Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.56 11.9 0.0 2.72 0.62 0.04 0.32 0.08 0.38 4.87 0.6 0.44 0.62 0.51 0.21 0.0 0.6 0.63 1.42 2.95 1.31 0.0 0.31 0.28 0.58 1.03
0.3 1.3 0.0 0.37 0.37 0.86 0.92 0.0 0.0 1.6 0.62 0.38 0.95 0.12 0.12 1.13 0.0 0.88 1.33 3.0 2.44 0.0 3.51 0.69 0.81 1.85
0.0 11.91 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 1.21 0.0 0.0 1.3 1.31 0.0 1.81 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.3 20.12 0.0 5.22 7.99 7.45 7.52 9.26 6.94 5.36 7.03 4.69 6.01 9.3 6.66 6.66 0.24 3.49 6.98 5.76 3.13 2.36 11.6 4.99 7.41 11.24
1.79 2.63 0.0 0.4 0.88 0.55 0.89 0.18 0.59 2.5 1.18 0.07 0.47 0.25 0.99 0.0 0.0 0.59 0.0 1.94 2.36 0.93 0.77 0.08 0.0 0.36
0.0 4.23 0.84 0.0 0.92 0.0 0.3 1.38 0.87 1.99 1.2 0.61 0.72 1.4 0.29 2.88 0.0 2.62 0.0 0.0 0.0 0.0 2.18 0.0 0.0 1.03
3.44 7.94 0.0 6.3 0.92 1.51 3.22 0.4 1.77 5.16 1.91 1.69 2.55 1.53 1.98 3.4 1.22 4.26 4.26 1.32 8.77 0.0 10.52 3.24 3.94 3.06
0.0 8.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.62 4.02 0.0 2.74 0.3 0.31 1.0 0.67 0.88 3.28 0.52 0.5 1.35 0.0 1.75 0.93 0.0 0.72 1.09 0.0 1.0 0.0 1.44 0.2 0.67 0.17
0.0 4.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.43 0.19 0.3 1.36 0.21 0.53 0.22 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0 0.52 0.22
6.14 4.49 0.0 0.0 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 8.32 0.0 1.0 0.0 2.25 2.1 0.0 0.0 0.0 0.0 6.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.71 4.09 0.0 2.09 0.73 1.09 0.73 0.55 0.86 0.86 1.36 1.03 1.09 0.54 0.85 2.12 5.39 0.71 1.42 1.21 0.33 0.0 1.17 0.66 0.0 0.0
2.22 5.41 0.0 0.0 0.74 1.18 0.17 0.14 1.13 4.07 1.07 0.87 0.63 1.1 0.14 2.67 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 3.37 2.17 0.35 1.29 1.48
0.4 0.4 0.0 0.08 0.08 0.0 0.17 0.05 0.14 0.18 0.29 0.17 0.21 0.14 0.3 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.2 0.02 0.0 0.0
4.45 18.4 0.0 0.0 2.4 4.41 4.75 5.24 1.8 12.05 1.41 0.0 1.94 9.5 4.58 17.03 6.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 0.0 0.0
0.0 7.22 0.0 0.0 1.38 2.15 2.3 2.03 2.0 1.76 2.08 1.55 1.39 1.98 2.11 3.49 3.0 3.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.65 1.18 0.42
0.0 2.9 0.0 0.0 0.52 0.0 0.2 0.48 0.0 1.12 0.17 0.34 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 1.96 1.23 0.41 0.57 0.29
0.27 0.38 0.0 0.55 0.05 0.07 0.11 0.11 0.06 0.46 0.09 0.02 0.11 0.06 0.06 0.21 0.31 0.27 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.02 0.11 0.21
2.95 29.2 0.0 1.04 1.15 0.75 1.6 2.01 1.57 1.2 0.76 1.33 0.74 0.17 1.92 0.0 1.18 1.47 1.85 0.0 0.0 0.0 2.59 7.38 1.14 1.59
7.7 6.39 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 3.85 0.13 0.0 0.0 0.0 0.11 1.63 0.4 0.0 1.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
13.26 70.34 0.0 64.45 8.57 1.4 9.39 1.65 7.1 7.93 10.17 2.9 5.48 8.27 14.86 0.0 0.0 25.89 8.97 0.0 11.91 0.0 57.54 26.73 4.16 5.6
0.0 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.24 5.52 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.84 2.81 0.0 0.0 0.0 0.78 0.29 0.25 0.25 7.48 1.04 0.0 0.55 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1.74
0.0 16.8 0.0 0.0 1.28 0.96 2.84 1.8 3.37 8.24 0.74 0.95 3.03 3.62 3.64 0.0 2.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36 0.27
0.0 1.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0
3.32 7.66 0.0 3.34 3.49 0.96 1.57 1.67 2.0 10.79 0.6 0.83 1.75 0.79 2.26 2.54 1.89 1.98 8.93 9.27 0.0 11.0 1.97 1.67 4.8 1.62
0.78 14.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.06 0.0 0.0 0.0 2.65 0.47 1.45
0.19 2.52 0.0 0.0 0.38 0.35 0.33 0.07 0.55 1.18 0.45 0.64 0.38 0.18 0.86 1.44 0.0 0.65 0.0 0.0 2.27 0.0 0.0 0.05 0.26 0.16
10.23 7.76 0.29 0.65 0.48 1.15 0.36 0.56 1.41 5.5 0.63 0.23 0.6 0.11 0.31 2.04 3.66 2.97 3.1 2.15 0.0 1.45 0.96 0.46 1.23 0.0
5.82 16.62 8.37 11.74 6.28 5.26 4.6 4.04 6.71 6.12 5.28 3.77 3.4 1.95 5.68 8.67 31.5 4.87 8.29 4.89 13.86 6.54 9.29 5.51 7.89 9.99
0.0 4.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.48
12.42 45.42 0.0 1.26 1.93 3.74 1.35 1.54 2.1 1.17 1.45 1.96 0.97 1.09 0.93 2.72 2.7 1.99 8.09 7.6 4.13 0.0 1.28 3.06 3.67 7.05
4.99 7.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.08 6.02 0.0 0.92 0.12 0.54 0.49 0.41 0.51 3.42 0.33 0.75 0.5 0.24 0.72 0.3 1.47 1.37 0.0 0.21 0.98 0.74 0.22 0.18 0.32 0.79
4.54 27.29 0.0 0.0 12.72 3.44 14.76 2.5 4.78 21.89 3.6 0.94 6.57 0.13 4.11 0.0 9.55 12.91 0.0 9.7 0.0 0.0 0.0 0.76 1.23 0.0
0.3 1.36 0.0 0.0 0.26 0.26 0.4 0.22 0.0 0.83 0.25 0.13 0.0 0.0 0.37 2.4 2.64 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.94 0.35 0.0 0.64
0.0 28.63 0.0 0.0 9.5 9.49 4.15 1.66 15.08 10.52 3.54 4.2 10.2 3.3 1.5 48.66 46.69 0.0 56.46 8.74 11.58 12.04 18.74 3.49 3.06 8.34
7.86 6.88 1.82 5.29 1.68 2.3 3.04 1.06 3.83 2.9 1.9 1.57 2.63 1.16 1.5 0.0 2.03 2.19 3.67 3.17 1.47 7.07 2.19 0.91 1.97 1.38
9.32 9.75 0.0 0.0 0.94 0.0 1.25 0.0 1.79 0.0 0.0 0.91 0.99 0.0 0.0 0.0 6.32 0.0 7.75 0.0 1.01 0.0 0.0 0.66 1.53 0.0
0.0 21.22 0.0 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 6.89 0.0 0.0 0.0 0.73 6.51 5.09
1.02 1.07 0.0 0.15 0.51 0.76 0.31 0.28 0.25 0.33 0.51 0.26 0.27 0.1 0.34 0.47 0.44 0.77 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.03 0.32 0.08
2.09 3.85 1.2 1.14 0.89 0.93 3.73 0.32 1.35 5.51 1.17 0.61 1.38 0.98 0.98 1.6 0.65 3.72 3.31 4.77 4.24 1.54 4.56 1.92 1.35 1.24
0.0 5.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0
2.07 7.28 0.0 6.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.33 0.0 0.66 0.22 0.22 0.43 0.0 0.0 1.42 0.22 0.43 0.0 0.24 0.22 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.0 2.49 0.0 0.0 0.0 0.37
0.0 8.37 0.0 1.44 0.36 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 5.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0
0.99 1.73 0.0 2.17 0.21 0.82 0.73 0.38 0.6 2.01 0.33 0.1 0.11 0.11 0.4 1.89 2.1 0.0 0.0 0.0 3.06 0.0 0.73 0.07 2.21 0.86
0.0 3.26 0.0 0.0 0.0 0.15 0.67 0.25 0.0 0.0 0.0 0.17 0.18 0.19 0.64 0.0 0.0 1.46 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.83 0.5 0.35
2.59 4.22 0.0 3.36 2.85 3.0 2.22 1.19 3.47 8.35 2.19 1.81 2.26 1.75 3.3 2.68 5.5 1.84 3.69 3.13 5.09 9.73 2.65 2.51 2.97 2.58
0.0 2.62 0.0 2.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 1.76 0.0 0.0 3.86 0.0 0.44 0.0 0.0
0.0 2.88 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.42 0.0 0.0 0.0 0.0
10.73 12.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.11 4.08 2.28 0.0 0.16 0.08 0.09 0.66 0.07 1.01 0.0 0.23 0.0 0.08 0.23 2.63 0.53 1.11 3.33 1.42 0.92 1.76 1.28 0.0 0.26 0.13
0.99 20.38 0.0 1.3 1.83 3.01 1.84 2.17 2.49 2.97 1.53 1.42 1.75 1.23 1.13 2.67 2.14 2.08 2.74 1.32 5.75 2.83 3.47 5.27 4.43 5.12
0.0 4.06 0.0 6.36 3.14 2.35 3.27 1.47 2.89 5.48 3.41 2.65 2.23 2.46 2.56 3.06 4.78 5.57 2.39 4.74 5.49 1.26 8.7 3.57 0.57 2.24
0.0 9.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.73 4.38 0.0 0.16 0.51 0.69 0.76 0.34 1.06 3.49 0.52 0.19 0.45 0.37 0.88 0.99 0.73 0.0 2.6 1.47 0.0 0.3 0.19 0.02 0.35 1.03
4.67 4.52 0.0 3.81 1.39 0.76 0.77 0.76 1.68 3.49 0.21 0.95 0.37 0.58 0.98 1.44 1.5 1.95 1.45 2.61 2.64 0.0 2.11 0.97 2.71 2.18
3.77 6.73 0.0 0.9 1.71 2.39 1.8 1.38 2.02 1.94 2.09 1.07 1.61 2.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 1.82 1.48 0.0 0.0 0.0 2.27 1.25
0.0 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 7.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.62 0.65 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 1.02 0.0 0.0 0.49 0.16 0.05 0.07 0.19 0.73 0.11 0.23 0.13 0.0 0.16 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.12 0.4 0.27
0.0 1.26 0.0 0.0 1.05 0.44 0.32 0.42 1.07 0.0 0.45 0.45 0.64 0.28 0.46 2.74 2.6 1.07 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
1.93 48.56 0.0 0.47 2.08 2.34 2.94 2.44 4.33 11.01 2.6 2.36 2.37 1.94 4.65 8.91 12.64 7.14 5.01 10.6 5.53 0.88 3.34 9.92 8.89 9.17
0.0 23.89 0.0 8.67 2.91 0.0 4.46 0.0 6.93 37.38 1.44 4.31 1.54 1.29 8.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.5 12.01
4.37 4.44 0.45 6.73 1.5 2.31 1.5 2.45 4.08 2.11 2.05 2.49 3.13 1.69 2.95 1.63 1.19 4.13 1.75 0.99 7.19 1.84 6.94 5.25 4.43 4.25
0.0 2.58 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0
4.83 15.39 0.0 15.91 10.64 6.4 7.44 3.14 11.27 12.26 9.0 3.75 12.33 5.31 7.24 6.93 5.14 5.41 24.34 16.09 26.12 12.85 26.84 10.01 10.95 12.0
0.0 16.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.45 0.0 1.24 0.0 0.0 1.26 7.25 2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.23 0.0 2.13
0.0 22.97 0.0 0.0 0.81 0.8 0.8 1.13 1.16 0.0 0.4 0.0 0.42 0.84 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 9.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
22.74 81.18 2.93 3.17 11.63 8.1 7.08 7.33 6.77 0.0 12.41 9.7 3.47 5.21 7.27 14.47 3.58 13.58 5.65 1.29 0.0 5.97 6.96 6.99 7.85 7.61
0.43 0.54 0.0 0.0 0.07 0.07 0.14 0.03 0.1 0.23 0.03 0.04 0.11 0.07 0.13 0.32 0.23 0.0 0.0 0.21 0.0 0.39 0.0 0.02 0.17 0.06
8.74 11.69 0.0 7.12 2.63 0.51 0.49 0.0 0.48 0.0 1.67 0.0 0.0 2.06 0.98 4.6 28.15 3.92 5.76 0.0 16.43 0.0 3.89 1.47 0.0 0.0
0.95 0.91 0.0 0.14 0.31 0.19 0.07 0.24 0.41 0.31 0.45 0.19 0.4 0.19 0.28 0.88 0.16 0.0 0.26 0.15 0.0 0.0 0.17 0.12 0.0 0.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)