Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000029.1_cds_GFH06253.1_730 (GFH06253)	0.16	0.0	0.0	0.04	0.01	0.01	0.11	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.33	0.71	0.32	0.0	0.0	0.62	0.04	1.0	0.01	0.05	0.03
lcl\|BLLF01000040.1_cds_GFH06468.1_945 (GFH06468)	0.0	0.0	0.0	0.16	0.05	0.33	0.0	0.15	0.11	0.0	0.05	0.0	0.06	0.11	0.05	1.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.16	0.0	0.27
lcl\|BLLF01000070.1_cds_GFH07036.1_1513 (GFH07036)	0.1	0.08	0.04	0.05	0.07	0.09	0.19	0.09	0.19	0.2	0.07	0.07	0.1	0.07	0.17	1.0	0.6	0.27	0.18	0.08	0.08	0.3	0.7	0.08	0.16	0.38
lcl\|BLLF01000093.1_cds_GFH07419.1_1896 (GFH07419)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000167.1_cds_GFH08529.1_3006 (GFH08529)	0.04	0.13	0.0	0.32	0.16	0.23	0.17	0.05	0.08	0.11	0.11	0.07	0.21	0.12	0.14	0.32	0.12	0.38	0.0	0.32	0.17	1.0	0.68	0.06	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000195.1_cds_GFH08927.1_3404 (GFH08927)	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.86	0.46	0.14	0.05	0.04	0.19	0.17	1.0	0.01	0.03	0.03
lcl\|BLLF01000215.1_cds_GFH09192.1_3669 (GFH09192)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.04	0.14	0.59	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.26	0.0	0.22
lcl\|BLLF01000232.1_cds_GFH09411.1_3888 (GFH09411)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.21	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000279.1_cds_GFH09993.1_4470 (GFH09993)	0.06	0.11	0.08	0.05	0.06	0.06	0.09	0.03	0.11	0.11	0.05	0.07	0.08	0.02	0.14	0.91	0.86	0.16	0.05	0.03	0.39	0.27	1.0	0.01	0.19	0.13
lcl\|BLLF01000299.1_cds_GFH10245.1_4722 (GFH10245)	0.15	0.04	0.0	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.98	0.09	0.12	0.14	0.16	0.13	0.72	0.12	0.04	0.02
lcl\|BLLF01000334.1_cds_GFH10658.1_5135 (GFH10658)	0.64	0.0	0.0	0.0	0.15	0.23	0.11	0.12	0.23	0.3	0.27	0.2	0.23	0.13	0.11	0.27	0.05	0.38	0.14	0.33	0.56	0.38	1.0	0.25	0.3	0.1
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11544.1_6021 (GFH11544)	0.08	0.06	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.08	0.03	0.04	0.05	0.01	0.09	1.0	0.68	0.11	0.13	0.04	0.32	0.28	0.73	0.0	0.1	0.08
lcl\|BLLF01000433.1_cds_GFH11759.1_6236 (GFH11759)	0.05	0.04	0.0	0.02	0.18	0.27	0.19	0.24	0.23	0.4	0.25	0.17	0.22	0.2	0.17	0.93	0.66	0.59	0.15	0.27	0.49	0.16	1.0	0.07	0.22	0.37
lcl\|BLLF01000450.1_cds_GFH11933.1_6410 (GFH11933)	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000471.1_cds_GFH12133.1_6610 (GFH12133)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.29	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12212.1_6689 (GFH12212)	0.52	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.11	0.0	0.04	0.24	0.32	0.04	0.0	0.0	0.07	1.0	0.34	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000513.1_cds_GFH12538.1_7015 (GFH12538)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.06	0.01	0.11	0.46	0.0	0.02	0.0	0.06	0.16	0.0	0.15	0.24	0.18	0.09	0.31	0.0	1.0	0.0	0.04	0.08
lcl\|BLLF01000610.1_cds_GFH13419.1_7896 (GFH13419)	0.13	0.05	0.0	0.1	0.06	0.05	0.27	0.04	0.18	0.37	0.07	0.04	0.07	0.02	0.2	0.86	1.0	0.25	0.25	0.29	0.25	0.28	0.36	0.14	0.03	0.07
lcl\|BLLF01000629.1_cds_GFH13580.1_8057 (GFH13580)	0.09	0.0	0.0	0.0	0.2	0.15	0.25	0.19	0.27	0.21	0.21	0.14	0.28	0.18	0.34	1.0	0.84	0.35	0.09	0.05	0.5	0.3	0.58	0.06	0.14	0.08
lcl\|BLLF01000658.1_cds_GFH13846.1_8323 (GFH13846)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.15	0.05	0.02	0.47	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.66	1.0	0.18	0.0	0.15	0.24	0.27	0.51	0.08	0.08	0.08
lcl\|BLLF01000673.1_cds_GFH13975.1_8452 (GFH13975)	0.06	0.04	0.14	0.0	0.04	0.06	0.09	0.02	0.12	0.12	0.06	0.03	0.06	0.02	0.07	0.2	0.04	0.17	0.02	0.01	0.16	0.19	1.0	0.01	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000692.1_cds_GFH14149.1_8626 (GFH14149)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000769.1_cds_GFH14806.1_9283 (GFH14806)	0.16	0.04	0.03	0.15	0.06	0.12	0.21	0.04	0.21	0.11	0.06	0.06	0.09	0.04	0.2	1.0	0.99	0.42	0.38	0.15	0.2	0.63	0.81	0.04	0.2	0.16
lcl\|BLLF01000769.1_cds_GFH14807.1_9284 (GFH14807)	0.09	0.03	0.02	0.1	0.05	0.12	0.17	0.04	0.16	0.13	0.04	0.05	0.08	0.04	0.14	1.0	0.98	0.31	0.29	0.09	0.15	0.65	0.51	0.02	0.18	0.17
lcl\|BLLF01000794.1_cds_GFH15010.1_9487 (GFH15010)	0.52	0.33	0.0	0.3	0.09	0.13	0.22	0.12	0.08	0.59	0.17	0.04	0.06	0.08	0.09	0.4	1.0	0.42	0.26	0.11	0.73	0.29	0.97	0.07	0.19	0.16
lcl\|BLLF01000873.1_cds_GFH15606.1_10083 (GFH15606)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.07	0.09	0.17	0.05	0.13	0.06	0.09	0.06	0.12	0.09	0.13	1.0	0.54	0.14	0.0	0.06	0.1	0.34	0.35	0.08	0.13	0.12
lcl\|BLLF01000917.1_cds_GFH15895.1_10372 (GFH15895)	0.1	0.05	0.0	0.08	0.13	0.11	0.13	0.04	0.08	0.22	0.05	0.09	0.24	0.11	0.07	0.28	0.18	0.58	0.19	0.1	0.2	0.39	1.0	0.09	0.09	0.06
lcl\|BLLF01000980.1_cds_GFH16323.1_10800 (GFH16323)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.02	0.0	0.13	0.0	0.02	0.04	0.1	0.02	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.2	0.23	1.0	0.12	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001035.1_cds_GFH16681.1_11158 (GFH16681)	0.14	0.03	0.0	0.0	0.17	0.23	0.22	0.13	0.28	0.2	0.19	0.22	0.29	0.18	0.36	1.0	0.46	0.49	0.15	0.25	0.6	0.39	0.56	0.14	0.04	0.04
lcl\|BLLF01001193.1_cds_GFH17733.1_12210 (GFH17733)	0.02	0.0	0.0	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.52	0.57	0.22	0.1	0.05	0.21	0.07	1.0	0.02	0.07	0.05
lcl\|BLLF01001220.1_cds_GFH17907.1_12384 (GFH17907)	0.04	0.12	0.37	0.08	0.13	0.08	0.09	0.12	0.14	0.51	0.08	0.15	0.08	0.11	0.15	0.22	0.12	0.45	0.19	0.11	0.32	0.07	1.0	0.1	0.18	0.18
lcl\|BLLF01001427.1_cds_GFH19231.1_13708 (GFH19231)	0.05	0.02	0.0	0.0	0.12	0.06	0.16	0.07	0.11	0.27	0.13	0.04	0.08	0.05	0.07	0.93	1.0	0.09	0.32	0.44	0.33	0.2	0.58	0.16	0.01	0.07
lcl\|BLLF01001459.1_cds_GFH19414.1_13891 (GFH19414)	0.33	0.24	0.37	0.22	0.35	0.47	0.45	0.34	0.37	0.93	0.37	0.38	0.29	0.4	0.4	0.35	0.39	0.91	0.52	0.32	1.0	0.29	0.95	0.25	0.3	0.5
lcl\|BLLF01001507.1_cds_GFH19706.1_14183 (GFH19706)	0.28	0.0	0.0	0.11	0.01	0.02	0.1	0.02	0.2	0.08	0.0	0.02	0.02	0.01	0.18	0.36	0.38	0.24	0.05	0.03	0.53	0.04	1.0	0.02	0.04	0.03
lcl\|BLLF01001507.1_cds_GFH19708.1_14185 (GFH19708)	0.09	0.0	0.0	0.05	0.05	0.07	0.1	0.06	0.12	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.1	0.72	0.43	0.07	0.06	0.03	0.13	0.22	1.0	0.05	0.1	0.15
lcl\|BLLF01001561.1_cds_GFH20032.1_14509 (GFH20032)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.09	0.67	0.0	0.52	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.38	0.12	0.0
lcl\|BLLF01001596.1_cds_GFH20213.1_14690 (GFH20213)	0.0	0.06	0.0	0.0	0.02	0.05	0.12	0.04	0.05	0.35	0.04	0.04	0.15	0.12	0.08	0.43	1.0	0.17	0.0	0.09	0.23	0.09	0.38	0.08	0.09	0.03
lcl\|BLLF01001729.1_cds_GFH20933.1_15410 (GFH20933)	0.17	0.18	0.08	0.52	0.1	0.19	0.28	0.06	0.26	0.23	0.08	0.08	0.14	0.07	0.19	0.97	0.83	0.66	0.42	0.09	0.37	0.33	1.0	0.04	0.22	0.17
lcl\|BLLF01001837.1_cds_GFH21475.1_15952 (GFH21475)	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001952.1_cds_GFH22028.1_16505 (GFH22028)	0.11	0.0	0.02	0.0	0.14	0.19	0.14	0.05	0.24	0.0	0.14	0.11	0.07	0.07	0.18	1.0	0.13	0.23	0.21	0.06	0.46	0.34	0.86	0.09	0.28	0.17
lcl\|BLLF01002066.1_cds_GFH22559.1_17036 (GFH22559)	0.75	0.0	0.0	0.07	0.1	0.19	0.1	0.04	0.09	0.16	0.34	0.1	0.0	0.17	0.21	1.0	0.33	0.52	0.0	0.0	0.47	0.27	0.34	0.11	0.16	0.16
lcl\|BLLF01002101.1_cds_GFH22691.1_17168 (GFH22691)	0.26	0.25	0.0	0.01	0.34	0.34	0.3	0.39	0.28	0.58	0.33	0.32	0.38	0.27	0.32	1.0	0.76	0.48	0.41	0.35	0.73	0.4	0.62	0.2	0.21	0.2
lcl\|BLLF01002253.1_cds_GFH23356.1_17833 (GFH23356)	0.04	0.02	0.07	0.01	0.15	0.15	0.14	0.06	0.12	0.06	0.13	0.11	0.1	0.07	0.1	0.9	0.86	0.45	0.11	0.06	0.54	0.09	1.0	0.0	0.32	0.27
lcl\|BLLF01002314.1_cds_GFH23612.1_18089 (GFH23612)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002356.1_cds_GFH23760.1_18237 (GFH23760)	0.01	0.04	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.98	0.47	0.12	0.05	0.02	0.39	0.22	1.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01002430.1_cds_GFH24054.1_18531 (GFH24054)	0.0	0.0	0.0	0.12	0.05	0.01	0.05	0.02	0.08	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.08	0.65	0.55	0.22	0.0	0.12	0.1	0.0	1.0	0.04	0.13	0.08
lcl\|BLLF01002677.1_cds_GFH24950.1_19427 (GFH24950)	0.35	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.55	0.11	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002798.1_cds_GFH25376.1_19853 (GFH25376)	0.17	0.0	0.0	0.17	0.0	0.02	0.04	0.05	0.0	0.28	0.04	0.02	0.05	0.0	0.24	0.19	0.12	0.32	0.24	0.23	0.19	0.0	1.0	0.19	0.15	0.06
lcl\|BLLF01003035.1_cds_GFH26138.1_20615 (GFH26138)	0.05	0.15	0.19	0.04	0.2	0.2	0.15	0.07	0.17	0.09	0.18	0.14	0.14	0.09	0.17	0.98	0.95	0.43	0.15	0.08	0.54	0.33	1.0	0.0	0.64	0.51
lcl\|BLLF01003035.1_cds_GFH26139.1_20616 (GFH26139)	0.07	0.08	0.05	0.07	0.18	0.15	0.18	0.07	0.23	0.07	0.17	0.11	0.17	0.07	0.27	0.83	1.0	0.4	0.1	0.03	0.54	0.16	0.85	0.0	0.29	0.26
lcl\|BLLF01003053.1_cds_GFH26194.1_20671 (GFH26194)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.11	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003071.1_cds_GFH26250.1_20727 (GFH26250)	0.01	0.03	0.2	0.13	0.06	0.16	0.24	0.04	0.15	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.09	0.34	0.44	0.22	0.39	0.05	0.35	0.72	1.0	0.19	0.03	0.02
lcl\|BLLF01003294.1_cds_GFH26938.1_21415 (GFH26938)	0.06	0.05	0.07	0.05	0.09	0.08	0.12	0.04	0.13	0.06	0.09	0.06	0.09	0.04	0.14	0.78	1.0	0.34	0.09	0.04	0.41	0.12	0.72	0.0	0.23	0.17
lcl\|BLLF01003294.1_cds_GFH26939.1_21416 (GFH26939)	0.06	0.06	0.05	0.09	0.08	0.06	0.08	0.05	0.07	0.05	0.07	0.05	0.08	0.05	0.09	0.73	0.83	0.44	0.09	0.06	0.52	0.22	1.0	0.0	0.22	0.14
lcl\|BLLF01003598.1_cds_GFH27742.1_22219 (GFH27742)	0.1	0.0	0.0	0.06	0.02	0.08	0.14	0.11	0.08	0.0	0.02	0.04	0.16	0.12	0.06	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.4	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003711.1_cds_GFH28021.1_22498 (GFH28021)	0.02	0.03	0.0	0.07	0.09	0.22	0.2	0.08	0.25	0.2	0.17	0.14	0.32	0.12	0.13	1.0	0.39	0.31	0.33	0.27	0.3	0.45	0.28	0.12	0.01	0.01
lcl\|BLLF01003773.1_cds_GFH28177.1_22654 (GFH28177)	0.81	0.27	0.0	0.13	0.31	0.28	0.28	0.22	0.37	0.31	0.31	0.2	0.25	0.16	0.28	0.62	1.0	0.74	0.17	0.11	0.79	0.3	1.0	0.29	0.4	0.33
lcl\|BLLF01003926.1_cds_GFH28544.1_23021 (GFH28544)	0.27	0.1	0.18	0.17	0.16	0.12	0.18	0.13	0.17	0.11	0.17	0.14	0.19	0.16	0.19	1.0	0.78	0.29	0.2	0.19	0.3	0.22	0.66	0.26	0.38	0.26
lcl\|BLLF01004481.1_cds_GFH29693.1_24170 (GFH29693)	0.34	0.0	0.0	0.28	0.18	0.06	0.33	0.32	0.2	0.0	0.0	0.01	0.05	0.12	0.18	0.43	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.25	0.27	0.25
lcl\|BLLF01004618.1_cds_GFH29963.1_24440 (GFH29963)	0.09	0.08	0.0	0.0	0.11	0.15	0.21	0.09	0.18	0.35	0.2	0.19	0.31	0.17	0.24	1.0	0.52	0.41	0.24	0.12	0.59	0.34	0.53	0.12	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004624.1_cds_GFH29971.1_24448 (GFH29971)	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.04	0.06	0.01	0.08	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	1.0	0.55	0.15	0.01	0.03	0.11	0.2	0.83	0.02	0.04	0.03
lcl\|BLLF01004702.1_cds_GFH30093.1_24570 (GFH30093)	0.42	0.0	0.0	0.37	0.12	0.19	0.24	0.12	0.08	0.11	0.22	0.12	0.33	0.14	0.15	0.65	0.48	0.5	0.19	0.0	0.17	0.6	1.0	0.35	0.41	0.41
lcl\|BLLF01004903.1_cds_GFH30441.1_24918 (GFH30441)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.38	0.0	0.36	0.0	0.25	0.0	0.57	1.0	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005641.1_cds_GFH31452.1_25929 (GFH31452)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.45	0.0	0.0	0.56	0.0	0.51	0.61	1.0	0.11	0.0	0.17
lcl\|BLLF01005648.1_cds_GFH31463.1_25940 (GFH31463)	0.34	0.11	0.05	0.0	0.04	0.07	0.04	0.0	0.04	0.45	0.05	0.04	0.07	0.02	0.04	0.46	0.46	0.17	0.25	0.0	0.67	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005985.1_cds_GFH31833.1_26310 (GFH31833)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.44	0.17	0.07	0.07	0.21	0.0	0.3	0.07	0.27	0.1	0.17	1.0	0.0	0.26	0.0	0.44	0.0	0.0	0.78	0.22	0.12	0.06
lcl\|BLLF01007552.1_cds_GFH33003.1_27480 (GFH33003)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007773.1_cds_GFH33103.1_27580 (GFH33103)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.08	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007778.1_cds_GFH33105.1_27582 (GFH33105)	0.34	0.0	0.0	0.0	0.19	0.1	0.0	0.04	0.05	0.0	0.1	0.0	0.0	0.09	0.05	1.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.06	0.08	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)