Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.05 1.0 0.0 0.23 0.05 0.0 0.03 0.01 0.03 0.41 0.05 0.04 0.05 0.04 0.02 0.0 0.05 0.05 0.12 0.25 0.11 0.0 0.03 0.02 0.05 0.09
0.08 0.37 0.0 0.11 0.11 0.24 0.26 0.0 0.0 0.46 0.18 0.11 0.27 0.03 0.03 0.32 0.0 0.25 0.38 0.86 0.7 0.0 1.0 0.2 0.23 0.53
0.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 1.0 0.0 0.26 0.4 0.37 0.37 0.46 0.34 0.27 0.35 0.23 0.3 0.46 0.33 0.33 0.01 0.17 0.35 0.29 0.16 0.12 0.58 0.25 0.37 0.56
0.68 1.0 0.0 0.15 0.33 0.21 0.34 0.07 0.23 0.95 0.45 0.03 0.18 0.1 0.38 0.0 0.0 0.22 0.0 0.74 0.9 0.35 0.29 0.03 0.0 0.14
0.0 1.0 0.2 0.0 0.22 0.0 0.07 0.33 0.21 0.47 0.28 0.14 0.17 0.33 0.07 0.68 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.24
0.33 0.75 0.0 0.6 0.09 0.14 0.31 0.04 0.17 0.49 0.18 0.16 0.24 0.15 0.19 0.32 0.12 0.4 0.4 0.13 0.83 0.0 1.0 0.31 0.37 0.29
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 1.0 0.0 0.68 0.08 0.08 0.25 0.17 0.22 0.82 0.13 0.12 0.34 0.0 0.43 0.23 0.0 0.18 0.27 0.0 0.25 0.0 0.36 0.05 0.17 0.04
0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.05 0.07 0.34 0.05 0.13 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.13 0.05
0.74 0.54 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.27 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.76 0.0 0.39 0.14 0.2 0.13 0.1 0.16 0.16 0.25 0.19 0.2 0.1 0.16 0.39 1.0 0.13 0.26 0.22 0.06 0.0 0.22 0.12 0.0 0.0
0.41 1.0 0.0 0.0 0.14 0.22 0.03 0.03 0.21 0.75 0.2 0.16 0.12 0.2 0.03 0.49 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.4 0.06 0.24 0.27
1.0 0.99 0.0 0.21 0.21 0.0 0.43 0.13 0.34 0.45 0.72 0.42 0.52 0.35 0.74 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.49 0.05 0.0 0.0
0.24 1.0 0.0 0.0 0.13 0.24 0.26 0.28 0.1 0.65 0.08 0.0 0.11 0.52 0.25 0.93 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.19 0.3 0.32 0.28 0.28 0.24 0.29 0.22 0.19 0.27 0.29 0.48 0.42 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.16 0.06
0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.07 0.17 0.0 0.39 0.06 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.68 0.42 0.14 0.2 0.1
0.49 0.69 0.0 1.0 0.09 0.12 0.2 0.2 0.11 0.83 0.16 0.04 0.21 0.1 0.11 0.38 0.57 0.49 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.04 0.19 0.37
0.1 1.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.05 0.07 0.05 0.04 0.03 0.05 0.03 0.01 0.07 0.0 0.04 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.25 0.04 0.05
1.0 0.83 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.05 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.19 1.0 0.0 0.92 0.12 0.02 0.13 0.02 0.1 0.11 0.14 0.04 0.08 0.12 0.21 0.0 0.0 0.37 0.13 0.0 0.17 0.0 0.82 0.38 0.06 0.08
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.38 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.03 0.03 1.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.23
0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.17 0.11 0.2 0.49 0.04 0.06 0.18 0.22 0.22 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.7 0.0 0.3 0.32 0.09 0.14 0.15 0.18 0.98 0.05 0.08 0.16 0.07 0.21 0.23 0.17 0.18 0.81 0.84 0.0 1.0 0.18 0.15 0.44 0.15
0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.18 0.03 0.1
0.08 1.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.13 0.03 0.22 0.47 0.18 0.25 0.15 0.07 0.34 0.57 0.0 0.26 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.02 0.1 0.06
1.0 0.76 0.03 0.06 0.05 0.11 0.03 0.05 0.14 0.54 0.06 0.02 0.06 0.01 0.03 0.2 0.36 0.29 0.3 0.21 0.0 0.14 0.09 0.05 0.12 0.0
0.18 0.53 0.27 0.37 0.2 0.17 0.15 0.13 0.21 0.19 0.17 0.12 0.11 0.06 0.18 0.28 1.0 0.15 0.26 0.16 0.44 0.21 0.29 0.17 0.25 0.32
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1
0.27 1.0 0.0 0.03 0.04 0.08 0.03 0.03 0.05 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.06 0.06 0.04 0.18 0.17 0.09 0.0 0.03 0.07 0.08 0.16
0.67 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.01 1.0 0.0 0.15 0.02 0.09 0.08 0.07 0.08 0.57 0.05 0.12 0.08 0.04 0.12 0.05 0.24 0.23 0.0 0.03 0.16 0.12 0.04 0.03 0.05 0.13
0.17 1.0 0.0 0.0 0.47 0.13 0.54 0.09 0.18 0.8 0.13 0.03 0.24 0.0 0.15 0.0 0.35 0.47 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0
0.12 0.51 0.0 0.0 0.1 0.1 0.15 0.09 0.0 0.32 0.1 0.05 0.0 0.0 0.14 0.91 1.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.36 0.13 0.0 0.24
0.0 0.51 0.0 0.0 0.17 0.17 0.07 0.03 0.27 0.19 0.06 0.07 0.18 0.06 0.03 0.86 0.83 0.0 1.0 0.15 0.21 0.21 0.33 0.06 0.05 0.15
1.0 0.88 0.23 0.67 0.21 0.29 0.39 0.13 0.49 0.37 0.24 0.2 0.33 0.15 0.19 0.0 0.26 0.28 0.47 0.4 0.19 0.9 0.28 0.12 0.25 0.18
0.96 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.13 0.0 0.18 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.8 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.03 0.31 0.24
0.95 1.0 0.0 0.14 0.48 0.71 0.29 0.26 0.23 0.31 0.48 0.24 0.26 0.09 0.32 0.44 0.41 0.72 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.03 0.3 0.08
0.38 0.7 0.22 0.21 0.16 0.17 0.68 0.06 0.24 1.0 0.21 0.11 0.25 0.18 0.18 0.29 0.12 0.68 0.6 0.86 0.77 0.28 0.83 0.35 0.24 0.23
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.28 1.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.93 0.0 0.27 0.09 0.09 0.17 0.0 0.0 0.57 0.09 0.17 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.0 1.0 0.0 0.17 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.32 0.57 0.0 0.71 0.07 0.27 0.24 0.12 0.2 0.66 0.11 0.03 0.04 0.04 0.13 0.62 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.02 0.72 0.28
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.2 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.06 0.2 0.0 0.0 0.45 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.25 0.15 0.11
0.27 0.43 0.0 0.34 0.29 0.31 0.23 0.12 0.36 0.86 0.23 0.19 0.23 0.18 0.34 0.28 0.57 0.19 0.38 0.32 0.52 1.0 0.27 0.26 0.31 0.27
0.0 0.68 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.0 1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.5 0.28 0.0 0.02 0.01 0.01 0.08 0.01 0.12 0.0 0.03 0.0 0.01 0.03 0.32 0.07 0.14 0.41 0.17 0.11 0.22 0.16 0.0 0.03 0.02
0.05 1.0 0.0 0.06 0.09 0.15 0.09 0.11 0.12 0.15 0.07 0.07 0.09 0.06 0.06 0.13 0.1 0.1 0.13 0.06 0.28 0.14 0.17 0.26 0.22 0.25
0.0 0.47 0.0 0.73 0.36 0.27 0.38 0.17 0.33 0.63 0.39 0.3 0.26 0.28 0.29 0.35 0.55 0.64 0.27 0.54 0.63 0.15 1.0 0.41 0.07 0.26
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.85 1.0 0.0 0.04 0.12 0.16 0.17 0.08 0.24 0.8 0.12 0.04 0.1 0.09 0.2 0.23 0.17 0.0 0.59 0.34 0.0 0.07 0.04 0.0 0.08 0.24
1.0 0.97 0.0 0.82 0.3 0.16 0.16 0.16 0.36 0.75 0.05 0.2 0.08 0.13 0.21 0.31 0.32 0.42 0.31 0.56 0.57 0.0 0.45 0.21 0.58 0.47
0.56 1.0 0.0 0.13 0.25 0.35 0.27 0.21 0.3 0.29 0.31 0.16 0.24 0.3 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.22 0.0 0.0 0.0 0.34 0.19
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 1.0 0.0 0.0 0.48 0.15 0.05 0.07 0.19 0.72 0.11 0.23 0.13 0.0 0.16 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.12 0.39 0.27
0.0 0.46 0.0 0.0 0.38 0.16 0.12 0.15 0.39 0.0 0.16 0.17 0.23 0.1 0.17 1.0 0.95 0.39 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.06 0.05 0.09 0.23 0.05 0.05 0.05 0.04 0.1 0.18 0.26 0.15 0.1 0.22 0.11 0.02 0.07 0.2 0.18 0.19
0.0 0.64 0.0 0.23 0.08 0.0 0.12 0.0 0.19 1.0 0.04 0.12 0.04 0.03 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.32
0.61 0.62 0.06 0.94 0.21 0.32 0.21 0.34 0.57 0.29 0.28 0.35 0.43 0.24 0.41 0.23 0.17 0.57 0.24 0.14 1.0 0.26 0.96 0.73 0.62 0.59
0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0
0.18 0.57 0.0 0.59 0.4 0.24 0.28 0.12 0.42 0.46 0.34 0.14 0.46 0.2 0.27 0.26 0.19 0.2 0.91 0.6 0.97 0.48 1.0 0.37 0.41 0.45
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.45 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.13
0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.05 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 1.0 0.04 0.04 0.14 0.1 0.09 0.09 0.08 0.0 0.15 0.12 0.04 0.06 0.09 0.18 0.04 0.17 0.07 0.02 0.0 0.07 0.09 0.09 0.1 0.09
0.79 1.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.27 0.06 0.19 0.43 0.06 0.07 0.21 0.12 0.25 0.59 0.44 0.0 0.0 0.4 0.0 0.72 0.0 0.05 0.32 0.11
0.31 0.42 0.0 0.25 0.09 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.03 0.16 1.0 0.14 0.2 0.0 0.58 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0
1.0 0.95 0.0 0.15 0.33 0.2 0.08 0.25 0.43 0.33 0.48 0.2 0.42 0.2 0.29 0.92 0.17 0.0 0.27 0.15 0.0 0.0 0.18 0.13 0.0 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)