Heatmap: Cluster_257 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000042.1_cds_GFH06499.1_976 (GFH06499)	0.22	0.12	0.15	0.04	0.36	0.32	0.14	0.45	0.12	0.55	0.39	0.33	0.21	0.38	0.14	0.32	0.55	1.0	0.39	0.32	0.97	0.28	0.61	0.06	0.36	0.41
lcl\|BLLF01000048.1_cds_GFH06638.1_1115 (GFH06638)	0.38	0.02	0.48	0.97	0.47	0.26	0.24	0.1	0.21	0.41	0.38	0.14	0.1	0.12	0.13	0.57	1.0	0.57	0.65	0.63	0.95	0.57	0.52	0.15	0.06	0.24
lcl\|BLLF01000068.1_cds_GFH07001.1_1478 (GFH07001)	0.61	0.46	0.02	0.28	0.41	0.33	0.24	0.2	0.24	0.43	0.32	0.18	0.22	0.21	0.17	0.33	0.44	1.0	0.43	0.57	0.76	0.34	0.91	0.06	0.47	0.26
lcl\|BLLF01000069.1_cds_GFH07012.1_1489 (GFH07012)	0.33	0.19	0.0	0.22	0.41	0.31	0.15	0.15	0.1	0.52	0.31	0.11	0.12	0.17	0.1	0.89	0.52	1.0	0.08	0.13	0.58	0.33	0.87	0.07	0.38	0.27
lcl\|BLLF01000083.1_cds_GFH07249.1_1726 (GFH07249)	0.54	0.21	0.34	0.07	0.23	0.2	0.17	0.23	0.19	0.18	0.3	0.19	0.23	0.32	0.21	0.41	0.65	1.0	0.47	0.39	0.82	0.22	0.7	0.05	0.13	0.23
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07536.1_2013 (GFH07536)	0.12	0.08	0.06	0.23	0.11	0.14	0.14	0.08	0.07	0.03	0.17	0.1	0.24	0.12	0.06	0.31	1.0	0.83	0.05	0.03	0.74	0.06	0.35	0.01	0.15	0.08
lcl\|BLLF01000108.1_cds_GFH07670.1_2147 (GFH07670)	0.85	0.35	0.25	0.57	0.48	0.51	0.39	0.19	0.35	0.56	0.41	0.35	0.28	0.2	0.3	0.69	1.0	1.0	0.53	0.76	0.79	0.22	0.89	0.27	0.48	0.36
lcl\|BLLF01000140.1_cds_GFH08135.1_2612 (GFH08135)	0.68	0.62	0.32	0.58	0.37	0.31	0.26	0.24	0.31	0.36	0.38	0.2	0.18	0.23	0.27	0.39	0.56	1.0	0.47	0.43	0.86	0.53	0.75	0.2	0.32	0.21
lcl\|BLLF01000354.1_cds_GFH10860.1_5337 (GFH10860)	0.32	0.06	0.0	0.11	0.44	0.16	0.13	0.36	0.08	0.43	0.44	0.15	0.16	0.42	0.12	0.54	0.42	1.0	0.22	0.32	0.77	0.19	0.73	0.05	0.47	0.34
lcl\|BLLF01000423.1_cds_GFH11658.1_6135 (GFH11658)	0.53	0.46	0.39	0.56	0.34	0.24	0.17	0.31	0.25	0.34	0.27	0.17	0.23	0.19	0.18	0.21	0.33	1.0	0.32	0.51	0.89	0.52	0.71	0.2	0.32	0.34
lcl\|BLLF01000462.1_cds_GFH12045.1_6522 (GFH12045)	0.48	0.12	0.32	0.19	0.19	0.35	0.23	0.12	0.15	0.27	0.25	0.24	0.29	0.23	0.09	0.39	0.25	1.0	0.21	0.35	0.87	0.14	0.62	0.11	0.29	0.33
lcl\|BLLF01000484.1_cds_GFH12268.1_6745 (GFH12268)	0.6	0.69	0.65	0.58	0.7	0.62	0.57	0.43	0.56	0.37	0.67	0.45	0.5	0.64	0.41	0.98	1.0	0.98	0.36	0.61	0.95	0.54	0.83	0.25	0.52	0.58
lcl\|BLLF01000495.1_cds_GFH12358.1_6835 (GFH12358)	0.41	0.15	0.34	0.82	0.6	0.49	0.35	0.35	0.36	0.84	0.61	0.37	0.36	0.46	0.28	0.62	0.72	0.59	0.72	1.0	0.84	0.48	0.67	0.34	0.2	0.47
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12567.1_7044 (GFH12567)	0.84	0.35	0.55	0.66	0.71	0.45	0.39	0.52	0.53	0.62	0.63	0.4	0.51	0.53	0.49	1.0	0.84	0.75	0.39	0.47	0.94	0.39	0.62	0.19	0.76	0.73
lcl\|BLLF01000593.1_cds_GFH13280.1_7757 (GFH13280)	0.17	0.0	0.0	0.9	0.71	0.47	0.32	0.38	0.4	0.52	0.61	0.22	0.12	0.44	0.23	0.09	0.27	1.0	0.43	0.67	0.99	0.0	0.57	0.38	0.49	0.7
lcl\|BLLF01000608.1_cds_GFH13408.1_7885 (GFH13408)	0.7	0.32	0.38	0.97	0.91	0.66	0.49	0.52	0.45	1.0	0.97	0.68	0.52	0.54	0.37	0.73	0.96	0.75	0.64	0.92	0.59	0.93	0.55	0.62	0.44	0.51
lcl\|BLLF01000627.1_cds_GFH13564.1_8041 (GFH13564)	0.22	0.38	0.28	0.27	0.55	0.26	0.14	0.33	0.2	0.45	0.57	0.23	0.3	0.36	0.2	0.3	0.83	1.0	0.3	0.61	0.88	0.07	0.63	0.03	0.19	0.28
lcl\|BLLF01000769.1_cds_GFH14813.1_9290 (GFH14813)	0.45	0.23	0.45	0.29	0.62	0.42	0.36	0.37	0.35	0.28	0.55	0.32	0.33	0.37	0.32	0.43	0.71	1.0	0.53	0.57	0.83	0.45	0.77	0.23	0.37	0.3
lcl\|BLLF01000966.1_cds_GFH16239.1_10716 (GFH16239)	0.43	0.12	0.47	0.39	0.27	0.17	0.22	0.21	0.14	0.23	0.24	0.16	0.13	0.22	0.14	0.18	0.45	1.0	0.67	0.57	0.72	0.29	0.77	0.08	0.29	0.17
lcl\|BLLF01000996.1_cds_GFH16422.1_10899 (GFH16422)	0.09	0.0	0.0	0.19	0.03	0.04	0.04	0.02	0.1	0.0	0.05	0.05	0.11	0.09	0.07	0.12	0.69	0.82	0.14	0.15	1.0	0.0	0.27	0.05	0.02	0.13
lcl\|BLLF01001206.1_cds_GFH17819.1_12296 (GFH17819)	0.2	0.39	0.01	0.22	0.4	0.2	0.25	0.25	0.28	0.48	0.41	0.16	0.22	0.29	0.25	0.48	0.76	0.97	0.32	0.32	1.0	0.09	0.8	0.06	0.39	0.3
lcl\|BLLF01001347.1_cds_GFH18737.1_13214 (GFH18737)	0.14	0.34	0.11	0.16	0.53	0.42	0.19	0.19	0.16	0.77	0.51	0.27	0.15	0.3	0.09	0.44	0.71	0.95	0.19	0.66	1.0	0.23	0.84	0.08	0.06	0.27
lcl\|BLLF01001359.1_cds_GFH18793.1_13270 (GFH18793)	0.29	0.28	0.28	0.28	0.39	0.24	0.21	0.2	0.16	0.3	0.33	0.18	0.2	0.28	0.18	0.27	0.91	1.0	0.28	0.29	0.97	0.18	0.51	0.02	0.26	0.18
lcl\|BLLF01001359.1_cds_GFH18794.1_13271 (GFH18794)	0.54	0.18	0.34	0.2	0.32	0.23	0.16	0.22	0.22	0.24	0.36	0.17	0.23	0.36	0.23	0.53	0.87	1.0	0.4	0.37	0.89	0.19	0.88	0.04	0.39	0.1
lcl\|BLLF01001368.1_cds_GFH18850.1_13327 (GFH18850)	0.06	0.46	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.7	1.0	0.32	0.36	0.71	0.1	0.51	0.07	0.22	0.3
lcl\|BLLF01001434.1_cds_GFH19273.1_13750 (GFH19273)	0.59	0.24	0.37	0.45	0.59	0.45	0.33	0.27	0.34	0.43	0.48	0.31	0.27	0.27	0.3	0.7	0.99	1.0	0.62	0.7	0.99	0.44	0.91	0.23	0.35	0.36
lcl\|BLLF01001537.1_cds_GFH19897.1_14374 (GFH19897)	0.49	0.07	0.31	0.36	0.39	0.28	0.27	0.17	0.2	0.78	0.29	0.15	0.2	0.16	0.13	0.49	0.74	1.0	0.45	0.51	0.91	0.33	0.87	0.11	0.12	0.16
lcl\|BLLF01001597.1_cds_GFH20218.1_14695 (GFH20218)	0.17	0.16	0.0	0.39	0.64	0.35	0.23	0.22	0.18	0.7	0.55	0.22	0.26	0.34	0.15	0.21	0.29	1.0	0.15	0.74	0.78	0.05	0.96	0.04	0.02	0.33
lcl\|BLLF01001600.1_cds_GFH20235.1_14712 (GFH20235)	0.2	0.0	0.06	0.6	0.56	0.13	0.1	0.05	0.11	0.77	0.47	0.05	0.06	0.11	0.07	0.19	0.21	1.0	0.22	0.62	0.67	0.08	0.46	0.01	0.03	0.18
lcl\|BLLF01001610.1_cds_GFH20293.1_14770 (GFH20293)	0.61	0.07	0.33	0.24	0.57	0.3	0.32	0.34	0.31	0.27	0.52	0.21	0.24	0.34	0.22	0.66	0.84	0.87	0.36	0.4	0.9	0.19	1.0	0.04	0.28	0.2
lcl\|BLLF01001633.1_cds_GFH20431.1_14908 (GFH20431)	0.17	0.1	0.13	0.21	0.5	0.2	0.1	0.22	0.14	0.2	0.44	0.2	0.15	0.21	0.14	0.12	0.32	1.0	0.47	0.73	0.74	0.16	0.53	0.03	0.27	0.24
lcl\|BLLF01001648.1_cds_GFH20504.1_14981 (GFH20504)	0.78	0.81	0.47	0.39	0.25	0.27	0.15	0.15	0.19	0.65	0.21	0.2	0.19	0.23	0.13	0.57	0.45	0.89	0.54	0.78	1.0	0.44	0.94	0.18	0.35	0.47
lcl\|BLLF01001755.1_cds_GFH21066.1_15543 (GFH21066)	0.45	0.03	0.09	0.11	0.22	0.2	0.08	0.1	0.12	0.14	0.15	0.02	0.04	0.06	0.07	0.04	0.18	1.0	0.19	0.48	0.75	0.0	0.43	0.0	0.28	0.12
lcl\|BLLF01001822.1_cds_GFH21402.1_15879 (GFH21402)	0.54	0.5	0.36	0.47	0.54	0.5	0.45	0.42	0.45	0.51	0.59	0.4	0.37	0.46	0.43	0.78	0.99	0.99	0.23	0.42	0.96	0.46	1.0	0.39	0.53	0.47
lcl\|BLLF01001838.1_cds_GFH21477.1_15954 (GFH21477)	0.63	0.75	0.69	1.0	0.53	0.37	0.33	0.25	0.33	0.39	0.48	0.27	0.29	0.29	0.25	0.53	0.88	0.98	0.7	0.59	0.87	1.0	0.81	0.26	0.21	0.35
lcl\|BLLF01001855.1_cds_GFH21563.1_16040 (GFH21563)	0.64	0.34	0.43	0.38	0.34	0.29	0.23	0.31	0.23	0.43	0.32	0.25	0.2	0.25	0.16	0.2	0.44	1.0	0.6	0.77	0.77	0.77	0.72	0.16	0.15	0.08
lcl\|BLLF01002004.1_cds_GFH22269.1_16746 (GFH22269)	0.39	0.16	0.15	0.09	0.31	0.17	0.19	0.14	0.16	0.26	0.23	0.13	0.17	0.12	0.16	0.37	0.6	0.81	0.23	0.35	1.0	0.3	0.52	0.06	0.1	0.12
lcl\|BLLF01002058.1_cds_GFH22523.1_17000 (GFH22523)	0.43	0.49	0.5	0.17	0.31	0.23	0.19	0.22	0.19	0.17	0.26	0.2	0.19	0.22	0.18	0.2	0.36	1.0	0.58	0.64	0.92	0.17	0.89	0.02	0.19	0.22
lcl\|BLLF01002079.1_cds_GFH22610.1_17087 (GFH22610)	0.3	0.06	0.12	0.26	0.31	0.25	0.18	0.2	0.2	0.14	0.34	0.23	0.25	0.22	0.13	0.19	0.29	1.0	0.37	0.39	0.74	0.17	0.72	0.03	0.19	0.22
lcl\|BLLF01002122.1_cds_GFH22787.1_17264 (GFH22787)	0.63	0.48	0.53	0.32	0.69	0.5	0.47	0.45	0.46	0.71	0.72	0.46	0.54	0.55	0.48	0.84	0.95	1.0	0.44	0.43	0.96	0.58	0.85	0.16	0.31	0.29
lcl\|BLLF01002248.1_cds_GFH23329.1_17806 (GFH23329)	0.18	0.05	0.0	0.09	0.47	0.33	0.18	0.25	0.12	0.33	0.34	0.14	0.16	0.18	0.05	0.14	0.24	1.0	0.32	0.18	0.98	0.58	0.48	0.01	0.25	0.12
lcl\|BLLF01002248.1_cds_GFH23333.1_17810 (GFH23333)	0.2	0.0	0.25	0.0	0.49	0.36	0.2	0.32	0.1	0.54	0.38	0.12	0.16	0.21	0.06	0.04	0.14	1.0	0.51	0.34	0.99	0.24	0.56	0.02	0.37	0.09
lcl\|BLLF01002543.1_cds_GFH24465.1_18942 (GFH24465)	0.69	0.11	0.42	0.21	0.46	0.42	0.31	0.24	0.28	0.24	0.59	0.37	0.4	0.44	0.24	0.51	0.62	1.0	0.29	0.53	0.95	0.46	0.63	0.14	0.42	0.38
lcl\|BLLF01002781.1_cds_GFH25327.1_19804 (GFH25327)	0.16	0.11	0.0	0.08	0.07	0.19	0.06	0.07	0.08	0.23	0.18	0.14	0.25	0.22	0.04	0.24	0.71	1.0	0.28	0.32	0.69	0.1	0.19	0.07	0.12	0.04
lcl\|BLLF01002832.1_cds_GFH25497.1_19974 (GFH25497)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.04	0.04	0.0	0.33	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	1.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.04	0.0	0.07
lcl\|BLLF01003075.1_cds_GFH26262.1_20739 (GFH26262)	0.37	0.73	0.22	0.2	0.23	0.2	0.14	0.08	0.17	0.4	0.24	0.12	0.18	0.09	0.11	0.6	0.69	0.81	0.49	0.42	1.0	0.3	0.61	0.09	0.16	0.29
lcl\|BLLF01003256.1_cds_GFH26832.1_21309 (GFH26832)	0.07	0.31	0.0	0.21	0.58	0.28	0.23	0.24	0.31	0.19	0.45	0.22	0.26	0.26	0.17	0.0	0.2	1.0	0.11	0.79	0.79	0.11	0.78	0.04	0.13	0.2
lcl\|BLLF01003257.1_cds_GFH26836.1_21313 (GFH26836)	0.42	0.29	0.16	0.39	0.54	0.42	0.33	0.26	0.34	0.29	0.44	0.28	0.27	0.25	0.23	0.49	0.57	1.0	0.35	0.46	0.7	0.46	0.91	0.22	0.35	0.33
lcl\|BLLF01003304.1_cds_GFH26971.1_21448 (GFH26971)	0.63	0.48	0.0	0.26	0.65	0.33	0.33	0.29	0.48	1.0	0.5	0.22	0.21	0.18	0.36	0.44	0.47	0.96	0.45	0.53	0.65	0.54	0.68	0.15	0.54	0.21
lcl\|BLLF01003454.1_cds_GFH27384.1_21861 (GFH27384)	0.53	0.37	0.33	0.26	0.46	0.36	0.42	0.35	0.47	0.98	0.4	0.31	0.37	0.38	0.44	0.55	0.93	1.0	0.63	0.55	0.88	0.26	0.87	0.4	0.43	0.41
lcl\|BLLF01003496.1_cds_GFH27495.1_21972 (GFH27495)	0.22	0.0	0.42	0.55	0.03	0.05	0.06	0.05	0.05	0.35	0.15	0.08	0.03	0.13	0.02	0.28	0.63	0.25	0.38	0.66	1.0	0.77	0.38	0.07	0.09	0.14
lcl\|BLLF01003604.1_cds_GFH27755.1_22232 (GFH27755)	0.39	0.15	0.01	0.23	0.48	0.26	0.19	0.21	0.12	0.34	0.47	0.24	0.19	0.27	0.1	0.25	0.63	1.0	0.28	0.32	0.73	0.35	0.5	0.05	0.45	0.16
lcl\|BLLF01003604.1_cds_GFH27756.1_22233 (GFH27756)	0.25	0.06	0.19	0.2	0.41	0.26	0.18	0.23	0.16	0.16	0.47	0.21	0.22	0.3	0.04	0.23	0.37	1.0	0.21	0.18	0.64	0.23	0.39	0.04	0.37	0.17
lcl\|BLLF01003854.1_cds_GFH28386.1_22863 (GFH28386)	0.44	0.59	0.0	0.33	1.0	0.42	0.44	0.61	0.47	0.84	0.79	0.25	0.33	0.35	0.57	0.65	0.31	0.96	0.59	0.38	0.59	0.58	0.95	0.06	0.86	0.29
lcl\|BLLF01004084.1_cds_GFH28887.1_23364 (GFH28887)	0.48	0.61	0.46	0.52	0.34	0.28	0.14	0.3	0.16	0.45	0.36	0.19	0.2	0.22	0.22	0.4	0.79	1.0	0.68	0.34	0.99	0.79	0.85	0.23	0.34	0.19
lcl\|BLLF01004693.1_cds_GFH30076.1_24553 (GFH30076)	0.59	0.49	0.35	0.72	0.35	0.35	0.3	0.15	0.3	0.59	0.35	0.22	0.4	0.24	0.22	0.64	1.0	0.83	0.62	0.6	1.0	0.37	0.66	0.21	0.29	0.37
lcl\|BLLF01004845.1_cds_GFH30348.1_24825 (GFH30348)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.14	0.13	0.09	0.02	0.0	0.08	0.16	0.02	0.16	0.06	0.18	0.41	1.0	0.0	0.12	0.99	0.0	0.28	0.13	0.03	0.07
lcl\|BLLF01005011.1_cds_GFH30598.1_25075 (GFH30598)	0.5	0.46	0.39	0.25	0.45	0.37	0.22	0.24	0.27	0.46	0.42	0.32	0.18	0.29	0.19	0.72	0.77	0.85	0.36	0.41	0.61	0.31	1.0	0.19	0.6	0.29
lcl\|BLLF01005263.1_cds_GFH30969.1_25446 (GFH30969)	0.35	0.22	0.35	0.22	0.26	0.18	0.12	0.35	0.16	0.04	0.25	0.08	0.15	0.24	0.09	0.01	0.31	1.0	0.41	0.11	0.89	0.01	0.7	0.03	0.14	0.24
lcl\|BLLF01005787.1_cds_GFH31635.1_26112 (GFH31635)	0.48	0.07	0.0	0.01	0.43	0.26	0.24	0.25	0.28	0.22	0.27	0.17	0.16	0.15	0.18	0.22	0.43	1.0	0.47	0.51	0.77	0.1	0.89	0.01	0.26	0.2
lcl\|BLLF01008648.1_cds_GFH33467.1_27944 (GFH33467)	0.05	0.0	0.0	0.6	0.54	0.12	0.06	0.15	0.13	0.26	0.61	0.14	0.02	0.28	0.1	0.0	0.0	1.0	0.43	0.85	0.99	0.0	0.71	0.02	0.03	0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)