Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0003s00047.1 (33187484)	0.18	0.01	0.01	0.01	1.0	0.76	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.2	0.08	0.27	0.24	0.23	0.01	0.04	0.01	0.01
Dusal.0003s00048.1 (33187546)	0.17	0.01	0.01	0.0	1.0	0.8	0.28	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.46	0.12	0.11	0.01	0.03	0.0	0.02
Dusal.0004s00015.1 (33201073)	0.43	0.19	0.14	0.03	1.0	0.71	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.22	0.06	0.24	0.46	0.63	0.13	0.12	0.05	0.05
Dusal.0005s00047.1 (33196959)	0.35	0.03	0.03	0.02	1.0	0.78	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.03	0.43	0.11	0.24	0.16	0.24	0.05	0.09
Dusal.0020s00026.1 (33193720)	0.48	0.03	0.03	0.0	1.0	0.84	0.28	0.0	0.0	0.02	0.06	0.15	0.31	0.09	0.37	0.41	0.45	0.02	0.01	0.02	0.02
Dusal.0024s00001.1 (33202201)	0.34	0.0	0.0	0.0	1.0	0.77	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.14	0.0	0.43	0.13	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0
Dusal.0025s00026.1 (33200692)	0.94	0.07	0.04	0.05	1.0	0.92	0.25	0.0	0.02	0.02	0.04	0.04	0.18	0.07	0.09	0.11	0.15	0.1	0.07	0.02	0.08
Dusal.0025s00040.1 (33200699)	0.03	0.0	0.01	0.0	1.0	0.69	0.18	0.0	0.0	0.02	0.0	0.09	0.16	0.02	0.11	0.18	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0
Dusal.0033s00033.1 (33202502)	0.36	0.14	0.14	0.09	1.0	0.73	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.23	0.13	0.04	0.04	0.19	0.14	0.15	0.05	0.01
Dusal.0034s00006.1 (33197165)	0.13	0.0	0.0	0.0	1.0	0.77	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.04	0.17	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0
Dusal.0036s00025.1 (33190406)	0.59	0.03	0.03	0.02	1.0	0.87	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.1	0.33	0.11	0.16	0.15	0.2	0.18	0.15
Dusal.0037s00036.1 (33185951)	0.25	0.07	0.07	0.06	1.0	0.93	0.34	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.14	0.03	0.2	0.27	0.26	0.09	0.11	0.09	0.13
Dusal.0044s00018.1 (33194924)	0.34	0.22	0.25	0.17	1.0	0.81	0.37	0.01	0.01	0.03	0.03	0.18	0.26	0.08	0.15	0.19	0.18	0.24	0.18	0.19	0.26
Dusal.0045s00003.1 (33191628)	0.05	0.07	0.07	0.08	1.0	0.84	0.41	0.03	0.03	0.05	0.03	0.06	0.12	0.07	0.19	0.17	0.2	0.06	0.07	0.02	0.03
Dusal.0048s00048.1 (33189481)	0.19	0.01	0.0	0.01	1.0	0.82	0.21	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.09	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02
Dusal.0050s00015.1 (33193822)	0.43	0.0	0.0	0.0	1.0	0.9	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.04	0.11	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0068s00015.1 (33187214)	0.11	0.08	0.07	0.04	1.0	0.79	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.14	0.08	0.29	0.14	0.23	0.08	0.08	0.02	0.07
Dusal.0077s00023.1 (33192479)	1.0	0.11	0.06	0.05	0.85	0.65	0.46	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.17	0.04	0.2	0.36	0.4	0.28	0.38	0.14	0.25
Dusal.0080s00016.1 (33203968)	0.09	0.17	0.21	0.08	1.0	0.84	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.25	0.19	0.35	0.2	0.14	0.13	0.26	0.11	0.09
Dusal.0088s00008.1 (33203547)	0.48	0.0	0.0	0.0	1.0	0.77	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.28	0.05	0.12	0.2	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0096s00024.1 (33195829)	0.12	0.07	0.06	0.01	1.0	0.82	0.44	0.0	0.0	0.01	0.02	0.06	0.1	0.06	0.12	0.15	0.13	0.14	0.23	0.05	0.09
Dusal.0107s00016.1 (33192127)	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.85	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.03	0.69	0.12	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0113s00021.1 (33191899)	0.57	0.14	0.14	0.09	1.0	0.75	0.51	0.0	0.04	0.0	0.0	0.12	0.17	0.07	0.26	0.21	0.32	0.22	0.28	0.2	0.3
Dusal.0113s00022.1 (33191901)	0.42	0.1	0.09	0.03	1.0	0.76	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.17	0.08	0.12	0.19	0.24	0.16	0.14	0.04	0.14
Dusal.0122s00002.1 (33203034)	0.08	0.04	0.09	0.05	1.0	0.82	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.03	0.14	0.09	0.19	0.06	0.05	0.02	0.12
Dusal.0128s00019.1 (33185276)	0.33	0.18	0.12	0.07	0.9	1.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.07	0.24	0.03	0.04	0.08	0.15	0.02	0.02
Dusal.0140s00012.1 (33196370)	0.51	0.14	0.13	0.1	1.0	0.94	0.38	0.03	0.08	0.08	0.08	0.08	0.22	0.07	0.22	0.08	0.11	0.18	0.14	0.16	0.12
Dusal.0155s00007.1 (33194771)	0.1	0.12	0.12	0.09	1.0	0.88	0.41	0.05	0.06	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.19	0.09	0.13	0.16	0.18	0.03	0.07
Dusal.0165s00012.1 (33193362)	0.29	0.3	0.34	0.25	1.0	0.85	0.51	0.23	0.26	0.08	0.18	0.29	0.41	0.18	0.46	0.44	0.54	0.4	0.44	0.36	0.45
Dusal.0165s00026.1 (33193364)	0.36	0.14	0.16	0.13	1.0	0.82	0.27	0.17	0.17	0.16	0.08	0.29	0.32	0.17	0.38	0.36	0.36	0.25	0.32	0.18	0.26
Dusal.0168s00005.1 (33200862)	0.08	0.05	0.05	0.03	1.0	0.73	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.11	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02
Dusal.0168s00019.1 (33200864)	0.33	0.19	0.24	0.08	1.0	0.72	0.4	0.07	0.11	0.06	0.02	0.23	0.26	0.11	0.18	0.34	0.44	0.07	0.11	0.06	0.11
Dusal.0205s00002.1 (33197312)	0.07	0.03	0.04	0.01	1.0	0.84	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.01	0.31	0.05	0.14	0.15	0.19	0.05	0.08
Dusal.0222s00010.1 (33201849)	0.04	0.01	0.01	0.03	1.0	0.76	0.22	0.05	0.05	0.03	0.07	0.04	0.08	0.03	0.11	0.09	0.13	0.02	0.02	0.02	0.04
Dusal.0244s00017.1 (33186502)	0.32	0.21	0.21	0.13	1.0	0.93	0.46	0.08	0.07	0.08	0.05	0.15	0.16	0.05	0.24	0.17	0.37	0.44	0.48	0.24	0.51
Dusal.0261s00001.1 (33200537)	0.16	0.07	0.07	0.08	1.0	0.89	0.42	0.0	0.02	0.0	0.0	0.27	0.3	0.12	0.43	0.34	0.33	0.07	0.12	0.1	0.08
Dusal.0296s00009.1 (33186013)	0.88	0.2	0.31	0.26	1.0	0.83	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.41	0.18	0.42	0.29	0.5	0.41	0.45	0.06	0.15
Dusal.0348s00001.1 (33203504)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.91	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0358s00005.1 (33203379)	0.09	0.11	0.15	0.1	1.0	0.81	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.23	0.13	0.42	0.37	0.43	0.14	0.08	0.09	0.11
Dusal.0416s00009.1 (33198865)	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.84	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.18	0.06	0.4	0.27	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0426s00009.1 (33189088)	0.1	0.02	0.02	0.02	1.0	0.76	0.16	0.22	0.17	0.11	0.09	0.03	0.04	0.02	0.25	0.13	0.11	0.03	0.04	0.09	0.05
Dusal.0457s00012.1 (33193808)	0.23	0.19	0.13	0.1	0.89	1.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.14	0.18	0.2	0.16	0.2	0.24	0.26	0.2	0.27
Dusal.0513s00002.1 (33186365)	0.24	0.04	0.04	0.05	1.0	0.83	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.14	0.03	0.02	0.08	0.12	0.04	0.04
Dusal.0534s00004.1 (33197449)	0.22	0.03	0.04	0.03	1.0	0.89	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.25	0.11	0.69	0.34	0.48	0.06	0.08	0.09	0.07
Dusal.0563s00006.1 (33202351)	0.2	0.03	0.04	0.01	1.0	0.75	0.3	0.23	0.08	0.2	0.1	0.1	0.19	0.07	0.62	0.33	0.38	0.1	0.08	0.1	0.13
Dusal.0620s00006.1 (33193413)	0.13	0.03	0.03	0.06	1.0	0.8	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.15	0.11	0.12	0.13	0.21	0.04	0.08	0.01	0.07
Dusal.0622s00009.1 (33200105)	0.32	0.09	0.05	0.03	1.0	0.83	0.46	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.13	0.09	0.35	0.21	0.19	0.19	0.26	0.05	0.13
Dusal.0658s00004.1 (33202428)	0.23	0.01	0.02	0.0	1.0	0.92	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.15	0.19	0.07	0.08	0.06	0.09	0.02	0.07
Dusal.0695s00005.1 (33201554)	0.37	0.14	0.16	0.07	1.0	0.77	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.25	0.13	0.39	0.24	0.46	0.14	0.16	0.04	0.07
Dusal.0760s00002.1 (33190089)	0.27	0.05	0.04	0.05	1.0	0.66	0.31	0.01	0.08	0.01	0.09	0.04	0.16	0.03	0.05	0.17	0.14	0.05	0.07	0.04	0.06
Dusal.0765s00003.1 (33197861)	0.07	0.08	0.06	0.14	1.0	0.7	0.32	0.13	0.11	0.05	0.16	0.07	0.11	0.04	0.19	0.18	0.17	0.13	0.21	0.32	0.19
Dusal.0798s00002.1 (33197432)	0.23	0.25	0.23	0.11	1.0	0.66	0.49	0.03	0.02	0.02	0.03	0.16	0.19	0.06	0.22	0.37	0.43	0.26	0.35	0.16	0.19
Dusal.0832s00006.1 (33198636)	0.54	0.13	0.13	0.2	1.0	0.91	0.32	0.0	0.0	0.01	0.0	0.18	0.29	0.13	0.18	0.3	0.33	0.13	0.17	0.05	0.08
Dusal.0868s00004.1 (33198175)	0.08	0.01	0.01	0.02	1.0	0.82	0.24	0.05	0.03	0.04	0.13	0.06	0.07	0.04	0.04	0.07	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01
Dusal.0934s00004.1 (33191139)	0.12	0.14	0.12	0.09	0.92	1.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.16	0.1	0.37	0.24	0.14	0.25	0.26	0.12	0.15
Dusal.0962s00003.1 (33190325)	0.96	0.22	0.15	0.17	1.0	0.88	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.74	0.19	0.13	0.36	0.38	0.05	0.07	0.1	0.18
Dusal.0975s00002.1 (33188983)	0.48	0.04	0.02	0.01	1.0	0.85	0.18	0.08	0.17	0.09	0.14	0.11	0.07	0.01	0.13	0.12	0.1	0.12	0.21	0.05	0.13
Dusal.1127s00002.1 (33192975)	0.12	0.02	0.02	0.02	0.97	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.16	0.01	0.64	0.11	0.11	0.29	0.32	0.05	0.12
Dusal.1142s00002.1 (33193684)	0.21	0.05	0.04	0.05	1.0	0.79	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.19	0.05	0.08	0.17	0.24	0.1	0.11	0.08	0.1
Dusal.1181s00004.1 (33196592)	0.49	0.09	0.11	0.02	1.0	0.74	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.32	0.03	0.1	0.24	0.14	0.05	0.11	0.01	0.06
Dusal.1193s00002.1 (33189972)	0.07	0.0	0.0	0.01	1.0	1.0	0.22	0.0	0.01	0.0	0.05	0.07	0.15	0.07	0.93	0.2	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.3767s00001.1 (33202258)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.7	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.13	0.02	0.0	0.25	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)