Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
2.36 1.36 0.0 6.24 2.32 3.19 2.54 2.05 3.0 4.66 2.82 1.19 2.72 2.6 3.13 1.46 3.26 4.0 0.86 3.4 11.82 0.9 6.8 1.44 1.84 2.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.26 1.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.42 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.47 0.0 6.1 0.28 0.0 0.0
0.54 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.59 0.0 0.0 0.0 3.75 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
5.09 0.0 0.0 0.0 4.47 5.42 2.03 2.02 3.37 2.06 7.3 2.54 6.23 4.66 5.76 8.73 5.76 18.18 6.82 5.79 37.64 7.2 4.51 3.3 2.36 0.27
0.96 0.0 0.0 6.75 6.86 4.39 2.22 6.16 5.03 5.22 3.95 2.03 3.08 1.88 0.38 3.69 9.31 19.45 4.32 0.0 37.8 4.56 13.73 4.45 9.95 3.36
0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.8 0.0 1.88 2.43 0.0 5.37 0.0 3.98 0.13 1.12 1.17
4.12 0.0 3.0 8.63 1.07 2.84 3.46 0.0 0.61 4.16 0.49 2.39 1.23 3.63 0.6 0.0 0.0 7.9 0.0 0.0 36.91 0.0 0.0 3.47 1.84 0.0
0.15 0.0 0.0 0.0 0.25 0.5 0.39 0.18 0.36 0.81 0.12 0.13 0.07 0.12 0.53 0.0 0.42 0.44 0.67 0.38 2.46 0.0 0.88 0.31 0.41 0.1
0.0 0.0 0.0 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.19 7.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.68 0.0 0.0 0.0 1.97 5.89 6.65 5.36 5.65 50.74 0.0 3.85 4.12 2.16 5.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 38.63 0.0 13.89 1.28 12.9 6.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 3.21 0.0 0.41 0.88 0.0 0.53 0.47 1.44 1.41 0.0 8.41 6.24 6.56 4.92 13.95 36.23 0.0 9.77 3.01 5.3 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.66 1.09 1.22 1.69 2.85 0.88 0.23 0.26 0.24 1.48 2.01 5.98 0.0 2.36 4.01 8.68 0.0 6.24 1.52 0.0 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 3.63 1.18 0.0 0.0 0.0 2.41 1.19 4.16 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.34 35.74 0.0 0.0 8.99 1.99 0.0
0.61 0.0 0.0 0.0 2.21 0.0 0.0 4.39 4.91 0.0 0.0 5.33 3.7 0.0 2.19 0.0 0.0 5.92 0.0 0.0 35.3 0.0 0.0 5.65 0.0 0.0
1.09 0.0 0.0 0.0 2.61 0.49 2.55 1.52 1.78 0.8 1.13 0.87 0.68 0.52 2.01 3.39 1.68 0.88 0.0 1.5 7.32 0.0 1.75 1.24 1.02 0.62
0.6 0.0 0.0 2.28 0.51 0.0 0.29 0.34 0.36 1.64 0.25 0.25 0.81 0.39 0.73 0.0 0.86 0.0 0.0 0.77 8.73 1.43 1.79 0.15 0.21 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.22 0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.42 0.13 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 1.45 0.0 0.0 0.0 0.36 0.25
0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.23 0.22 0.0 1.74 0.0 0.22 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.91 0.0 0.0 0.36 0.18 0.09 0.24 0.19 1.29 0.3 0.18 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.56 0.0 0.0 0.07 0.18 0.6
0.22 1.32 0.0 1.69 0.64 0.72 1.3 0.95 1.06 2.07 0.68 0.24 0.74 0.52 0.64 1.64 2.17 4.57 0.86 1.77 8.91 1.81 2.48 0.77 0.13 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.53 0.0 0.0 1.74 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.58 16.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.23 0.0 0.0 0.0 0.4 0.59 0.3 0.19 0.4 1.97 0.51 0.54 0.31 0.38 0.11 1.71 4.38 1.4 0.0 1.24 3.45 0.19 1.86 0.77 0.24 0.57
0.0 2.85 0.0 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.88 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.43 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.88 0.0 2.45 7.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 6.4 6.1 0.0 5.25 0.0 0.0 0.0 38.77 0.0 0.0 1.48 0.0 3.25
0.0 0.0 0.0 3.63 8.47 8.41 2.73 2.19 0.0 0.0 6.03 3.57 2.69 3.86 3.46 0.0 8.21 8.63 0.0 22.01 59.56 0.0 0.0 0.85 9.95 4.0
4.2 1.23 1.0 1.8 1.12 2.66 3.08 1.11 1.72 1.81 2.48 1.67 2.56 2.19 1.37 6.57 5.41 7.4 3.85 7.02 12.58 2.71 10.74 3.15 6.1 4.92
0.47 0.0 0.0 0.0 0.2 0.78 0.39 0.74 0.0 1.28 0.65 0.19 0.21 1.0 0.0 0.0 4.01 0.0 0.0 2.39 7.77 4.46 5.59 0.0 0.32 0.0
23.8 0.0 0.0 12.78 14.94 19.06 12.47 8.77 12.28 13.78 28.81 11.58 18.38 11.73 12.2 0.0 0.0 37.99 34.2 19.38 94.39 12.04 15.09 5.76 14.02 7.09
0.0 0.39 0.0 0.38 0.6 0.31 0.14 0.2 0.33 0.52 0.37 0.27 0.14 0.28 0.27 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 4.17 0.0 2.05 0.4 0.34 0.35
0.1 0.54 0.0 0.26 0.4 0.32 0.25 0.07 0.27 1.06 0.28 0.08 0.09 0.19 0.08 0.0 0.61 0.61 0.51 0.51 1.8 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0
6.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.0 0.0 0.0 1.5 0.0 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25.32 14.54 0.0 0.74 0.0 2.15
0.24 0.0 0.0 0.25 1.06 1.08 0.88 0.39 1.11 2.99 0.85 0.52 0.56 0.81 1.15 3.05 1.7 3.29 4.54 2.57 7.84 1.89 0.76 0.59 1.43 1.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.43 1.37 0.0 1.16 7.82 0.0 0.0 1.44 3.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56
2.41 11.82 0.0 9.49 1.84 3.66 4.85 1.08 6.68 6.53 4.87 5.25 3.16 2.24 5.41 3.08 2.65 7.21 11.67 6.5 22.99 3.81 10.21 4.37 1.66 1.68
2.89 0.0 0.0 0.0 2.44 4.85 1.18 1.12 4.65 0.0 2.61 2.38 1.29 1.08 2.31 0.0 0.0 8.63 12.95 7.34 47.65 0.0 34.28 8.41 1.99 6.03
0.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.19 0.0 0.0 1.13 0.22 0.14 0.05 0.0 0.0
2.94 1.24 0.0 1.23 3.28 9.58 1.96 3.03 1.77 3.97 6.92 4.28 4.64 4.75 0.78 3.74 4.16 16.04 2.19 6.2 26.16 2.31 2.9 3.39 3.36 4.77
3.6 0.0 0.0 11.32 3.77 8.11 2.22 2.03 4.02 0.0 5.52 4.31 3.36 6.0 7.15 0.0 0.0 16.16 16.16 4.58 44.6 0.0 10.69 1.36 4.97 6.28
0.0 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.32 0.0 0.0 0.0 27.52 0.0 6.6 0.61 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 8.32 2.8 6.99 6.34 0.0 0.0 0.12 0.0 4.63 1.87 1.6 0.0 0.0 0.0 0.0 10.29 66.14 0.0 0.0 3.97 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.68 0.0 0.0 3.94 0.0 1.36 1.4 0.0 1.22 3.9 0.0 0.0 9.73 0.0 0.0 40.3 0.0 9.66 3.86 0.0 0.0
0.58 0.0 0.0 6.02 0.84 0.01 0.11 0.96 0.0 0.0 0.65 0.0 1.9 0.54 0.0 0.0 0.0 6.47 3.76 0.0 28.23 0.0 0.86 1.91 8.26 0.0
44.51 5.14 0.0 28.64 36.87 28.49 25.16 31.37 36.69 0.0 39.66 22.81 22.37 23.54 16.91 24.93 18.51 58.4 0.0 82.73 134.34 0.0 67.65 40.08 29.17 34.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.13 2.45 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 42.2 24.22 30.36 1.28 3.72 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.09 0.13 0.05 0.0 0.34 0.0 0.0 0.06 0.07 0.06 0.0 0.56 0.0 0.0 0.31 1.21 0.0 0.0 0.16 0.08 0.08
8.38 0.0 0.0 12.65 4.93 5.63 5.05 6.33 6.75 9.09 8.75 2.07 9.99 2.64 12.12 0.0 9.53 15.04 7.52 21.31 41.52 0.0 14.93 13.08 5.78 8.21
16.27 0.0 0.0 4.09 10.94 16.34 16.58 3.84 18.33 0.0 21.3 13.49 14.45 6.89 17.0 24.93 18.51 29.2 14.6 8.27 120.91 30.84 28.99 24.1 20.2 29.6
0.0 0.0 0.0 0.0 6.09 0.0 14.69 2.7 8.8 9.88 15.48 3.06 10.19 7.59 7.29 13.96 10.36 0.0 16.35 9.26 75.19 0.0 10.82 3.77 0.0 0.0
54.26 2.14 0.0 34.07 30.79 21.53 31.58 26.63 34.91 22.04 40.0 25.98 30.45 38.1 43.52 41.53 53.95 72.05 12.16 6.89 165.23 0.0 72.43 22.61 24.29 28.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.34 0.0 0.0 0.0 4.85 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0
0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.45 0.4 0.41 0.0 1.48 0.43 0.0 1.17 0.82 0.0 5.75 0.0 0.0 1.29 6.26 2.4 4.95 0.26 0.35 0.36
1.01 0.0 0.0 0.27 1.18 0.9 0.46 0.92 1.13 0.0 0.94 0.53 0.5 1.18 0.26 1.65 1.84 3.22 0.97 4.92 8.88 0.0 5.11 0.34 1.93 1.96
0.0 0.0 0.0 0.45 0.45 0.15 0.0 0.41 0.14 0.97 0.0 0.15 0.0 0.0 0.14 0.0 1.02 1.07 0.0 0.0 2.96 0.0 0.0 0.3 1.25 0.5
2.64 1.25 0.0 0.61 3.33 3.97 1.87 2.57 2.73 2.62 4.74 3.84 2.51 4.79 0.84 5.56 3.21 11.09 2.89 6.97 19.3 4.58 8.14 1.31 5.33 5.17
37.92 0.0 0.0 5.09 3.42 11.85 3.84 0.0 4.89 0.0 0.0 6.65 7.39 8.38 0.0 15.51 69.06 24.21 0.0 10.29 100.25 0.0 12.02 11.41 25.11 14.11
5.27 14.0 0.0 0.0 8.05 8.03 9.25 5.82 4.96 18.56 8.15 6.54 8.06 5.1 5.5 2.62 0.0 6.14 3.07 1.74 22.61 3.24 12.2 5.86 9.44 4.77
2.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.28 1.31 2.16 0.75 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 3.9 0.0 9.63 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.37 8.11 1.54 1.21 0.0 0.0 0.0 1.4 0.0 2.72 3.94 12.47 0.0 0.0 0.0 0.0 26.87 0.0 28.99 1.59 0.0 0.0
3.36 2.7 0.0 12.4 6.46 6.44 9.29 11.36 10.58 28.07 7.42 4.26 8.79 7.67 13.19 18.1 25.7 14.13 12.9 16.71 28.83 7.84 23.79 11.52 3.68 6.89
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.25 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.3 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 7.82 3.45 0.88 0.87 2.34 1.67 0.0 7.8 5.81 4.67 0.0 0.0 0.0 17.69 12.41 0.0 5.27 34.25 21.69 36.95 2.64 0.0 1.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.38 0.0 0.0 2.79 0.0 5.14 0.0 1.85 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 1.35 0.0 1.85 0.0 4.36 1.01 0.0 0.35 0.67 0.0 3.08 2.28 2.4 0.0 2.04 9.95 0.0 0.0 0.63 0.55 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 0.0 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.99 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 1.87 0.97 0.0 0.0 7.11 10.67 6.05 29.45 0.0 7.06 0.0 9.84 6.68
0.25 0.6 0.0 0.0 1.37 1.37 1.57 1.57 1.72 1.36 2.24 1.05 2.26 1.82 1.71 5.78 1.43 3.76 4.51 3.19 16.6 5.95 6.72 2.29 1.04 0.7
6.14 2.42 0.0 4.07 5.92 0.0 0.0 0.0 4.21 0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 9.17 0.0 7.8 25.32 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0
0.65 0.55 0.0 0.0 0.0 1.39 0.53 0.0 0.49 0.0 0.21 0.0 0.41 0.0 0.23 0.0 1.92 3.21 0.0 0.0 9.42 0.0 3.12 0.0 0.54 0.0
0.78 1.02 0.0 1.47 1.31 1.94 1.27 1.2 1.25 4.22 1.25 2.28 1.25 1.58 1.09 0.0 2.21 1.16 3.49 4.95 16.06 0.0 3.47 1.88 3.49 1.63
1.64 0.0 0.0 0.0 1.43 2.05 1.11 2.34 0.76 1.2 2.82 2.39 2.23 1.1 0.6 1.45 6.39 11.28 0.0 1.92 17.17 1.79 2.25 1.79 1.04 2.65
0.23 1.22 0.0 1.83 0.77 0.83 0.61 0.63 0.41 1.1 1.08 1.19 1.12 0.67 0.86 1.85 2.35 4.32 1.13 2.53 7.9 0.0 3.16 0.63 0.7 1.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 4.23 0.0 0.0 0.7 0.72 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.44 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1
2.54 5.81 0.0 0.0 0.96 2.54 5.81 0.6 0.92 4.12 1.43 1.89 2.68 0.99 1.53 2.91 2.16 0.0 0.0 0.0 12.55 0.0 6.77 3.24 3.67 4.26
0.0 0.0 0.0 2.25 0.0 0.0 0.26 0.44 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 6.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.42 0.0 0.4 0.83 2.78 0.43 0.0 0.45 0.77 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.47 4.86 3.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 5.24 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.98 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41
0.14 0.0 0.0 0.0 0.39 0.11 0.14 0.26 0.24 0.0 0.22 0.0 0.11 0.1 0.14 0.32 0.24 1.52 0.0 0.27 1.74 0.4 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 1.17 0.0 0.0 0.0 0.0 10.73 23.83 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
1.43 2.5 0.0 0.46 1.1 1.11 3.39 1.34 1.92 9.56 1.66 0.5 3.57 3.34 4.13 0.0 5.99 0.62 0.0 2.49 15.64 0.0 7.85 1.28 0.59 0.99
0.0 0.11 0.0 0.36 0.3 0.54 0.51 0.38 0.4 0.0 0.6 0.42 0.57 0.12 0.4 0.0 0.0 0.64 0.0 0.46 2.89 0.0 0.0 0.03 0.2 1.1
2.24 1.53 0.0 0.77 1.94 0.91 3.14 2.06 2.41 0.0 2.19 1.03 1.05 0.66 1.25 0.0 2.78 4.02 0.0 0.17 11.34 0.0 7.61 1.71 0.88 0.51
0.0 1.19 0.0 1.83 1.36 0.42 1.0 0.49 1.35 0.0 0.35 1.95 0.91 0.56 1.77 6.45 2.62 0.02 0.0 2.09 5.8 0.0 10.41 0.0 0.4 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 5.24 0.0 0.0 0.84 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 4.92 15.96 0.0 5.74 0.57 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.94 0.0 0.0 0.0 0.38 2.29 1.89 2.64 2.38 0.0 0.6 0.57 0.83 1.77 1.27 5.23 1.29 6.8 0.0 0.0 16.89 4.31 6.75 0.11 1.25 1.27

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)