0.2 1.0 0.2 0.28 0.09 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.07 0.04 0.09 0.45 0.12 0.12 0.07 0.09 0.03 0.39 1.0 0.32 0.0 0.28 0.79 0.04 0.42 0.17 0.05 0.13
0.0 0.38 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.31 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.17 0.16 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.14 0.05 0.04 0.0 0.0 0.1 0.06 0.05 0.06 0.06 0.0 0.14 0.14 0.0 0.37 1.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.07
0.33 0.1 0.08 0.14 0.09 0.21 0.24 0.09 0.14 0.14 0.2 0.13 0.2 0.17 0.11 0.52 0.43 0.59 0.31 0.56 1.0 0.22 0.85 0.25 0.49 0.39
0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.05 0.1 0.0 0.16 0.08 0.02 0.03 0.13 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.31 1.0 0.57 0.72 0.0 0.04 0.0
0.25 0.0 0.0 0.14 0.16 0.2 0.13 0.09 0.13 0.15 0.31 0.12 0.19 0.12 0.13 0.0 0.0 0.4 0.36 0.21 1.0 0.13 0.16 0.06 0.15 0.08
0.0 0.09 0.0 0.09 0.15 0.08 0.03 0.05 0.08 0.12 0.09 0.06 0.03 0.07 0.06 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 1.0 0.0 0.49 0.1 0.08 0.08
0.06 0.3 0.0 0.15 0.22 0.18 0.14 0.04 0.15 0.59 0.15 0.04 0.05 0.11 0.04 0.0 0.34 0.34 0.28 0.28 1.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.0 0.03 0.0 0.09
0.03 0.0 0.0 0.03 0.13 0.14 0.11 0.05 0.14 0.38 0.11 0.07 0.07 0.1 0.15 0.39 0.22 0.42 0.58 0.33 1.0 0.24 0.1 0.07 0.18 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.1 0.66 0.0 0.0 0.12 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.1 0.51 0.0 0.41 0.08 0.16 0.21 0.05 0.29 0.28 0.21 0.23 0.14 0.1 0.24 0.13 0.12 0.31 0.51 0.28 1.0 0.17 0.44 0.19 0.07 0.07
0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.02 0.02 0.1 0.0 0.05 0.05 0.03 0.02 0.05 0.0 0.0 0.18 0.27 0.15 1.0 0.0 0.72 0.18 0.04 0.13
0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.19 0.12 0.04 0.0 0.0
0.11 0.05 0.0 0.05 0.13 0.37 0.07 0.12 0.07 0.15 0.26 0.16 0.18 0.18 0.03 0.14 0.16 0.61 0.08 0.24 1.0 0.09 0.11 0.13 0.13 0.18
0.08 0.0 0.0 0.25 0.08 0.18 0.05 0.05 0.09 0.0 0.12 0.1 0.08 0.13 0.16 0.0 0.0 0.36 0.36 0.1 1.0 0.0 0.24 0.03 0.11 0.14
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.21 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 0.13 0.0 1.0 0.0 0.03 0.07 0.29 0.0
0.33 0.04 0.0 0.21 0.27 0.21 0.19 0.23 0.27 0.0 0.3 0.17 0.17 0.18 0.13 0.19 0.14 0.43 0.0 0.62 1.0 0.0 0.5 0.3 0.22 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.72 0.03 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.07 0.11 0.04 0.0 0.28 0.0 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.46 0.0 0.0 0.25 1.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.06
0.2 0.0 0.0 0.3 0.12 0.14 0.12 0.15 0.16 0.22 0.21 0.05 0.24 0.06 0.29 0.0 0.23 0.36 0.18 0.51 1.0 0.0 0.36 0.31 0.14 0.2
0.13 0.0 0.0 0.03 0.09 0.14 0.14 0.03 0.15 0.0 0.18 0.11 0.12 0.06 0.14 0.21 0.15 0.24 0.12 0.07 1.0 0.26 0.24 0.2 0.17 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.2 0.04 0.12 0.13 0.21 0.04 0.14 0.1 0.1 0.19 0.14 0.0 0.22 0.12 1.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0
0.33 0.01 0.0 0.21 0.19 0.13 0.19 0.16 0.21 0.13 0.24 0.16 0.18 0.23 0.26 0.25 0.33 0.44 0.07 0.04 1.0 0.0 0.44 0.14 0.15 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.06 0.07 0.0 0.24 0.07 0.0 0.19 0.13 0.0 0.92 0.0 0.0 0.21 1.0 0.38 0.79 0.04 0.06 0.06
0.11 0.0 0.0 0.03 0.13 0.1 0.05 0.1 0.13 0.0 0.11 0.06 0.06 0.13 0.03 0.19 0.21 0.36 0.11 0.55 1.0 0.0 0.58 0.04 0.22 0.22
0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.05 0.0 0.14 0.05 0.33 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.34 0.36 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.42 0.17
0.14 0.06 0.0 0.03 0.17 0.21 0.1 0.13 0.14 0.14 0.25 0.2 0.13 0.25 0.04 0.29 0.17 0.57 0.15 0.36 1.0 0.24 0.42 0.07 0.28 0.27
0.38 0.0 0.0 0.05 0.03 0.12 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.07 0.08 0.0 0.15 0.69 0.24 0.0 0.1 1.0 0.0 0.12 0.11 0.25 0.14
0.23 0.62 0.0 0.0 0.36 0.36 0.41 0.26 0.22 0.82 0.36 0.29 0.36 0.23 0.24 0.12 0.0 0.27 0.14 0.08 1.0 0.14 0.54 0.26 0.42 0.21
0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.14 0.22 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.28 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09 0.14 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0
0.12 0.09 0.0 0.43 0.22 0.22 0.32 0.39 0.37 0.97 0.26 0.15 0.3 0.27 0.46 0.63 0.89 0.49 0.45 0.58 1.0 0.27 0.83 0.4 0.13 0.24
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.19 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.21 0.09 0.02 0.02 0.06 0.05 0.0 0.21 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0 0.48 0.34 0.0 0.14 0.93 0.59 1.0 0.07 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.54 0.0 1.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.0 0.19 0.0 0.44 0.1 0.0 0.04 0.07 0.0 0.31 0.23 0.24 0.0 0.21 1.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.03 0.0 0.0 0.24 0.36 0.21 1.0 0.0 0.24 0.0 0.33 0.23
0.02 0.04 0.0 0.0 0.08 0.08 0.09 0.09 0.1 0.08 0.13 0.06 0.14 0.11 0.1 0.35 0.09 0.23 0.27 0.19 1.0 0.36 0.4 0.14 0.06 0.04
0.24 0.1 0.0 0.16 0.23 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.31 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.06 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.2 0.34 0.0 0.0 1.0 0.0 0.33 0.0 0.06 0.0
0.05 0.06 0.0 0.09 0.08 0.12 0.08 0.07 0.08 0.26 0.08 0.14 0.08 0.1 0.07 0.0 0.14 0.07 0.22 0.31 1.0 0.0 0.22 0.12 0.22 0.1
0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.06 0.14 0.04 0.07 0.16 0.14 0.13 0.06 0.04 0.08 0.37 0.66 0.0 0.11 1.0 0.1 0.13 0.1 0.06 0.15
0.03 0.15 0.0 0.23 0.1 0.11 0.08 0.08 0.05 0.14 0.14 0.15 0.14 0.09 0.11 0.23 0.3 0.55 0.14 0.32 1.0 0.0 0.4 0.08 0.09 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.11 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.2 0.46 0.0 0.0 0.08 0.2 0.46 0.05 0.07 0.33 0.11 0.15 0.21 0.08 0.12 0.23 0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.54 0.26 0.29 0.34
0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.05 0.1 0.33 0.05 0.0 0.05 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.36 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.08 0.0 0.0 0.0 0.22 0.06 0.08 0.15 0.14 0.0 0.13 0.0 0.06 0.06 0.08 0.19 0.14 0.87 0.0 0.15 1.0 0.23 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.16 0.0 0.03 0.07 0.07 0.22 0.09 0.12 0.61 0.11 0.03 0.23 0.21 0.26 0.0 0.38 0.04 0.0 0.16 1.0 0.0 0.5 0.08 0.04 0.06
0.0 0.04 0.0 0.12 0.1 0.19 0.18 0.13 0.14 0.0 0.21 0.14 0.2 0.04 0.14 0.0 0.0 0.22 0.0 0.16 1.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.38
0.2 0.13 0.0 0.07 0.17 0.08 0.28 0.18 0.21 0.0 0.19 0.09 0.09 0.06 0.11 0.0 0.24 0.35 0.0 0.01 1.0 0.0 0.67 0.15 0.08 0.05
0.0 0.11 0.0 0.18 0.13 0.04 0.1 0.05 0.13 0.0 0.03 0.19 0.09 0.05 0.17 0.62 0.25 0.0 0.0 0.2 0.56 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.0 0.36 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.11 0.16 0.14 0.0 0.04 0.03 0.05 0.1 0.08 0.31 0.08 0.4 0.0 0.0 1.0 0.26 0.4 0.01 0.07 0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)